SARS-CoV-2: различия между версиями
[отпатрулированная версия] | [непроверенная версия] |
Ailbeve (обсуждение | вклад) +карточка универсальная |
Нет описания правки |
||
Строка 6: | Строка 6: | ||
== Вирусология == |
== Вирусология == |
||
Последовательности {{iw|Бетакоронавирус|бетакоронавируса|en|Betacoronavirus}} обнаруживают сходство с бетакоронавирусами, выявленными у [[Рукокрылые|летучих мышей]]. Однако вирус генетически отличается от других коронавирусов, вызывающих [[тяжёлый острый респираторный синдром]] (SARS-CoV) и [[ближневосточный респираторный синдром]] (MERS-CoV)<ref>{{Cite web|title=Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses|url=https://nextstrain.org/groups/blab/sars-like-cov|website=nextstrain|accessdate=18 January 2020}}</ref>. 2019-nCoV, как и SARS-CoV, является членом линии Beta-CoV B<ref>{{Cite web|title=Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses|url=https://nextstrain.org/groups/blab/sars-like-cov|website=nextstrain|accessdate=18 January 2020}}</ref>. |
|||
== Примечания == |
== Примечания == |
Версия от 10:38, 21 января 2020
SARS-CoV-2 | |
---|---|
![]() | |
Официальное название |
англ. severe acute respiratory syndrome coronavirus 2[1] фр. coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère[2] араб. فيروس كورونا المسبب للمتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة[3] кит. 严重急性呼吸综合征冠状病毒2[4] исп. coronavirus de tipo 2 causante del síndrome respiratorio agudo severo[5] коронавирус тяжелого острого респираторного синдрома‑2[6] |
Краткое имя/название | SARS-CoV-2[1], SARS-CoV-2[7], SRAS-CoV-2[8], SARS-CoV-2[9], SARS-CoV-2[5], SRAS-CoV-2[6] и SRAS-CoV-2[4] |
Международное научное название |
|
Таксономический ранг | вид |
Ближайший таксон уровнем выше | Sarbecovirus[вд][10][11][…] |
Народное название таксона | severe acute respiratory syndrome coronavirus 2[12][11] и SARS-CoV-2[11] |
Названо в честь | Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus[вд] |
Первооткрыватель или изобретатель | Zhang Jixian[вд] |
Дата открытия (изобретения) | декабрь 2019 |
Место обнаружения | Ухань |
Размер генома | 29 903 спаренные основания[13][14] |
Взаимодействует с | Transmembrane serine protease 2[вд][15][16] и гепарин[17] |
Уровень биологической безопасности | biosafety level 3[вд][18][19] |
Метод изготовления | естественный отбор[20] |
Носитель возбудителя инфекции | неизвестно[21] |
Носитель | H. sapiens[22][23], F. catus[вд][24], C. familiaris[вд][25], VeroE6/TMPRSS2[вд][26][27], Vero C1008[вд][27], Caco-2[вд][27], Calu-3[вд][27], HEK293T[вд][27] и Huh7[27] |
Risk group | risk group 3 agent (high individual risk, low community risk)[вд] |
ICTV virus genome composition | одноцепочечные РНК-вирусы с позитивной цепью[вд] |
Entry receptor | angiotensin I converting enzyme 2[вд][28][29][…] |
URL секвенированного генома | ncbi.nlm.nih.gov/nuccore… |
![]() |
Новый коро̀нави́рус, обозначенный Всемирной организацией здравоохранения как 2019-nCoV[30][31], также известный как коронавирус Уха́ня, вирус пневмонии на рынке морепродуктов Уханя и пневмония Уханя[32] — одноцепочечный коронавирус РНК, впервые обнаруженный в 2019 году после тестирования нуклеиновой кислоты на положительной пробе у пациента с пневмонией во время вспышки пневмонии в Ухане 2019—2020 годов[укр.][33][34][35].
По данным ВОЗ, возможна ограниченная передача этого коронавируса от человека к человеку в пределах семей пациентов, и возможны более широкие вспышки. Пока не существует специфического лечения нового вируса, но существующие антивирусные препараты могут быть «повторно назначены»[36].
Вирусология
Последовательности бетакоронавируса[англ.] обнаруживают сходство с бетакоронавирусами, выявленными у летучих мышей. Однако вирус генетически отличается от других коронавирусов, вызывающих тяжёлый острый респираторный синдром (SARS-CoV) и ближневосточный респираторный синдром (MERS-CoV)[37]. 2019-nCoV, как и SARS-CoV, является членом линии Beta-CoV B[38].
Примечания
- ↑ 1 2 https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/naming-the-coronavirus-disease-(covid-2019)-and-the-virus-that-causes-it
- ↑ https://www.who.int/fr/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/naming-the-coronavirus-disease-(covid-2019)-and-the-virus-that-causes-it (фр.)
- ↑ https://www.who.int/ar/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/naming-the-coronavirus-disease-(covid-2019)-and-the-virus-that-causes-it (араб.)
- ↑ 1 2 https://www.who.int/zh/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/naming-the-coronavirus-disease-(covid-2019)-and-the-virus-that-causes-it
- ↑ 1 2 https://www.who.int/es/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/naming-the-coronavirus-disease-(covid-2019)-and-the-virus-that-causes-it
- ↑ 1 2 https://www.who.int/ru/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/naming-the-coronavirus-disease-(covid-2019)-and-the-virus-that-causes-it
- ↑ https://www.who.int/fr/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/naming-the-coronavirus-disease-(covid-2019)-and-the-virus-that-causes-it
- ↑ http://gdt.oqlf.gouv.qc.ca/ficheOqlf.aspx?Id_Fiche=26557605
- ↑ https://www.who.int/ar/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/naming-the-coronavirus-disease-(covid-2019)-and-the-virus-that-causes-it
- ↑ https://ictv.global/msl/current
- ↑ 1 2 3 https://ictv.global/report/chapter/coronaviridae/taxonomy/coronaviridae
- ↑ Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses, Gorbalenya A. E., Baker S. C., Drosten C., Haagmans B. L., Neuman B. W., Perlman S., Poon L. L. M., Sidorov I., Sola I. et al. The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2 (англ.) // Nature Microbiology — Springer Nature, Springer Science+Business Media, 2020. — Vol. 5, Iss. 4. — P. 536—544. — ISSN 2058-5276 — doi:10.1038/S41564-020-0695-Z — PMID:32123347
- ↑ https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/MN908947
- ↑ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN908947
- ↑ Hoffmann M., Kleine-Weber H., Schroeder S., Krüger N., Herrler T., Erichsen S., Schiergens T. S., Herrler G., Wu N., Müller M. A. et al. SARS-CoV-2 Cell Entry Depends on ACE2 and TMPRSS2 and Is Blocked by a Clinically Proven Protease Inhibitor (англ.) // Cell — Cell Press, Elsevier BV, 2020. — ISSN 0092-8674; 1097-4172 — doi:10.1016/J.CELL.2020.02.052 — PMID:32142651
- ↑ Hoffmann M., Kleine-Weber H., Krüger N., Müller M. A., Drosten C., Pöhlmann S. The novel coronavirus 2019 (2019-nCoV) uses the SARS-coronavirus receptor ACE2 and the cellular protease TMPRSS2 for entry into target cells — 2020. — doi:10.1101/2020.01.31.929042
- ↑ Kim S. Y., Jin W., Sood A., Montgomery D. W., Grant O. C., Fuster M. M., Fu L., Dordick J. S., Woods R. J., Zhang F. et al. Characterization of heparin and severe acute respiratory syndrome-related coronavirus 2 (SARS-CoV-2) spike glycoprotein binding interactions (англ.) // Antiviral Research — Elsevier BV, 2020. — P. 104873. — ISSN 0166-3542; 1872-9096 — doi:10.1016/J.ANTIVIRAL.2020.104873 — PMID:32653452
- ↑ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7524674/
- ↑ https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/lab/lab-biosafety-guidelines.html
- ↑ Andersen K. G., Rambaut A., Lipkin W. I., Garry R. F. The proximal origin of SARS-CoV-2 (англ.) // Nature Medicine — NPG, Springer Science+Business Media, 2020. — Vol. 26, Iss. 4. — P. 450—452. — 3 p. — ISSN 1078-8956; 1546-170X — doi:10.1038/S41591-020-0820-9 — PMID:32284615
- ↑ http://virological.org/t/ncov-2019-codon-usage-and-reservoir-not-snakes-v2/339/4
- ↑ http://virological.org/t/epidemiological-data-from-the-ncov-2019-outbreak-early-descriptions-from-publicly-available-data/337
- ↑ https://www.nature.com/articles/s41586-020-2169-0
- ↑ Zhang Q., Zhang H., Huang K., Yang Y., Hui X., Gao J., He X., Li C., Gong W., Zhang Y. и др. SARS-CoV-2 neutralizing serum antibodies in cats: a serological investigation — 2020. — doi:10.1101/2020.04.01.021196
- ↑ Sit T. H. C., Sit T. H. C., Brackman C. J., Tam K. W. S., Law P. Y. T., Ip S. M., Yu V. Y. T., Sims L. D., Tsang D. N. C., Tam K. W. S. et al. Infection of dogs with SARS-CoV-2 (англ.) // Nature / M. Skipper — NPG, Springer Science+Business Media, 2020. — ISSN 1476-4687; 0028-0836 — doi:10.1038/S41586-020-2334-5 — PMID:32408337
- ↑ Matsuyama S., Nao N., Shirato K., Kawase M., Saito S., Takayama I., Nagata N., Sekizuka T., Kato F., Sakata M. et al. Enhanced isolation of SARS-CoV-2 by TMPRSS2-expressing cells (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America / M. R. Berenbaum — Washington, D.C., United States of America: National Academy of Sciences [etc.], 2020. — Vol. 117, Iss. 13. — P. 7001—7003. — ISSN 0027-8424; 1091-6490 — doi:10.1073/PNAS.2002589117 — PMID:32165541
- ↑ 1 2 3 4 5 6 https://web.expasy.org/cellosaurus/sars-cov-2.html
- ↑ Zhou P., Yang X., Wang X., Wang X., Hu B., Zhang L., Si H., Zhang W., Si H., Zhu Y. et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin (англ.) // Nature / M. Skipper — NPG, Springer Science+Business Media, 2020. — Vol. 579, Iss. 7798. — P. 270—273. — ISSN 1476-4687; 0028-0836 — doi:10.1038/S41586-020-2012-7 — PMID:32015507
- ↑ https://www.genengnews.com/news/sars-cov-2-uses-a-second-receptor-neuropilin-1-to-infect-human-cells/
- ↑ Surveillance case definitions for human infection with novel coronavirus (nCoV)
- ↑ Novel coronavirus (2019-nCoV), Wuhan, China . Cdc.gov (10 января 2020). Дата обращения: 16 января 2020.
- ↑ Zhang, Y.-Z.; et al. (12 January 2020). "Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome". GenBank (англ.). Bethesda MD. Дата обращения: 13 января 2020.
- ↑ 中国疾病预防控制中心 . www.chinacdc.cn. Дата обращения: 9 января 2020.
- ↑ New-type coronavirus causes pneumonia in Wuhan: expert – Xinhua | English.news.cn . www.xinhuanet.com. Дата обращения: 9 января 2020.
- ↑ CoV2020 . platform.gisaid.org. Дата обращения: 12 января 2020.
- ↑ WHO says new China coronavirus could spread, warns hospitals worldwide
- ↑ Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses . nextstrain. Дата обращения: 18 января 2020.
- ↑ Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses . nextstrain. Дата обращения: 18 января 2020.