Интеграза

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Цинк-связывающий домен интегразы
PDB 1wjd EBI.jpg
Структура N-концевого цинк-связывающего домена интегразы вируса hiv-1
Идентификаторы
Символ

Integrase_Zn

Pfam

PF02022

InterPro

IPR003308

SCOP

1wjb

SUPERFAMILY

1wjb

Ядро интегразы
PDB 1c1a EBI.jpg
Идентификаторы
Символ

rve

Pfam

PF00665

Pfam clan

CL0219

InterPro

IPR001584

SCOP

2itg

SUPERFAMILY

2itg

ДНК-связывающий домен интегразы
PDB 1c1a EBI.jpg
Идентификаторы
Символ

IN_DBD_C

Pfam

PF00552

InterPro

IPR001037

SCOP

1ihw

SUPERFAMILY

1ihw

Интеграза (IN) — фермент, катализирующий интеграцию (включение) ДНК вируса (ретровируса, в частности, ВИЧ[1][2]) в хромосому клетки-хозяина. Перед интеграцией линейные молекулы ДНК вируса сначала замыкаются в кольцо и затем уже встраиваются.

Ретровирусные интегразы — ключевой компонент прединтеграционного комплекса (PIC).

Сходные ферменты фагов — phage integrase, например λ phage integrase (Int)

Структура[править | править вики-текст]

Все ретрофирусные интегразы состоят из трех канонических доменов:

  • N-концевой цинк-связывающий домен с мотивом HHCC (например, His12 His16 Cys40 Cys43 у ВИЧ-1)
  • каталитический домен (RNaseH)
  • C-концевой ДНК-связывающий домен (SH3)

Изучена структура доменов интеграз вирусов HIV-1, HIV-2, SIV, Rous Sarcoma Virus (RSV), первые результаты опубликованы в 1994 году. Имеются данные, свидетельствующие, что интеграза функционирует как тетрамер. Несколько белков клетки взаимодействуют с интегразой, в частности, человеческий хроматин-ассоциированный LEDGF.

Интеграза ВИЧ[править | править вики-текст]

Вирус иммунодефицита человека содержит интегразу размером 32 кДа в гене Pol. Данный фермент является перспективной целью для ВААРТ. Используется 3 препарата, являющихся ингибиторами интегразы ВИЧ: Ралтегравир (RAL, Исентресс, с 2007 года), Долутегравир (DTG, Тивикай), Элвитегравир (EVG, с 2012 года)[3]

Примечания[править | править вики-текст]

  1. HIV Integrase, a Brief Overview from Chemistry to Therapeutics
  2. СТРУКТУРА И ФУНКЦИИ ИНТЕГРАЗЫ ВИЧ-1, Успехи биологической химии, т. 45, 2005, с. 87—122
  3. HIV Integrase Inhibitors: 20-Year Landmark and Challenges / Adv Pharmacol. 2013;67:75-105. ISSN 1054-3589, doi:10.1016/B978-0-12-405880-4.00003-2 PMID 23885999.

Ссылки[править | править вики-текст]