PRPF8

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Обрабатывающий сплайсинг пре-мРНК фактор 8
Protein PRPF8 PDB 3E9L.png
Прорисовка основана на PDB 3E9L.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
СимволPRPF8 ; HPRP8; PRP8; PRPC8; RP13; SNRNP220
Внешние IDOMIM: 607300 MGI2179381 HomoloGene4706 GeneCards: PRPF8 Gene
Профиль экспрессии РНК
PBB GE PRPF8 200001 at tn.png
PBB GE PRPF8 200003 s at tn.png
PBB GE PRPF8 200004 at tn.png
Больше информации
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez10594192159
EnsemblENSG00000174231ENSMUSG00000020850
UniProtQ6P2Q9Q99PV0
RefSeq (мРНК)NM_006445NM_138659
RefSeq (белок)NP_006436NP_619600
Локус (UCSC)Chr 17:
1.55 – 1.59 Mb
Chr 11:
75.49 – 75.51 Mb
Поиск в PubMed[1][2]

Обрабатывающий сплайсинг пре-мРНК фактор 8 (англ. «Pre-mRNA-processing-splicing factor 8) — белок, который у человека кодируется геном PRPF8.[1][2]

Сплайсинг пре-мРНК проходит две последовательные стадии трансэтерификации. Белок, кодируемый этим геном, является компонентом как U2- так и U12- зависимых сплайсосом, и создаёт что необходимо для катализа стадии II процесса сплайсинга пре-мРНК. Он производит несколько повторов WD, которые функционируют в межбелковых взаимодействиях. Этот белок имеет некоторое сходство с дрожжевым белком Prp8. Этот ген является кандидатом для аутосомно-доминантного пигментного ретинита.[3]

Взаимодействия[править | править код]

PRPF8, как было выявлено, взаимодействует с WDR57[4][5] и EFTUD2.[5]

Примечания[править | править код]

  1. McKie AB, McHale JC, Keen TJ, Tarttelin EE, Goliath R, van Lith-Verhoeven JJ, Greenberg J, Ramesar RS, Hoyng CB, Cremers FP, Mackey DA, Bhattacharya SS, Bird AC, Markham AF, Inglehearn CF (Jul 2001). “Mutations in the pre-mRNA splicing factor gene PRPC8 in autosomal dominant retinitis pigmentosa (RP13)”. Hum Mol Genet. 10 (15): 1555—62. DOI:10.1093/hmg/10.15.1555. PMID 11468273.
  2. Luo HR, Moreau GA, Levin N, Moore MJ (Jul 1999). “The human Prp8 protein is a component of both U2- and U12-dependent spliceosomes”. RNA. 5 (7): 893—908. DOI:10.1017/S1355838299990520. PMC 1369814. PMID 10411133.
  3. Entrez Gene: PRPF8 PRP8 pre-mRNA processing factor 8 homolog (S. cerevisiae).
  4. Ewing, Rob M; Chu Peter, Elisma Fred, Li Hongyan, Taylor Paul, Climie Shane, McBroom-Cerajewski Linda, Robinson Mark D, O'Connor Liam, Li Michael, Taylor Rod, Dharsee Moyez, Ho Yuen, Heilbut Adrian, Moore Lynda, Zhang Shudong, Ornatsky Olga, Bukhman Yury V, Ethier Martin, Sheng Yinglun, Vasilescu Julian, Abu-Farha Mohamed, Lambert Jean-Philippe, Duewel Henry S, Stewart Ian I, Kuehl Bonnie, Hogue Kelly, Colwill Karen, Gladwish Katharine, Muskat Brenda, Kinach Robert, Adams Sally-Lin, Moran Michael F, Morin Gregg B, Topaloglou Thodoros, Figeys Daniel (2007). “Large-scale mapping of human protein–protein interactions by mass spectrometry”. Mol. Syst. Biol. England. 3 (1): 89. DOI:10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931. Используется устаревший параметр |coauthors= (справка)
  5. 1 2 Achsel, T; Ahrens K; Brahms H; Teigelkamp S; Lührmann R (Nov 1998). “The Human U5-220kD Protein (hPrp8) Forms a Stable RNA-Free Complex with Several U5-Specific Proteins, Including an RNA Unwindase, a Homologue of Ribosomal Elongation Factor EF-2, and a Novel WD-40 Protein”. Mol. Cell. Biol. UNITED STATES. 18 (11): 6756—66. ISSN 0270-7306. PMC 109259. PMID 9774689.

Ссылки[править | править код]

Литература[править | править код]