Дезамидирование

Не следует путать с Дезаминирование.

Дезамидирование — химическая реакция, в которой амидная функциональная группа удаляется из органического соединения. В биохимии реакция играет важную роль в деградации белков, так как повреждает амидосодержащие боковые цепи аминокислот аспарагина и глутамина.

Дезамидирование остатка аспарагина происходит в белке при физиологических условиях следующим образом. Боковая цепь аспарагина атакуется азотом следующего аминокислотного остатка, в результате чего образуется промежуточное соединение — асимметрично встроенный в полипептидную цепь сукцинимид. Из-за асимметрии последний может гидролизоваться либо в остаток аспартата, либо в остаток бета-аминокислоты изоаспартата. Этот процесс считается дезамидированием, поскольку амид в боковой цепи аспарагина заменяется карбоксильной группой. В то же время подобная реакция может происходить с участием боковой цепи не только аспарагина, но и аспартата, приводя к его превращению в изоаспартат.

Дезамидирование происходит значительно быстрее, если следующий аминокислотный остаток имеет небольшую или гибкую боковую цепь. Примером является глицин, у которого стерическое препятствие атаке пептидной группы минимально. Дезамидированию способствуют высокие значения рН (> 10) и температуры.

Предположительно, дезамидирование является одним из факторов, ограничивающих срок функциональности молекул белка.

Литература

• Clarke S. (1987) "Propensity for spontaneous succinimide formation from aspartyl and asparaginyl residues in cellular proteins", Int. J., Peptide Protein Res., 30, 808-821. PMID 3440704
• Stephenson RC and Clarke S. (1989) "Succinimide Formation from Aspartyl and Asparaginyl Peptides as a Model for the Spontaneous Degradation of Proteins", J. Biol. Chem., 264, 6164-6170. PMID 2703484
• Robinson NE, Robinson AB. Molecular Clocks: Deamidation of Asparaginyl and Glutaminyl Residues in Peptides and Proteins. Althouse Press: Cave Junction, Ore. OCLC 56978028

См. также

• Пептидная связь
• Посттрансляционная модификация