TPSAB1

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
TPSAB1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1A0L, 2BM2, 2FPZ, 2FS8, 2FS9, 2FWW, 2FXR, 2GDD, 2ZA5, 3V7T,%%s1LTO, 2F9N, 2F9O, 2F9P, 2ZEB, 2ZEC, 4A6L, 4MPU, 4MPV, 4MPW, 4MPX, 4MQA, 5F03

Идентификаторы
ПсевдонимыTPSAB1, TPS1, TPS2, TPSB1, tryptase alpha/beta 1, TPSB2, Tryptase-2
Внешние IDOMIM: 191080 MGI: 96942 HomoloGene: 55729 GeneCards: TPSAB1
Расположение гена (человек)
16-я хромосома человека
Хр.16-я хромосома человека[1]
16-я хромосома человека
Расположение в геноме TPSAB1
Расположение в геноме TPSAB1
Локус16p13.3Начало1,240,379 bp[1]
Конец1,242,554 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
17-я хромосома мыши
Хр.17-я хромосома мыши[2]
17-я хромосома мыши
Расположение в геноме TPSAB1
Расположение в геноме TPSAB1
Локус17 A3.3|17 12.53 cMНачало25,585,279 bp[2]
Конец25,588,072 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • fundus

  • upper lobe of left lung

  • body of stomach

  • subcutaneous adipose tissue
Наибольшая экспрессия в
  • skin of back

  • mucous cell of stomach

  • skin of abdomen
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

7177

17229

Ensembl

ENSG00000172236

ENSMUSG00000033825

UniProt

P20231
Q15661

P21845

RefSeq (мРНК)

NM_003294

NM_010781

RefSeq (белок)

NP_077078
NP_003285

NP_034911

Локус (UCSC)Chr 16: 1.24 – 1.24 MbChr 17: 25.59 – 25.59 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

TPSAB1 (англ. Tryptase alpha/beta-1; Шифр КФ 3.4.21.59) — фермент триптаза, продукт гена TPSAB1[5][6]. Триптаза бета-1 является изоферментом, экспрессированным на тучных клетках, тогда как изофермент триптаза альфа-1 преимущественно находится на базофилах[7].

Структура и функции[править | править код]

Триптазы входят в семейство S1 трипсино-подобных сериновых протеаз. Они каталитически активны в тетрамерной форме, стабилизируемой гепарином, и устойчивы к известным эндогенным ингибиторам протеаз. Несколько генов триптаз сгруппированы на хромосоме 16p13.3 и обладают некоторыми общими свойствами. Все эти гены имеют высококонсервативные участки 3' UTR и содержат тандемные повторы на 5'-конце, а их 3' UTR участок играет роль в регуляции стабильности их мРНК. Гены содержат интрон непосредственно после инициирующего Met-кодона, отделяющего Met-кодон от кодирующей белок последовательности. Такая особенность структуры гена характерна в основном только для триптаз. Ген TPSAB1 отличается множественностью аллелей, две основные из которых альфа-1 и бета-1 ранее считались различными белками[7].

Триптаза бета-1 — основная нейтральная протеаза, присутствующая в тучных клетках. Она секретируется из клетки в ходе процесса активации-дегрануляции. Может играть роль во врождённом иммунитете. Изоформа 2 расщепляет крупные субстраты, такие как фибронектин, с большей эффективностью, чем изоформа 1 и, наоборот, менее эффективна в расщеплении небольших белковых субстратов[8].

См. также[править | править код]

Примечания[править | править код]

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000172236 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000033825 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Miller J. S., Moxley G., Schwartz L. B. Cloning and characterization of a second complementary DNA for human tryptase (англ.) // J Clin Invest  (англ.) (рус. : journal. — 1990. — October (vol. 86, no. 3). — P. 864—870. — doi:10.1172/JCI114786. — PMID 2203827. — PMC 296804.
  6. ↑ Pallaoro M., Fejzo M. S., Shayesteh L., Blount J. L., Caughey G. H. Characterization of genes encoding known and novel human mast cell tryptases on chromosome 16p13.3 (англ.) // J Biol Chem : journal. — 1999. — February (vol. 274, no. 6). — P. 3355—3362. — doi:10.1074/jbc.274.6.3355. — PMID 9920877.
  7. ↑ 1 2 Entrez Gene: TPSAB1 tryptase alpha/beta 1.
  8. ↑ Jackson N. E., Wang H. W., Bryant K. J., McNeil H. P., Husain A., Liu K. et al. Alternate mRNA splicing in multiple human tryptase genes is predicted to regulate tetramer formation (англ.) // J Biol Chem : journal. — 2008. — Vol. 283, no. 49. — P. 34178—34187. — doi:10.1074/jbc.M807553200. — PMID 18854315. — PMC 2662235.

Литература[править | править код]

  • Sommerhoff C. P., Bode W., Matschiner G., etal. The human mast cell tryptase tetramer: a fascinating riddle solved by structure (англ.) // Biochim. Biophys. Acta  (англ.) (рус. : journal. — 2000. — Vol. 1477, no. 1—2. — P. 75—89. — doi:10.1016/s0167-4838(99)00265-4. — PMID 10708850.
  • Kam C. M., Hudig D., Powers J. C. Granzymes (lymphocyte serine proteases): characterization with natural and synthetic substrates and inhibitors (англ.) // Biochim. Biophys. Acta  (англ.) (рус. : journal. — 2000. — Vol. 1477, no. 1—2. — P. 307—323. — doi:10.1016/s0167-4838(99)00282-4. — PMID 10708866.
  • Caughey G. H. New developments in the genetics and activation of mast cell proteases (англ.) // Mol. Immunol.  (англ.) (рус. : journal. — 2003. — Vol. 38, no. 16—18. — P. 1353—1357. — doi:10.1016/S0161-5890(02)00087-1. — PMID 12217407.
  • Vanderslice P., Ballinger S. M., Tam E. K., etal. Human mast cell tryptase: multiple cDNAs and genes reveal a multigene serine protease family (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1990. — Vol. 87, no. 10. — P. 3811—3815. — doi:10.1073/pnas.87.10.3811. — PMID 2187193. — PMC 53993.
  • Miller J. S., Westin E. H., Schwartz L. B. Cloning and characterization of complementary DNA for human tryptase (англ.) // J. Clin. Invest.  (англ.) (рус. : journal. — 1989. — Vol. 84, no. 4. — P. 1188—1195. — doi:10.1172/JCI114284. — PMID 2677049. — PMC 329777.
  • Schwartz L. B., Bradford T. R., Littman B. H., Wintroub B. U. The fibrinogenolytic activity of purified tryptase from human lung mast cells (англ.) // J. Immunol.  (англ.) (рус. : journal. — 1985. — Vol. 135, no. 4. — P. 2762—2767. — PMID 3161948.
  • Schwartz L. B., Lewis R. A., Seldin D., Austen K. F. Acid hydrolases and tryptase from secretory granules of dispersed human lung mast cells (англ.) // J. Immunol.  (англ.) (рус. : journal. — 1981. — Vol. 126, no. 4. — P. 1290—1294. — PMID 7009736.
  • Xia H. Z., Kepley C. L., Sakai K., etal. Quantitation of tryptase, chymase, Fc epsilon RI alpha, and Fc epsilon RI gamma mRNAs in human mast cells and basophils by competitive reverse transcription-polymerase chain reaction (англ.) // J. Immunol.  (англ.) (рус. : journal. — 1995. — Vol. 154, no. 10. — P. 5472—5480. — PMID 7730649.
  • Blom T., Hellman L. Characterization of a tryptase mRNA expressed in the human basophil cell line KU812 (англ.) // Scand. J. Immunol. : journal. — 1993. — Vol. 37, no. 2. — P. 203—208. — doi:10.1111/j.1365-3083.1993.tb01757.x. — PMID 8434231.
  • Cairns J. A., Walls A. F. Mast cell tryptase is a mitogen for epithelial cells. Stimulation of IL-8 production and intercellular adhesion molecule-1 expression (англ.) // J. Immunol.  (англ.) (рус. : journal. — 1996. — Vol. 156, no. 1. — P. 275—283. — PMID 8598474.
  • Schwartz L. B., Sakai K., Bradford T. R., etal. The alpha form of human tryptase is the predominant type present in blood at baseline in normal subjects and is elevated in those with systemic mastocytosis (англ.) // J. Clin. Invest.  (англ.) (рус. : journal. — 1996. — Vol. 96, no. 6. — P. 2702—2710. — doi:10.1172/JCI118337. — PMID 8675637. — PMC 185977.
  • Cairns J. A., Walls A. F. Mast cell tryptase stimulates the synthesis of type I collagen in human lung fibroblasts (англ.) // J. Clin. Invest.  (англ.) (рус. : journal. — 1997. — Vol. 99, no. 6. — P. 1313—1321. — doi:10.1172/JCI119290. — PMID 9077541. — PMC 507947.
  • Xia H. Z., Du Z., Craig S., etal. Effect of recombinant human IL-4 on tryptase, chymase, and Fc epsilon receptor type I expression in recombinant human stem cell factor-dependent fetal liver-derived human mast cells (англ.) // J. Immunol.  (англ.) (рус. : journal. — 1997. — Vol. 159, no. 6. — P. 2911—2921. — PMID 9300715.
  • Thomas V. A., Wheeless C. J., Stack M. S., Johnson D. A. Human mast cell tryptase fibrinogenolysis: kinetics, anticoagulation mechanism, and cell adhesion disruption (англ.) // Biochemistry : journal. — 1998. — Vol. 37, no. 8. — P. 2291—2298. — doi:10.1021/bi972119z. — PMID 9485375.
  • Pereira P. J., Bergner A., Macedo-Ribeiro S., etal. Human beta-tryptase is a ring-like tetramer with active sites facing a central pore (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 392, no. 6673. — P. 306—311. — doi:10.1038/32703. — PMID 9521329.
  • Huang C., Li L., Krilis S. A., etal. Human tryptases alpha and beta/II are functionally distinct due, in part, to a single amino acid difference in one of the surface loops that forms the substrate-binding cleft (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1999. — Vol. 274, no. 28. — P. 19670—19676. — doi:10.1074/jbc.274.28.19670. — PMID 10391906.
  • Sommerhoff C. P., Bode W., Pereira P. J., etal. The structure of the human betaII-tryptase tetramer: fo(u)r better or worse (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96, no. 20. — P. 10984—10991. — doi:10.1073/pnas.96.20.10984. — PMID 10500112. — PMC 34230.
  • Romagnani P., De Paulis A., Beltrame C., etal. Tryptase-chymase double-positive human mast cells express the eotaxin receptor CCR3 and are attracted by CCR3-binding chemokines (англ.) // Am. J. Pathol.  (англ.) (рус. : journal. — 1999. — Vol. 155, no. 4. — P. 1195—1204. — doi:10.1016/S0002-9440(10)65222-4. — PMID 10514402. — PMC 1867029.
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=TPSAB1&oldid=124553460