Энхансер

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
(перенаправлено с «Энхансер (генетика)»)
Перейти к: навигация, поиск

Энхансер (англ. enhancer — усилитель, увеличитель) — небольшой участок ДНК, который после связывания с ним факторов транскрипции стимулирует транскрипцию с основных промоторов гена или группы генов. Энхансеры не обязательно находятся в непосредственной близости от генов, активность которых они регулируют, и даже не обязательно располагаются с ними на одной хромосоме. Энхансеры могут располагаться как в 5'-, так и в 3'-положении относительно матричной цепи регулируемого гена и в любой ориентации к ней. Энхансеры также могут находиться внутри интронов. Тем не менее для работы энхансера необходим его физический контакт с промотором, который осуществляется за счёт «выпетливания» ДНК между энхансером и промотором[1]. Молекулярный механизм действия энхансера заключается в том, что он благодаря собранному на нём белковому комплексу привлекает РНК-полимеразу II и кофакторы транскрипции в область промотора.

Энхансеры были впервые обнаружены в эукариотических системах[2][3], но впоследствии сходные примеры регуляции транскрипции были открыты и у прокариот[4].

Свойства энхансеров[править | править вики-текст]

Энхансерные участки хроматина обладают следующими свойствами[5]:

Исходя из этих свойств, с помощью высокопроизводительных методов в геноме человека было обнаружено около миллиона потенциальных энхансеров[6][7].

Теории[править | править вики-текст]

На данный момент существует две теории, объясняющие механизм считывания информации с энхансера:

  • Энхансеосомы — основаны на высококоординированном действии и могут быть выключены из работы единичной точечной мутацией, удаляющей или перемещающей сайты связывания белков.
  • Гибкие системы — менее интегративные белки, независимо регулирующие экспрессию генов и лишь их суммарная активность влияет на транскрипцию.

Примечания[править | править вики-текст]

  1. Lee T. I., Young R. A. Transcriptional regulation and its misregulation in disease. (англ.) // Cell. — 2013. — Vol. 152, no. 6. — P. 1237—1251. — DOI:10.1016/j.cell.2013.02.014. — PMID 23498934. исправить
  2. Banerji J., Rusconi S., Schaffner W. Expression of a beta-globin gene is enhanced by remote SV40 DNA sequences. (англ.) // Cell. — 1981. — Vol. 27, no. 2 Pt 1. — P. 299—308. — PMID 6277502. исправить
  3. Moreau P., Hen R., Wasylyk B., Everett R., Gaub M. P., Chambon P. The SV40 72 base repair repeat has a striking effect on gene expression both in SV40 and other chimeric recombinants. (англ.) // Nucleic acids research. — 1981. — Vol. 9, no. 22. — P. 6047—6068. — PMID 6273820. исправить
  4. Xu H., Hoover T. R. Transcriptional regulation at a distance in bacteria. (англ.) // Current opinion in microbiology. — 2001. — Vol. 4, no. 2. — P. 138—144. — PMID 11282468. исправить
  5. Li W., Notani D., Rosenfeld M. G. Enhancers as non-coding RNA transcription units: recent insights and future perspectives. (англ.) // Nature reviews. Genetics. — 2016. — Vol. 17, no. 4. — P. 207—223. — DOI:10.1038/nrg.2016.4. — PMID 26948815. исправить
  6. An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome. (англ.) // Nature. — 2012. — Vol. 489, no. 7414. — P. 57—74. — DOI:10.1038/nature11247. — PMID 22955616. исправить
  7. Thurman R. E., Rynes E., Humbert R., Vierstra J., Maurano M. T., Haugen E., Sheffield N. C., Stergachis A. B., Wang H., Vernot B., Garg K., John S., Sandstrom R., Bates D., Boatman L., Canfield T. K., Diegel M., Dunn D., Ebersol A. K., Frum T., Giste E., Johnson A. K., Johnson E. M., Kutyavin T., Lajoie B., Lee B. K., Lee K., London D., Lotakis D., Neph S., Neri F., Nguyen E. D., Qu H., Reynolds A. P., Roach V., Safi A., Sanchez M. E., Sanyal A., Shafer A., Simon J. M., Song L., Vong S., Weaver M., Yan Y., Zhang Z., Zhang Z., Lenhard B., Tewari M., Dorschner M. O., Hansen R. S., Navas P. A., Stamatoyannopoulos G., Iyer V. R., Lieb J. D., Sunyaev S. R., Akey J. M., Sabo P. J., Kaul R., Furey T. S., Dekker J., Crawford G. E., Stamatoyannopoulos J. A. The accessible chromatin landscape of the human genome. (англ.) // Nature. — 2012. — Vol. 489, no. 7414. — P. 75—82. — DOI:10.1038/nature11232. — PMID 22955617. исправить

См. также[править | править вики-текст]

  • STARR-seq — высокопроизводительный метод идентификации энхансеров в геномах.

Литература[править | править вики-текст]

Ссылки[править | править вики-текст]