GAMESS (US)

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
GAMESS
Тип ПО для вычислительной химии
Разработчик Iowa State University Quantum Chemistry Group
Операционная система Linux, FreeBSD, Unix и UNIX-подобные операционные системы, Microsoft Windows, Mac OS X
Последняя версия 20130501.1 (1 мая 2013)
Лицензия No cost license
Сайт msg.chem.iastate.edu/gam…

GAMESS (US) — программа пакета вычислительной квантовой химии.[1][2][3] Аббревиатура расшифровывается как General Atomic and Molecular Electronic Structure System. В 1981 году появилось две стабильных ветви GAMESS: GAMESS (US) и GAMESS (UK), с тех пор их развитие шло самостоятельно и на сегодняшний день эти две программы отличаются довольно существенно. Проект GAMESS поддерживается членами исследовательской группы Гордона в Государственном Университете штата Айова.

Возможности[править | править код]

Суммарная таблица по ряду основных возможностей GAMESS
(C - хранение интегралов, D - прямые вычисления интегралов АО, p - параллельное исполнение, F - использование фрагентарных МО)
SCFTYP= RHF ROHF UHF GVB MCSCF
Энергия CDpF CDp CDp CDp CDpF
Аналитический градиент CDpF CDp CDp CDp CDpF
Численный Гессиан CDpF CDp CDp CDp CDp
Аналитический Гессиан CDp CDp - CDp CDp
MP2 энергия CDpF CDp CDp - CDp
MP2 градиент CDpF Dp CDp - -
CI энергия CDp CDp - CDp CDp
CI градиент CD - - - -
CC энергия CDpF - - - -
EOM энергия CD - - - -
DFT энергия CDpF CDp CDp - -
DFT градиент CDpF CDp CDp - -
MOPAC энергия yes yes yes yes -
MOPAC градиент yes yes yes - -

GAMESS (US) способен производить расчеты МО при помощи многих методов вычислительной квантовой химии, включая метод Хартри-Фока, теорию функционала плотности (DFT), теория валентных связей (GVB), и многоконфигурационное самосогласованное поле (MCSCF). Коррекция энергии электронной корреляции после процедуры самосогласования может быть осуществлена при помощи конфигурационного взаимодействия (CI), теории возмущений Меллера-Плессета второго порядка. Эффект растворителя может учитываться в рамках моделей SCRF, PCM или моделироваться с помощью, т.н. "эффективных фрагментов". Релятивистские поправки также могут быть учтены с помощью различных методов, например приближением Дугласа-Кролла третьего порядка.

Поскольку в программе молекулярная механика не реализована, комбинированные расчеты используют пакет TINKER для вычислений механической части. Метод фрагментарных МО может использоваться для расчета крупных систем, деля их на "фрагменты".

Связь с другими программами[править | править код]

GAMESS сохраняет расчет в текстовый файл специального формата. Хранящиеся в данном файле координаты могут быть преобразованы программой OpenBabel. Молекулярные орбитали можно визуализировать такими программами, как Molekel (англ. Molekel) или wxMacMolPlt.

Совместимость и доступность[править | править код]

US GAMESS работает на всех POSIX-совместимых операционных системах, OS X и Windows. На официальном сайте доступны бинарные пакеты для Mac OS X, MacOS 7-9 и Microsoft Windows. Также поддерживаются платформы Sun Solaris UltraSPARC/x86/x86-64, IBM BlueGene, AIX POWER/PowerPC, Linux x86/x86-64, Cray X1/XT Unicos, Fujitsu PrimePower Solaris, HP PA-RISC/x86 HP-UX и NEC SUPER-UX[4].

Исходный код US GAMESS распространяется бесплатно при условии некоммерческого использования программы.

См. также[править | править код]

Примечания[править | править код]

  1. Computational Chemistry, David Young, Wiley-Interscience, 2001. Appendix A. A.2.3 pg 334, GAMESS
  2. M.W. Schmidt et al. (1993). «General Atomic and Molecular Electronic Structure System». J. Comput. Chem. 14: 1347–1363. DOI:10.1002/jcc.540141112.
  3. M. S. Gordon and M. W. Schmidt, Advances in electronic structure theory: GAMESS a decade later, in Theory and Applications of Computational Chemistry, the first 40 years, C. E. Dykstra, G. Frenking. K. S. Lim and G. E. Scusaria, Elsevier, Amsterdam, 2005.
  4. GAMESS Registration: download

Внешние ссылки[править | править код]