Jmol

Jmol
Jmol
	; Jmol — Java программа для визуализации трёхмерных молекулярных структур
Тип	Биоинформатика
Разработчик	Команда разработчиков Jmol
Написана на	Java
Операционная система	Кроссплатформенный
Языки интерфейса	каталанский, китайский, чешский, немецкий, английский, французский, нидерландский, венгерский, итальянский, корейский, португальский, испанский, турецкий, русский
Аппаратная платформа	Java Virtual Machine
Последняя версия	16.1.9 (23 марта 2023)
Репозиторий	sourceforge.net/p/jmol/c…
Читаемые форматы файлов:
	Protein Data Bank[d], CIF, MDL Molfile[d], CML, SMILES и XYZ file format[d]
Лицензия	LGPL
Сайт	jmol.org
	Медиафайлы на Викискладе

Jmol — программа для просмотра структуры молекул в трёх измерениях.

Jmol используется как для учебных целей^[2], так и при проведении научных исследований в области молекулярной биологии, химии и биохимии. Программа является свободной и открытой. Она написана на языке Java и потому является кроссплатформенной. Существует как отдельная программа, так и средства для интеграции в другое Java-приложение. Чаще всего программа используется как аплет, встраиваемый в веб-страницу. Программа позволяет строить изображения молекул несколькими способами. Jmol поддерживает большое количество форматов файлов, включая:

Protein Data Bank (pdb)
Crystallographic Information File (cif)
MDL Molfile (mol)
Chemical Markup Language (CML)
Chemical File Format (XYZ).

Скриншоты[править | править код]

Кристаллическая структура H/ACA коробки RNP из архебактерии Pyrococcus furiosus.
Подсвечивание двух солевых мостиков в тетрамере гемоглобина (гемо-группа изображена палочками в нижнем правом углу).
Фрагмент транскрипционного фактора TFIIIA, образующего три последовательных цинковых пальца, присоединённых к последовательности ДНК.
70S-субъединица рибосомы из эубактерии Thermus thermophilus.