Клуб был основан 30 мая1923 года, когда клубы Šk Čechie и ČšŠk были объединены в ФК «Спартак» (Трнава). После прихода к власти коммунистов клуб был переименован в «Металлург». Но в 1952 году историческое название было возвращено.
Начало золотой эры «Спартака» приходится на сезон 1966/67. Команда под руководством легендарного тренера Антона Малатинского была лидером осенней части чемпионата, но к концу сезона спустилась на 3-e место. Величайшим успехом является победа в Кубке Митропы, на пути к которой были повержены такие гранды, как «Лацио» и «Фиорентина». В следующем сезоне «Спартак» вышел в полуфинал Кубка чемпионов, где проиграл «Аяксу». В общей сложности, за 10 лет (с 1968 по 1978), команда 5 раз брала золотые медали. Также Спартак вышел в четвертьфинал Кубка чемпионов в 1973 и 1974 годах.
В чемпионате Словакии Спартак вышел на одну из главных ролей. Клуб редко опускается ниже 5-го места. Команда дважды брала серебряные медали и четырежды бронзовые, а высшим достижением является победа в национальном кубке 1998 года. В финале был обыгран Кошице со счетом 2-0.
Спартак (Трнава)
Ладислав Куна (посмертно)
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
«Баник» 
