AHR (белок): различия между версиями

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
[отпатрулированная версия][отпатрулированная версия]
Содержимое удалено Содержимое добавлено
Строка 4: Строка 4:


== Структура ==
== Структура ==
Белок AhR содержит несколько доменов, критичных в функционировании, и классифицируется как член базового семейства транскрипционных факторов, основанного на мотиве Спираль-петля-спираль/Per-Arnt-Sim (bHLH/PAS). Мотив bHLH расположен в N-конце белка и является общей особенностью среди множества транскрипционных факторов. Члены суперсемейства bHLH имеют две функционально отличительные и высококонсервативные области. Первая — базовая область, которая участвует в связывании фактора транскрипции с [[ДНК]]. Вторая — область спираль-петля-спираль (HLH), которая облегчает белково-белковые взаимодействия. Также в AhR содеражтся два домена PAS, PAS-A и PAS-B, которые представляют собой отрезки из остатков 200-350 аминокислот, которые показывают гомологию с высокой последовательностью до белковых доменов, которые были первоначально обнаружены в периоде генов Drosophila (Per) и (Sim) и в партнёре по димеризации AhR — ядерный транслокатор ароматических углеводородов (ARNT). Домены PAS поддерживают специфические вторичные взаимодействия с другими белками, содержащими PAS, как в случае с AhR и ARNT, с которыми могут образовываться димерные и гетеромерные [[белковые комплексы]]. Лиганд-связывающий сайт AhR содержится в домене PAS-B и включает несколько консервативных остатков, критических для связывания лиганда. Наконец, богатый [[глутамин]]ом (Q-богатый) домен расположен в С-концевой области белка и участвует в коактиваторном наборе и трансактивации.
Белок AhR содержит несколько доменов, критичных в функционировании, и классифицируется как член базового семейства транскрипционных факторов, основанного на мотиве Спираль-петля-спираль/Per-Arnt-Sim (bHLH/PAS)<ref name="pmid1325649">{{cite journal | vauthors = Burbach KM, Poland A, Bradfield CA | title = Cloning of the Ah-receptor cDNA reveals a distinctive ligand-activated transcription factor | journal = Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. | volume = 89 | issue = 17 | pages = 8185–9 | year = 1992 | pmid = 1325649 | pmc = 49882 | doi = 10.1073/pnas.89.17.8185 }}</ref><ref name="pmid7493958">{{cite journal | vauthors = Fukunaga BN, Probst MR, Reisz-Porszasz S, Hankinson O | title = Identification of functional domains of the aryl hydrocarbon receptor | journal = J. Biol. Chem. | volume = 270 | issue = 49 | pages = 29270–8 | year = 1995 | pmid = 7493958 | doi = 10.1074/jbc.270.49.29270 }}</ref> . Мотив bHLH расположен в N-конце белка и является общей особенностью среди множества транскрипционных факторов<ref name="pmid15186484">{{cite journal | vauthors = Jones S | title = An overview of the basic helix-loop-helix proteins | journal = Genome Biol. | volume = 5 | issue = 6 | pages = 226 | year = 2004 | pmid = 15186484 | pmc = 463060 | doi = 10.1186/gb-2004-5-6-226 }}</ref>. Члены суперсемейства bHLH имеют две функционально отличительные и высококонсервативные области. Первая — базовая область, которая участвует в связывании фактора транскрипции с [[ДНК]]<ref name="pmid1314586">{{cite journal | vauthors = Ema M, Sogawa K, Watanabe N, Chujoh Y, Matsushita N, Gotoh O, Funae Y, Fujii-Kuriyama Y | title = cDNA cloning and structure of mouse putative Ah receptor | journal = Biochem. Biophys. Res. Commun. | volume = 184 | issue = 1 | pages = 246–53 | year = 1992 | pmid = 1314586 | doi = 10.1016/0006-291X(92)91185-S }}</ref>. Вторая — область спираль-петля-спираль (HLH), которая облегчает белково-белковые взаимодействия. Также в AhR содеражтся два домена PAS, PAS-A и PAS-B, представляющие собой отрезки из остатков 200-350 [[аминокислоты|аминокислот]], которые показывают гомологию с высокой последовательностью до белковых доменов, которые были первоначально обнаружены в генах [[Дрозофила большая|Дрозофилы]] — ''Per'' (сокр. от period) и ''Sim'' (сокр. от single-minded protein) и в партнёре по димеризации AhR — ядерный транслокатор ароматических углеводородов (ARNT)<ref name="pmid1314586">{{cite journal | vauthors = Ema M, Sogawa K, Watanabe N, Chujoh Y, Matsushita N, Gotoh O, Funae Y, Fujii-Kuriyama Y | title = cDNA cloning and structure of mouse putative Ah receptor | journal = Biochem. Biophys. Res. Commun. | volume = 184 | issue = 1 | pages = 246–53 | year = 1992 | pmid = 1314586 | doi = 10.1016/0006-291X(92)91185-S }}</ref> . Домены PAS поддерживают специфические вторичные взаимодействия с другими белками, содержащими PAS, как в случае с AhR и ARNT, с которыми могут образовываться димерные и гетеромерные [[белковые комплексы]]. Лиганд-связывающий сайт AhR содержится в домене PAS-B<ref name="pmid7559670">{{cite journal | vauthors = Coumailleau P, Poellinger L, Gustafsson JA, Whitelaw ML | title = Definition of a minimal domain of the dioxin receptor that is associated with Hsp90 and maintains wild type ligand binding affinity and specificity | journal = J. Biol. Chem. | volume = 270 | issue = 42 | pages = 25291–300 | year = 1995 | pmid = 7559670 | doi = 10.1074/jbc.270.42.25291 }}</ref> и включает в себя несколько консервативных остатков, критических для связывания лиганда<ref name="pmid17227672">{{cite journal | vauthors = Goryo K, Suzuki A, Del Carpio CA, Siizaki K, Kuriyama E, Mikami Y, Kinoshita K, Yasumoto K, Rannug A, Miyamoto A, Fujii-Kuriyama Y, Sogawa K | title = Identification of amino acid residues in the Ah receptor involved in ligand binding | journal = Biochem. Biophys. Res. Commun. | volume = 354 | issue = 2 | pages = 396–402 | year = 2007 | pmid = 17227672 | doi = 10.1016/j.bbrc.2006.12.227 }}</ref. Наконец, богатый [[глутамин]]ом (Q-богатый) домен расположен в С-концевой области белка и участвует в коактиваторном наборе и трансактивации<ref name="pmid11551916">{{cite journal | vauthors = Kumar MB, Ramadoss P, Reen RK, Vanden Heuvel JP, Perdew GH | title = The Q-rich subdomain of the human Ah receptor transactivation domain is required for dioxin-mediated transcriptional activity | journal = J. Biol. Chem. | volume = 276 | issue = 45 | pages = 42302–10 | year = 2001 | pmid = 11551916 | doi = 10.1074/jbc.M104798200 }}</ref>.


== Лиганды воздействующие на рецептор ==
== Лиганды воздействующие на рецептор ==

Версия от 12:25, 9 сентября 2017

AHR (белок)
Идентификаторы
ПсевдонимыAHRaromatic hydrocarbon receptorbHLHe76ah receptorclass E basic helix-loop-helix protein 76AH-receptor
Внешние IDGeneCards: [1]
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

н/д

н/д

RefSeq (белок)

н/д

н/д

Локус (UCSC)н/дн/д
Поиск по PubMedн/дн/д
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)

AHR (сокр. от англ. Aryl hydrocarbon receptor), также Ahr или Ah-рецептор — рецептор ароматических углеводородов, белок, у человека кодируется одноименным геном AHR, локализованный на коротком плече (p-плече) 7-хромосомы. AHR относится к лиганд-зависимым транскрипционным факторам, которые осуществляют регуляцию биологических реакций плоских ароматических систем (ароматических углеводородов). Было показано, что этот рецептор регулирует ферменты, способствующие метаболизму ксенобиотиков, такие как цитохром P450.

Структура

Белок AhR содержит несколько доменов, критичных в функционировании, и классифицируется как член базового семейства транскрипционных факторов, основанного на мотиве Спираль-петля-спираль/Per-Arnt-Sim (bHLH/PAS)[1][2] . Мотив bHLH расположен в N-конце белка и является общей особенностью среди множества транскрипционных факторов[3]. Члены суперсемейства bHLH имеют две функционально отличительные и высококонсервативные области. Первая — базовая область, которая участвует в связывании фактора транскрипции с ДНК[4]. Вторая — область спираль-петля-спираль (HLH), которая облегчает белково-белковые взаимодействия. Также в AhR содеражтся два домена PAS, PAS-A и PAS-B, представляющие собой отрезки из остатков 200-350 аминокислот, которые показывают гомологию с высокой последовательностью до белковых доменов, которые были первоначально обнаружены в генах ДрозофилыPer (сокр. от period) и Sim (сокр. от single-minded protein) и в партнёре по димеризации AhR — ядерный транслокатор ароматических углеводородов (ARNT)[4] . Домены PAS поддерживают специфические вторичные взаимодействия с другими белками, содержащими PAS, как в случае с AhR и ARNT, с которыми могут образовываться димерные и гетеромерные белковые комплексы. Лиганд-связывающий сайт AhR содержится в домене PAS-B[5] и включает в себя несколько консервативных остатков, критических для связывания лигандаОшибка в сносках?: Отсутствует закрывающий тег </ref>.

Лиганды воздействующие на рецептор

Лиганды воздействующие на AHR обычно подразделяются на две категории:синтетические или природные.

Сигнальный путь

Не связанный с лигандами AHR сохраняется в цитоплазме как неактивный белковый комплекс, состоящий из димера остатка гистидина Hsp90[6][7], простагландин E-синтазы 3 (PTGES3, p23)[8][9][10][11] и одной молекулы иммунофилин-подобного белка, взаимодействующего с рецептором AH, также известного как Х-ассоциированный белок 2 вируса гепатита В (XAP2)[12], АR-взаимодействующего белка (AIP)[13], и активированного АR9 (ARA9)[14]. Димер Hsp90 вместе с PTGES3 (p23) имеет многофункциональную роль в защите рецептора от протеолиза, ограничивает рецептор в конформации, которая восприимчива к связыванию лиганда, и предотвращает преждевременное связывание ARNT[5][9][11][15][16][17]. AIP взаимодействует с карбоксильным концом Hsp90 и связывается с сигналом ядерной локализации AhR (NLS), предотвращающей ненадлежающую траспортировку рецептора в клеточное ядро[18][19][20].

Физиологическая роль и токсикология

Взаимодействие с другими белками

AHR взаимодействует помимо вышеуказанных белков со следующими:

Примечания

  1. Burbach KM, Poland A, Bradfield CA (1992). "Cloning of the Ah-receptor cDNA reveals a distinctive ligand-activated transcription factor". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89 (17): 8185—9. doi:10.1073/pnas.89.17.8185. PMC 49882. PMID 1325649.
  2. Fukunaga BN, Probst MR, Reisz-Porszasz S, Hankinson O (1995). "Identification of functional domains of the aryl hydrocarbon receptor". J. Biol. Chem. 270 (49): 29270—8. doi:10.1074/jbc.270.49.29270. PMID 7493958.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  3. Jones S (2004). "An overview of the basic helix-loop-helix proteins". Genome Biol. 5 (6): 226. doi:10.1186/gb-2004-5-6-226. PMC 463060. PMID 15186484.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  4. 1 2 Ema M, Sogawa K, Watanabe N, Chujoh Y, Matsushita N, Gotoh O, Funae Y, Fujii-Kuriyama Y (1992). "cDNA cloning and structure of mouse putative Ah receptor". Biochem. Biophys. Res. Commun. 184 (1): 246—53. doi:10.1016/0006-291X(92)91185-S. PMID 1314586.
  5. 1 2 Coumailleau P, Poellinger L, Gustafsson JA, Whitelaw ML (1995). "Definition of a minimal domain of the dioxin receptor that is associated with Hsp90 and maintains wild type ligand binding affinity and specificity". J. Biol. Chem. 270 (42): 25291—300. doi:10.1074/jbc.270.42.25291. PMID 7559670.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  6. Denis M, Cuthill S, Wikström AC, Poellinger L, Gustafsson JA (1988). "Association of the dioxin receptor with the Mr 90,000 heat shock protein: a structural kinship with the glucocorticoid receptor". Biochem. Biophys. Res. Commun. 155 (2): 801—7. doi:10.1016/S0006-291X(88)80566-7. PMID 2844180.
  7. Perdew GH (1988). "Association of the Ah receptor with the 90-kDa heat shock protein". J. Biol. Chem. 263 (27): 13802—5. PMID 2843537.
  8. Cox MB, Miller CA (2004). "Cooperation of heat shock protein 90 and p23 in aryl hydrocarbon receptor signaling". Cell Stress Chaperones. 9 (1): 4—20. doi:10.1379/460.1. PMC 1065305. PMID 15270073.
  9. 1 2 Kazlauskas A, Poellinger L, Pongratz I (1999). "Evidence that the co-chaperone p23 regulates ligand responsiveness of the dioxin (Aryl hydrocarbon) receptor". J. Biol. Chem. 274 (19): 13519—24. doi:10.1074/jbc.274.19.13519. PMID 10224120.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  10. Kazlauskas A, Sundström S, Poellinger L, Pongratz I (2001). "The hsp90 chaperone complex regulates intracellular localization of the dioxin receptor". Mol. Cell. Biol. 21 (7): 2594—607. doi:10.1128/MCB.21.7.2594-2607.2001. PMC 86890. PMID 11259606.
  11. 1 2 Shetty PV, Bhagwat BY, Chan WK (2003). "P23 enhances the formation of the aryl hydrocarbon receptor-DNA complex". Biochem. Pharmacol. 65 (6): 941—8. doi:10.1016/S0006-2952(02)01650-7. PMID 12623125.
  12. Meyer BK, Pray-Grant MG, Vanden Heuvel JP, Perdew GH (1998). "Hepatitis B virus X-associated protein 2 is a subunit of the unliganded aryl hydrocarbon receptor core complex and exhibits transcriptional enhancer activity". Mol. Cell. Biol. 18 (2): 978—88. PMC 108810. PMID 9447995.
  13. Ma Q, Whitlock JP (1997). "A novel cytoplasmic protein that interacts with the Ah receptor, contains tetratricopeptide repeat motifs, and augments the transcriptional response to 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin". J. Biol. Chem. 272 (14): 8878—84. doi:10.1074/jbc.272.14.8878. PMID 9083006.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  14. Carver LA, Bradfield CA (1997). "Ligand-dependent interaction of the aryl hydrocarbon receptor with a novel immunophilin homolog in vivo". J. Biol. Chem. 272 (17): 11452—6. doi:10.1074/jbc.272.17.11452. PMID 9111057.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  15. Carver LA, Jackiw V, Bradfield CA (1994). "The 90-kDa heat shock protein is essential for Ah receptor signaling in a yeast expression system". J. Biol. Chem. 269 (48): 30109—12. PMID 7982913.
  16. Pongratz I, Mason GG, Poellinger L (1992). "Dual roles of the 90-kDa heat shock protein hsp90 in modulating functional activities of the dioxin receptor. Evidence that the dioxin receptor functionally belongs to a subclass of nuclear receptors that require hsp90 both for ligand-binding activity and repression of intrinsic DNA binding activity". J. Biol. Chem. 267 (19): 13728—34. PMID 1320028.
  17. Whitelaw M, Pongratz I, Wilhelmsson A, Gustafsson JA, Poellinger L (1993). "Ligand-dependent recruitment of the Arnt coregulator determines DNA recognition by the dioxin receptor". Mol. Cell. Biol. 13 (4): 2504—14. PMC 359572. PMID 8384309.
  18. Carver LA, LaPres JJ, Jain S, Dunham EE, Bradfield CA (1998). "Characterization of the Ah receptor-associated protein, ARA9". J. Biol. Chem. 273 (50): 33580—7. doi:10.1074/jbc.273.50.33580. PMID 9837941.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  19. Petrulis JR, Hord NG, Perdew GH (2000). "Subcellular localization of the aryl hydrocarbon receptor is modulated by the immunophilin homolog hepatitis B virus X-associated protein 2". J. Biol. Chem. 275 (48): 37448—53. doi:10.1074/jbc.M006873200. PMID 10986286.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  20. Petrulis JR, Kusnadi A, Ramadoss P, Hollingshead B, Perdew GH (2003). "The hsp90 Co-chaperone AIP alters importin beta recognition of the bipartite nuclear localization signal of the Ah receptor and represses transcriptional activity". J. Biol. Chem. 278 (4): 2677—85. doi:10.1074/jbc.M209331200. PMID 12431985.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  21. Hogenesch JB, Chan WK, Jackiw VH, Brown RC, Gu YZ, Pray-Grant M, Perdew GH, Bradfield CA (1997). "Characterization of a subset of the basic-helix-loop-helix-PAS superfamily that interacts with components of the dioxin signaling pathway". J. Biol. Chem. 272 (13): 8581—93. doi:10.1074/jbc.272.13.8581. PMID 9079689.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  22. Tian Y, Ke S, Chen M, Sheng T (2003). "Interactions between the aryl hydrocarbon receptor and P-TEFb. Sequential recruitment of transcription factors and differential phosphorylation of C-terminal domain of RNA polymerase II at cyp1a1 promoter". J. Biol. Chem. 278 (45): 44041—8. doi:10.1074/jbc.M306443200. PMID 12917420.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  23. Wormke M, Stoner M, Saville B, Walker K, Abdelrahim M, Burghardt R, Safe S (2003). "The aryl hydrocarbon receptor mediates degradation of estrogen receptor alpha through activation of proteasomes". Mol. Cell. Biol. 23 (6): 1843—55. doi:10.1128/MCB.23.6.1843-1855.2003. PMC 149455. PMID 12612060.
  24. Klinge CM, Kaur K, Swanson HI (2000). "The aryl hydrocarbon receptor interacts with estrogen receptor alpha and orphan receptors COUP-TFI and ERRalpha1". Arch. Biochem. Biophys. 373 (1): 163—74. doi:10.1006/abbi.1999.1552. PMID 10620335.
  25. Beischlag TV, Wang S, Rose DW, Torchia J, Reisz-Porszasz S, Muhammad K, Nelson WE, Probst MR, Rosenfeld MG, Hankinson O (2002). "Recruitment of the NCoA/SRC-1/p160 family of transcriptional coactivators by the aryl hydrocarbon receptor/aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator complex". Mol. Cell. Biol. 22 (12): 4319—33. doi:10.1128/MCB.22.12.4319-4333.2002. PMC 133867. PMID 12024042.
  26. Antenos M, Casper RF, Brown TJ (2002). "Interaction with Nedd8, a ubiquitin-like protein, enhances the transcriptional activity of the aryl hydrocarbon receptor". J. Biol. Chem. 277 (46): 44028—34. doi:10.1074/jbc.M202413200. PMID 12215427.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  27. Kumar MB, Tarpey RW, Perdew GH (1999). "Differential recruitment of coactivator RIP140 by Ah and estrogen receptors. Absence of a role for LXXLL motifs". J. Biol. Chem. 274 (32): 22155—64. doi:10.1074/jbc.274.32.22155. PMID 10428779.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  28. Kim DW, Gazourian L, Quadri SA, Romieu-Mourez R, Sherr DH, Sonenshein GE (2000). "The RelA NF-kappaB subunit and the aryl hydrocarbon receptor (AhR) cooperate to transactivate the c-myc promoter in mammary cells". Oncogene. 19 (48): 5498—506. doi:10.1038/sj.onc.1203945. PMID 11114727.
  29. Ruby CE, Leid M, Kerkvliet NI (2002). "2,3,7,8-Tetrachlorodibenzo-p-dioxin suppresses tumor necrosis factor-alpha and anti-CD40-induced activation of NF-kappaB/Rel in dendritic cells: p50 homodimer activation is not affected". Mol. Pharmacol. 62 (3): 722—8. doi:10.1124/mol.62.3.722. PMID 12181450.
  30. Vogel CF, Sciullo E, Li W, Wong P, Lazennec G, Matsumura F (2007). "RelB, a new partner of aryl hydrocarbon receptor-mediated transcription". Molecular Endocrinology (Baltimore, Md.). 21 (12): 2941—55. doi:10.1210/me.2007-0211. PMC 2346533. PMID 17823304.
  31. Ge NL, Elferink CJ (1998). "A direct interaction between the aryl hydrocarbon receptor and retinoblastoma protein. Linking dioxin signaling to the cell cycle". J. Biol. Chem. 273 (35): 22708—13. doi:10.1074/jbc.273.35.22708. PMID 9712901.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)