Проект «Микробиом человека»: различия между версиями

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
[непроверенная версия][непроверенная версия]
Содержимое удалено Содержимое добавлено
м подстановка даты в шаблон:Нет ссылок
references added and more original text translated into Russian
Строка 2: Строка 2:
{{оформить}}
{{оформить}}
{{нет источников|дата=2019-11-12}}
{{нет источников|дата=2019-11-12}}
[[Файл:Human Microbiome Project logo.jpg|альт=Официальный логотип ПМЧ|мини|Официальный логотип ПМЧ]]
'''Проект «Микробиом Человека» (ПМЧ)''' – [[:en:Human_Microbiome_Project|The '''Human Microbiome Project''' ('''HMP''')]] – это исследовательская инициатива [[:en:National_Institutes_of_Health|Национальных институтов здравоохранения США]], проявленная с целью лучшего понимания [[Микрофлора человека|микрофлоры человека]] и её значения для человеческого здоровья и проблем, с ним связанных. Первая фаза запущенного в 2007 году<ref>{{Cite web|url=https://www.sciencedaily.com/releases/2010/05/100520141214.htm|title=Human microbiome project: Diversity of human microbes greater than previously predicted|publisher=ScienceDaily|lang=en|accessdate=2019-11-13}}</ref> проекта была сосредоточена на определении и характеристиках микрофлоры человека. Вторая фаза, известная как Интегративный Проект «Микробиом Человека» (иПМЧ), началась в 2014 году с целью развития ресурсной базы для характеристики микробиома и прояснения роли микробов в состояниях здоровья и болезни человека. Эта программа получила финансовую поддержку в размере 170 миллионов долларов США от общего фонда  [[:en:National_Institutes_of_Health|Национальных институтов здравоохранения США]] с 2007 по 2016 гг.<ref>{{Cite web|url=https://commonfund.nih.gov/hmp|title=Human Microbiome Project - Home {{!}} NIH Common Fund|publisher=commonfund.nih.gov|accessdate=2019-11-13}}</ref>


Важными компонентами '''ПМЧ''' стали культурно-свободные методы характеристики микробиального сообщества, такие как [[метагеномика]] (которая открывает широкую генетическую перспективу в пределах отдельно взятого микробиального сообщества), а также обширное определение последовательности полного генома (что даёт «глубокий» взгляд на некоторые аспекты определённого микробиального сообщества, то есть индивидуальных видов бактерий). Последний компонент исследования послужил делу адресного секвенирования геномов – в настоящее время запланировано определение около 3000 последовательностей индивидуальных бактериальных изолятов – во время последующего метагеномного анализа. Проект также финансировал «глубокое» секвенирование бактериальной [[16S рРНК]] на фоне усиления [[Полимеразная цепная реакция|полимеразной цепной реакции]] у наблюдаемый людей.<ref>{{Cite web|url=http://commonfund.nih.gov/hmp/|title=Human Microbiome Project - Home {{!}} NIH Common Fund|publisher=commonfund.nih.gov|accessdate=2019-11-13}}</ref>
'''Проект «Микробиом Человека» (ПМЧ)''' – [[:en:Human_Microbiome_Project|The '''Human Microbiome Project''' ('''HMP''')]] – это исследовательская инициатива [[:en:National_Institutes_of_Health|Национальных институтов здравоохранения США]], проявленная с целью лучшего понимания [[Микрофлора человека|микрофлоры человека]] и её значения для человеческого здоровья и проблем, с ним связанных. Первая фаза запущенного в 2007 году проекта была сосредоточена на определении и характеристиках микрофлоры человека. Вторая фаза, известная как Интегративный Проект «Микробиом Человека» (иПМЧ), началась в 2014 году с целью развития ресурсной базы для характеристики микробиома и прояснения роли микробов в состояниях здоровья и болезни человека. Эта программа получила финансовую поддержку в размере 170 миллионов долларов США от общего фонда  [[:en:National_Institutes_of_Health|Национальных институтов здравоохранения США]] с 2007 по 2016 гг.

Важными компонентами '''ПМЧ''' стали культурно-свободные методы характеристики микробиального сообщества, такие как [[метагеномика]] (которая открывает широкую генетическую перспективу в пределах отдельно взятого микробиального сообщества), а также обширное определение последовательности полного генома (что даёт «глубокий» взгляд на некоторые аспекты определённого микробиального сообщества, то есть индивидуальных видов бактерий). Последний компонент исследования послужил делу адресного секвенирования геномов – в настоящее время запланировано определение около 3000 последовательностей индивидуальных бактериальных изолятов – во время последующего метагеномного анализа. Проект также финансировал «глубокое» секвенирование бактериальной [[16S рРНК]] на фоне усиления [[Полимеразная цепная реакция|полимеразной цепной реакции]] у наблюдаемый людей.


'''Введение'''
'''Введение'''


Ещё до запуска '''ПМЧ''' в популярных СМИ и в научной литературе часто сообщалось, что в теле человека микробиальных клеток примерно в 10 раз, а микробиальных генов в 100 раз больше, чем человеческих клеток. Эти цифры основывались на оценке человеческого микробиома, который содержит около 100 триллионов бактериальных клеток, в то время как типичный взрослый человек имеет примерно 10 триллионов человеческих клеток. В 2014 году Американское Общество Микробиологии опубликовало брошюру, в которой был сделан акцент на том, что число микробиальных клеток и число человеческих клеток – это приблизительные величины. Также отмечалось, что в ходе недавних исследований учёные пришли к выводу, что человеческие клетки насчитывают примерно 37 триллионов, имея в виду соотношение микробиальных к человеческим клеткам 3:1. В 2016 году другая группа опубликовала новую оценку соотношения 1:1 (1.3:1, с неопределённостью 25% и вариативностью 53% среди популяции типичных мужчин весом 70 кг).
Ещё до запуска '''ПМЧ''' в популярных СМИ и в научной литературе часто сообщалось, что в теле человека микробиальных клеток примерно в 10 раз, а микробиальных генов в 100 раз больше, чем человеческих клеток. Эти цифры основывались на оценке человеческого микробиома, который содержит около 100 триллионов бактериальных клеток, в то время как типичный взрослый человек имеет примерно 10 триллионов человеческих клеток.<ref>{{Cite web|url=http://academy.asm.org/index.php/faq-series/5122-humanmicrobiome|title=Оценка микробиома человека|author=|website=|date=|publisher=}}</ref> В 2014 году Американское Общество Микробиологии опубликовало брошюру, в которой был сделан акцент на том, что число микробиальных клеток и число человеческих клеток – это приблизительные величины. Также отмечалось, что в ходе недавних исследований учёные пришли к выводу, что человеческие клетки насчитывают примерно 37 триллионов, имея в виду соотношение микробиальных к человеческим клеткам 3:1.<ref>{{Статья|автор=Judah L. Rosner|год=2014-02-01|doi=10.1128/microbe.9.47.2|issn=1558-7452, 1558-7460|выпуск=2|язык=en|страницы=47–47|издание=Microbe Magazine|заглавие=Ten Times More Microbial Cells than Body Cells in Humans?|ссылка=https://www.asmscience.org/content/journal/microbe/10.1128/microbe.9.47.2|том=9}}</ref> В 2016 году другая группа опубликовала новую оценку соотношения 1:1 (1.3:1, с неопределённостью 25% и вариативностью 53% среди популяции типичных мужчин весом 70 кг).<ref>{{Статья|автор=Alison Abbott|doi=10.1038/nature.2016.19136|язык=en|издание=Nature News|заглавие=Scientists bust myth that our bodies have more bacteria than human cells|ссылка=http://www.nature.com/news/scientists-bust-myth-that-our-bodies-have-more-bacteria-than-human-cells-1.19136}}</ref><ref>{{Статья|автор=Ron Sender, Shai Fuchs, Ron Milo|год=2016-01-28|doi=10.1016/j.cell.2016.01.013|issn=0092-8674, 1097-4172|выпуск=3|язык=English|страницы=337–340|издание=Cell|заглавие=Are We Really Vastly Outnumbered? Revisiting the Ratio of Bacterial to Host Cells in Humans|ссылка=https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(16)00053-2|том=164}}</ref>


Несмотря на разные оценки огромного числа микробов внутри и снаружи тела человека, мало было известно об их ролях в состоянии здоровья (и нездоровья) человека. Многие из организмов, которые составляют микробиом, не были успешно выделены, определены или как-то охарактеризованы. Организмы, которые, как считается, могут быть найдены в человеческом микробиоме, однако, попадают под определение [[бактерии]], членов [[Домен (биология)|домена]] [[Археи]], [[дрожжи]] и [[простейшие]], также как различные [[гельминты]] и [[вирусы]], включая вирусы, поражающие клетки человеческого микробиома ([[бактериофаги]]). '''ПМЧ''' выступил как открыватель и описатель микробиома человека, уделяя особое внимание оральному, кожному, вагинальному, желудочно-кишечному и дыхательному участкам тела.
Несмотря на разные оценки огромного числа микробов внутри и снаружи тела человека, мало было известно об их ролях в состоянии здоровья (и нездоровья) человека. Многие из организмов, которые составляют микробиом, не были успешно выделены, определены или как-то охарактеризованы. Организмы, которые, как считается, могут быть найдены в человеческом микробиоме, однако, попадают под определение [[бактерии]], членов [[Домен (биология)|домена]] [[Археи]], [[дрожжи]] и [[простейшие]], также как различные [[гельминты]] и [[вирусы]], включая вирусы, поражающие клетки человеческого микробиома ([[бактериофаги]]). '''ПМЧ''' выступил как открыватель и описатель микробиома человека, уделяя особое внимание оральному, кожному, вагинальному, желудочно-кишечному и дыхательному участкам тела.


'''ПМЧ''' призван ответить на некоторые из самых вдохновляющих, раздражающих и просто основных научных вопросов сегодняшнего дня. Главное то, что у проекта есть потенциал для устранения искусственных барьеров между микробиологией в медицине и в окружающей среде. Возможно, '''ПМЧ''' не только обозначит новые пути определения здоровья и предрасположенности к болезням, но также уточнит параметры, необходимые для создания, применения и оценки стратегий сознательного управления человеческой микрофлорой, чтобы достичь качественно нового уровня в контексте оптимального физиологического здоровья.
'''ПМЧ''' призван ответить на некоторые из самых вдохновляющих, раздражающих и просто основных научных вопросов сегодняшнего дня. Главное то, что у проекта есть потенциал для устранения искусственных барьеров между микробиологией в медицине и в окружающей среде. Возможно, '''ПМЧ''' не только обозначит новые пути определения здоровья и предрасположенности к болезням, но также уточнит параметры, необходимые для создания, применения и оценки стратегий сознательного управления человеческой микрофлорой, чтобы достичь качественно нового уровня в контексте оптимального физиологического здоровья.<ref>{{Статья|автор=Peter J. Turnbaugh, Ruth E. Ley, Micah Hamady, Claire Fraser-Liggett, Rob Knight|год=2007-10-18|doi=10.1038/nature06244|issn=0028-0836|выпуск=7164|страницы=804–810|издание=Nature|заглавие=The human microbiome project: exploring the microbial part of ourselves in a changing world|ссылка=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3709439/|том=449}}</ref>


'''ПМЧ''' был описан как "логическое, концептуальное и экспериментальное продолжение [[Проект «Геном человека»|Проекта «Геном человека»]]". В 2007 году '''ПМЧ''' был включён в Дорожную Карту Медицинских Исследований [[:en:National_Institutes_of_Health|Национальных институтов здравоохранения США]] как один из ''Новых Путей к Открытию''. Организованное описание микробиома человека осуществляется на международном уровне при содействии '''International Human Microbiome Consortium'''.
'''ПМЧ''' был описан как "логическое, концептуальное и экспериментальное продолжение [[Проект «Геном человека»|Проекта «Геном человека»]]".<ref>{{Статья|автор=Peter J. Turnbaugh, Ruth E. Ley, Micah Hamady, Claire M. Fraser-Liggett, Rob Knight|год=2007-10|doi=10.1038/nature06244|issn=1476-4687|выпуск=7164|язык=en|страницы=804–810|издание=Nature|заглавие=The Human Microbiome Project|ссылка=https://www.nature.com/articles/nature06244|том=449}}</ref> В 2007 году '''ПМЧ''' был включён в Дорожную Карту Медицинских Исследований<ref>{{Cite web|url=https://web.archive.org/web/20130217072814/https://commonfund.nih.gov/aboutroadmap.aspx|title=NIH Common Fund - About the NIH Roadmap|publisher=web.archive.org|accessdate=2019-11-13}}</ref> [[:en:National_Institutes_of_Health|Национальных институтов здравоохранения США]] как один из ''Новых Путей к Открытию''. Организованное описание микробиома человека осуществляется на международном уровне при содействии '''International Human Microbiome Consortium'''.


== Первая Фаза (2007-2014) ==
== Первая Фаза (2007-2014) ==
Объединив усилия многих институтов, '''ПМЧ''' ставил перед собой следующие задачи:
Объединив усилия многих институтов,<ref>{{Cite web|url=https://commonfund.nih.gov/hmp/fundedresearch|title=Human Microbiome Project - Funded Research|publisher=commonfund.nih.gov|accessdate=2019-11-13}}</ref> '''ПМЧ''' ставил перед собой следующие задачи<ref>{{Cite web|url=http://commonfund.nih.gov/hmp/initiatives|title=Human Microbiome Project - Program Initiatives|publisher=commonfund.nih.gov|accessdate=2019-11-13}}</ref>:


·        Разработать множество элементарных исходов секвенирования микробиального генома и сделать предварительное описание микробиома человека
·        Разработать множество элементарных исходов секвенирования микробиального генома и сделать предварительное описание микробиома человека
Строка 33: Строка 33:
В 2014 году [[:en:National_Institutes_of_Health|Национальные институты здравоохранения США]] перешли к следующей фазе '''ПМЧ''', которая больше известна как Интегративный Проект «Микробиом Человека» (иПМЧ).
В 2014 году [[:en:National_Institutes_of_Health|Национальные институты здравоохранения США]] перешли к следующей фазе '''ПМЧ''', которая больше известна как Интегративный Проект «Микробиом Человека» (иПМЧ).


Проект объединил три подпроекта, которые реализовывались в разных институтах. Миссия проекта была заявлена так:
Проект объединил три подпроекта, которые реализовывались в разных институтах. Методы изучения включали профиль генной экспрессии [[16S рРНК]], цельную [[метагеномика|метагеномику]] [[Метод дробовика|методом дробовика]], определение последовательности полного генома, метатранскриптомику (экспрессию микробиальных генов в естественной среде обитания), метаболомику, липидомику, а также иммунопротеомику. Ключевые открытия иПМЧ были опубликованы в 2019 году. Наряду с созданием отсылочной базы данных по микробиому человека '''ПМЧ''' также открыл несколько «сюрпризов», которые нашли выражение в следующих тезисах:

иПМЧ создаст интегрированные продольные наборы данных биологических свойств как самого микробиома, так и "хозяина" на основе трёх различных когортных исследований микробиомозависимых состояний с использованием множественных "-омик" (технологий). The project mission, as stated by the NIH, was as follows:

The iHMP will create integrated longitudinal datasets of biological properties from both the microbiome and host from three different cohort studies of microbiome-associated conditions using multiple "omics" technologies.Методы изучения включали профиль генной экспрессии [[16S рРНК]], цельную [[метагеномика|метагеномику]] [[Метод дробовика|методом дробовика]], определение последовательности полного генома, метатранскриптомику (экспрессию микробиальных генов в естественной среде обитания), метаболомику, липидомику, а также иммунопротеомику<ref>{{Cite web|url=https://hmpdacc.org/ihmp/overview/|title=NIH Human Microbiome Project - About the Human Microbiome|publisher=hmpdacc.org|accessdate=2019-11-13}}</ref>. Ключевые открытия иПМЧ были опубликованы в 2019 году.<ref>{{Статья|автор=Lita Proctor, Jonathan LoTempio, Aron Marquitz, Phil Daschner, Dan Xi|год=2019-02-26|doi=10.1186/s40168-019-0620-y|issn=2049-2618|выпуск=1|страницы=31|издание=Microbiome|заглавие=A review of 10 years of human microbiome research activities at the US National Institutes of Health, Fiscal Years 2007-2016|ссылка=https://doi.org/10.1186/s40168-019-0620-y|том=7}}</ref> Наряду с созданием отсылочной базы данных по микробиому человека '''ПМЧ''' также открыл несколько «сюрпризов», которые нашли выражение в следующих тезисах:


·        Микробы вносят в дело выживания человека больше генов, чем гены человека сами по себе. Установлено, что бактериальные гены протеинового кодирования в 360 раз более распространены, чем подобные им человеческие гены.
·        Микробы вносят в дело выживания человека больше генов, чем гены человека сами по себе. Установлено, что бактериальные гены протеинового кодирования в 360 раз более распространены, чем подобные им человеческие гены.

Версия от 08:12, 13 ноября 2019

Официальный логотип ПМЧ
Официальный логотип ПМЧ

Проект «Микробиом Человека» (ПМЧ)The Human Microbiome Project (HMP) – это исследовательская инициатива Национальных институтов здравоохранения США, проявленная с целью лучшего понимания микрофлоры человека и её значения для человеческого здоровья и проблем, с ним связанных. Первая фаза запущенного в 2007 году[1] проекта была сосредоточена на определении и характеристиках микрофлоры человека. Вторая фаза, известная как Интегративный Проект «Микробиом Человека» (иПМЧ), началась в 2014 году с целью развития ресурсной базы для характеристики микробиома и прояснения роли микробов в состояниях здоровья и болезни человека. Эта программа получила финансовую поддержку в размере 170 миллионов долларов США от общего фонда  Национальных институтов здравоохранения США с 2007 по 2016 гг.[2]

Важными компонентами ПМЧ стали культурно-свободные методы характеристики микробиального сообщества, такие как метагеномика (которая открывает широкую генетическую перспективу в пределах отдельно взятого микробиального сообщества), а также обширное определение последовательности полного генома (что даёт «глубокий» взгляд на некоторые аспекты определённого микробиального сообщества, то есть индивидуальных видов бактерий). Последний компонент исследования послужил делу адресного секвенирования геномов – в настоящее время запланировано определение около 3000 последовательностей индивидуальных бактериальных изолятов – во время последующего метагеномного анализа. Проект также финансировал «глубокое» секвенирование бактериальной 16S рРНК на фоне усиления полимеразной цепной реакции у наблюдаемый людей.[3]

Введение

Ещё до запуска ПМЧ в популярных СМИ и в научной литературе часто сообщалось, что в теле человека микробиальных клеток примерно в 10 раз, а микробиальных генов в 100 раз больше, чем человеческих клеток. Эти цифры основывались на оценке человеческого микробиома, который содержит около 100 триллионов бактериальных клеток, в то время как типичный взрослый человек имеет примерно 10 триллионов человеческих клеток.[4] В 2014 году Американское Общество Микробиологии опубликовало брошюру, в которой был сделан акцент на том, что число микробиальных клеток и число человеческих клеток – это приблизительные величины. Также отмечалось, что в ходе недавних исследований учёные пришли к выводу, что человеческие клетки насчитывают примерно 37 триллионов, имея в виду соотношение микробиальных к человеческим клеткам 3:1.[5] В 2016 году другая группа опубликовала новую оценку соотношения 1:1 (1.3:1, с неопределённостью 25% и вариативностью 53% среди популяции типичных мужчин весом 70 кг).[6][7]

Несмотря на разные оценки огромного числа микробов внутри и снаружи тела человека, мало было известно об их ролях в состоянии здоровья (и нездоровья) человека. Многие из организмов, которые составляют микробиом, не были успешно выделены, определены или как-то охарактеризованы. Организмы, которые, как считается, могут быть найдены в человеческом микробиоме, однако, попадают под определение бактерии, членов домена Археи, дрожжи и простейшие, также как различные гельминты и вирусы, включая вирусы, поражающие клетки человеческого микробиома (бактериофаги). ПМЧ выступил как открыватель и описатель микробиома человека, уделяя особое внимание оральному, кожному, вагинальному, желудочно-кишечному и дыхательному участкам тела.

ПМЧ призван ответить на некоторые из самых вдохновляющих, раздражающих и просто основных научных вопросов сегодняшнего дня. Главное то, что у проекта есть потенциал для устранения искусственных барьеров между микробиологией в медицине и в окружающей среде. Возможно, ПМЧ не только обозначит новые пути определения здоровья и предрасположенности к болезням, но также уточнит параметры, необходимые для создания, применения и оценки стратегий сознательного управления человеческой микрофлорой, чтобы достичь качественно нового уровня в контексте оптимального физиологического здоровья.[8]

ПМЧ был описан как "логическое, концептуальное и экспериментальное продолжение Проекта «Геном человека»".[9] В 2007 году ПМЧ был включён в Дорожную Карту Медицинских Исследований[10] Национальных институтов здравоохранения США как один из Новых Путей к Открытию. Организованное описание микробиома человека осуществляется на международном уровне при содействии International Human Microbiome Consortium.

Первая Фаза (2007-2014)

Объединив усилия многих институтов,[11] ПМЧ ставил перед собой следующие задачи[12]:

·        Разработать множество элементарных исходов секвенирования микробиального генома и сделать предварительное описание микробиома человека

·        Исследовать связь между болезнью и изменениями в микробиоме человека

·        Разработать новые технологии и инструменты для компьютерного анализа

·        Основать ресурсное хранилище

·        Изучать этические, юридические и социальные последствия исследования микробиома человека

Вторая Фаза (2014-2016)

В 2014 году Национальные институты здравоохранения США перешли к следующей фазе ПМЧ, которая больше известна как Интегративный Проект «Микробиом Человека» (иПМЧ).

Проект объединил три подпроекта, которые реализовывались в разных институтах. Миссия проекта была заявлена так:

иПМЧ создаст интегрированные продольные наборы данных биологических свойств как самого микробиома, так и "хозяина" на основе трёх различных когортных исследований микробиомозависимых состояний с использованием множественных "-омик" (технологий). The project mission, as stated by the NIH, was as follows:

The iHMP will create integrated longitudinal datasets of biological properties from both the microbiome and host from three different cohort studies of microbiome-associated conditions using multiple "omics" technologies.Методы изучения включали профиль генной экспрессии 16S рРНК, цельную метагеномику методом дробовика, определение последовательности полного генома, метатранскриптомику (экспрессию микробиальных генов в естественной среде обитания), метаболомику, липидомику, а также иммунопротеомику[13]. Ключевые открытия иПМЧ были опубликованы в 2019 году.[14] Наряду с созданием отсылочной базы данных по микробиому человека ПМЧ также открыл несколько «сюрпризов», которые нашли выражение в следующих тезисах:

·        Микробы вносят в дело выживания человека больше генов, чем гены человека сами по себе. Установлено, что бактериальные гены протеинового кодирования в 360 раз более распространены, чем подобные им человеческие гены.

·        Микробиальная метаболическая активность: например, усвоение жиров, которое зависит не от одинаковых видов бактерий. Исследование продолжается.

·        Компоненты микробиома человека меняются с течением времени под влиянием болезненных изменений и лекарственных средств. Однако микробиом так или иначе возвращается в состояние (обеднённого) равновесия, даже если бактериальный состав изменился.

Клиническое использование

На основе данных ПМЧ выявлено обеднение вагинального микробиома у подавляющего большинства наблюдавшихся женщин непосредственно перед родами, а также высокая нагрузка вирусных ДНК в назальной микрофлоре детей с необъяснимыми случаями жара. Дополнительно было подтверждено изменение состояния (обеднение) микробиома при различных заболеваниях пищеварительного тракта, кожи, репродуктивных органов и при психических расстройствах (особенно у детей и подростков).

Официальный сайт ПМЧ

  1. Human microbiome project: Diversity of human microbes greater than previously predicted (англ.). ScienceDaily. Дата обращения: 13 ноября 2019.
  2. Human Microbiome Project - Home | NIH Common Fund. commonfund.nih.gov. Дата обращения: 13 ноября 2019.
  3. Human Microbiome Project - Home | NIH Common Fund. commonfund.nih.gov. Дата обращения: 13 ноября 2019.
  4. Оценка микробиома человека.
  5. Judah L. Rosner. Ten Times More Microbial Cells than Body Cells in Humans? (англ.) // Microbe Magazine. — 2014-02-01. — Vol. 9, iss. 2. — P. 47–47. — ISSN 1558-7460 1558-7452, 1558-7460. — doi:10.1128/microbe.9.47.2.
  6. Alison Abbott. Scientists bust myth that our bodies have more bacteria than human cells (англ.) // Nature News. — doi:10.1038/nature.2016.19136.
  7. Ron Sender, Shai Fuchs, Ron Milo. Are We Really Vastly Outnumbered? Revisiting the Ratio of Bacterial to Host Cells in Humans (англ.) // Cell. — 2016-01-28. — Т. 164, вып. 3. — С. 337–340. — ISSN 1097-4172 0092-8674, 1097-4172. — doi:10.1016/j.cell.2016.01.013.
  8. Peter J. Turnbaugh, Ruth E. Ley, Micah Hamady, Claire Fraser-Liggett, Rob Knight. The human microbiome project: exploring the microbial part of ourselves in a changing world // Nature. — 2007-10-18. — Т. 449, вып. 7164. — С. 804–810. — ISSN 0028-0836. — doi:10.1038/nature06244.
  9. Peter J. Turnbaugh, Ruth E. Ley, Micah Hamady, Claire M. Fraser-Liggett, Rob Knight. The Human Microbiome Project (англ.) // Nature. — 2007-10. — Vol. 449, iss. 7164. — P. 804–810. — ISSN 1476-4687. — doi:10.1038/nature06244.
  10. NIH Common Fund - About the NIH Roadmap. web.archive.org. Дата обращения: 13 ноября 2019.
  11. Human Microbiome Project - Funded Research. commonfund.nih.gov. Дата обращения: 13 ноября 2019.
  12. Human Microbiome Project - Program Initiatives. commonfund.nih.gov. Дата обращения: 13 ноября 2019.
  13. NIH Human Microbiome Project - About the Human Microbiome. hmpdacc.org. Дата обращения: 13 ноября 2019.
  14. Lita Proctor, Jonathan LoTempio, Aron Marquitz, Phil Daschner, Dan Xi. A review of 10 years of human microbiome research activities at the US National Institutes of Health, Fiscal Years 2007-2016 // Microbiome. — 2019-02-26. — Т. 7, вып. 1. — С. 31. — ISSN 2049-2618. — doi:10.1186/s40168-019-0620-y.