Коронавирус человека OC43: различия между версиями

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Интерактивная навигация по истории
[непроверенная версия][непроверенная версия]
Следующая правка →
Содержимое удалено Содержимое добавлено
ВизуальныйВики-текст
Создано переводом страницы «Human coronavirus OC43»
 
Создано переводом страницы «Human coronavirus OC43»
Строка 1: Строка 1:
[[Вирусы|Вирус]]Царство:<nowiki><i>Orthornavirae</i></nowiki>Класс:''[[Nidovirales]]''Род:Породы:
[[Вирусы|Вирус]]Царство:<nowiki><i>Orthornavirae</i></nowiki>Класс:''[[Nidovirales]]''Род:Породы:


'''Коронавирус человека OC43''' ( '''HCoV-OC43''' ) - коронавирус, представитель [[Подрод|подрода]] ''Betacoronavirus 1'', заразный для людей и [[Крупный рогатый скот|крупного рогатого скота]]<ref name=":0">{{Cite web|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Undef&id=694003&lvl=3&keep=1&srchmode=1&unlock|title=Taxonomy browser (Betacoronavirus 1)|website=www.ncbi.nlm.nih.gov|accessdate=2020-02-29}}</ref><ref>{{Cite journal|author=Lim|first=Yvonne Xinyi|date=2016-07-25|title=Human Coronaviruses: A Review of Virus–Host Interactions|journal=Diseases|volume=4|issue=3|pages=26|doi=10.3390/diseases4030026|pmid=28933406|quote=See Table 1.}}</ref>. [[Вирусная оболочка|Оболочечный]] [[Рибонуклеиновая кислота|одноцепочечный]] (+) [[Классификация вирусов по Балтимору|РНК-вирус]] , который проникает в клетку, связываясь с [[N-Ацетилнейраминовая кислота|рецептором N-ацетил-9-O-ацетилнейраминовой кислоты]] . <ref>{{Cite journal|author=Li|first=Fang|date=2016-09-29|title=Structure, Function, and Evolution of Coronavirus Spike Proteins|journal=Annual Review of Virology|volume=3|issue=1|pages=237–261|doi=10.1146/annurev-virology-110615-042301|pmid=27578435|quote=BCoV S1-NTD does not recognize galactose as galectins do. Instead, it recognizes 5-N-acetyl-9-O-acetylneuraminic acid (Neu5,9Ac2) (30, 43). The same sugar receptor is also recognized by human coronavirus OC43 (43, 99). OC43 and BCoV are closely related genetically, and OC43 might have resulted from zoonotic spillover of BCoV (100, 101).}}</ref>
'''Коронавирус человека OC43''' ('''HCoV-OC43''') - вирус из семейства коронавирусов, представитель [[Род (биология)|рода]] ''Betacoronavirus 1'', заразный для людей и [[Крупный рогатый скот|крупного рогатого скота]]<ref name=":0">{{Cite web|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Undef&id=694003&lvl=3&keep=1&srchmode=1&unlock|title=Taxonomy browser (Betacoronavirus 1)|website=www.ncbi.nlm.nih.gov|accessdate=2020-02-29}}</ref><ref>{{Cite journal|author=Lim|first=Yvonne Xinyi|date=2016-07-25|title=Human Coronaviruses: A Review of Virus–Host Interactions|journal=Diseases|volume=4|issue=3|pages=26|doi=10.3390/diseases4030026|pmid=28933406|quote=See Table 1.}}</ref>. [[Вирусная оболочка|Оболочечный]] [[Рибонуклеиновая кислота|одноцепочечный]] (+) [[Классификация вирусов по Балтимору|РНК-вирус]] , который проникает в клетку, связываясь с [[N-Ацетилнейраминовая кислота|рецептором N-ацетил-9-O-ацетилнейраминовой кислоты]]<ref>{{Cite journal|author=Li|first=Fang|date=2016-09-29|title=Structure, Function, and Evolution of Coronavirus Spike Proteins|journal=Annual Review of Virology|volume=3|issue=1|pages=237–261|doi=10.1146/annurev-virology-110615-042301|pmid=27578435|quote=BCoV S1-NTD does not recognize galactose as galectins do. Instead, it recognizes 5-N-acetyl-9-O-acetylneuraminic acid (Neu5,9Ac2) (30, 43). The same sugar receptor is also recognized by human coronavirus OC43 (43, 99). OC43 and BCoV are closely related genetically, and OC43 might have resulted from zoonotic spillover of BCoV (100, 101).}}</ref>.

OC43 - один из семи известных коронавирусов, заражающих людей, ответственный за примерно 10-15% случаев [[Простуда|простуды]]<ref name="DoiJVIMissing">{{Cite journal|author=Lau|first=Susanna K. P.|year=2011|title=Molecular Epidemiology of Human Coronavirus OC43 Reveals Evolution of Different Genotypes over Time and Recent Emergence of a Novel Genotype due to Natural Recombination|journal=Journal of Virology|volume=85|issue=21|pages=11325–37|doi=10.1128/JVI.05512-11|pmid=21849456}}</ref><ref>{{Cite journal|first=E.R.|author=Gaunt|title=Epidemiology and clinical presentations of the four human coronaviruses 229E, HKU1, NL63, and OC43 detected over 3 years using a novel multiplex real-time PCR method|journal=J Clin Microbiol|volume=48|issue=8|pages=2940–7|year=2010|doi=10.1128/JCM.00636-10|pmid=20554810}}</ref>. Он имеет, как и другие коронавирусы из [[Подрод|подрода]] ''Embecovirus'', короткий [[Пепломеры|белок-шип,]] называемый гемагглютинин-эстеразой (HE)<ref name=":03">{{Cite journal|author=Woo|first=Patrick C. Y.|date=2010-08-24|title=Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis|journal=Viruses|volume=2|issue=8|pages=1804–20|doi=10.3390/v2081803|pmid=21994708|quote=In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).}}</ref><ref name=":0">{{Cite web|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Undef&id=694003&lvl=3&keep=1&srchmode=1&unlock|title=Taxonomy browser (Betacoronavirus 1)|website=www.ncbi.nlm.nih.gov|accessdate=2020-02-29}}</ref>.

== Вирусология ==
Идентифицированы четыре [[Генотип|генотипа]] HCoV-OC43 (от A до D) с генотипом D, скорее всего возникшим в результате [[Рекомбинация (биология)|генетической рекомбинации]] . Полное секвенирование генома двух [[Штамм|штаммов]] генотипов C и D и [[бутскан-анализ]] показывают признаки рекомбинации между генотипами B и C при образовании генотипа D. Из 29 идентифицированных штаммов ни один не принадлежит к более древнему генотипу A. Метод [[Молекулярные часы|молекулярных часов]] с использованием шипа и [[Капсид|нуклеокапсида]] относит [[Ближайший общий предок|ближайшего общего предка]] всех генотипов к 1950-м годам, генотип B к 1990-м годам и генотип C к концу 1990-х - началу 2000-х годов. Рекомбинантные штаммы генотипа D были обнаружены уже в 2004 году<ref name="DoiJVIMissing">{{Cite journal|author=Lau|first=Susanna K. P.|year=2011|title=Molecular Epidemiology of Human Coronavirus OC43 Reveals Evolution of Different Genotypes over Time and Recent Emergence of a Novel Genotype due to Natural Recombination|journal=Journal of Virology|volume=85|issue=21|pages=11325–37|doi=10.1128/JVI.05512-11|pmid=21849456}}</ref>,

Сравнение HCoV-OC43 с ближайшим к нему штаммом вида Betacoronavirus 1, коронавирусом крупного рогатого скота, показало, что у них был [[ближайший общий предок]] в конце 19 века, при этом несколько методов датируют разделение примерно 1890 годом, что заставило исследователей предположить, что попадание первого штамма в человеческое население вызвало пандемию гриппа 1889–1890 гг . <ref>{{Cite journal|author=Vijgen|first=Leen|title=Complete Genomic Sequence of Human Coronavirus OC43: Molecular Clock Analysis Suggests a Relatively Recent Zoonotic Coronavirus Transmission Event|journal=Journal of Virology|date=2005|volume=79|issue=3|pages=1595–1604|doi=10.1128/JVI.79.3.1595-1604.2005|pmid=15650185}}</ref> HCoV-OC43, вероятно, зародился у [[Грызуны|грызунов]] . <ref>{{Cite journal|doi=10.1146/annurev-micro-020518-115759|title=Human Coronavirus: Host-Pathogen Interaction|year=2019|author=Fung|first=To Sing|journal=Annual Review of Microbiology|volume=73|pages=529–557|pmid=31226023}}</ref>

== Патогенез ==
Наряду с [[Коронавирус человека 229E|HCoV-229E]], видом из рода ''Alphacoronavirus'', HCoV-OC43 входит в число известных вирусов, вызывающих [[Простуда|простуду]]. Оба вируса могут вызывать тяжелые инфекции нижних дыхательных путей, включая [[Пневмония|пневмонию]] у младенцев, пожилых людей и лиц с [[Иммунодефицит|ослабленным иммунитетом,]] например, тех, кто проходит [[Химиотерапия злокачественных новообразований|химиотерапию,]] и людей с [[Синдром приобретённого иммунного дефицита|ВИЧ / СПИДом]] <ref>{{Cite journal|doi=10.1016/j.cll.2009.07.007|title=Recently Discovered Human Coronaviruses|year=2009|author=Wevers|first=Brigitte A.|journal=Clinics in Laboratory Medicine|volume=29|issue=4|pages=715–724|pmid=19892230}}</ref><ref>{{Cite book|isbn=978-1-55581-371-0}}</ref><ref>{{Cite journal|doi=10.2174/187152607780090757|title=Antiviral Strategies Against Human Coronaviruses|year=2007|author=Pyrc|first=K.|journal=Infectious Disorders Drug Targets|volume=7|pages=59–66|pmid=17346212|issue=1}}</ref>.

== Эпидемиология ==
Коронавирусы распространены по всему миру, вызывая 10–15% случаев простуды (вирус, чаще всего вызывающий простуду - это [[Риновирусы|риновирус]], обнаруживаемый в 30–50% случаев). Инфекции имеют [[Сезонное заболевание|сезонный характер]], причем большинство случаев приходится на зимние месяцы<ref>{{Cite journal|pmid=17944272|year=2007|author=Van Der Hoek|first=L|title=Human coronaviruses: What do they cause?|volume=12|issue=4 Pt B|pages=651–8|journal=Antiviral Therapy|url=https://www.intmedpress.com/journals/avt/abstract.cfm?id=460&pid=88}}</ref><ref name="Wat">{{Cite journal|doi=10.1016/j.ejim.2004.01.006|title=The common cold: A review of the literature|year=2004|author=Wat|first=Dennis|journal=European Journal of Internal Medicine|volume=15|issue=2|pages=79–88|pmid=15172021}}</ref><ref name="SARS-CoV-2">{{Cite journal|doi=10.1126/science.abb5793|title=Projecting the transmission dynamics of SARS-CoV-2 through the postpandemic period|year=2020|author=Kissler|first=Stephen M.|journal=Science|date=April 14, 2020|pages=eabb5793|pmid=32291278}}</ref>.

== Ссылки ==

<nowiki>
<nowiki>
[[Категория:Острые респираторные вирусные инфекции]]</nowiki>
[[Категория:Острые респираторные вирусные инфекции]]</nowiki>

Версия от 21:11, 9 августа 2020

ВирусЦарство:<i>Orthornavirae</i>Класс:NidoviralesРод:Породы:

Коронавирус человека OC43 (HCoV-OC43) - вирус из семейства коронавирусов, представитель рода Betacoronavirus 1, заразный для людей и крупного рогатого скота[1][2]. Оболочечный одноцепочечный (+) РНК-вирус , который проникает в клетку, связываясь с рецептором N-ацетил-9-O-ацетилнейраминовой кислоты[3].

OC43 - один из семи известных коронавирусов, заражающих людей, ответственный за примерно 10-15% случаев простуды[4][5]. Он имеет, как и другие коронавирусы из подрода Embecovirus, короткий белок-шип, называемый гемагглютинин-эстеразой (HE)[6][1].

Вирусология

Идентифицированы четыре генотипа HCoV-OC43 (от A до D) с генотипом D, скорее всего возникшим в результате генетической рекомбинации . Полное секвенирование генома двух штаммов генотипов C и D и бутскан-анализ показывают признаки рекомбинации между генотипами B и C при образовании генотипа D. Из 29 идентифицированных штаммов ни один не принадлежит к более древнему генотипу A. Метод молекулярных часов с использованием шипа и нуклеокапсида относит ближайшего общего предка всех генотипов к 1950-м годам, генотип B к 1990-м годам и генотип C к концу 1990-х - началу 2000-х годов. Рекомбинантные штаммы генотипа D были обнаружены уже в 2004 году[4],

Сравнение HCoV-OC43 с ближайшим к нему штаммом вида Betacoronavirus 1, коронавирусом крупного рогатого скота, показало, что у них был ближайший общий предок в конце 19 века, при этом несколько методов датируют разделение примерно 1890 годом, что заставило исследователей предположить, что попадание первого штамма в человеческое население вызвало пандемию гриппа 1889–1890 гг . [7] HCoV-OC43, вероятно, зародился у грызунов . [8]

Патогенез

Наряду с HCoV-229E, видом из рода Alphacoronavirus, HCoV-OC43 входит в число известных вирусов, вызывающих простуду. Оба вируса могут вызывать тяжелые инфекции нижних дыхательных путей, включая пневмонию у младенцев, пожилых людей и лиц с ослабленным иммунитетом, например, тех, кто проходит химиотерапию, и людей с ВИЧ / СПИДом [9][10][11].

Эпидемиология

Коронавирусы распространены по всему миру, вызывая 10–15% случаев простуды (вирус, чаще всего вызывающий простуду - это риновирус, обнаруживаемый в 30–50% случаев). Инфекции имеют сезонный характер, причем большинство случаев приходится на зимние месяцы[12][13][14].

Ссылки

[[Категория:Острые респираторные вирусные инфекции]]

  1. ↑ 1 2 Taxonomy browser (Betacoronavirus 1). www.ncbi.nlm.nih.gov. Дата обращения: 29 февраля 2020.
  2. ↑ Lim, Yvonne Xinyi (2016-07-25). "Human Coronaviruses: A Review of Virus–Host Interactions". Diseases. 4 (3): 26. doi:10.3390/diseases4030026. PMID 28933406. See Table 1.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  3. ↑ Li, Fang (2016-09-29). "Structure, Function, and Evolution of Coronavirus Spike Proteins". Annual Review of Virology. 3 (1): 237—261. doi:10.1146/annurev-virology-110615-042301. PMID 27578435. BCoV S1-NTD does not recognize galactose as galectins do. Instead, it recognizes 5-N-acetyl-9-O-acetylneuraminic acid (Neu5,9Ac2) (30, 43). The same sugar receptor is also recognized by human coronavirus OC43 (43, 99). OC43 and BCoV are closely related genetically, and OC43 might have resulted from zoonotic spillover of BCoV (100, 101).
  4. ↑ 1 2 Lau, Susanna K. P. (2011). "Molecular Epidemiology of Human Coronavirus OC43 Reveals Evolution of Different Genotypes over Time and Recent Emergence of a Novel Genotype due to Natural Recombination". Journal of Virology. 85 (21): 11325—37. doi:10.1128/JVI.05512-11. PMID 21849456.
  5. ↑ Gaunt, E.R. (2010). "Epidemiology and clinical presentations of the four human coronaviruses 229E, HKU1, NL63, and OC43 detected over 3 years using a novel multiplex real-time PCR method". J Clin Microbiol. 48 (8): 2940—7. doi:10.1128/JCM.00636-10. PMID 20554810.
  6. ↑ Woo, Patrick C. Y. (2010-08-24). "Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis". Viruses. 2 (8): 1804—20. doi:10.3390/v2081803. PMID 21994708. In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  7. ↑ Vijgen, Leen (2005). "Complete Genomic Sequence of Human Coronavirus OC43: Molecular Clock Analysis Suggests a Relatively Recent Zoonotic Coronavirus Transmission Event". Journal of Virology. 79 (3): 1595—1604. doi:10.1128/JVI.79.3.1595-1604.2005. PMID 15650185.
  8. ↑ Fung, To Sing (2019). "Human Coronavirus: Host-Pathogen Interaction". Annual Review of Microbiology. 73: 529—557. doi:10.1146/annurev-micro-020518-115759. PMID 31226023.
  9. ↑ Wevers, Brigitte A. (2009). "Recently Discovered Human Coronaviruses". Clinics in Laboratory Medicine. 29 (4): 715—724. doi:10.1016/j.cll.2009.07.007. PMID 19892230.
  10. ↑ Ошибка: не задан параметр |заглавие = в шаблоне {{публикация}}. — ISBN 978-1-55581-371-0.
  11. ↑ Pyrc, K. (2007). "Antiviral Strategies Against Human Coronaviruses". Infectious Disorders Drug Targets. 7 (1): 59—66. doi:10.2174/187152607780090757. PMID 17346212.
  12. ↑ Van Der Hoek, L (2007). "Human coronaviruses: What do they cause?". Antiviral Therapy. 12 (4 Pt B): 651—8. PMID 17944272.
  13. ↑ Wat, Dennis (2004). "The common cold: A review of the literature". European Journal of Internal Medicine. 15 (2): 79—88. doi:10.1016/j.ejim.2004.01.006. PMID 15172021.
  14. ↑ Kissler, Stephen M. (April 14, 2020). "Projecting the transmission dynamics of SARS-CoV-2 through the postpandemic period". Science: eabb5793. doi:10.1126/science.abb5793. PMID 32291278.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (дата и год) (ссылка)
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=Коронавирус_человека_OC43&oldid=108646932