SAP30
Перейти к навигации
Перейти к поиску
| Белок, ассоциированный с Sin3A, 30kDa | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Доступные структуры | |||||||||||
| PDB | Поиск ортологов: PDBe, RCSB | ||||||||||
Список идентификаторов PDB | |||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||
| Символ | SAP30 | ||||||||||
| Внешние ID | OMIM: 603378 MGI: 1929129 HomoloGene: 2869 GeneCards: Ген SAP30 | ||||||||||
| |||||||||||
| Профиль экспрессии РНК | |||||||||||
 | |||||||||||
 | |||||||||||
| Больше информации | |||||||||||
| Ортологи | |||||||||||
| Вид | Человек | Мышь | |||||||||
| Entrez | 8819 | 60406 | |||||||||
| Ensembl | ENSG00000164105 | ENSMUSG00000031609 | |||||||||
| UniProt | O75446 | O88574 | |||||||||
| RefSeq (мРНК) | NM_003864 | NM_021788 | |||||||||
| RefSeq (белок) | NP_003855 | NP_068560 | |||||||||
| Локус (UCSC) | Chr 4: 174.29 – 174.3 Mb |
Chr 8: 57.48 – 57.49 Mb |
|||||||||
| Поиск в PubMed | Искать | Искать | |||||||||
Белок, ассоциированный с Sin3A, 30 кДа, известный также как SAP30, — белок, кодируемый у человека геном SAP30[1].
Функция
[править | править код]Ацетилирование гистонов играет ключевую роль в регуляции экспрессии эукариотических генов. Ацетилирование и деацетилирование гистонов катализируют мультисубъединичные комплексы. Белок, кодируемый этим геном — составляющая комплекса гистондеацетилазы, который включает в себя SIN3A, SAP18, HDAC1, HDAC2, RbAp46, RbAp48 и другие полипептиды. Этот комплекс принимает активное участие в деацетилировании основных гистонов октамеров, но бездействует при деацетилировании нуклеосомных гистонов. Псевдоген этого гена находится на хромосоме 3[1].
Млекопитающие имеют один паралог SAP30, названный SAP30-подобным (SAP30L), доступные последовательности которого на 70 % идентичны с SAP30[2]. SAP30 и SAP30L вместе составляют хорошо сохранившееся семейство белков SAP30. SAP30L также взаимодействует с несколькими компонентами корепрессора комплекса Sin3A и вызывает репрессию транскрипции с помощью рекрутирования Sin3A и гистондеацетилаз[3].
Белки семейства SAP30 имеют функциональную ядерную локализацию сигнала и они могут передавать сигнал Sin3A к ядру[3]. Белки SAP30 имеют независимый контакт последовательностей с ДНК, их N-терминальнвй цинкозависимой модуль и их кислый центральный регион вносит свой вклад в взаимодействия гистонов и нуклеосом. ДНК-связывание белков SAP30 регулируется ядерной сигнализацией липидов, фосфоинозитидов (PI)[4]. Белки SAP30 предоставляют первый пример, в котором ДНК и PI, кажется, стоят во взаимно антагонистических взаимоотношениях в части их взаимодействия с белками цинкового пальца и, таким образом, иллюстрируют молекулярный механизм, как эти липиды могут способствовать регуляции генов[4][5].
Взаимодействия
[править | править код]SAP30, как было выявлено, взаимодействует с HDAC1[6][7][8][9][10][11], гистондеацетилазой 2[7][8][11], SIN3A[7][8][10][11][12][13], RBBP7[7][8][11], корепрессором ядерных рецепторов 1[13][14], RBBP4[7][8][11], ING1[11] и YY1[6].
Примечания
[править | править код]- ↑ 1 2 Entrez Gene: SAP30 Sin3A-associated protein, 30kDa.
- ↑ Lindfors K., Viiri K.M., Niittynen M., Heinonen T.Y., Mäki M., Kainulainen H. TGF-beta induces the expression of SAP30L, a novel nuclear protein (англ.) // BMC Genomics[англ.] : journal. — 2003. — December (vol. 4). — P. 53. — doi:10.1186/1471-2164-4-53. — PMID 14680513. — PMC 319701.
- ↑ 1 2 Viiri K.M., Korkeamäki H., Kukkonen M.K., Nieminen L.K., Lindfors K., Peterson P., Mäki M., Kainulainen H., Lohi O. SAP30L interacts with members of the Sin3A corepressor complex and targets Sin3A to the nucleolus (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — 2006. — Vol. 34, no. 11. — P. 3288—3298. — doi:10.1093/nar/gkl401. — PMID 16820529. — PMC 1500868.
- ↑ 1 2 Viiri K.M., Jänis J., Siggers T., Heinonen T.Y., Valjakka J., Bulyk M.L., Mäki M., Lohi O. DNA-binding and -bending activities of SAP30L and SAP30 are mediated by a zinc-dependent module and monophosphoinositides (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2009. — January (vol. 29, no. 2). — P. 342—356. — doi:10.1128/MCB.01213-08. — PMID 19015240. — PMC 2612513.
- ↑ TamPub. Дата обращения: 20 апреля 2015. Архивировано из оригинала 25 мая 2011 года.
- ↑ 1 2 Huang, Nu En; Lin Ching Hui; Lin Young Sun; Yu Winston C Y. Modulation of YY1 activity by SAP30 (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications[англ.] : journal. — United States, 2003. — June (vol. 306, no. 1). — P. 267—275. — ISSN 0006-291X. — doi:10.1016/S0006-291X(03)00966-5. — PMID 12788099.
- ↑ 1 2 3 4 5 Zhang, Y; Sun Z W; Iratni R; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Hampsey M; Reinberg D. SAP30, a novel protein conserved between human and yeast, is a component of a histone deacetylase complex (англ.) // Molecular Cell[англ.] : journal. — UNITED STATES, 1998. — June (vol. 1, no. 7). — P. 1021—1031. — ISSN 1097-2765. — doi:10.1016/S1097-2765(00)80102-1. — PMID 9651585.
- ↑ 1 2 3 4 5 Zhang, Y; Ng H H; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Bird A; Reinberg D. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation (англ.) // Genes & Development : journal. — UNITED STATES, 1999. — August (vol. 13, no. 15). — P. 1924—1935. — ISSN 0890-9369. — doi:10.1101/gad.13.15.1924. — PMID 10444591. — PMC 316920.
- ↑ Swanson, Kurt A; Knoepfler Paul S; Huang Kai; Kang Richard S; Cowley Shaun M; Laherty Carol D; Eisenman Robert N; Radhakrishnan Ishwar. HBP1 and Mad1 repressors bind the Sin3 corepressor PAH2 domain with opposite helical orientations (англ.) // Nature Structural & Molecular Biology : journal. — United States, 2004. — August (vol. 11, no. 8). — P. 738—746. — ISSN 1545-9993. — doi:10.1038/nsmb798. — PMID 15235594.
- ↑ 1 2 Yochum, G S; Ayer D E. Pf1, a novel PHD zinc finger protein that links the TLE corepressor to the mSin3A-histone deacetylase complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — United States, 2001. — July (vol. 21, no. 13). — P. 4110—4118. — ISSN 0270-7306. — doi:10.1128/MCB.21.13.4110-4118.2001. — PMID 11390640. — PMC 87072.
- ↑ 1 2 3 4 5 6 Kuzmichev, A; Zhang Y; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Reinberg D. Role of the Sin3-histone deacetylase complex in growth regulation by the candidate tumor suppressor p33(ING1) (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — United States, 2002. — February (vol. 22, no. 3). — P. 835—848. — ISSN 0270-7306. — doi:10.1128/MCB.22.3.835-848.2002. — PMID 11784859. — PMC 133546.
- ↑ Fleischer, Tracey C; Yun Ui Jeong; Ayer Donald E. Identification and characterization of three new components of the mSin3A corepressor complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — United States, 2003. — May (vol. 23, no. 10). — P. 3456—3467. — ISSN 0270-7306. — doi:10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003. — PMID 12724404. — PMC 164750.
- ↑ 1 2 Laherty, C D; Billin A N., Lavinsky R M., Yochum G S., Bush A C., Sun J M., Mullen T M., Davie J R., Rose D W., Glass C K., Rosenfeld M G., Ayer D E., Eisenman R N. SAP30, a component of the mSin3 corepressor complex involved in N-CoR-mediated repression by specific transcription factors (англ.) // Molecular Cell[англ.] : journal. — UNITED STATES, 1998. — July (vol. 2, no. 1). — P. 33—42. — ISSN 1097-2765. — doi:10.1016/S1097-2765(00)80111-2. — PMID 9702189.
- ↑ Underhill, C; Qutob M S; Yee S P; Torchia J. A novel nuclear receptor corepressor complex, N-CoR, contains components of the mammalian SWI/SNF complex and the corepressor KAP-1 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — UNITED STATES, 2000. — December (vol. 275, no. 51). — P. 40463—40470. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M007864200. — PMID 11013263.
Литература
[править | править код]- Ayer D.E., Lawrence Q.A., Eisenman R.N. Mad-Max transcriptional repression is mediated by ternary complex formation with mammalian homologs of yeast repressor Sin3. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1995. — Vol. 80, no. 5. — P. 767—776. — doi:10.1016/0092-8674(95)90355-0. — PMID 7889570.
- Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., et al. Histone deacetylases and SAP18, a novel polypeptide, are components of a human Sin3 complex. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — Vol. 89, no. 3. — P. 357—364. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80216-0. — PMID 9150135.
- Zhang Y., Sun Z.W., Iratni R., et al. SAP30, a novel protein conserved between human and yeast, is a component of a histone deacetylase complex. (англ.) // Molecular Cell[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 1, no. 7. — P. 1021—1031. — doi:10.1016/S1097-2765(00)80102-1. — PMID 9651585.
- Laherty C.D., Billin A.N., Lavinsky R.M., et al. SAP30, a component of the mSin3 corepressor complex involved in N-CoR-mediated repression by specific transcription factors. (англ.) // Molecular Cell[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 2, no. 1. — P. 33—42. — doi:10.1016/S1097-2765(00)80111-2. — PMID 9702189.
- Zhang Y., LeRoy G., Seelig H.P., et al. The dermatomyositis-specific autoantigen Mi2 is a component of a complex containing histone deacetylase and nucleosome remodeling activities. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1998. — Vol. 95, no. 2. — P. 279—289. — doi:10.1016/S0092-8674(00)81758-4. — PMID 9790534.
- Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., et al. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex. (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 395, no. 6705. — P. 917—921. — doi:10.1038/27699. — PMID 9804427.
- Hsieh J.J., Zhou S., Chen L., et al. CIR, a corepressor linking the DNA binding factor CBF1 to the histone deacetylase complex. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96, no. 1. — P. 23—8. — doi:10.1073/pnas.96.1.23. — PMID 9874765. — PMC 15086.
- Boutell J.M., Thomas P., Neal J.W., et al. Aberrant interactions of transcriptional repressor proteins with the Huntington's disease gene product, huntingtin. (англ.) // Human Molecular Genetics[англ.] : journal. — Oxford University Press, 2000. — Vol. 8, no. 9. — P. 1647—1655. — doi:10.1093/hmg/8.9.1647. — PMID 10441327.
- Zhang Y., Ng H.H., Erdjument-Bromage H., et al. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation. (англ.) // Genes & Development : journal. — 1999. — Vol. 13, no. 15. — P. 1924—1935. — doi:10.1101/gad.13.15.1924. — PMID 10444591. — PMC 316920.
- Krithivas A., Young D.B., Liao G., et al. Human herpesvirus 8 LANA interacts with proteins of the mSin3 corepressor complex and negatively regulates Epstein-Barr virus gene expression in dually infected PEL cells. (англ.) // Journal of Virology[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 74, no. 20. — P. 9637—9645. — doi:10.1128/JVI.74.20.9637-9645.2000. — PMID 11000236. — PMC 112396.
- Underhill C., Qutob M.S., Yee S.P., Torchia J. A novel nuclear receptor corepressor complex, N-CoR, contains components of the mammalian SWI/SNF complex and the corepressor KAP-1. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — Vol. 275, no. 51. — P. 40463—40470. — doi:10.1074/jbc.M007864200. — PMID 11013263.
- Humphrey G.W., Wang Y., Russanova V.R., et al. Stable histone deacetylase complexes distinguished by the presence of SANT domain proteins CoREST/kiaa0071 and Mta-L1. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 9. — P. 6817—6824. — doi:10.1074/jbc.M007372200. — PMID 11102443.
- Skowyra D., Zeremski M., Neznanov N., et al. Differential association of products of alternative transcripts of the candidate tumor suppressor ING1 with the mSin3/HDAC1 transcriptional corepressor complex. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 12. — P. 8734—8739. — doi:10.1074/jbc.M007664200. — PMID 11118440.
- Yochum G.S., Ayer D.E. Pf1, a novel PHD zinc finger protein that links the TLE corepressor to the mSin3A-histone deacetylase complex. (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2001. — Vol. 21, no. 13. — P. 4110—4118. — doi:10.1128/MCB.21.13.4110-4118.2001. — PMID 11390640. — PMC 87072.
- Kuzmichev A., Zhang Y., Erdjument-Bromage H., et al. Role of the Sin3-histone deacetylase complex in growth regulation by the candidate tumor suppressor p33(ING1). (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 3. — P. 835—848. — doi:10.1128/MCB.22.3.835-848.2002. — PMID 11784859. — PMC 133546.
- Saito M., Ishikawa F. The mCpG-binding domain of human MBD3 does not bind to mCpG but interacts with NuRD/Mi2 components HDAC1 and MTA2. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 38. — P. 35434—35439. — doi:10.1074/jbc.M203455200. — PMID 12124384.
- Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
- Wysocka J., Myers M.P., Laherty C.D., et al. Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1. (англ.) // Genes & Development : journal. — 2003. — Vol. 17, no. 7. — P. 896—911. — doi:10.1101/gad.252103. — PMID 12670868. — PMC 196026.
- Huang N.E., Lin C.H., Lin Y.S., Yu W.C. Modulation of YY1 activity by SAP30. (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 306, no. 1. — P. 267—275. — doi:10.1016/S0006-291X(03)00966-5. — PMID 12788099.
- Sironi E., Cerri A., Tomasini D., et al. Loss of heterozygosity on chromosome 4q32-35 in sporadic basal cell carcinomas: evidence for the involvement of p33ING2/ING1L and SAP30 genes. (англ.) // J. Cutan. Pathol. : journal. — 2004. — Vol. 31, no. 4. — P. 318—322. — doi:10.1111/j.0303-6987.2004.0187.x. — PMID 15005689.