Цинковый палец и BTB домен, содержащий белок 16

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Цинковый палец и домен BTB содержащий 16
Protein ZBTB16 PDB 1buo.png
PDB представлено на примере 1buo.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
СимволZBTB16 ; PLZF; ZNF145
Внешние IDOMIM: 176797 MGI103222 HomoloGene21214 GeneCards: ZBTB16 Gene
Профиль экспрессии РНК
PBB GE ZBTB16 205883 at tn.png
Больше информации
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez7704235320
EnsemblENSG00000109906ENSMUSG00000066687
UniProtQ05516A3KMN0
RefSeq (мРНК)NM_001018011NM_001033324
RefSeq (белок)NP_001018011NP_001028496
Локус (UCSC)Chr 11:
113.93 – 114.12 Mb
Chr 9:
48.65 – 48.84 Mb
Поиск в PubMed[1][2]

Цинковый палец и домен ВТВ содержащий белок 16  — белок, кодируемый у человека геном ZBTB16 .

Функция[править | править код]

Этот ген — член семейства круппель-белков цинкового пальца типа C2H2 и кодирует транскрипционный фактор цинкового пальца, который содержит девять доменов типа круппель (нем. Krueppel) цинкового палльца на С-конце. Этот белок находится в ядре, участвует в прогрессировании клеточного цикла и взаимодействует с гистондезацетилазой. Конкретные случаи аберрантных перестроек генов в этом локусе были связаны с острым промиелоцитарным лейкозом[1] и физиологические функции были определены у мышей в качестве естественных киллеров Т-клеток[2][3] и гамма-дельта Т-клеток.[4] Существуют альтернативные варианты сплайсинга транскрипции, которые были охарактеризованы у человека.[5][6]

Взаимодействия[править | править код]

Цинковый палец и ВТВ домен, содержащий белок 16, как было выявлено, взаимодействуют со следующими структурами:

Примечания[править | править код]

  1. Chen Z., Brand N.J., Chen A., Chen S.J., Tong J.H., Wang Z.Y., Waxman S., Zelent A. Fusion between a novel Krüppel-like zinc finger gene and the retinoic acid receptor-alpha locus due to a variant t(11;17) translocation associated with acute promyelocytic leukaemia (англ.) // The EMBO Journal (англ.) : journal. — 1993. — Vol. 12, no. 3. — P. 1161—1167. — PMID 8384553.
  2. Kovalovsky D., Uche O.U., Eladad S., Hobbs R.M., Yi W., Alonzo E., Chua K., Eidson M., Kim H.J., Im J.S., Pandolfi P.P., Sant'Angelo D.B. The BTB-zinc finger transcriptional regulator, PLZF, controls the development of iNKT cell effector functions (англ.) // Nature Immunology : journal. — 2008. — Vol. 9, no. 9. — P. 1055—1064. — doi:10.1038/ni.1641. — PMID 18660811.
  3. Savage A.K., Constantinides M.G., Han J., Picard D., Martin E., Li B., Lantz O., Bendelac A. The transcription factor PLZF (Zbtb16) directs the effector program of the NKT cell lineage (англ.) // Immunity : journal. — Cell Press (англ.), 2008. — Vol. 29, no. 3. — P. 391—403. — doi:10.1016/j.immuni.2008.07.011. — PMID 18703361.
  4. Kreslavsky T., Savage A.K., Hobbs R., Gounari F., Bronson R., Pereira P., Pandolfi P.P., Bendelac A., von Boehmer H. TCR-inducible PLZF transcription factor required for innate phenotype of a subset of γδ T cells with restricted TCR diversity (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2009. — Vol. 106, no. 30. — P. 12453—12458. — doi:10.1073/pnas.0903895106. — PMID 19617548.
  5. Zhang T., Xiong H., Kan L.X., Zhang C.K., Jiao X.F., Fu G., Zhang Q.H., Lu L., Tong J.H., Gu B.W., Yu M., Liu J.X., Licht J., Waxman S., Zelent A., Chen E., Chen S.J. Genomic sequence, structural organization, molecular evolution, and aberrant rearrangement of promyelocytic leukemia zinc finger gene (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96, no. 20. — P. 11422—11427. — doi:10.1073/pnas.96.20.11422. — PMID 10500192.
  6. ZBTB16 zinc finger and BTB domain containing 16. Entrez (4 октября 2009). Дата обращения 10 октября 2009.
  7. Senbonmatsu T., Saito T., Landon E.J., Watanabe O., Price E., Roberts R.L., Imboden H., Fitzgerald T.G., Gaffney F.A., Inagami T. A novel angiotensin II type 2 receptor signaling pathway: possible role in cardiac hypertrophy (англ.) // EMBO J. (англ.) : journal. — Vol. 22, no. 24. — P. 6471—6482. — doi:10.1093/emboj/cdg637. — PMID 14657020.
  8. Dhordain P., Albagli O., Honore N., Guidez F., Lantoine D., Schmid M., The H.D., Zelent A., Koken M.H. Colocalization and heteromerization between the two human oncogene POZ/zinc finger proteins, LAZ3 (BCL6) and PLZF (англ.) // Oncogene (англ.) : journal. — Vol. 19, no. 54. — P. 6240—6250. — doi:10.1038/sj.onc.1203976. — PMID 11175338.
  9. Barna M., Merghoub T., Costoya J.A., Ruggero D., Branford M., Bergia A., Samori B., Pandolfi P.P. Plzf mediates transcriptional repression of HoxD gene expression through chromatin remodeling (англ.) // Dev. Cell (англ.) : journal. — Vol. 3, no. 4. — P. 499—510. — doi:10.1016/s1534-5807(02)00289-7. — PMID 12408802.
  10. 1 2 Ward J.O., McConnell M.J., Carlile G.W., Pandolfi P.P., Licht J.D., Freedman L.P. The acute promyelocytic leukemia-associated protein, promyelocytic leukemia zinc finger, regulates 1,25-dihydroxyvitamin D(3)-induced monocytic differentiation of U937 cells through a physical interaction with vitamin D(3) receptor (англ.) // Blood (англ.) : journal. — American Society of Hematology (англ.). — Vol. 98, no. 12. — P. 3290—3300. — doi:10.1182/blood.v98.12.3290. — PMID 11719366.
  11. Puccetti E., Obradovic D., Beissert T., Bianchini A., Washburn B., Chiaradonna F., Boehrer S., Hoelzer D., Ottmann O.G., Pelicci P.G., Nervi C., Ruthardt M. AML-associated translocation products block vitamin D(3)-induced differentiation by sequestering the vitamin D(3) receptor (англ.) // Cancer Research (англ.) : journal. — American Association for Cancer Research (англ.). — Vol. 62, no. 23. — P. 7050—7058. — PMID 12460926.
  12. McLoughlin P., Ehler E., Carlile G., Licht J.D., Schäfer B.W. The LIM-only protein DRAL/FHL2 interacts with and is a corepressor for the promyelocytic leukemia zinc finger protein (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 277, no. 40. — P. 37045—37053. — doi:10.1074/jbc.M203336200. — PMID 12145280.
  13. Labbaye C., Quaranta M.T., Pagliuca A., Militi S., Licht J.D., Testa U., Peschle C. PLZF induces megakaryocytic development, activates Tpo receptor expression and interacts with GATA1 protein (англ.) // Oncogene (англ.) : journal. — Vol. 21, no. 43. — P. 6669—6679. — doi:10.1038/sj.onc.1205884. — PMID 12242665.
  14. Tsuzuki S., Enver T. Interactions of GATA-2 with the promyelocytic leukemia zinc finger (PLZF) protein, its homologue FAZF, and the t(11;17)-generated PLZF-retinoic acid receptor alpha oncoprotein (англ.) // Blood (англ.) : journal. — American Society of Hematology (англ.). — Vol. 99, no. 9. — P. 3404—3410. — doi:10.1182/blood.v99.9.3404. — PMID 11964310.
  15. 1 2 3 4 Chauchereau A., Mathieu M., de Saintignon J., Ferreira R., Pritchard L.L., Mishal Z., Dejean A., Harel-Bellan A. HDAC4 mediates transcriptional repression by the acute promyelocytic leukaemia-associated protein PLZF (англ.) // Oncogene (англ.) : journal. — Vol. 23, no. 54. — P. 8777—8784. — doi:10.1038/sj.onc.1208128. — PMID 15467736.
  16. 1 2 3 David G., Alland L., Hong S.H., Wong C.W., DePinho R.A., Dejean A. Histone deacetylase associated with mSin3A mediates repression by the acute promyelocytic leukemia-associated PLZF protein (англ.) // Oncogene (англ.) : journal. — Vol. 16, no. 19. — P. 2549—2556. — doi:10.1038/sj.onc.1202043. — PMID 9627120.
  17. 1 2 3 Wong C.W., Privalsky M.L. Components of the SMRT corepressor complex exhibit distinctive interactions with the POZ domain oncoproteins PLZF, PLZF-RARalpha, and BCL-6 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 273, no. 42. — P. 27695—27702. — doi:10.1074/jbc.273.42.27695. — PMID 9765306.
  18. 1 2 Lemercier C., Brocard M.P., Puvion-Dutilleul F., Kao H.Y., Albagli O., Khochbin S. Class II histone deacetylases are directly recruited by BCL6 transcriptional repressor (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 277, no. 24. — P. 22045—22052. — doi:10.1074/jbc.M201736200. — PMID 11929873.
  19. Nanba D., Mammoto A., Hashimoto K., Higashiyama S. Proteolytic release of the carboxy-terminal fragment of proHB-EGF causes nuclear export of PLZF (англ.) // J. Cell Biol. (англ.) : journal. — Vol. 163, no. 3. — P. 489—502. — doi:10.1083/jcb.200303017. — PMID 14597771.
  20. Nanba D., Toki F., Higashiyama S. Roles of charged amino acid residues in the cytoplasmic domain of proHB-EGF (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun. (англ.) : journal. — Vol. 320, no. 2. — P. 376—382. — doi:10.1016/j.bbrc.2004.05.176. — PMID 15219838.
  21. Takahashi S., McConnell M.J., Harigae H., Kaku M., Sasaki T., Melnick A.M., Licht J.D. The Flt3 internal tandem duplication mutant inhibits the function of transcriptional repressors by blocking interactions with SMRT (англ.) // Blood (англ.) : journal. — American Society of Hematology (англ.). — Vol. 103, no. 12. — P. 4650—4658. — doi:10.1182/blood-2003-08-2759. — PMID 14982881.
  22. Hong S.H., David G., Wong C.W., Dejean A., Privalsky M.L. SMRT corepressor interacts with PLZF and with the PML-retinoic acid receptor alpha (RARalpha) and PLZF-RARalpha oncoproteins associated with acute promyelocytic leukemia (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — Vol. 94, no. 17. — P. 9028—9033. — doi:10.1073/pnas.94.17.9028. — PMID 9256429.
  23. Koken M.H., Reid A., Quignon F., Chelbi-Alix M.K., Davies J.M., Kabarowski J.H., Zhu J., Dong S., Chen S., Chen Z., Tan C.C., Licht J., Waxman S., de Thé H., Zelent A. Leukemia-associated retinoic acid receptor alpha fusion partners, PML and PLZF, heterodimerize and colocalize to nuclear bodies (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — Vol. 94, no. 19. — P. 10255—10260. — doi:10.1073/pnas.94.19.10255. — PMID 9294197.
  24. Melnick A.M., Westendorf J.J., Polinger A., Carlile G.W., Arai S., Ball H.J., Lutterbach B., Hiebert S.W., Licht J.D. The ETO protein disrupted in t(8;21)-associated acute myeloid leukemia is a corepressor for the promyelocytic leukemia zinc finger protein (англ.) // Mol. Cell. Biol. (англ.) : journal. — Vol. 20, no. 6. — P. 2075—2086. — doi:10.1128/mcb.20.6.2075-2086.2000. — PMID 10688654.
  25. Melnick A., Carlile G.W., McConnell M.J., Polinger A., Hiebert S.W., Licht J.D. AML-1/ETO fusion protein is a dominant negative inhibitor of transcriptional repression by the promyelocytic leukemia zinc finger protein (англ.) // Blood (англ.) : journal. — American Society of Hematology (англ.). — Vol. 96, no. 12. — P. 3939—3947. — PMID 11090081.
  26. Martin P.J., Delmotte M.H., Formstecher P., Lefebvre P. PLZF is a negative regulator of retinoic acid receptor transcriptional activity (англ.) // Nucl. Recept. : journal. — Vol. 1, no. 1. — P. 6. — doi:10.1186/1478-1336-1-6. — PMID 14521715.
  27. Hoatlin M.E., Zhi Y., Ball H., Silvey K., Melnick A., Stone S., Arai S., Hawe N., Owen G., Zelent A., Licht J.D. A novel BTB/POZ transcriptional repressor protein interacts with the Fanconi anemia group C protein and PLZF (англ.) // Blood (англ.) : journal. — American Society of Hematology (англ.). — Vol. 94, no. 11. — P. 3737—3747. — PMID 10572087.

Литература[править | править код]

  • Chen Z., Brand N.J., Chen A., Chen S.J., Tong J.H., Wang Z.Y., Waxman S., Zelent A. Fusion between a novel Krüppel-like zinc finger gene and the retinoic acid receptor-alpha locus due to a variant t(11;17) translocation associated with acute promyelocytic leukaemia (англ.) // The EMBO Journal (англ.) : journal. — 1993. — Vol. 12, no. 3. — P. 1161—1167. — PMID 8384553.
  • Chen S.J., Zelent A., Tong J.H., Yu H.Q., Wang Z.Y., Derré J., Berger R., Waxman S., Chen Z. Rearrangements of the retinoic acid receptor alpha and promyelocytic leukemia zinc finger genes resulting from t(11;17)(q23;q21) in a patient with acute promyelocytic leukemia (англ.) // The Journal of Clinical Investigation (англ.) : journal. — 1993. — Vol. 91, no. 5. — P. 2260—2267. — doi:10.1172/JCI116453. — PMID 8387545.
  • Reid A., Gould A., Brand N., Cook M., Strutt P., Li J., Licht J., Waxman S., Krumlauf R., Zelent A. Leukemia translocation gene, PLZF, is expressed with a speckled nuclear pattern in early hematopoietic progenitors (англ.) // Blood (англ.) : journal. — American Society of Hematology (англ.), 1995. — Vol. 86, no. 12. — P. 4544—4552. — PMID 8541544.
  • Dong S., Zhu J., Reid A., Strutt P., Guidez F., Zhong H.J., Wang Z.Y., Licht J., Waxman S., Chomienne C., Chen Z., Zelent A., Chen S.J. Amino-terminal protein-protein interaction motif (POZ-domain) is responsible for activities of the promyelocytic leukemia zinc finger-retinoic acid receptor-alpha fusion protein (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 8. — P. 3624—3629. — doi:10.1073/pnas.93.8.3624. — PMID 8622986.
  • Bonaldo M.F., Lennon G., Soares M.B. Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery (англ.) // Genome Research (англ.) : journal. — 1996. — Vol. 6, no. 9. — P. 791—806. — doi:10.1101/gr.6.9.791. — PMID 8889548.
  • Hong S.H., David G., Wong C.W., Dejean A., Privalsky M.L. SMRT corepressor interacts with PLZF and with the PML-retinoic acid receptor α (RARα) and PLZF-RARα oncoproteins associated with acute promyelocytic leukemia (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1997. — Vol. 94, no. 17. — P. 9028—9033. — doi:10.1073/pnas.94.17.9028. — PMID 9256429.
  • Koken M.H., Reid A., Quignon F., Chelbi-Alix M.K., Davies J.M., Kabarowski J.H., Zhu J., Dong S., Chen S., Chen Z., Tan C.C., Licht J., Waxman S., de Thé H., Zelent A. Leukemia-associated retinoic acid receptor α fusion partners, PML and PLZF, heterodimerize and colocalize to nuclear bodies (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1997. — Vol. 94, no. 19. — P. 10255—10260. — doi:10.1073/pnas.94.19.10255. — PMID 9294197.
  • Lin R.J., Nagy L., Inoue S., Shao W., Miller W.H., Evans R.M. Role of the histone deacetylase complex in acute promyelocytic leukaemia (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 391, no. 6669. — P. 811—814. — doi:10.1038/35895. — PMID 9486654.
  • Guidez F., Ivins S., Zhu J., Söderström M., Waxman S., Zelent A. Reduced retinoic acid-sensitivities of nuclear receptor corepressor binding to PML- and PLZF-RARalpha underlie molecular pathogenesis and treatment of acute promyelocytic leukemia (англ.) // Blood (англ.) : journal. — American Society of Hematology (англ.), 1998. — Vol. 91, no. 8. — P. 2634—2642. — PMID 9531570.
  • David G., Alland L., Hong S.H., Wong C.W., DePinho R.A., Dejean A. Histone deacetylase associated with mSin3A mediates repression by the acute promyelocytic leukemia-associated PLZF protein (англ.) // Oncogene (англ.) : journal. — 1998. — Vol. 16, no. 19. — P. 2549—2556. — doi:10.1038/sj.onc.1202043. — PMID 9627120.
  • Ahmad K.F., Engel C.K., Privé G.G. Crystal structure of the BTB domain from PLZF (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1998. — Vol. 95, no. 21. — P. 12123—12128. — doi:10.1073/pnas.95.21.12123. — PMID 9770450.
  • van Schothorst E.M., Prins D.E., Baysal B.E., Beekman M., Licht J.D., Waxman S., Zelent A., Cornelisse C.J., van Ommen G.J., Richard C.W., Devilee P. Genomic structure of the human PLZF gene (англ.) // Gene (англ.). — Elsevier, 1999. — Vol. 236, no. 1. — P. 21—4. — doi:10.1016/S0378-1119(99)00277-2. — PMID 10433962.
  • Ball H.J., Melnick A., Shaknovich R., Kohanski R.A., Licht J.D. The promyelocytic leukemia zinc finger (PLZF) protein binds DNA in a high molecular weight complex associated with cdc2 kinase (англ.) // Nucleic Acids Research (англ.) : journal. — 1999. — Vol. 27, no. 20. — P. 4106—4113. — doi:10.1093/nar/27.20.4106. — PMID 10497277.
  • Zhang T., Xiong H., Kan L.X., Zhang C.K., Jiao X.F., Fu G., Zhang Q.H., Lu L., Tong J.H., Gu B.W., Yu M., Liu J.X., Licht J., Waxman S., Zelent A., Chen E., Chen S.J. Genomic sequence, structural organization, molecular evolution, and aberrant rearrangement of promyelocytic leukemia zinc finger gene (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96, no. 20. — P. 11422—11427. — doi:10.1073/pnas.96.20.11422. — PMID 10500192.
  • Li X., Peng H., Schultz D.C., Lopez-Guisa J.M., Rauscher F.J., Marmorstein R. Structure-function studies of the BTB/POZ transcriptional repression domain from the promyelocytic leukemia zinc finger oncoprotein (англ.) // Cancer Research (англ.) : journal. — American Association for Cancer Research (англ.), 1999. — Vol. 59, no. 20. — P. 5275—5282. — PMID 10537309.
  • Hoatlin M.E., Zhi Y., Ball H., Silvey K., Melnick A., Stone S., Arai S., Hawe N., Owen G., Zelent A., Licht J.D. A novel BTB/POZ transcriptional repressor protein interacts with the Fanconi anemia group C protein and PLZF (англ.) // Blood (англ.) : journal. — American Society of Hematology (англ.), 1999. — Vol. 94, no. 11. — P. 3737—3747. — PMID 10572087.
  • Melnick A.M., Westendorf J.J., Polinger A., Carlile G.W., Arai S., Ball H.J., Lutterbach B., Hiebert S.W., Licht J.D. The ETO Protein Disrupted in t(8;21)-Associated Acute Myeloid Leukemia Is a Corepressor for the Promyelocytic Leukemia Zinc Finger Protein (англ.) // Molecular and Cellular Biology (англ.) : journal. — 2000. — Vol. 20, no. 6. — P. 2075—2086. — doi:10.1128/MCB.20.6.2075-2086.2000. — PMID 10688654.
  • Hyman J., Chen H., Di Fiore P.P., De Camilli P., Brunger A.T. Epsin 1 Undergoes Nucleocytosolic Shuttling and Its Eps15 Interactor Nh2-Terminal Homology (Enth) Domain, Structurally Similar to Armadillo and Heat Repeats, Interacts with the Transcription Factor Promyelocytic Leukemia Zn2+ Finger Protein (Plzf) (англ.) // The Journal of Cell Biology (англ.) : journal. — 2000. — Vol. 149, no. 3. — P. 537—546. — doi:10.1083/jcb.149.3.537. — PMID 10791968.
  • Melnick A., Carlile G.W., McConnell M.J., Polinger A., Hiebert S.W., Licht J.D. AML-1/ETO fusion protein is a dominant negative inhibitor of transcriptional repression by the promyelocytic leukemia zinc finger protein (англ.) // Blood (англ.) : journal. — American Society of Hematology (англ.), 2000. — Vol. 96, no. 12. — P. 3939—3947. — PMID 11090081.
  • Beez S., Demmer P., Puccetti E. Targeting the Acute Promyelocytic Leukemia-Associated Fusion Proteins PML/RARα and PLZF/RARα with Interfering Peptides (англ.) // PLOS One : journal. — 2012. — Vol. 7, no. 11. — P. e48636. — doi:10.1371/journal.pone.0048636. — PMID 23152790.
  • He L.Z., Bhaumik M., Tribioli C., Rego E.M., Ivins S., Zelent A., Pandolfi P.P. Two critical hits for promyelocytic leukemia (англ.) // Molecular Cell (англ.) : journal. — 2000. — Vol. 6, no. 5. — P. 1131—1141. — doi:10.1016/S1097-2765(00)00111-8. — PMID 11106752.