HCFC1

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Хостфактор клеток C1
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

4GO6, 4N39, 4N3A, 4N3B, 4N3C

Идентификаторы
Символ HCFC1 ; CFF; HCF-1; HCF1; HFC1; MRX3; PPP1R89; VCAF
Внешние ID OMIM: 300019 MGI: 105942 HomoloGene: 3898 GeneCards: Ген HCFC1
Генная онтология
Функция • chromatin binding

• sequence-specific DNA binding transcription factor activity
• transcription coactivator activity
• protein binding
• identical protein binding
• histone acetyltransferase activity (H4-K5 specific)
• histone acetyltransferase activity (H4-K8 specific)

• histone acetyltransferase activity (H4-K16 specific)
Компонент клетки • histone acetyltransferase complex

• nucleus
• nucleoplasm
• Ada2/Gcn5/Ada3 transcription activator complex
• nucleolus
• cytoplasm
• mitochondrion
• membrane
• neuronal cell body
• Set1C/COMPASS complex
• SAGA-type complex
• MLL5-L complex

• MLL1 complex
Биологический процесс • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

• chromatin organization
• regulation of transcription, DNA-templated
• transcription from RNA polymerase II promoter
• cell cycle
• positive regulation of gene expression
• release from viral latency
• regulation of protein complex assembly
• histone H4-K5 acetylation
• histone H4-K8 acetylation
• histone H4-K16 acetylation
• positive regulation of cell cycle

• protein stabilization
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 3054 15161
Ensembl ENSG00000172534 ENSMUSG00000031386
UniProt P51610 Q61191
RefSeq (мРНК) NM_005334 NM_008224
RefSeq (белок) NP_005325 NP_032250
Локус (UCSC) Chr HG1497_PATCH:
153.12 – 153.14 Mb		 Chr X:
73.94 – 73.97 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Хостфактор клеток 1 (HCFC1, HCF1 или HCF-1), также известный как VP16-вспомогательный белок[1] — белок, который у человека кодируется геном HCFC1 [2][3].

Структура[править | править код]

HCF1 является членом высококонсервативного семейства хостфакторов клеток и кодирует белок с пятью Kelch[en]*-повторами, фибронектино-подобным мотивом, и шестью HCF-повторами, каждый из которых имеет весьма специфичный сигнал расщепления. Это ядерный транскрипционный корегулятор[en] протеолитически расщеплённый на один или более из шести возможных сайтов, в результате чего создаётся N-концевая цепь и соответствующая С-концевая цепь. Окончательная форма этого белка состоит из нековалентно связанных N- и С-концевых цепей, которые взаимодействуют с помощью электростатических сил.

Функция[править | править код]

HCF1 участвует в управлении клеточным циклом, а также имеет регуляторную роль во множестве процессов, связанных с транскрипцией. Кроме того, работы с модельными организмами указывают на HCF1, как на фактор, предположительно определяющий долголетие[4]. Существуют варианты сплайсинга, кодирующие разные изоформы белка, однако, не все варианты были полностью охарактеризованы[3].

Мутации в этом гене были связаны с нарушениями метаболизма кобаламина. ( https://dx.doi.org/10.1016/j.ajhg.2013.07.022 )

Взаимодействия[править | править код]

Хостфактор клеток C1, как было выявлено, взаимодействует с:

Примечания[править | править код]

  1. ↑ GeneCards entry for HCFC1 Архивная копия от 31 января 2013 на Wayback Machine, http://genecards.org Архивировано 14 октября 2013 года.
  2. ↑ Wilson A.C., LaMarco K., Peterson M.G., Herr W. The VP16 accessory protein HCF is a family of polypeptides processed from a large precursor protein (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1993. — August (vol. 74, no. 1). — P. 115—125. — doi:10.1016/0092-8674(93)90299-6. — PMID 8392914.
  3. ↑ 1 2 Entrez Gene: HCFC1 host cell factor C1 (VP16-accessory protein).
  4. ↑ Li J., Ebata A., Dong Y., Rizki G., Iwata T., Lee S.S. Caenorhabditis elegans HCF-1 functions in longevity maintenance as a DAF-16 regulator (англ.) // PLoS Biol. : journal. — 2008. — September (vol. 6, no. 9). — P. e233. — doi:10.1371/journal.pbio.0060233. — PMID 18828672. — PMC 2553839.
  5. ↑ Machida Y.J., Machida Y., Vashisht A.A., Wohlschlegel J.A., Dutta A. The deubiquitinating enzyme BAP1 regulates cell growth via interaction with HCF-1 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2009. — December (vol. 284, no. 49). — P. 34179—34188. — doi:10.1074/jbc.M109.046755. — PMID 19815555. — PMC 2797188.
  6. ↑ Lu R., Yang P., Padmakumar S., Misra V. The herpesvirus transactivator VP16 mimics a human basic domain leucine zipper protein, luman, in its interaction with HCF (англ.) // J. Virol.  (англ.) (рус. : journal. — 1998. — August (vol. 72, no. 8). — P. 6291—6297. — PMID 9658067. — PMC 109766.
  7. ↑ Freiman R.N., Herr W. Viral mimicry: common mode of association with HCF by VP16 and the cellular protein LZIP (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1997. — December (vol. 11, no. 23). — P. 3122—3127. — doi:10.1101/gad.11.23.3122. — PMID 9389645. — PMC 316754.
  8. ↑ Vogel J.L., Kristie T.M. The novel coactivator C1 (HCF) coordinates multiprotein enhancer formation and mediates transcription activation by GABP (англ.) // EMBO J.  (англ.) (рус. : journal. — 2000. — February (vol. 19, no. 4). — P. 683—690. — doi:10.1093/emboj/19.4.683. — PMID 10675337. — PMC 305606.
  9. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 Wysocka J., Myers M.P., Laherty C.D., Eisenman R.N., Herr W. Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1 (англ.) // Genes Dev. : journal. — 2003. — April (vol. 17, no. 7). — P. 896—911. — doi:10.1101/gad.252103. — PMID 12670868. — PMC 196026.
  10. ↑ 1 2 3 Yokoyama A., Wang Z., Wysocka J., Sanyal M., Aufiero D.J., Kitabayashi I., Herr W., Cleary M.L. Leukemia proto-oncoprotein MLL forms a SET1-like histone methyltransferase complex with menin to regulate Hox gene expression (англ.) // Mol. Cell. Biol.  (англ.) (рус. : journal. — 2004. — July (vol. 24, no. 13). — P. 5639—5649. — doi:10.1128/MCB.24.13.5639-5649.2004. — PMID 15199122. — PMC 480881.
  11. ↑ Scarr R.B., Sharp P.A. PDCD2 is a negative regulator of HCF-1 (C1) (англ.) // Oncogene  (англ.) (рус.. — 2002. — August (vol. 21, no. 34). — P. 5245—5254. — doi:10.1038/sj.onc.1205647. — PMID 12149646.
  12. ↑ La Boissière S., Hughes T., O'Hare P. HCF-dependent nuclear import of VP16 (англ.) // EMBO J.  (англ.) (рус. : journal. — 1999. — January (vol. 18, no. 2). — P. 480—489. — doi:10.1093/emboj/18.2.480. — PMID 9889203. — PMC 1171141.
  13. ↑ Kristie T.M., Sharp P.A. Purification of the cellular C1 factor required for the stable recognition of the Oct-1 homeodomain by the herpes simplex virus alpha-trans-induction factor (VP16) (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1993. — March (vol. 268, no. 9). — P. 6525—6534. — PMID 8454622.
  14. ↑ Ajuh P.M., Browne G.J., Hawkes N.A., Cohen P.T., Roberts S.G., Lamond A.I. Association of a protein phosphatase 1 activity with the human factor C1 (HCF) complex (англ.) // Nucleic Acids Res.  (англ.) (рус. : journal. — 2000. — February (vol. 28, no. 3). — P. 678—686. — doi:10.1093/nar/28.3.678. — PMID 10637318. — PMC 102561.
  15. ↑ Gunther M., Laithier M., Brison O. A set of proteins interacting with transcription factor Sp1 identified in a two-hybrid screening (англ.) // Mol. Cell. Biochem.  (англ.) (рус. : journal. — 2000. — July (vol. 210, no. 1—2). — P. 131—142. — doi:10.1023/A:1007177623283. — PMID 10976766.
  16. ↑ Piluso D., Bilan P., Capone J.P. Host cell factor-1 interacts with and antagonizes transactivation by the cell cycle regulatory factor Miz-1 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — November (vol. 277, no. 48). — P. 46799—46808. — doi:10.1074/jbc.M206226200. — PMID 12244100.

Литература[править | править код]

  • Oehler T., Angel P. A common intermediary factor (p52/54) recognizing "acidic blob"-type domains is required for transcriptional activation by the Jun proteins (англ.) // Mol. Cell. Biol.  (англ.) (рус. : journal. — 1992. — Vol. 12, no. 12. — P. 5508—5515. — PMID 1448082. — PMC 360488.
  • Wilson A.C., Peterson M.G., Herr W. The HCF repeat is an unusual proteolytic cleavage signal (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1995. — Vol. 9, no. 20. — P. 2445—2458. — doi:10.1101/gad.9.20.2445. — PMID 7590226.
  • Klemm R.D., Goodrich J.A., Zhou S., Tjian R. Molecular cloning and expression of the 32-kDa subunit of human TFIID reveals interactions with VP16 and TFIIB that mediate transcriptional activation (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1995. — Vol. 92, no. 13. — P. 5788—5792. — doi:10.1073/pnas.92.13.5788. — PMID 7597030. — PMC 41586.
  • Frattini A., Faranda S., Redolfi E., et al. Genomic organization of the human VP16 accessory protein, a housekeeping gene (HCFC1) mapping to Xq28 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1995. — Vol. 23, no. 1. — P. 30—5. — doi:10.1006/geno.1994.1455. — PMID 7829097.
  • Kristie T.M., Pomerantz J.L., Twomey T.C., et al. The cellular C1 factor of the herpes simplex virus enhancer complex is a family of polypeptides (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1995. — Vol. 270, no. 9. — P. 4387—4394. — doi:10.1074/jbc.270.9.4387. — PMID 7876203.
  • Kristie T.M., Sharp P.A. Purification of the cellular C1 factor required for the stable recognition of the October–1 homeodomain by the herpes simplex virus alpha-trans-induction factor (VP16) (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1993. — Vol. 268, no. 9. — P. 6525—6534. — PMID 8454622.
  • Zoppè M., Frattini A., Faranda S., Vezzoni P. The complete sequence of the host cell factor 1 (HCFC1) gene and its promoter: a role for YY1 transcription factor in the regulation of its expression (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1996. — Vol. 34, no. 1. — P. 85—91. — doi:10.1006/geno.1996.0244. — PMID 8661027.
  • Wilson A.C., Freiman R.N., Goto H., et al. VP16 targets an amino-terminal domain of HCF involved in cell cycle progression (англ.) // Mol. Cell. Biol.  (англ.) (рус. : journal. — 1997. — Vol. 17, no. 10. — P. 6139—6146. — PMID 9315674. — PMC 232464.
  • Freiman R.N., Herr W. Viral mimicry: common mode of association with HCF by VP16 and the cellular protein LZIP (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1998. — Vol. 11, no. 23. — P. 3122—3127. — doi:10.1101/gad.11.23.3122. — PMID 9389645. — PMC 316754.
  • Lu R., Yang P., Padmakumar S., Misra V. The herpesvirus transactivator VP16 mimics a human basic domain leucine zipper protein, luman, in its interaction with HCF (англ.) // J. Virol.  (англ.) (рус. : journal. — 1998. — Vol. 72, no. 8. — P. 6291—6297. — PMID 9658067. — PMC 109766.
  • Ge H., Si Y., Roeder R.G. Isolation of cDNAs encoding novel transcription coactivators p52 and p75 reveals an alternate regulatory mechanism of transcriptional activation (англ.) // EMBO J.  (англ.) (рус. : journal. — 1999. — Vol. 17, no. 22. — P. 6723—6729. — doi:10.1093/emboj/17.22.6723. — PMID 9822615. — PMC 1171017.
  • La Boissière S., Hughes T., O'Hare P. HCF-dependent nuclear import of VP16 (англ.) // EMBO J.  (англ.) (рус. : journal. — 1999. — Vol. 18, no. 2. — P. 480—489. — doi:10.1093/emboj/18.2.480. — PMID 9889203. — PMC 1171141.
  • Lu R., Misra V. Potential role for luman, the cellular homologue of herpes simplex virus VP16 (alpha gene trans-inducing factor), in herpesvirus latency (англ.) // J. Virol.  (англ.) (рус. : journal. — 2000. — Vol. 74, no. 2. — P. 934—943. — doi:10.1128/JVI.74.2.934-943.2000. — PMID 10623756. — PMC 111614.
  • Mahajan S.S., Wilson A.C. Mutations in host cell factor 1 separate its role in cell proliferation from recruitment of VP16 and LZIP (англ.) // Mol. Cell. Biol.  (англ.) (рус. : journal. — 2000. — Vol. 20, no. 3. — P. 919—928. — doi:10.1128/MCB.20.3.919-928.2000. — PMID 10629049. — PMC 85209.
  • Ajuh P.M., Browne G.J., Hawkes N.A., et al. Association of a protein phosphatase 1 activity with the human factor C1 (HCF) complex (англ.) // Nucleic Acids Res.  (англ.) (рус. : journal. — 2000. — Vol. 28, no. 3. — P. 678—686. — doi:10.1093/nar/28.3.678. — PMID 10637318. — PMC 102561.
  • Vogel J.L., Kristie T.M. The novel coactivator C1 (HCF) coordinates multiprotein enhancer formation and mediates transcription activation by GABP (англ.) // EMBO J.  (англ.) (рус. : journal. — 2000. — Vol. 19, no. 4. — P. 683—690. — doi:10.1093/emboj/19.4.683. — PMID 10675337. — PMC 305606.
  • Scarr R.B., Smith M.R., Beddall M., Sharp P.A. A novel 50-kilodalton fragment of host cell factor 1 (C1) in G(0) cells (англ.) // Mol. Cell. Biol.  (англ.) (рус. : journal. — 2000. — Vol. 20, no. 10. — P. 3568—3575. — doi:10.1128/MCB.20.10.3568-3575.2000. — PMID 10779346. — PMC 85649.
  • Choi Y., Asada S., Uesugi M. Divergent hTAFII31-binding motifs hidden in activation domains (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 21. — P. 15912—15916. — doi:10.1074/jbc.275.21.15912. — PMID 10821850.
  • Lu R., Misra V. Zhangfei: a second cellular protein interacts with herpes simplex virus accessory factor HCF in a manner similar to Luman and VP16 (англ.) // Nucleic Acids Res.  (англ.) (рус. : journal. — 2000. — Vol. 28, no. 12. — P. 2446—2454. — doi:10.1093/nar/28.12.2446. — PMID 10871379. — PMC 102720.
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=HCFC1&oldid=122193205