Локус количественных признаков

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Пример ЛКП, идентифицированного на 20-й хромосоме человека и связанного с проявлением остеопороза
Полногеномный поиск ассоциаций, направленный на выявление ЛКП остеопороза у человека

Локусы количественных признаков, сокращённо — ЛКП (от англ. Quantitative Trait Loci — QTLs), являются участками ДНК, либо содержащими гены, либо сцепленными с генами, которые отвечают за тот или иной количественный признак. Количественные признаки относятся к характеристикам, которые различаются по степени своего выражения и могут быть отнесены к полигенным эффектам, то есть являются продуктом двух или более генов.

Природа количественных признаков[править | править вики-текст]

Полигенное наследование[править | править вики-текст]

Для количественных признаков характерно полигенное наследование, также известное как «множественное», или мультифакторное. Оно относится к наследованию характеристик фенотипа, за которые отвечают два или более гена, или взаимодействие последних с окружающей средой, или и то, и другое. В отличие от моногенных признаков, полигенные признаки не подчиняются законам Менделя. Вместо этого фенотипические признаки обычно варьируют с равномерным отклонением, изображаемым при помощи кривой нормального распределения[1].

Примером полигенных признаков может служить цвет человеческой кожи. За определение естественного цвета кожи индивида отвечают многие гены, так что изменение лишь одного из них едва ли приведёт к существенным переменам в цвете.

Полигенные заболевания[править | править вики-текст]

Многие наследственные заболевания имеют полигенную природу; к таковым относятся аутизм, рак, диабет и другие. Большинство фенотипических характеристик являются результатом взаимодействия множества генов.

Примеры заболеваний мультифакторной этиологии:

Врожденные пороки
Болезни, развивающиеся у взрослых

Считается, что заболевания мультифакторной природы составляют большинство среди генетических нарушений человека[4].

Размеры ЛКП[править | править вики-текст]

Показано, что комплексная генетическая система, включающая группу полигенов и образующая локус количественных признаков, может быть достаточно чётко локализованной (компактной). Предполагается, что ЛКП существует в геномах многих высших организмов как цельная единица, и, как было оценено в 1980 году, размер ЛКП может составлять у человека 20 сантиморганид[en][5].

QTL-картирование[править | править вики-текст]

Картирование ЛКП может осуществляться в скрещиваниях инбредных линий

Картирование участков генома, включающих гены, связанные с определённым количественного признака, производится при помощи молекулярных маркеров, таких как AFLP[en] (полиморфизм длин амплифицированных фрагментовсайтах рестрикции), или ПДАФ), микросателлитов или SNP (однонуклеотидный полиморфизм). Это первый шаг в идентификации и определении генов, отвечающих за изменчивость признаков. Затем проводят анализ последовательности ДНК и определяют кандидатные гены, которые могут участвовать в контроле изучаемого количественного признака. В тех случаях, когда геном организма ещё не секвенирован полностью, прибегают к позиционному клонированию[en]. На основе данных сцепления количественного признака с генетически локализоваными полиморфными маркерами выделяют геномные клоны, соответствующие картированному локусу, и путём их секвенирования идентифицируют вероятные гены, связанные с проявлением признака[6][7][8].

Значение в сельском хозяйстве[править | править вики-текст]

У сельскохозяйственных растений и животных множество хозяйственно полезных признаков (продуктивность, выход рисовой крупы, качество яиц и т. п.) наследуются по сложному полигенному типу и находятся под контролем многих генов, расположенных в QTL-локусах[9][10]. Сведения о нуклеотидных последовательностях из районов QTL могут быть использованы, например, в практическом животноводстве для проведения селекции посредством молекулярных маркеров (англ. marker-assisted selection — MAS)[8]. Исследование комплексной молекулярной архитектуры этих локусов является важным и с точки зрения общей генетики. При этом часто применяют методику позиционного клонирования районов хромосом, контролирующих количественные признаки, которые предварительно локализованы с помощью полиморфных (например, микросателлитных) маркеров[11].

См. также[править | править вики-текст]

Примечания[править | править вики-текст]

  1. Lewis R. Multifactorial Traits // Human Genetics: Concepts and Applications. — 5th edn. — New York, NY, USA: McGraw-Hill, 2003. — 454 p. — ISBN 0071198490. (англ.) (Проверено 18 марта 2015) Архивировано из первоисточника 18 марта 2015.
  2. Proud V., Roberts H. Multifactorial Inheritance (англ.). Health Library: Health Information: Medical Genetics. Norfolk, VA, USA: Children's Hospital of The King's Daughters (31 December 2005). Проверено 6 января 2007. Архивировано из первоисточника 15 октября 2006.
  3. 1 2 3 Multifactorial Inheritance (англ.). The March of Dimes: Pregnancy and Newborn Health Education Centre. White Plains, NY, USA: March of Dimes Foundation. Проверено 6 января 2007. Архивировано из первоисточника 10 сентября 2010.
  4. Tissot R. Course Director E. Kaufman: Multifactorial Inheritance (англ.). Human Genetics for 1st Year Students. Chicago, IL, USA: Department of Molecular Genetics, College of Medicine, University of Illinois at Chicago. Проверено 19 марта 2015. Архивировано из первоисточника 19 марта 2015.
  5. локусы количественных признаков. Словари и энциклопедии на Академике: Биология: Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь. Академик. — Источник: Арефьев В. А., Лисовенко Л. А. Англо-русский толковый словарь генетических терминов / Науч. ред. Л. И. Патрушев. — М.: Изд-во ВНИРО, 1995. — 407 с. Проверено 18 марта 2015. Архивировано из первоисточника 18 марта 2015.
  6. Александров А. А., Ковалёв П. В. Позиционное клонирование. База знаний по молекулярной и общей биологии человека. М.: HUMBIO; ООО «Лайт Телеком». Проверено 22 марта 2015. Архивировано из первоисточника 22 марта 2015.
  7. Тарантул B. З. Позиционное клонирование, позиционное картирование (positional cloning, positional mapping) // Толковый биотехнологический словарь. Русско-английский. — М.: Языки славянских культур, 2009. — 936 с. — ISBN 978-5-9551-0342-6. (Проверено 22 марта 2015) Архивировано из первоисточника 18 марта 2015.
  8. 1 2 Сазанов А. А., Царёва В. А., Смирнов А. Ф., Вардецка Б., Корчак М., Ящак К., Романов M. Н. (2003-04-03). "Позиционное клонирование районов хромосом, контролирующих количественные признаки у кур" (PDF) in Итоговый семинар по физике и астрономии по результатам конкурса грантов 2002 г. для молодых учёных Санкт-Петербурга. Тез. докл: 44—45, СПб.: Физико-технический институт им. А. Ф. Иоффе. Проверено 2015-03-19.  Архивировано из первоисточника 19 марта 2015.
  9. Song B.-K., Nadarajah K., Romanov M. N. Ratnam W. Cross-species bacterial artificial chromosome (BAC) library screening via overgo-based hybridization and BAC-contig mapping of a yield enhancement quantitative trait locus (QTL) yld1.1 in the Malaysian wild rice Oryza rufipogon (англ.) // Cellular & Molecular Biology Letters : журнал. — Wrocław, Poland; Berlin, Heidelberg, Germany: Cellular & Molecular Biology Letters, University of Wrocław, Ministry of Science and Higher Education, Poland; Springer Science+Business Media, 2005. — Vol. 10. — № 3. — P. 425—437. — ISSN 1425-8153. — PMID 16217554. Архивировано из первоисточника 15 марта 2015. (Проверено 15 марта 2015)
  10. Сазанов А. А., Царёва В. А., Смирнов А. Ф., Вардецка Б., Корчак М., Ящак К., Романов M. Н. (2004-04-26). "Позиционное клонирование локусов количественных признаков у домашней курицы" (PDF) in Итоговый семинар по физике и астрономии по результатам конкурса грантов 2003 года для молодых учёных Санкт-Петербурга. Тез. докл: 42, СПб.: Физико-технический институт им. А. Ф. Иоффе. Проверено 2015-03-19.  Архивировано из первоисточника 19 марта 2015.
  11. Sazanov A. A., Romanov M. N., Wardecka B., Sazanova A. L., Korczak M., Stekol'nikova V. A., Kozyreva A. A., Smirnov A. F., Dodgson J. B., Jaszczak K. (2004-07-06). "Chromosomal localization of GGA4 BACs containing QTL-linked microsatellites" in Abstracts of the 16th ECACGM (European Colloquium on Animal Cytogenetics and Gene Mapping), Jouy-en-Josas, July 6—9, 2004. Coordinator H. Hayes Cytogenetic and Genome Research 106 (1): 19, Basel: Karger Publishers. DOI:10.1159/000078555. Abstract P18. OCLC 254439250. Проверено 2015-03-19.  (англ.) Архивировано из первоисточника 19 марта 2015.