ClpP
ClpP (Caseinolytic protease P, произносится «клип пи») — сериновая протеаза в клетках бактерий, митохондриях и хлоропластах эукариот. Компонент ClpXP и ClpAPкомплексов[1] , принадлежащих к важной группе АТФ-зависимых протеаз, куда также относятся протеасомы, Lon, HslVU и FtsH. Все участники этой группы используют АТФ в процессе гидролиза полипептидов.
По классификации MEROPS относится к семейству S14[2]. Структурно семь отдельных полипептидных цепей ClpP соединены нековалентно в кольцо. Два семичленных кольца соединены вместе, одно над другим, образуя цилиндрический тетрадодекамер, в полости которого находится активный сайт и происходит разрушение попавших туда полипептидов клетки[3].
ClpP осуществляет процессивную неспецифичную деградацию белков и пептидов[1]. Специфичность обеспечивается дополнительными белками, в комплексе с которыми ClpP существует в клетке — белками-шаперонами ClpX (прокариоты, митохондрии)[4], ClpA (грам-отрицательные бактерии)[5] или ClpC (грам-положительные бактерии)[6] и связанными с ними дополнительными факторами, такими как ClpS (для ClpA)[7] , SspB[8] и RssB (для ClpX)[9]. Белки-шапероны также активируют ClpP, осуществляют разворачивание белков-субстратов и их перемещение внутрь тетрадодекамера, для чего используют энергию гидролиза АТФ[1]. В отсутствие белков-шаперонов ClpP неактивен, однако некоторые антибиотики, в частности ацилдепсипептиды (ADEP), способны активировать ClpP, что приводит к бесконтрольному протеолизу и, в конечном итоге, к смерти бактериальной клетки[10].
Белки-субстраты для СlpXP или ClpAP комплексов обычно распознаются по коротким аминокислотным мотивам или даже, как в случае с ClpS, по одной N-концевой аминокислоте. Большой класс субстратов в клетках бактерий составляют белки с ssrA-хвостом. Такой хвост из 11 аминокислот (у Escherichia coli) добавляется к белкам, чья мРНК была повреждена и их синтез на рибосоме не может быть закончен (см. тмРНК).
Примечания
- ↑ 1 2 3 Maurizi et al. J Biol Chem. 1990 Jul 25;265(21):12536-45.
- ↑ MEROPS, семейство S14
- ↑ Wang et al. Cell. 1997 Nov 14;91(4):447-56.
- ↑ Gottesman et al. J Biol Chem. 1993 Oct 25;268(30):22618-26.
- ↑ Katayama et al. J Biol Chem. 1988 Oct 15;263(29):15226-36.
- ↑ Msadek et al. Proc Natl Acad Sci U S A. 1994 Jun 21;91(13):5788-92.
- ↑ Dougan et al. Mol Cell. 2002 Mar;9(3):673-83.
- ↑ Levchenko et al. Science. 2000 Sep 29;289(5488):2354-6.
- ↑ Zhou et al. Genes Dev. 2001 Mar 1;15(5):627-37.
- ↑ Kirstein et al. EMBO Mol Med. 2009 Apr;1(1):37-49
 | Это заготовка статьи по молекулярной биологии. Помогите Википедии, дополнив её. |