Протеаза ВИЧ-1: различия между версиями

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Интерактивная навигация по истории
[отпатрулированная версия][отпатрулированная версия]
← Предыдущая правкаСледующая правка →
Содержимое удалено Содержимое добавлено
ВизуальныйВики-текст
дополнение
Строка 12: Строка 12:


== Структура и функция ==
== Структура и функция ==
Структура протеазы ВИЧ-1 была исследована с помощью [[рентгеноструктурный анализ|рентгеноструктурного анализа]]. Фермент существует в виде гомодимера, в котором каждая субъединица состоит из 99 аминокислотных остатков<ref name="pmid2194475"/>.
Структура протеазы ВИЧ-1 была исследована с помощью [[рентгеноструктурный анализ|рентгеноструктурного анализа]]. Фермент существует в виде гомодимера, в котором каждая субъединица состоит из 99 аминокислотных остатков<ref name="pmid2194475"/>. Структурно каждая субъединица состоит из девяти [[бета-лист]]ов и одной [[Альфа-спираль|альфа-спирали]]<ref name="pmid22971934">{{cite pmid|22971934}}</ref>.


[[Активный центр фермента|Активный центр]] расположен между субъединицами и имеет характерную для аспартатных протеаз аминокислотную последовательность [[Аспартат|Asp]]-[[Треонин|Thr]]-[[Глицин|Gly]] (Asp25, Thr26 и Gly27).
[[Активный центр фермента|Активный центр]] расположен между субъединицами и имеет характерную для [[аспартатные протеазы|аспартатных протеаз]] аминокислотную последовательность [[Аспартат|Asp]]-[[Треонин|Thr]]-[[Глицин|Gly]] (Asp25, Thr26 и Gly27)<ref name="pmid12929379">{{cite pmid|12929379}}</ref>. Ядро активного центра содержит два остатка аспартата от субъединиц и является гидрофобным. Бета-листы субъединиц формируют две «створки» ({{lang-en|flaps}}), которые покрывают активную зону<ref name="pmid22971934"/>.


== Примечания ==
== Примечания ==

Версия от 11:09, 30 июня 2016

HIV-1 Protease (Retropepsin)
Димер протеазы обозначен белым и серым цветами, чёрным обозначен пептидный субстрат, красным — аспартатная цепочка. (PDB 1KJF)
Димер протеазы обозначен белым и серым цветами, чёрным обозначен пептидный субстрат, красным — аспартатная цепочка. (PDB 1KJF)
Идентификаторы
Шифр КФ 3.4.23.16
Номер CAS 144114-21-6
Базы ферментов
IntEnz IntEnz view
BRENDA BRENDA entry
ExPASy NiceZyme view
MetaCyc metabolic pathway
KEGG KEGG entry
PRIAM profile
PDB structures RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Gene Ontology AmiGO • EGO
Поиск
PMC статьи
PubMed статьи
NCBI NCBI proteins
CAS 144114-21-6

Протеаза ВИЧ-1 (англ. HIV-1 protease) — ретровирусная аспартатная протеаза (ретропепсин), фермент, играющий важную роль в жизненном цикле вируса иммунодефицита человека (ВИЧ)[1][2]. Протеаза разрезает синтезируемые полипротеины (в частности, Gag и Gag-Pol[3]) в нужных местах, благодаря чему образуются зрелые белки вириона ВИЧ. Без протеазы вирионы ВИЧ остаются неинфективными[4][5]. Таким образом, мутации в активном центре фермента или ингибирование его активности нарушают способность ВИЧ реплицировать и заражать клетки[6], что делает ингибиторы протеазы целью множества исследований[7].

Структура и функция

Структура протеазы ВИЧ-1 была исследована с помощью рентгеноструктурного анализа. Фермент существует в виде гомодимера, в котором каждая субъединица состоит из 99 аминокислотных остатков[1]. Структурно каждая субъединица состоит из девяти бета-листов и одной альфа-спирали[8].

Активный центр расположен между субъединицами и имеет характерную для аспартатных протеаз аминокислотную последовательность Asp-Thr-Gly (Asp25, Thr26 и Gly27)[2]. Ядро активного центра содержит два остатка аспартата от субъединиц и является гидрофобным. Бета-листы субъединиц формируют две «створки» (англ. flaps), которые покрывают активную зону[8].

Примечания

  1. ↑ 1 2 Davies DR (1990). "The structure and function of the aspartic proteinases". Annu Rev Biophys Biophys Chem. 19 (1): 189—215. doi:10.1146/annurev.bb.19.060190.001201. PMID 2194475.
  2. ↑ 1 2 Brik A, Wong CH (January 2003). "HIV-1 protease: mechanism and drug discovery". Org. Biomol. Chem. 1 (1): 5—14. doi:10.1039/b208248a. PMID 12929379. Ошибка в сносках?: Неверный тег <ref>: название «pmid12929379» определено несколько раз для различного содержимого
  3. ↑ Huang X., Britto M. D., Kear-Scott J. L., Boone C. D., Rocca J. R., Simmerling C., Mckenna R., Bieri M., Gooley P. R., Dunn B. M., Fanucci G. E. The role of select subtype polymorphisms on HIV-1 protease conformational sampling and dynamics. (англ.) // The Journal of biological chemistry. — 2014. — Vol. 289, no. 24. — P. 17203—17214. — doi:10.1074/jbc.M114.571836. — PMID 24742668. [исправить]
  4. ↑ Kräusslich HG, Ingraham RH, Skoog MT, Wimmer E, Pallai PV, Carter CA (February 1989). "Activity of purified biosynthetic proteinase of human immunodeficiency virus on natural substrates and synthetic peptides". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86 (3): 807—11. doi:10.1073/pnas.86.3.807. PMC 286566. PMID 2644644.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  5. ↑ Kohl NE, Emini EA, Schleif WA; et al. (July 1988). "Active human immunodeficiency virus protease is required for viral infectivity". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85 (13): 4686—90. doi:10.1073/pnas.85.13.4686. PMC 280500. PMID 3290901. {{cite journal}}: Явное указание et al. в: |author= (справка)Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  6. ↑ Seelmeier S, Schmidt H, Turk V, von der Helm K (September 1988). "Human immunodeficiency virus has an aspartic-type protease that can be inhibited by pepstatin A". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85 (18): 6612—6. doi:10.1073/pnas.85.18.6612. PMC 282027. PMID 3045820.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  7. ↑ McPhee F, Good AC, Kuntz ID, Craik CS (October 1996). "Engineering human immunodeficiency virus 1 protease heterodimers as macromolecular inhibitors of viral maturation". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93 (21): 11477—81. doi:10.1073/pnas.93.21.11477. PMC 56635. PMID 8876160.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  8. ↑ 1 2 Yang H., Nkeze J., Zhao R. Y. Effects of HIV-1 protease on cellular functions and their potential applications in antiretroviral therapy. (англ.) // Cell & bioscience. — 2012. — Vol. 2, no. 1. — P. 32. — doi:10.1186/2045-3701-2-32. — PMID 22971934. [исправить]
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=Протеаза_ВИЧ-1&oldid=79279239