Retaria: различия между версиями

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
[отпатрулированная версия][отпатрулированная версия]
Содержимое удалено Содержимое добавлено
Нет описания правки
Строка 1: Строка 1:
{{к улучшению|2018-01-17}}
{{к улучшению|2018-01-17}}
{{Таксон
{{Таксон
|image file =
|image file = Ammonia tepida.jpg
|image descr = [[Фораминиферы|Фораминифера]] ''Ammonia tepida''
|image descr =
|regnum = Протисты
|regnum = Протисты
|parent =
|parent =
|rang =
|rang =
|latin = Retaria
|latin = Retaria
|author = Cavalier-Smith, 1999
|author = [[Кавалье-Смит, Томас|Cavalier-Smith]], 1999
|syn =
|syn =
|typus =
|typus =
Строка 16: Строка 16:
|wikispecies = Retaria
|wikispecies = Retaria
}}
}}
'''Ретарии'''{{нет АИ|14|07|2016}} ({{lang-la|Retaria}}) — клада внутри группы [[Ризарии]], в которую входят [[фораминиферы]] и [[радиолярии]]<ref name="pmid17174576">{{статья |заглавие=Global eukaryote phylogeny: Combined small- and large-subunit ribosomal DNA trees support monophyly of Rhizaria, Retaria and Excavata |издание=Mol. Phylogenet. Evol. |том=44 |номер=1 |страницы=255—266 |pmid=17174576 |doi=10.1016/j.ympev.2006.11.001 |язык=en |тип=journal |автор=Moreira D., von der Heyden S., Bass D., López-García P., Chao E., Cavalier-Smith T. |месяц=7 |год=2007}}</ref>.
'''Ретарии'''{{нет АИ|14|07|2016}} ({{lang-la|Retaria}}) [[клада]] [[ризарии|ризарий]]. Включает [[фораминиферы|фораминифер]] и [[радиолярии|радиолярий]]. Существует спорное<ref name=Irwin_2019/> мнение о принадлежности к ней и [[Endomyxa]]<ref name=Cavalier_Smith_2018/>.


== История классификации ==
== Примечания ==
Группу Retaria выделил [[Кавалье-Смит, Томас|Томас Кавалье-Смит]] в 1999 году, поместив в неё фораминифер и радиолярий. Она получила [[ранг (биология)|ранг]] инфрацарства в подцарстве Neozoa царства [[Protozoa]]. Автор дал ей следующий [[диагноз таксона|диагноз]]: питание с помощью ретикулоподий, которые, как правило, выходят из одной или более пор в жёсткой [[гликопротеин]]овой раковине или стенке капсулы и имеют внутренний скелет из [[микротрубочки|микротрубочек]]; наличие крупной трофической стадии без [[ундулиподия|ундулиподий]] и меньшей расселительной стадии с двумя [[жгутик]]ами, возникающей путём множественного деления; закрытый [[митоз]] (внутриядерное [[веретено деления]]); [[ядрышко]] в ходе митоза распадается<ref name=Cavalier_Smith_1999/>. Группу в этом объёме можно было охарактеризовать как преимущественно морских [[гетеротрофы|гетеротрофов]] с ретикулоподиями или аксоподиями и обычно со скелетом разных типов<ref name=Adl_2012/>.
{{примечания}}


В 2002 году Кавалье-Смит понизил ранг Retaria до типа в новом инфрацарстве [[Rhizaria]] подцарства Gymnomyxa царства Protozoa<ref name=Cavalier_Smith_2002/>. В 2007 году [[монофилия]] этого типа в тогдашнем составе была подтверждена [[молекулярная филогенетика|молекулярными данными]]<ref name=Moreira_2007/>.
{{rq|empty}}

В 2018 году Кавалье-Смит перенёс в тип Retaria (в составе инфрацарства Rhizaria подцарства [[Harosa]] царства [[Chromista]]) группу [[Endomyxa]], ранее относимую к [[церкозои|церкозоям]]. Объединение фораминифер и радиолярий (то есть Retaria в прежнем составе) получило название Ectoreta и ранг подтипа<ref name=Cavalier_Smith_2018/>. Но в следующем году молекулярный анализ Николаса Ирвина с соавторами показал принадлежность Endomyxa к церкозоям, а не Retaria<ref name=Irwin_2019/>.

== Классификация ==
Согласно системе [[Кавалье-Смит, Томас|Томаса Кавалье-Смита]] (2018), тип Retaria включает 10 классов и его система выглядит следующим образом<ref name=Cavalier_Smith_2018/>:
* тип Retaria
** подтип Endomyxa
**** надкласс Marimyxia
**** надкласс Proteomyxia
** подтип Ectoreta
*** инфратип Foraminifera
*** инфратип Radiozoa
**** надкласс Polycystinia
**** надкласс Spasmaria.

== Эволюционная история ==
Древнейшие надёжно идентифицированные остатки ретарий относятся к [[кембрий]]скому периоду и одновременно являются древнейшими надёжно идентифицированными остатками [[хромисты|хромистов]] в целом (на 2018 год). Это остатки фораминифер (возрастом около 535 млн лет) и радиолярий с [[кремнезём]]овым скелетом. Предки ретарий, вероятно, были морскими организмами и имели вид крупных амебоидных клеток с ретикулоподиями<ref name=Cavalier_Smith_2018/>.

== Примечания ==
{{примечания|refs=
<ref name=Adl_2012>{{статья
|автор=Adl S. M., Simpson A. G., Lane C. E., Lukeš J., Bass D., Bowser S. S., Brown M. W., Burki F., Dunthorn M., Hampl V., Heiss A., Hoppenrath M., Lara E., Le Gall L., Lynn D. H., McManus H., Mitchell E. A., Mozley-Stanridge S. E, Parfrey L. W., Pawlowski J., Rueckert S., Shadwick R. S., Schoch C. L., Smirnov A., Spiegel F. W.
 |заглавие=The revised classification of eukaryotes
|ссылка=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3483872/pdf/nihms394066.pdf
|издание=The Journal of Eukaryotic Microbiology
|год=2012
|volume=59
|issue=5
|pages=429—493
|pmid=23020233
|doi=10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x
}}</ref>
<ref name=Cavalier_Smith_1999>{{cite journal
|title =Principles of protein and lipid targeting in secondary symbiogenesis: euglenoid, dinoflagellate, and sporozoan plastid origins and the eukaryote family tree
|author =Cavalier-Smith T.
|date =1999
|journal=The Journal of Eukaryotic Microbiology
|volume =46
|issue =4
|pages =347–366
|doi =10.1111/j.1550-7408.1999.tb04614.x
|pmid =18092388
}}</ref>
<ref name=Cavalier_Smith_2002>{{cite journal
|title =The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa
|author =Cavalier-Smith T.
|date =2002
|journal=International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
|volume =52
|pages =297–354
|doi =10.1099/00207713-52-2-297
|pmid =11931142
|url =https://www.microbiologyresearch.org/docserver/fulltext/ijsem/52/2/0520297a.pdf
}}</ref>
<ref name=Cavalier_Smith_2018>{{cite journal
|title =Kingdom Chromista and its eight phyla: a new synthesis emphasising periplastid protein targeting, cytoskeletal and periplastid evolution, and ancient divergences
|author =Cavalier-Smith T.
|date =2018
|journal=Protoplasma
|volume =255
|issue =1
|pages =297–357
|doi =10.1007/s00709-017-1147-3
|pmid =28875267
|url =https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5756292/pdf/709_2017_Article_1147.pdf
}}</ref>
<ref name=Irwin_2019>{{cite journal
|title =Phylogenomics supports the monophyly of the Cercozoa
|author =Irwin N. A. T., Tikhonenkov D. V., Hehenberger E., Mylnikov A. P., Burki F., Keeling P. J.
|date =2019
|journal=Molecular Phylogenetics and Evolution
|volume =130
|issue =
|pages =416–423
|doi =10.1016/j.ympev.2018.09.004
|pmid =30318266
|url =
}}</ref>
<ref name=Moreira_2007>{{статья
|заглавие=Global eukaryote phylogeny: Combined small- and large-subunit ribosomal DNA trees support monophyly of Rhizaria, Retaria and Excavata
|издание=[[Molecular Phylogenetics and Evolution]]
|том=44
|номер=1
|страницы=255—266
|pmid=17174576
|doi=10.1016/j.ympev.2006.11.001
|язык=en
|автор=Moreira D., von der Heyden S., Bass D., López-García P., Chao E., Cavalier-Smith T.
|месяц=7
|год=2007
}}</ref>
}}


{{Ризарии}}
{{Ризарии}}

Версия от 21:25, 25 октября 2019

Retaria
Фораминифера Ammonia tepida
Фораминифера Ammonia tepida
Научная классификация
Клада:
Надтип:
Тип:
Retaria
Международное научное название
Retaria Cavalier-Smith, 1999
Типы

Ретарии[источник не указан 2907 дней] (лат. Retaria) — клада ризарий. Включает фораминифер и радиолярий. Существует спорное[1] мнение о принадлежности к ней и Endomyxa[2].

История классификации

Группу Retaria выделил Томас Кавалье-Смит в 1999 году, поместив в неё фораминифер и радиолярий. Она получила ранг инфрацарства в подцарстве Neozoa царства Protozoa. Автор дал ей следующий диагноз: питание с помощью ретикулоподий, которые, как правило, выходят из одной или более пор в жёсткой гликопротеиновой раковине или стенке капсулы и имеют внутренний скелет из микротрубочек; наличие крупной трофической стадии без ундулиподий и меньшей расселительной стадии с двумя жгутиками, возникающей путём множественного деления; закрытый митоз (внутриядерное веретено деления); ядрышко в ходе митоза распадается[3]. Группу в этом объёме можно было охарактеризовать как преимущественно морских гетеротрофов с ретикулоподиями или аксоподиями и обычно со скелетом разных типов[4].

В 2002 году Кавалье-Смит понизил ранг Retaria до типа в новом инфрацарстве Rhizaria подцарства Gymnomyxa царства Protozoa[5]. В 2007 году монофилия этого типа в тогдашнем составе была подтверждена молекулярными данными[6].

В 2018 году Кавалье-Смит перенёс в тип Retaria (в составе инфрацарства Rhizaria подцарства Harosa царства Chromista) группу Endomyxa, ранее относимую к церкозоям. Объединение фораминифер и радиолярий (то есть Retaria в прежнем составе) получило название Ectoreta и ранг подтипа[2]. Но в следующем году молекулярный анализ Николаса Ирвина с соавторами показал принадлежность Endomyxa к церкозоям, а не Retaria[1].

Классификация

Согласно системе Томаса Кавалье-Смита (2018), тип Retaria включает 10 классов и его система выглядит следующим образом[2]:

  • тип Retaria
    • подтип Endomyxa
        • надкласс Marimyxia
        • надкласс Proteomyxia
    • подтип Ectoreta
      • инфратип Foraminifera
      • инфратип Radiozoa
        • надкласс Polycystinia
        • надкласс Spasmaria.

Эволюционная история

Древнейшие надёжно идентифицированные остатки ретарий относятся к кембрийскому периоду и одновременно являются древнейшими надёжно идентифицированными остатками хромистов в целом (на 2018 год). Это остатки фораминифер (возрастом около 535 млн лет) и радиолярий с кремнезёмовым скелетом. Предки ретарий, вероятно, были морскими организмами и имели вид крупных амебоидных клеток с ретикулоподиями[2].

Примечания

  1. 1 2 Irwin N. A. T., Tikhonenkov D. V., Hehenberger E., Mylnikov A. P., Burki F., Keeling P. J. (2019). "Phylogenomics supports the monophyly of the Cercozoa". Molecular Phylogenetics and Evolution. 130: 416—423. doi:10.1016/j.ympev.2018.09.004. PMID 30318266.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  2. 1 2 3 4 Cavalier-Smith T. (2018). "Kingdom Chromista and its eight phyla: a new synthesis emphasising periplastid protein targeting, cytoskeletal and periplastid evolution, and ancient divergences" (PDF). Protoplasma. 255 (1): 297—357. doi:10.1007/s00709-017-1147-3. PMID 28875267.
  3. Cavalier-Smith T. (1999). "Principles of protein and lipid targeting in secondary symbiogenesis: euglenoid, dinoflagellate, and sporozoan plastid origins and the eukaryote family tree". The Journal of Eukaryotic Microbiology. 46 (4): 347—366. doi:10.1111/j.1550-7408.1999.tb04614.x. PMID 18092388.
  4. Adl S. M., Simpson A. G., Lane C. E., Lukeš J., Bass D., Bowser S. S., Brown M. W., Burki F., Dunthorn M., Hampl V., Heiss A., Hoppenrath M., Lara E., Le Gall L., Lynn D. H., McManus H., Mitchell E. A., Mozley-Stanridge S. E, Parfrey L. W., Pawlowski J., Rueckert S., Shadwick R. S., Schoch C. L., Smirnov A., Spiegel F. W.   The revised classification of eukaryotes // The Journal of Eukaryotic Microbiology. — 2012. — Vol. 59. — P. 429—493. — doi:10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. — PMID 23020233.
  5. Cavalier-Smith T. (2002). "The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa" (PDF). International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 52: 297—354. doi:10.1099/00207713-52-2-297. PMID 11931142.
  6. Moreira D., von der Heyden S., Bass D., López-García P., Chao E., Cavalier-Smith T. Global eukaryote phylogeny: Combined small- and large-subunit ribosomal DNA trees support monophyly of Rhizaria, Retaria and Excavata (англ.) // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2007. — July (vol. 44, no. 1). — P. 255—266. — doi:10.1016/j.ympev.2006.11.001. — PMID 17174576.