Alcanivorax borkumensis
| Alcanivorax borkumensis | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Научная классификация | ||||||||||
|
Домен: Тип: Класс: Порядок: Семейство: Род: Вид: Alcanivorax borkumensis |
||||||||||
| Международное научное название | ||||||||||
|
Alcanivorax borkumensis Yakimov et al. 1998 |
||||||||||
| ||||||||||
Alcanivorax borkumensis (лат.) — вид грамотрицательных, палочковидных бактерий рода Alcanivorax, типовой вид рода. Впервые выделена в акватории Северного моря и описана Якимовым, Голишиным, Лангом, Муром, Абрахамом, Люсдорфом и Тиммисом в 1998 году. Способна использовать углеводороды в качестве единственного источника углерода. Принимает участие в биоочистке морских экосистем от нефтяных загрязнений.
Биологические свойства[править | править код]
Морфология[править | править код]
Неподвижные, неспорообразующие грамотрицательные палочковидные бактерии размером 2—3 × 0,4—0,7 мкм. Не образуют капсул и жгутиков, клетки чувствительны к осмотическому шоку. Зёрна, которые можно увидеть в клетках на электронно-микроскопических снимках, являются гранулами полифосфата. Клетки становятся короче (1—1,5 мкм) в присутствии н-алканов в питательной среде.
Культуральные свойства[править | править код]
Хемоорганогетеротроф, аэроб. Оптимальная температура роста 20—30 °C. Галофил, оптимальная концентрация хлорида натрия в среде 3—10 %, максимальная 12,5 %, рост в осмотически эквивалентной среде в отсутствии ионов натрия невозможен. Оксидазоположителен, образуют каталазу, восстанавливает нитраты до нитритов. Использует углеводороды (например, н-гексадекан) в качестве единственного источника углерода, не способен использовать углеводы (глюкозу, лактозу, фруктозу, сахарозу и т. д.) в качестве источника углерода. Способны утилизировать формиат, ацетат, пропионат, метилпируват и α-кетоглутарат. Продуцируют внеклеточные глюколипиды, обладающие поверхностно-активными свойствами[1].
Геном[править | править код]
Геном Alcanivorax borkumensis штамма SK2 представлен кольцевой двуцепочечной молекулой ДНК размером 3120143 п.н. и содержит 2806 генов, из которых 2755 кодируют белки, процент % Г+Ц пар составляет 54 %[2]. Особенностями генома Alcanivorax borkumensis является сильная упрощённость, малочисленность мобильных генетических элементов и генов, ответственных за продукцию энергии, большое количество генов, ответственных за деградацию углеводородов, образование детергентов, облегчающих эмульгирование углеводородов в морской воде, образование биоплёнок на поверхности капель нефти, что связано с специфическим приспособлениям к биодеградации углеводородов[3][4]. При росте на пирувате и гексадекане отмечается изменение уровня экспрессии 97 мембранных и цитоплазматических белков, предположительно относящихся к 46 оперонным структурам[5]. Также для Alcanivorax borkumensis характерен альтернативный путь биосинтеза триацилглицеролов[6].
Значение[править | править код]
Alcanivorax borkumensis является доминирующим микроорганизмом нефтяных загрязнений в присутствии доступных источников фосфора и азота, осуществляя биодеградацию углеводородов[7][8]. Таким образом, представители рода Alcanivorax принимают важное значение в биоочистке нефтяных загрязнений морских экосистем. Также представляют интерес внеклеточные глюколипиды Alcanivorax borkumensis, имеющие свойства детергента и способные к эмульгации нефти, разрушая нефтяные пятна[9][10]. Разрабатываются генно-инженерные подходы использования внеклеточных полигидроксиалконатов Alcanivorax borkumensis [11].
См. также[править | править код]
Примечания[править | править код]
- ↑ Alcanivorax borkumensis gen. nov., sp. nov., a new, hydrocarbon-degrading and surfactant-producing marine bacterium — Yakimov et al. 48 (2): 339 — International Journal of Sys … Архивная копия от 4 июля 2008 на Wayback Machine Архивировано 4 июля 2008 года.
- ↑ uid=19683 Genome Result
- ↑ Genome sequence of the ubiquitous hydrocarbon-degrading marine bacterium : Alcanivorax borkumensis : Abstract : Nature Biotechnology. Дата обращения: 8 сентября 2008. Архивировано 10 февраля 2009 года.
- ↑ http://bib1lp1.rz.tu-bs.de/docportal/servlets/MCRFileNodeServlet/DocPortal_derivate_00003237/Sabirova-diss.pdf;jsessionid=0000Ld7MQC9JW1rnqPz0pkvn0Ty?hosts=local (недоступная ссылка)
- ↑ Proteomic Insights into Metabolic Adaptations in Alcanivorax borkumensis Induced by Alkane Utilization
- ↑ Analysis of Storage Lipid Accumulation in Alcanivorax borkumensis: Evidence for Alternative Triacylglycerol Biosynthesis Routes in Bacteria — Kalscheuer et al. 189 (3): 918 — … Дата обращения: 8 сентября 2008. Архивировано 12 октября 2008 года.
- ↑ Alcanivorax which prevails in oil-contaminated seawater exhibits broad substrate specificity for alkane degradation — Hara — 2003 — Environmental Microbiology — Wiley Online L … (недоступная ссылка)
- ↑ Distribution of oil-degrading bacteria in coastal seawater, Toyama Bay, Japan — Tanaka — 2008 — Environmental Toxicology — Wiley Online Library (недоступная ссылка)
- ↑ Novel glycine containing glucolipids from the alka… [Biochim Biophys Acta. 1998] — PubMed result
- ↑ http://www2.psu.ac.th/PresidentOffice/EduService/journal/27-6-pdf/15-marine-microorganisms.pdf (недоступная ссылка)
- ↑ Extracellular polyhydroxyalkanoates produced by genetically engineered microorganisms — Patent EP1752532. Дата обращения: 8 сентября 2008. Архивировано 4 марта 2016 года.