Музей авиации берёт начало в 1965 году, когда было решено восстановить самолёт Боинг 80А-1, который был обнаружен в Анкоридже. Реставрация проходила в течение 16-ти лет, после окончания которой самолёт был выставлен на обозрение в центральном месте музея. В 1968 году музей получил имя Музея авиации.
В 1975 году «Красный амбар Уильяма Боинга» был приобретён за один доллар в порту Сиэтла, который владел им после того как Боинг оставил его во время Второй мировой войны. Красный амбар, постройки 1909 года был родиной компании Boeing и был перевезён две мили по реке в его настоящее местоположение в юго-западной части музея. И после реставрации, двухэтажный Красный сарай был открыт для публики в 1983 году.
Образовательные программы музея значительно возросли с открытием учебного центра «Челленджер» в 1992 году. Эта интерактивная выставка позволяет студентам испытать миссии шаттла. Он включает в себя макет управления полётами корабля НАСА, и эксперименты во всех областях космических исследований.
Также самолёт Boeing VC-137B, приземлился в Сиэтле в 1996 году и уже скоро был открыт для посетителей.
В 1997 году в музее был открыт полномасштабный Центр интерактивного управления воздушным движением. Башня с видом на взлётно-посадочные полосы King County International Airport (Boeing Field), одного из самых загруженных аэропортов в стране. Выставка предлагает заглянуть на то, что происходит в диспетчерской.
Следующее крупное расширение было в 2004 году, когда в Музей были преданы экспонаты из Музея в Месе, который был закрыт в 2003 году.
Представленные экспонаты
Музей владеет более чем 150 самолётами в своей коллекции, включая:
Boeing 747 «City of Everett» в музее до обширной реставрации в 2014 году(British Airways), один из четырёх Конкордов, представленных за пределами Европы.
В 2007 году в Музее открылась новая космическая выставка: «Космос: открытие новых горизонтов», которая прослеживает эволюцию космического развития со времен первого полёта в космос до идей будущих коммерческих космических полётов.
Библиотека Музея авиации была основана в 1985 году. По состоянию на 2011 год она содержит 66 000 книг и подписывается на 100 периодических изданий. Она специализируется в аэрокосмической и авиационной отрасли. Существует также онлайн-каталог.
Архивы Музея доступны общественности через Kenneth H. Dalhberg Aviation Research Center. Архивы включает в себя миллионы фотографий и тысячи погонных метров рукописных материалов.