SIMAP@home
| Тип | |
|---|---|
| Операционная система | |
| Аппаратная платформа | |
| Последняя версия |
• simap (Windows): 5.10 |
| Состояние |
Активное |
| Сайт |
SIMAP — расшифровывается как «Similarity Matrix of Proteins», представляет собой базу данных о сходстве белков, созданную с помощью добровольных вычислений, которая свободно доступна для научных целей. SIMAP использует алгоритм FASTA для предвычисления сходства белков, пока другое приложение использует скрытую Марковскую модель для поиска доменов белка.
SIMAP является совместным проектом Мюнхенского технического университета и Национального исследовательского центра окружающей среды и здоровья в Нойерберге.
В четвертом квартале 2010 года, проект переехал в Венский университет.
C 2011 года, данные SIMAP используются в базе данных белок-белковых взаимодействий STRING (с версии 9.0), вместо данных BLAST, выполненных для предыдущих версий STRING[1][2].
Проект обычно выдает задания в начале каждого месяца.
Примечания [править]
Литература [править]
- Arnold R., Rattei T, Tischler P., Truong M.D., Stumpflen V., Mewes W. SIMAP—the similarity matrix of proteins, Bioinformatics (Oxford, England), September 01, 2005.
- Garcia M.C., Sanz-Bobia M. A., Picob J.SIMAP: Intelligent System for Predictive Maintenance: Application to the health condition monitoring of a windturbine gearbox, 2006.
- Rattei T., Tischler P., Arnold R., Hamberger F., Krebs J., Krumsiek J., Wachinger B., Stümpflen V., Mewes W. SIMAP—structuring the network of protein similarities, 2007
- H. Werner Mewes, Andreas Ruepp, Fabian Theis, Thomas Rattei, Mathias Walter, Dmitrij Frishman, Karsten Suhre, Manuel Spannagl, Klaus F.X. Mayer, Volker Stumpflen and Alexey Antonov. MIPS: curated databases and comprehensive secondary data resources in 2010
Ссылки [править]
 |
Это заготовка статьи о программном обеспечении. Вы можете помочь проекту, исправив и дополнив её. |
