TPSB2

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
TPSB2
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1A0L, 2BM2, 2FPZ, 2FS8, 2FS9, 2FWW, 2FXR, 2GDD, 2ZA5, 3V7T

Идентификаторы
ПсевдонимыTPSB2, TPS2, tryptaseB, tryptaseC, tryptase beta 2 (gene/pseudogene), tryptase beta 2
Внешние IDOMIM: 191081 MGI: 96942 HomoloGene: 55729 GeneCards: TPSB2
Расположение гена (человек)
16-я хромосома человека
Хр.16-я хромосома человека[1]
16-я хромосома человека
Расположение в геноме TPSB2
Расположение в геноме TPSB2
Локус16p13.3Начало1,227,272 bp[1]
Конец1,230,184 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
17-я хромосома мыши
Хр.17-я хромосома мыши[2]
17-я хромосома мыши
Расположение в геноме TPSB2
Расположение в геноме TPSB2
Локус17 A3.3|17 12.53 cMНачало25,585,279 bp[2]
Конец25,588,072 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_024164

NM_010781

RefSeq (белок)

NP_077078

NP_034911

Локус (UCSC)Chr 16: 1.23 – 1.23 MbChr 17: 25.59 – 25.59 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

TPSB2 (англ. Tryptase beta-2; Шифр КФ 3.4.21.59) — фермент триптаза, продукт гена TPSB2[5].

Триптаза бета-2 состоит из 275 аминокислот, молекулярная масса 30,6 кДа.

Триптазы входят в семейство S1 трипсино-подобных сериновых протеаз. Они каталитически активны в тетрамерной форме, стабилизируемой гепарином, и устойчивы к известным эндогенным ингибиторам протеаз. Несколько генов триптаз сгруппированы на хромосоме 16p13.3 и обладают некоторыми общими свойствами. Все эти гены имеют высококонсервативные участки 3' UTR и содержат тандемные повторы на 5'-конце, а их 3' UTR участок играет роль в регуляции стабильности их мРНК. Гены содержат интрон непосредственно после инициирующего Met-кодона, отделяющего Met-кодон от кодирующей белок последовательности. Такая особенность структуры гена характерна в основном только для триптаз. Ген TPSB2 отличается множественностью аллелей, две основные из которых бета II и бета III ранее считались отдельными белками. Бета-триптазы - основные нейтральные протеазы, присутствующие в тучных клетках, которые секретируются из клетки в ходе процесса активации-дегрануляции. Может играть роль во врождённом иммунитете[5].

Хотя основные физиологические субстраты бета-триптаз не выяснены, известно, что эти ферменты могут расщеплять несколько потенциально важных белков, включая фибриноген, фибронектин, предшественник матриксной металлопротеиназы про-MMP-3, протеазо-активируемый рецептор PAR2 и компонент комплемента C3[6].

Примечания

[править | править код]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000197253 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000033825 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. 1 2 Entrez Gene: tryptase beta 2 (gene/pseudogene).
  6. Fukuoka Y, Schwartz LB (2007). "Active monomers of human beta-tryptase have expanded substrate specificities". Int Immunopharmacol. 7 (14): 1900–8. doi:10.1016/j.intimp.2007.07.007. PMC 2278033. PMID 18039527.

Литература

[править | править код]