Протеом: различия между версиями
| [отпатрулированная версия] | [отпатрулированная версия] |
м викификация, орфография |
Samal (обсуждение | вклад) |
||
| Строка 24: | Строка 24: | ||
== Ссылки == |
== Ссылки == |
||
* [http://bioinformatics.oupjournals.org/ Bioinformatics Journal] |
* [http://bioinformatics.oupjournals.org/ Bioinformatics Journal] |
||
* Базы данных: PIR | Swissprot | Pfam |
* Базы данных: PIR | Swissprot | [[Pfam]] |
||
[[Категория:биоинформатика]] |
[[Категория:биоинформатика]] |
||
Версия от 11:48, 7 июня 2015
Протеом — термин для обозначения всей совокупности белков организма, производимых клеткой, тканью или организмом в определённый период времени. Или, более строго, это совокупность экспрессированных белков в данном типе клеток или в организме, в данный период времени при данных условиях. Термин является производным слова «протеин» (белок), аналогичным по происхождению слову «геном» (совокупность всех генов организма).
Термин применялся к нескольким разным типам биологических систем. Протеом клетки — совокупность белков, найденных в определённой клетке при определённых внешних условиях, как например под действием определенных гормонов. Полный протеом организма — совокупный набор протеомов всех клеток. Термином «протеом» также обозначают набор белков субклеточного организма, например вируса (вирусный протеом).
Протеом, особенно у эукариот, больше, чем геном, то есть количество белков превышает количество генов. Это связано с альтернативным сплайсингом, а также с посттрансляционной модификацией белков, например, их гликозилированием и фосфорилированием.
В то время как геном определяется последовательностью нуклеотидов, протеом не сводится к сумме последовательностей аминокислот. Протеом включает в себя также пространственные структуры всех содержащихся в нём белков (см. вторичная структура белка, третичная структура белков) и функционального взаимодействия между ними.
Протеомика — наука о протеомах, развивалась в значительной степени путём разделения белков методом двумерного электрофореза. Первое измерение — разделение белков на основе их электрического заряда методом изоэлектрического фокусирования. Второе измерение — разделение белков на основе их молекулярного веса методом en:SDS-PAGE.
История
Термин «протеом» предложил в 1994 году австралийский генетик Марк Уилкинс[1] на симпозиуме 2D Electrophoresis: from protein maps to genomes" в городе Сиена, Италия. В печать термин появился в 1995 году[2] в публикации части кандидатской диссертации Уилкинса.
Исследование протеома — крупный международный научный проект. В 2001 году для работы над ним была создана международная Организация протеома человека (англ. Human Proteome Organization/HUPO). Особое внимание участников проекта вызывают белки крови, печени и головного мозга.
См. также
Примечания
- ↑ Wilkins, Marc (2009). "Proteomics data mining". Expert review of proteomics. England. 6 (6): 599—603. doi:10.1586/epr.09.81. PMID 19929606.
{{cite journal}}: Неизвестный параметр|month=игнорируется (справка); Шаблон цитирования имеет пустые неизвестные параметры:|laydate=,|laysummary=, and|laysource=(справка) - ↑ Wasinger VC, Cordwell SJ, Cerpa-Poljak A, Yan JX, Gooley AA, Wilkins MR, Duncan MW, Harris R, Williams KL, Humphery-Smith I. (1995). "Progress with gene-product mapping of the Mollicutes: Mycoplasma genitalium". Electrophoresis. 7 (7): 1090—94. doi:10.1002/elps.11501601185. PMID 7498152.
{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
Ссылки
- Bioinformatics Journal
- Базы данных: PIR | Swissprot | Pfam