SPI1

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Протоонкоген Spi1
PDB в комплексе с 1pue.PDB в комплексе с 1pue.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

1pue

Идентификаторы
Символ SPI1 ; OF; PU.1; SFPI1; SPI-1; SPI-A
Внешние ID OMIM: 165170 MGI: 98282 HomoloGene: 2346 GeneCards: Ген SPI1
Генная онтология
Функция • RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific DNA binding

• sequence-specific DNA binding RNA polymerase II transcription factor activity
• core promoter binding
• RNA polymerase II transcription factor binding
• RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific DNA binding transcription factor activity involved in positive regulation of transcription
• sequence-specific DNA binding transcription factor activity
• RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific DNA binding transcription factor activity
• RNA binding
• protein binding

• NFAT protein binding
Компонент клетки • nuclear chromatin
Биологический процесс • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

• lymphoid progenitor cell differentiation
• regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
• transcription from RNA polymerase II promoter
• lymphocyte differentiation
• erythrocyte differentiation
• macrophage differentiation
• granulocyte differentiation
• somatic stem cell maintenance
• myeloid dendritic cell differentiation
• histone H3 acetylation
• hypermethylation of CpG island
• negative regulation of MHC class II biosynthetic process
• regulation of erythrocyte differentiation
• negative regulation of gene expression, epigenetic
• negative regulation of transcription, DNA-templated
• positive regulation of transcription, DNA-templated
• positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
• anatomical structure regression
• negative regulation of histone H4 acetylation

• apoptotic process involved in patterning of blood vessels
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 6688 20375
Ensembl ENSG00000066336 ENSMUSG00000002111
UniProt P17947 P17433
RefSeq (мРНК) NM_001080547 NM_011355
RefSeq (белок) NP_001074016 NP_035485
Локус (UCSC) Chr 11:
47.38 – 47.4 Mb		 Chr 2:
91.08 – 91.12 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Фактор транскрипции PU.1  — белок, который у человека кодируется геном SPI1[1].

Функция[править | править код]

Этот ген кодирует транскрипционный фактор ETS-домена, который активирует экспрессию генов во время развития миелоидных и B-лимфоидных клеток. Локализованный в ядре белок связывается с богатыми пуринами последовательностями, известными как PU-боксы, находится вблизи промоторов целевых генов и регулирует их экспрессию совместно с другими факторами транскрипции и кофакторами. Белок может также регулировать альтернативный сплайсинг целевых генов. Существуют несколько вариантов транскриптов, кодирующих различные изоформы этого гена[2].

Предполагается, что многократный рост синтеза Pu.1 в некоторых клетках подкожного жира при старении способствует ингибированию адипогенеза и истончению подкожной жировой ткани у пожилых.[3]

DB2313[править | править код]

DB2313 представляет собой малую молекулу, гетероциклический диамидин, который может ингибировать связывание PU.1 с его генами-мишенями, тем самым ингибируя функцию его факторов транскрипции.[4]

Взаимодействия[править | править код]

SPI1, как было выявлено, взаимодействуют с:

Примечания[править | править код]

  1. ↑ Ray D., Culine S., Tavitain A., Moreau-Gachelin F. The human homologue of the putative proto-oncogene Spi-1: characterization and expression in tumors (англ.) // Oncogene  (англ.) (рус. : journal. — 1990. — July (vol. 5, no. 5). — P. 663—668. — PMID 1693183.
  2. ↑ Entrez Gene: SPI1 spleen focus forming virus (SFFV) proviral integration oncogene spi1.
  3. ↑ Hai P. Nguyen, Frances Lin, Danielle Yi, Ying Xie, Jennie Dinh, Pengya Xue, Hei Sook Sul, (2021). Aging-dependent regulatory cells emerge in subcutaneous fat to inhibit adipogenesis. Developmental Cell doi:10.1016/j.devcel.2021.03.026
  4. ↑ Antony-Debré, I., Paul, A., Leite, J., Mitchell, K., Kim, H. M., Carvajal, L. A., ... & Steidl, U. (2017). Pharmacological inhibition of the transcription factor PU. 1 in leukemia. The Journal of clinical investigation, 127(12), 4297-4313. PMID 29083320 PMC 5707147 doi:10.1172/JCI92504
  5. ↑ Hallier M., Lerga A., Barnache S., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. The transcription factor Spi-1/PU.1 interacts with the potential splicing factor TLS (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1998. — February (vol. 273, no. 9). — P. 4838—4842. — PMID 9478924.
  6. ↑ Zhang P., Behre G., Pan J., Iwama A., Wara-Aswapati N., Radomska H.S., Auron P.E., Tenen D.G., Sun Z. Negative cross-talk between hematopoietic regulators: GATA proteins repress PU.1 (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — July (vol. 96, no. 15). — P. 8705—8710. — PMID 10411939. — PMC 17580.
  7. ↑ Brass A.L., Zhu A.Q., Singh H. Assembly requirements of PU.1-Pip (IRF-4) activator complexes: inhibiting function in vivo using fused dimers (англ.) // The EMBO Journal  (англ.) (рус. : journal. — 1999. — February (vol. 18, no. 4). — P. 977—991. — doi:10.1093/emboj/18.4.977. — PMID 10022840. — PMC 1171190.
  8. ↑ Escalante C.R., Shen L., Escalante M.C., Brass A.L., Edwards T.A., Singh H., Aggarwal A.K. Crystallization and characterization of PU.1/IRF-4/DNA ternary complex (англ.) // Journal of Structural Biology  (англ.) (рус. : journal. — 2002. — July (vol. 139, no. 1). — P. 55—9. — PMID 12372320.
  9. ↑ Hallier M., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. The transcription factor Spi-1/PU.1 binds RNA and interferes with the RNA-binding protein p54nrb (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1996. — May (vol. 271, no. 19). — P. 11177—11181. — PMID 8626664.

Литература[править | править код]

  • Klemsz M.J., McKercher S.R., Celada A., Van Beveren C., Maki R.A. The macrophage and B cell-specific transcription factor PU.1 is related to the ets oncogene. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1990. — Vol. 61, no. 1. — P. 113—124. — doi:10.1016/0092-8674(90)90219-5. — PMID 2180582.
  • Nguyen V.C., Ray D., Gross M.S., de Tand M.F., Frézal J., Moreau-Gachelin F. Localization of the human oncogene SPI1 on chromosome 11, region p11.22. (англ.) // Human Genetics : journal. — 1990. — Vol. 84, no. 6. — P. 542—546. — doi:10.1007/bf00210807. — PMID 2338340.
  • Chen H., Ray-Gallet D., Zhang P., Hetherington C.J., Gonzalez D.A., Zhang D.E., Moreau-Gachelin F., Tenen D.G. PU.1 (Spi-1) autoregulates its expression in myeloid cells. (англ.) // Oncogene  (англ.) (рус.. — 1995. — Vol. 11, no. 8. — P. 1549—1560. — PMID 7478579.
  • Nagulapalli S., Pongubala J.M., Atchison M.L. Multiple proteins physically interact with PU.1. Transcriptional synergy with NF-IL6 beta (C/EBP delta, CRP3). (англ.) // Journal of Immunology  (англ.) (рус. : journal. — 1995. — Vol. 155, no. 9. — P. 4330—4338. — PMID 7594592.
  • Pongubala J.M., Atchison M.L. Activating transcription factor 1 and cyclic AMP response element modulator can modulate the activity of the immunoglobulin kappa 3' enhancer. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1995. — Vol. 270, no. 17. — P. 10304—10313. — doi:10.1074/jbc.270.17.10304. — PMID 7730336.
  • Hromas R., Orazi A., Neiman R.S., Maki R., Van Beveran C., Moore J., Klemsz M. Hematopoietic lineage- and stage-restricted expression of the ETS oncogene family member PU.1. (англ.) // Blood  (англ.) (рус. : journal. — American Society of Hematology  (англ.) (рус., 1993. — Vol. 82, no. 10. — P. 2998—3004. — PMID 8219191.
  • Hagemeier C., Bannister A.J., Cook A., Kouzarides T. The activation domain of transcription factor PU.1 binds the retinoblastoma (RB) protein and the transcription factor TFIID in vitro: RB shows sequence similarity to TFIID and TFIIB. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1993. — Vol. 90, no. 4. — P. 1580—1584. — doi:10.1073/pnas.90.4.1580. — PMID 8434021. — PMC 45918.
  • Hallier M., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. The transcription factor Spi-1/PU.1 binds RNA and interferes with the RNA-binding protein p54nrb. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1996. — Vol. 271, no. 19. — P. 11177—11181. — doi:10.1074/jbc.271.19.11177. — PMID 8626664.
  • Bassuk A.G., Anandappa R.T., Leiden J.M. Physical interactions between Ets and NF-kappaB/NFAT proteins play an important role in their cooperative activation of the human immunodeficiency virus enhancer in T cells. (англ.) // Journal of Virology  (англ.) (рус. : journal. — 1997. — Vol. 71, no. 5. — P. 3563—3573. — PMID 9094628. — PMC 191503.
  • Li S.L., Valente A.J., Zhao S.J., Clark R.A. PU.1 is essential for p47(phox) promoter activity in myeloid cells. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — Vol. 272, no. 28. — P. 17802—17809. — doi:10.1074/jbc.272.28.17802. — PMID 9211934.
  • Tsukada J., Misago M., Serino Y., Ogawa R., Murakami S., Nakanishi M., Tonai S., Kominato Y., Morimoto I., Auron P.E., Eto S. Human T-cell leukemia virus type I Tax transactivates the promoter of human prointerleukin-1beta gene through association with two transcription factors, nuclear factor-interleukin-6 and Spi-1. (англ.) // Blood  (англ.) (рус. : journal. — American Society of Hematology  (англ.) (рус., 1997. — Vol. 90, no. 8. — P. 3142—3153. — PMID 9376596.
  • Hallier M., Lerga A., Barnache S., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. The transcription factor Spi-1/PU.1 interacts with the potential splicing factor TLS. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1998. — Vol. 273, no. 9. — P. 4838—4842. — doi:10.1074/jbc.273.9.4838. — PMID 9478924.
  • Suzuki S., Kumatori A., Haagen I.A., Fujii Y., Sadat M.A., Jun H.L., Tsuji Y., Roos D., Nakamura M. PU.1 as an essential activator for the expression of gp91(phox) gene in human peripheral neutrophils, monocytes, and B lymphocytes. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1998. — Vol. 95, no. 11. — P. 6085—6090. — doi:10.1073/pnas.95.11.6085. — PMID 9600921. — PMC 27589.
  • Carrère S., Verger A., Flourens A., Stehelin D., Duterque-Coquillaud M. Erg proteins, transcription factors of the Ets family, form homo, heterodimers and ternary complexes via two distinct domains. (англ.) // Oncogene  (англ.) (рус. : journal. — 1998. — Vol. 16, no. 25. — P. 3261—3268. — doi:10.1038/sj.onc.1201868. — PMID 9681824.
  • Sato M., Morii E., Takebayashi-Suzuki K., Yasui N., Ochi T., Kitamura Y., Nomura S. Microphthalmia-associated transcription factor interacts with PU.1 and c-Fos: determination of their subcellular localization. (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications  (англ.) (рус. : journal. — 1999. — Vol. 254, no. 2. — P. 384—387. — doi:10.1006/bbrc.1998.9918. — PMID 9918847.
  • Brass A.L., Zhu A.Q., Singh H. Assembly requirements of PU.1-Pip (IRF-4) activator complexes: inhibiting function in vivo using fused dimers. (англ.) // The EMBO Journal  (англ.) (рус. : journal. — 1999. — Vol. 18, no. 4. — P. 977—991. — doi:10.1093/emboj/18.4.977. — PMID 10022840. — PMC 1171190.
  • Yamamoto H., Kihara-Negishi F., Yamada T., Hashimoto Y., Oikawa T. Physical and functional interactions between the transcription factor PU.1 and the coactivator CBP. (англ.) // Oncogene  (англ.) (рус. : journal. — 1999. — Vol. 18, no. 7. — P. 1495—1501. — doi:10.1038/sj.onc.1202427. — PMID 10050886.
  • Rao S., Matsumura A., Yoon J., Simon M.C. SPI-B activates transcription via a unique proline, serine, and threonine domain and exhibits DNA binding affinity differences from PU.1. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1999. — Vol. 274, no. 16. — P. 11115—11124. — doi:10.1074/jbc.274.16.11115. — PMID 10196196.
  • Mao S., Frank R.C., Zhang J., Miyazaki Y., Nimer S.D. Functional and physical interactions between AML1 proteins and an ETS protein, MEF: implications for the pathogenesis of t(8;21)-positive leukemias. (англ.) // Molecular and Cellular Biology  (англ.) (рус. : journal. — 1999. — Vol. 19, no. 5. — P. 3635—3644. — PMID 10207087. — PMC 84165.
  • Tu X., Kim R. Y., Brown A. C., ... & Donovan C. Airway and parenchymal transcriptomics in a novel model of asthma and COPD overlap. (англ.) // Journal of Allergy and Clinical Immunology  (англ.) (рус. : journal. — 2022. — Vol. 150, no. 4. — P. 817-829. — doi:10.1016/j.jaci.2022.04.032. — PMID 35643377. Фармакологическое ингибирование SPI1 с использованием DB2313 уменьшало ремоделирование дыхательных путей и гиперреактивность дыхательных путей у мышей с моделью астмы осложненной ХОБЛ.



Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=SPI1&oldid=129865954