Категория:Биоинформатика

• Биоинформатика

А

• Агроинформатика
• Алгоритм Баума — Велша
• Алгоритм Нидлмана — Вунша
• Алгоритм Смита — Ватермана
• Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA)
• Анализ метаболических потоков
• Атлас ракового генома

Б

• Байесовский подход в филогенетике
• Баркодирование ДНК
• Белок-белковые взаимодействия
• Биочип

В

• Виртуальная ПЦР
• Выравнивание последовательностей
• Вычислительная биология

Г

• Генная онтология
• Граф де Брёйна

Д

• Двугибридный анализ

И

• Интерактомика
• Ионное полупроводниковое секвенирование

К

• Картирование коротких прочтений
• Количественный анализ альтернативного сплайсинга
• Количественный анализ экспрессии генов
• Контиг
• Ксенобиология
• Кэп-анализ экспрессии генов (CAGE)

Л

• Левитт, Майкл
• Логотип последовательностей

М

• Матричные популяционные модели
• Международное общество вычислительной биологии
• Метаболомика
• Метод дробовика
• Метод присоединения соседей
• Метод Illumina/Solexa
• Методы секвенирования нового поколения
• Множественное выравнивание последовательностей
• Модель замен
• Молекулярное моделирование
• Молекулярный докинг
• Мотив (молекулярная биология)

Н

• Нанопоровое секвенирование
• Национальный центр биотехнологической информации

О

• Одномолекулярное секвенирование в реальном времени
• Однонуклеотидный полиморфизм
• Открытые биомедицинские онтологии
• Оценки качества сборки генома: N50, L50

П

• Парадокс Левинталя
• Персональная геномика
• Пиросеквенирование
• Позиционирование нуклеосом
• Позиционная весовая матрица
• Поиск пиков в данных ChiP-Seq
• Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico
• Полногеномный поиск ассоциаций
• Предпочтение кодонов
• Предсказание вторичной структуры РНК
• Предсказание генов
• Предсказание структуры белка
• Предсказание функции белка
• Пространственное выравнивание
• Протеом

С

• Сборка генома
• Секвенирование спаренных концов
• Секвенирование экзома
• Секретомика
• Синтения
• Скрытая марковская модель

Т

• Транскриптомика одиночных клеток

Ф

• Функциональная аннотация геномов млекопитающих

B

• Bioconductor
• BLAST
• BWA (выравнивание биологических последовательностей)

C

• CASP
• ChIA-PET
• ChIP-seq
• Clustal
• Cytoscape

D

• De novo сборка транскриптома

E

• Ensembl
• EyeWire

F

• FAIRE-Seq
• FASTA
• FastPCR
• Foldit

G

• GC-состав
• GDF - Общий формат данных для биомедицинских сигналов
• GenBank
• GENCODE
• GFF (формат файла)

H

• Helicos Biosciences

I

• Information Hyperlinked over Proteins

J

• Участник:Janemoiseeva/Черновик
• Jmol

K

• KEGG

M

• Medical Subject Headings
• MEME

P

• Pfam
• Protein Data Bank
• PSI Protein Classifier
• PyMOL

Q

• QuteMol

R

• RasMol
• Rosalind

S

• SAMtools
• SBGN
• SMART (база данных)
• SOLiD
• STARR-seq

T

• TopHat

U

• UGENE
• UniProt