Метод Trim-Away
Метод Trim-Away — это метод быстрой принудительной высокоизбирательной (селективной) деградации эндогенных белков в клетках млекопитающих, который не требует предварительной модификации генома или матричной РНК. Поскольку избирательность метода Trim-Away основана на использовании антител, его можно применять к широкому спектру белков-мишеней с использованием готовых моноклональных антител. Trim-Away позволяет исследовать функцию белка в самых разных типах клеток[1][2]. Разработан под началом Мелины Шух в сотрудничестве с Dean Clift[3].
Принцип действия
[править | править код]В основе метода лежит использование лигазы убиквитина - TRIM21, которая связывается с высоким сродством с доменом кристаллизующегося фрагмента иммуноглобулина Fc антител[4]. Во время заражения TRIM21 транспортирует систему убиквитин-протеасом к связанным с антителом патогенам, что приводит к их разрушению. Разработаны многочисленные модификации этого метода[5].
PROTAC
[править | править код]Широкое распространение получили также методы PROTAC (PROteolysis TArgeting Chimeras) использующие гетеробифункциональные молекулы, которые соединяют белок подлежащий удалению с E3 убиквитин-лигазой[6][7].
Примечания
[править | править код]- ↑ Clift D., McEwan W. A., Labzin L. I., Konieczny V., Mogessie B., James L. C., Schuh M. A Method for the Acute and Rapid Degradation of Endogenous Proteins. (англ.) // Cell. — 2017. — doi:10.1016/j.cell.2017.10.033. — PMID 29153837.
- ↑ How to destroy any protein in any cell Архивная копия от 1 декабря 2017 на Wayback Machine. ScienceDaily, 16 November 2017, Max-Planck-Gesellschaft.
- ↑ Melina Schuh awarded the EMBO Gold Medal - MRC Laboratory of Molecular Biology. Дата обращения: 1 марта 2019. Архивировано 2 марта 2019 года.
- ↑ James L. C., Keeble A. H., Khan Z., Rhodes D. A., Trowsdale J. Structural basis for PRYSPRY-mediated tripartite motif (TRIM) protein function. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. — 2007. — Vol. 104, no. 15. — P. 6200—6205. — doi:10.1073/pnas.0609174104. — PMID 17400754.
- ↑ Röth, S., Fulcher, L. J., & Sapkota, G. P. (2019). Advances in targeted degradation of endogenous proteins. Cellular and Molecular Life Sciences, 76(14), 2761–2777 doi:10.1007/s00018-019-03112-6 PMC 6588652
- ↑ Sun, X., Gao, H., Yang, Y., He, M., Wu, Y., Song, Y., ... & Rao, Y. (2019). PROTACs: great opportunities for academia and industry. Signal Transduction and Targeted Therapy, 4, 64(2019). doi:10.1038/s41392-019-0101-6 PMC 6927964
- ↑ Gao, H., Sun, X., & Rao, Y. (2020). PROTAC Technology: Opportunities and Challenges. ACS Medicinal Chemistry Letters, 11(3), 237-240. https://doi.org/10.1021/acsmedchemlett.9b00597