POLR2D

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Полипептид D РНК-полимеразы II (управляемой ДНК)
Protein POLR2D PDB 2c35.png
PDB представлено на примере 2c35.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
Символ POLR2D ; HSRBP4; HSRPB4; RBP4; RPB16
Внешние ID OMIM: 606017 MGI1916491 HomoloGene37968 GeneCards: POLR2D Gene
номер EC 2.7.7.6
Профиль экспрессии РНК
PBB GE POLR2D 203664 s at tn.png
PBB GE POLR2D 214144 at tn.png
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 5433 69241
Ensembl ENSG00000144231 ENSMUSG00000024258
UniProt O15514 Q9D7M8
RefSeq (мРНК) NM_004805 NM_027002
RefSeq (белок) NP_004796 NP_081278
Локус (UCSC) Chr 2:
128.6 – 128.62 Mb
Chr 18:
31.79 – 31.8 Mb
Поиск в PubMed [1] [2]

Субъединица RPB4 ДНК-зависимой РНК-полимеразы II — фермент, кодируемый у человека геном POLR2D[1].

Этот ген кодирует четвертую по величине субъединицу РНК-полимеразы II, ответственной за синтез РНК у эукариот. У дрожжей, эта полимеразная субъединица связывается с полимеразой при субоптимальных условиях роста и может играть роль защиты от стресса. В 3' нетранслируемой области транскрипта этого гена содержится последовательность для рибосомального псевдогена[2].

Примечания[править | править код]

  1. Khazak V, Estojak J, Cho H, Majors J, Sonoda G, Testa JR, Golemis EA (May 1998). «Analysis of the interaction of the novel RNA polymerase II (pol II) subunit hsRPB4 with its partner hsRPB7 and with pol II». Mol Cell Biol 18 (4): 1935–45. PMID 9528765.
  2. Entrez Gene: POLR2D polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide D.

Литература[править | править код]

  • Jeang KT (1998). «Tat, Tat-associated kinase, and transcription.». J. Biomed. Sci. 5 (1): 24–7. DOI:10.1007/BF02253352. PMID 9570510.
  • Yankulov K, Bentley D (1998). «Transcriptional control: Tat cofactors and transcriptional elongation.». Curr. Biol. 8 (13): R447–9. DOI:10.1016/S0960-9822(98)70289-1. PMID 9651670.
  • Romano G, Kasten M, De Falco G, et al. (2000). «Regulatory functions of Cdk9 and of cyclin T1 in HIV tat transactivation pathway gene expression.». J. Cell. Biochem. 75 (3): 357–68. DOI:10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K. PMID 10536359.
  • Marcello A, Zoppé M, Giacca M (2002). «Multiple modes of transcriptional regulation by the HIV-1 Tat transactivator.». IUBMB Life 51 (3): 175–81. DOI:10.1080/152165401753544241. PMID 11547919.
  • Stevens M, De Clercq E, Balzarini J (2007). «The regulation of HIV-1 transcription: molecular targets for chemotherapeutic intervention.». Med Res Rev 26 (5): 595–625. DOI:10.1002/med.20081. PMID 16838299.
  • Harrich D, McMillan N, Munoz L, et al. (2007). «Will diverse Tat interactions lead to novel antiretroviral drug targets?». Current drug targets 7 (12): 1595–606. DOI:10.2174/138945006779025338. PMID 17168834.
  • Kato H, Sumimoto H, Pognonec P, et al. (1992). «HIV-1 Tat acts as a processivity factor in vitro in conjunction with cellular elongation factors.». Genes Dev. 6 (4): 655–66. DOI:10.1101/gad.6.4.655. PMID 1559613.
  • Southgate C, Zapp ML, Green MR (1990). «Activation of transcription by HIV-1 Tat protein tethered to nascent RNA through another protein.». Nature 345 (6276): 640–2. DOI:10.1038/345640a0. PMID 2190099.
  • Wu-Baer F, Sigman D, Gaynor RB (1995). «Specific binding of RNA polymerase II to the human immunodeficiency virus trans-activating region RNA is regulated by cellular cofactors and Tat.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92 (16): 7153–7. DOI:10.1073/pnas.92.16.7153. PMID 7638159.
  • Herrmann CH, Rice AP (1995). «Lentivirus Tat proteins specifically associate with a cellular protein kinase, TAK, that hyperphosphorylates the carboxyl-terminal domain of the large subunit of RNA polymerase II: candidate for a Tat cofactor.». J. Virol. 69 (3): 1612–20. PMID 7853496.
  • Keen NJ, Gait MJ, Karn J (1996). «Human immunodeficiency virus type-1 Tat is an integral component of the activated transcription-elongation complex.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93 (6): 2505–10. DOI:10.1073/pnas.93.6.2505. PMID 8637904.
  • Yang X, Herrmann CH, Rice AP (1996). «The human immunodeficiency virus Tat proteins specifically associate with TAK in vivo and require the carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II for function.». J. Virol. 70 (7): 4576–84. PMID 8676484.
  • Agostini I, Navarro JM, Rey F, et al. (1996). «The human immunodeficiency virus type 1 Vpr transactivator: cooperation with promoter-bound activator domains and binding to TFIIB.». J. Mol. Biol. 261 (5): 599–606. DOI:10.1006/jmbi.1996.0485. PMID 8800208.
  • Zhou Q, Sharp PA (1996). «Tat-SF1: cofactor for stimulation of transcriptional elongation by HIV-1 Tat.». Science 274 (5287): 605–10. DOI:10.1126/science.274.5287.605. PMID 8849451.
  • Okamoto H, Sheline CT, Corden JL, et al. (1996). «Trans-activation by human immunodeficiency virus Tat protein requires the C-terminal domain of RNA polymerase II.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93 (21): 11575–9. DOI:10.1073/pnas.93.21.11575. PMID 8876177.
  • Chun RF, Jeang KT (1996). «Requirements for RNA polymerase II carboxyl-terminal domain for activated transcription of human retroviruses human T-cell lymphotropic virus I and HIV-1.». J. Biol. Chem. 271 (44): 27888–94. DOI:10.1074/jbc.271.44.27888. PMID 8910388.
  • Parada CA, Roeder RG (1996). «Enhanced processivity of RNA polymerase II triggered by Tat-induced phosphorylation of its carboxy-terminal domain.». Nature 384 (6607): 375–8. DOI:10.1038/384375a0. PMID 8934526.
  • García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). «Association of Tat with purified HIV-1 and HIV-2 transcription preinitiation complexes.». J. Biol. Chem. 272 (11): 6951–8. DOI:10.1074/jbc.272.11.6951. PMID 9054383.
  • Cujec TP, Cho H, Maldonado E, et al. (1997). «The human immunodeficiency virus transactivator Tat interacts with the RNA polymerase II holoenzyme.». Mol. Cell. Biol. 17 (4): 1817–23. PMID 9121429.
  • García-Martínez LF, Mavankal G, Neveu JM, et al. (1997). «Purification of a Tat-associated kinase reveals a TFIIH complex that modulates HIV-1 transcription.». EMBO J. 16 (10): 2836–50. DOI:10.1093/emboj/16.10.2836. PMID 9184228.