Thaumarchaeota

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Thaumarchaeota
Научная классификация
Международное научное название

Thaumarchaeota
Brochier-Armanet et al. 2008

Синонимы

Thaumarchaeota (лат., от греч. thaumas — чудо) — тип архей, содержащий по всего 3 культивируемых вида и около 20 кандидатов (Candidatus). Все открытые на данный момент представители являются хемолитотрофами и окисляют аммиак. Они могут играть важную роль в биохимическом круговороте веществ, в частности круговороте азота.

История изучения[править | править код]

Тип был выделен в 2008 году на основании филогенетических данных, таких как последовательности генов рРНК этих организмов, а также образование ими топоизомеразы I типа, который раньше считался уникальным для эукариот[2][3]. Эти положения были подтверждены дополнительными анализами, результаты которых были опубликованы в 2010 году. В них проверялись геномы окисляющих аммиак архей Nitrosopumilus maritimus и Candidatus Nitrososphaera gargensis. По результатам этих исследований было установлено, что эти два вида имеют отдельное происхождение вместе с другим видом, Cenarchaeum symbiosum, который был первым описанным видом Thaumarchaeota[4].

Классификация[править | править код]

Современная классификация базируется на данных List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature[en] (LPSN), а также Национального центра биотехнологической информации (NCBI). Если на июль 2017 года в первом источнике тип представлен единственным видом Nitrososphaera viennensis[5] из класса Nitrososphaeria[6], то второй включает большее число таксонов рангом от вида до порядка, из которых большая часть — кандидаты. В классификации ниже показаны все таксоны до рода включительно и все культивируемые виды[7], при этом таксоны, чьи представители известны в чистой культуре, вынесены на первое место:

Примечания[править | править код]

  1. 1 2 Thaumarchaeota на сайте Национального центра биотехнологической информации (NCBI). (Проверено 5 августа 2017).
  2. Brochier-Armanet C., Boussau B., Gribaldo S., Forterre P. (2008). «Mesophilic crenarchaeota: Proposal for a third archaeal phylum, the Thaumarchaeota». Nature Reviews Microbiology 6 (3): 245—252. DOI:10.1038/nrmicro1852. PMID 18274537.
  3. Brochier-Armanet C., Gribaldo S., Forterre P. (2008). «A DNA topoisomerase IB in Thaumarchaeota testifies for the presence of this enzyme in the last common ancestor of Archaea and Eucarya». Biology Direct 3: 54. DOI:10.1186/1745-6150-3-54. PMID 19105819.
  4. Spang A., Hatzenpichler R., Brochier-Armanet C., Rattei T., (2010). «Distinct gene set in two different lineages of ammonia-oxidizing archaea supports the phylum Thaumarchaeota». Trends in Microbiology 18 (8): 331—340. DOI:10.1016/j.tim.2010.06.003. PMID 20598889.
  5. Genus Nitrososphaera : [англ.] // LPSN. (Проверено 5 августа 2017).
  6. Classification of domains and phyla - Hierarchical classification of prokaryotes (bacteria) : Version 2.0 : [англ.] // LPSN. — 2016. — 2 October.
  7. Taxonomy Browser : Thaumarchaeota : [англ.] // NCBI. (Проверено 5 августа 2017).
  8. Tourna M., Stieglmeier M., Spang A., Könneke M., Schintlmeister A., Urich T., Engel M., Schloter M., Wagner M. (2011). «Nitrososphaera viennensis, an ammonia oxidizing archaeon from soil». Proceedings of the National Academy of Sciences 108 (20): 8420—8425. DOI:10.1073/pnas.1013488108. PMID 21525411.