Здесь находятся завершившиеся обсуждения. Просьба не вносить изменений.
Ещё одна статья о важнейшем биохимическом процессе. В дальнейшем планирую выставить статью КХС или КИС, в зависимости от того, что получится по итогам рецензирования. Как мне кажется, тема для КИС раскрыта достаточно полно, однако очень хотелось бы услышать мнения коллег о том, чего всё-таки не хватает и что ещё надо улучшить, какие проскакивают ляпы и неточности. Стиль, естественно, далеко не безупречен, поэтому замечания по стилю также очень приветствуются. Буду очень рада, если кто-нибудь поможет русифицировать картинки, потому что мои технические возможности в этом деле ограничены. С уважением, --Eruvanda12:45, 26 июля 2014 (UTC)[ответить]
Если в гликолизе я полностью согласен с тем, чтобы разделы назывались Стадия 1, стадия 2... то в ЦИКЛЕ это, на мой взгляд, несколько некорректно. --Sirozha.ru15:27, 26 июля 2014 (UTC)[ответить]
Может, никак и не называть? Раздел назвать "стадии" вместо "механизм" (вообще механизм может быть у конкретной реакции), и далее подразделы "образование цитрата" и так далее до "окисление малата до оксалоацетата"
Нет, никак не называть не получится, иначе на эти стадии никак не сошлёшься, если не пронумеровать их. А чем не подходит Стадия 1, стадия 2...? --Eruvanda14:49, 10 августа 2014 (UTC)[ответить]
Учитывая то, что этот цикл играет КЛЮЧЕВУЮ роль в метаболизме, например, практически всех аминокислот. И информацию, изложенную в разделе "анаплеротические реакции", а также некоторые современные данные об особенностях цикла в разных клетках, не следует так вот объявлять его посредником между гликолизом и дыхательной цепью. --Sirozha.ru15:27, 26 июля 2014 (UTC)[ответить]
И можете указать, пожалуйста, где ЦТК называется «посредником между гликолизом и дыхательной цепью»? Что-то на мой замыленный взгляд они не попадаются... Мне кажется, наоборот тут и там говорится о неэнергетических функциях ЦТК. --Eruvanda18:03, 26 июля 2014 (UTC)[ответить]
Странно, но 26 июля у меня сложилось именно такое впечатление. Сегодня читаю и наоборот мне показалось, что с методической точки зрения во введении неплохо бы изложить значение ЦТК как промежуточного этапа между гликолизом и ЭТЦ. --Sirozha.ru13:44, 27 июля 2014 (UTC)[ответить]
Кстати, гликолиз заканчивается пируватом, ЦТК начинается ацетатом (Ас-S-СоА). Вы планируете написать статью про ПДК, или может быть, добавить информацию об этой важной стадии между гликолизом и ЦТК в одну из этих статей? --Sirozha.ru15:27, 26 июля 2014 (UTC)[ответить]
Комментарий: Странно, что я ее не заметил, когда искал про пируватдегидрогеназный комплекс. Статья о ПДК находится в зачаточно-плачевном состоянии. Обе эти статьи в формате энциклопедии не обязательно нужны, может, стоит сделать редирект с ПДК на Окислительное декарбоксилирование? Но это так, оффтоп. -Sirozha.ru13:44, 27 июля 2014 (UTC)[ответить]
Ой, а может Вы сможете их на Викисклад загрузить? Я, в принципе, и сама могу сделать, но, если у Вас нет там аккаунта, то я не знаю, как указать, что именно Вы перевели подписи... --Eruvanda18:27, 10 августа 2014 (UTC)[ответить]
Хорошо, теперь я понял. :) Я имею в виду, что нужно обязательно уточнить, что из цитрата образуется AcCoA и то, что цитрат — регулятор. Это всё резко проясняет. --Shell13:18, 24 августа 2014 (UTC)[ответить]
В таком случае нужно также прояснить, каким таким боком и коим образом оксалоацетат — предшественник аргинина. Кольман и Рём этот момент как-то объясняют? Описывают путь биосинтеза аргинина, отмечают прекурсорную роль в нём именно оксалоацетата? --Shell13:18, 24 августа 2014 (UTC)[ответить]
Нет, у них нет пояснений на этот счёт. Удалила это, потому что иных подтверждений образованию аргинина из оксалоацетата мне найти не удалось. --Eruvanda (обс) 15:08, 29 августа 2014 (UTC)[ответить]
Очевидно, что глиоксилатный шунт способен выполнять анаплеротическую функцию. Почему же в подразделе «Анаплеротические пути» о нём не упоминается? ИМХО, нужно упомянуть. --Shell23:26, 21 августа 2014 (UTC)[ответить]
«цитратсинтазная реакция представляет собой конденсацию Клайзена» Цитратсинтазная реакция — не есть конденсация Кляйзена (!), более верно было бы написать так: «происходит по типу альдольной конденсации». --Shell00:21, 24 августа 2014 (UTC)[ответить]
В статье Конденсация Клайзена написано, то можно и Клайзена, и Кляйзена. Пожалуйста, приведите АИ для Вашего варианта. Информация про конденсацию Клайзена в цитратсинтазной реакции есть в Ленинджере, т. е. она подтверждена АИ. --Eruvanda08:51, 24 августа 2014 (UTC)[ответить]
Эфир (AcCoA) выступает метиленовой компонентой, в качестве карбонильной компоненты — кетон (оксалоацетат). Это есть альдольная конденсация. Ну ладно, если думаете, что разница между альдольной конденсацией и конденсацией Кляйзена (хорошо характеризует конденсацию Кляйзена синоним: ацилирование по Кляйзену) неочевидна, я попробую подыскать подходящие АИ. --Shell 13:18, 24 августа 2014 (UTC) P. S. 1, 2; «aldol-like condensation» на русском правильно будет «по типу альдольной конденсации». --Shell15:43, 24 августа 2014 (UTC)[ответить]
Вот что пишет нам "Биохимия Ленинджера": по сути это конденсация Клайзена The reaction catalyzed by citrate synthase is essentially a Claisen condensation, involving a thioester (AcCoA) and ketone (Ox-Ac) Lehninger biochemistry, 4 Ed, 2005 p.608 --Sirozha.ru02:30, 25 августа 2014 (UTC)[ответить]
Не стоит игнорировать хорошо обоснованное мнение множества других авторов, которые считают, что цитратсинтазная, гомоцитратсинтазная, цитрамалатсинтазная, 2-изопропилмалатсинтазная и прочие подобные «carboxymethyl-forming» реакции происходят по типу альдольной конденсации (aldol-type reaction), а по типу конденсации Кляйзена — ацилтрансферазные реакции другого типа (тиоэфир в этих реакциях играет роль карбонильной компоненты), например, реакция, которую катализирует тиолаза (образование ацетоацетил-CoA из AcCoA). Показательно описание вот здесь мевалонатного пути, в котором первый и второй шаги как раз являются примерами разных типов коденсаций. И да, ещё. Когда ссылаются на фразу, когда цитируют, то хорошим тоном (в том числе и по отношению к автору цитаты) является дословное цитирование, без всяких мелких искажений. --Shell13:41, 25 августа 2014 (UTC)[ответить]
Чисто для быстроты набора. Это вообще довольно принятая в ру-ВП практика — записываемые латинскими буквами названия писать кириллическими буквами, которые совпадают в латинице и кириллице. Мне кажется, что в нашем случае это необязательно исправлять (не название же статьи, в конце концов), и можно не тратить на это время. --Eruvanda (обс) 14:51, 29 августа 2014 (UTC)[ответить]
Сделано, вкратце указала, так как подробнее это раскрывается по тексту статьи. --Eruvanda 14:49, 10 августа 2014 (UTC)
Комментарий: Странно, что я ее не заметил, когда искал про пируватдегидрогеназный комплекс. Статья о ПДК находится в зачаточно-плачевном состоянии. Обе эти статьи в формате энциклопедии не обязательно нужны, может, стоит сделать редирект с ПДК на Окислительное декарбоксилирование? Но это так, оффтоп. -Sirozha.ru 13:44, 27 июля 2014 (UTC)
