SARS-CoV-2: различия между версиями

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
[непроверенная версия][непроверенная версия]
Содержимое удалено Содержимое добавлено
→‎Ссылки: Добавить ссылку на отслеживание эволюции вируса
Строка 157: Строка 157:
|accessdate = 2020-01-26
|accessdate = 2020-01-26
|ref = CDC, Novel Coronavirus 2019 Situation Summary
|ref = CDC, Novel Coronavirus 2019 Situation Summary
}}
* {{Cite web 2
|title = Genomic epidemiology of novel coronavirus (nCoV)
|url = https://nextstrain.org/ncov?c=num_date
|work = Real-time tracking of pathogen evolution
|publisher = Nextstrain
|lang = en
|description = Система отслеживания эволюции вируса в реальном времени
|ref = Nextstrain
}}
}}
* {{Cite web|lang=en
* {{Cite web|lang=en

Версия от 17:32, 27 января 2020

SARS-CoV-2
Научная классификация
Группа:
Реалм:
Царство:
Класс:
Порядок:
Подпорядок:
Cornidovirineae
Семейство:
Подсемейство:
Штамм:
SARS-CoV-2
Международное научное название
2019-nCoV
Группа по Балтимору
IV: (+)оцРНК-вирусы

2019-nCoV (англ. Wuhan coronavirus, Wuhan seafood market pneumonia virus[2][3]) — новый штамм коронавируса, выявленный в конце 2019 года во время вспышки пневмонии в Ухане 2019—2020 годов. Представляет собой одноцепочечный РНК-содержащий вирус, вызывающий заболевания дыхательных путей у людей[4][5].

По заявлению министра Национальной комиссии здравоохранения Китая[англ.] Ма Сяовэя[англ.], инкубационный период вируса составляет от 1 до 14 дней, в течении которого также возможно заражение от человека к человеку[6][7], где на этой стадии его обнаружение тепловизорами неэффективно[8].

История изучения

Штамм 2019-nCoV впервые обнаружен в декабре 2019 года в результате анализа нуклеиновой кислоты у пациента с пневмонией во время вспышки пневмонии в Ухане 2019—2020 годов[9].

31 декабря 2019 года Всемирная Организация Здравоохранения была оповещена о нескольких случаях пневмонии, вызванной неизвестным вирусом. 7 января 2020 года информация о новом вирусе была подтверждена, а сам вирус был отнесён к коронавирусам[10]. Геном вируса первыми полностью расшифровали службы здравоохранения Китая[11], а 13 января он был уже зарегистрирован в базе данных GenBank[12]. 20 января 2020 года в китайской провинции Гуандун была подтверждена передача вируса от человека к человеку[13]. Cпецифическая противовирусная терапия для него ещё не разработана.

Коронавирусы, к которым относится 2019-nCoV, обычно вызывают простуду, но к этому же семейству относятся опасные вирусы SARS-CoV и MERS-CoV, вызывающие тяжёлый острый респираторный синдром и ближневосточный респираторный синдром соответственно[10]. Коронавирусная инфекция является зооантропонозной, то есть возможна передача от животных к человеку. Выяснено, что источником SARS-CoV были циветы, а MERS-CoV — одногорбые верблюды[14]. Возможно, что и в случае 2019-nCoV источником инфекции являются животные — генетический анализ вируса выявил схожесть с коронавирусами, распространёнными среди подковоносых летучих мышей, однако пока достоверно не известно, являются ли они изначальным источником инфекции. Сейчас же основным способом распространения вируса является передача от человека к человеку[15][⇨].

12 января 2020 года в Шанхай приехала жительница Уханя, заболевшая дома 10 января. 15 января она обратилась в амбулаторию, была изолирована, через 6 дней выздоровела и была выписана. Это первый лабораторно-подтверждённый случай инфекции 2019-nCov в Шанхае[16].

Распространение вируса

Карта распространения вируса на 25 января. Красный — подтверждённые случаи, синий — подозреваемые случаи.

На 27 января подтверждён 2901 случай заражения: на материковом Китае (2839), в Гонконге (8), Таиланде (8), Макао (6), Австралии (5), Сингапуре (5), США (5), Тайване (5), Южной Корее (4), Малайзии (4), Японии (4), Франции (3), Вьетнаме (2), Камбодже (1), Непале (1), Шри-Ланке (1), и 82 смертельных случая (все в Китае). Излечено около 60 человек.

По мнению бывшей чиновницы Центра по контролю и профилактике заболеваний КНР Ян Гунхуань, пик эпидемии придётся на февраль 2020 года при условии, что развитие эпидемии будет сходным с эпидемией атипичной пневмонии в 2003 году[17].

Симптомы

Симптомы коронавируса 2019-nCoV схожи с симптомами пневмонии или тяжёлого острого респираторного синдрома:

Инкубационный период длится в течение 6—12 дней. Если инфицирование произошло от человека к человеку, то инкубационный период не превышает пяти дней. Более продолжительные сроки инкубационного периода могут быть характерны при передаче вируса от животных.

Предварительный анализ данных позволяет утверждать, что имеется высокая контагиозность при контакте с больным человеком.

Подтверждена и продемонстрирована передача вируса от человека к человеку[19].

Лица, контактировавшие в домашних или больничных условиях с заболевшими, наиболее подверженны возникновению стадии острого респираторного заболевания, в случае которого непосредственной причиной смерти является прогрессирующая острая неконтролируемая дыхательная недостаточность (респираторный дистресс-синдром).

Вирусология

Предполагаемая организация генома коронавируса 2019-nCoV
Предполагаемая организация генома коронавируса 2019-nCoV

Последовательности бетакоронавируса[англ.] обнаруживают сходство с бетакоронавирусами, выявленными у летучих мышей из Китая. Однако вирус генетически отличается от других коронавирусов, которые вызывают[20]:

2019-nCoV, как и SARS-CoV, является членом линии Beta-CoV B[21].

Было выделено, описано и исследуется пять геномов нового коронавируса[22][23][24]:

  • BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-01/2019;
  • BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-04/2019;
  • BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-05/2019;
  • BetaCoV/Wuhan/WIV04/2019;
  • BetaCoV/Wuhan/IPBCAMS-WH-01/2019.

Длина РНК-последовательности коронавируса составляет около 30 000 нуклеотидов.

РНК варианта Wuhan-Hu-1[25] (номер GenBank MN908947) 2019-nCoV содержит 29 903 нуклеотида с нетранслируемыми участками длиной 281 и 325 нуклеотидов. Предполагаемые кодирующие области распределены по 10 белкам. С точки зрения последовательности генов это соответствует вирусу SARS-CoV и иным коронавирусам.

Генетически вирус на 80 % идентичен Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS)[26].

Источник вируса

22 января 2020 года медицинский журнал Journal of Medical Virology[англ.] опубликовал исследование китайских учёных, в котором пять геномов вируса 2019-nCoV сопоставили с 276 известными геномными последовательностями коронавирусов, поражающих людей и различных животных. По мнению учёных, построенное филогенетическое древо коронавирусов показывает, что новые вирусы появились ориентировочно два года назад от одного общего предка, путём гомологичной рекомбинации между коронавирусом летучей мыши и, возможно, коронавирусом китайских змей — южнокитайского многополосного крайта или китайской кобры (обе разновидности змей продавались на рынке в Ухане в качестве экзотической пищи[англ.])[27][28].

Однако, ряд исследователей оспаривают (публикация в журнале Nature)[29] подобный вывод китайских учёных[30], и утверждают, что, с их точки зрения, маловероятно, что в качестве источника заражения могли выступить змеи, где наиболее вероятными кандидатами на эту роль являются млекопитающие и птицы. По мнению Пауло Эдуардо Брандао, вирусолога из Университета Сан-Паулу, китайские учёные не предоставили доказательств того, что змеи могут заражаться новым коронавирусом и служат для него хозяином, в том числе поскольку нет надёжных доказательств наличия коронавирусов у хозяев, кроме млекопитающих и птиц. Цуй Цзе, вирусолог из Шанхайского института Пастера, входивший в группу, выявившую в 2017 году вирусы, связанные с атипичной пневмонией у летучих мышей, сообщает, что полевые работы после вспышки атипичной пневмонии в 2002—2003 годах обнаружили такие вирусы только у млекопитающих.

Другая группа китайских учёных предположила, что источником вируса 2019-nCoV являются летучие мыши, поскольку РНК образцов 2019-nCoV на 96 % совпала с РНК вируса, который ранее находили у азиатских подковоносов (Rhinolophus affinis). Кроме того, коронавирус 2019-nCoV на 79,5 % похож на вирус атипичной пневмонии, эпидемия которой началась в Китае в 2002 году[31].

Профилактика и лечение

Всемирная организация здравоохранения дала рекомендации[32] по снижению риска заражения 2019-nCoV:

  • Часто мойте руки с мылом или спиртосодержащим средством. Продолжительность мытья должна быть не менее 20 секунд.
  • Старайтесь не касаться грязными руками слизистых, глаз, рта;
  • Избегайте тесного контакта с заражёнными людьми;
  • Проводите влажную уборку с дезинфицирующими средствами. Особенно тщательно обрабатывайте поверхности, с которыми чаще всего контактируете.

В основном, пациенты получают симптоматическую и поддерживающую терапию[33]. В январе 2020 года медики в Китае опробовали метод лечения пневмонии, вызванной коронавирусом 2019-nCoV, путём экстракорпоральной оксигенации — насыщения крови кислородом (ЭКМО)[34].

См. также

Примечания

  1. Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
  2. Zhang, 2020.
  3. Wuhan seafood market pneumonia virus (англ.). Taxonomy browser. NCBI.
  4. Surveillance case definitions for human infection with novel coronavirus (nCoV) : Interim guidance v2 : [англ.]. — World Health Organization, 2020. — 15 January. — 1 p. — WHO/2019-nCoV/Surveillance/v2020.2.
  5. Novel coronavirus (2019-nCoV), Wuhan, China : [англ.]. — CDC USA, 2020. — 23 January. — Дата обращения: 23.01.2020.
  6. Коронавирус в Китае: какой инкубационный период и сколько дней заразный.
  7. Hong Kong bans entry of visitors from China virus province.
  8. Снять «корону»: в РФ создают тест для выявления «китайской» пневмонии.
  9. New-type coronavirus causes pneumonia in Wuhan : expert : [англ.] // News. — Xinhua. — Дата обращения: 09.01.2020.
  10. 1 2 Novel Coronavirus (2019-nCoV) (англ.). World Health Organisation. Дата обращения: 26 января 2020.
  11. CDC, Novel Coronavirus 2019 Situation Summary.
  12. ASM985889v3. (Wuhan seafood market pneumonia virus) (англ.). GenBank. U.S. National Center for Biotechnology Information (13 января 2020). Дата обращения: 26 января 2020.
  13. Associated Press. China confirms human-to-human transmission of new coronavirus (англ.). CBC News (20 января 2020). Дата обращения: 21 января 2020.
  14. Coronavirus (англ.). World Health Organisation. Дата обращения: 26 января 2020.
  15. Questions and Answers on 2019novel-Coronavirus. Scientific expertise (англ.). OIE. World Organisation for Animal Health. Дата обращения: 26 января 2020.
  16. 上海发布. 快讯!上海首例新型冠状病毒感染的肺炎确诊病例治愈出院 (кит.). ThePaper.cn (24 января 2020). Дата обращения: 24 января 2020.
  17. Пик эпидемии пневмонии нового типа в Китае может прийтись на февраль. ТАСС (23 января 2020). Дата обращения: 25 января 2020.
  18. Коронавирус в Китае: какой инкубационный период и сколько дней заразный.
  19. The Associated Press. China confirms human-to-human transmission of new coronavirus. CBC / Radio Canada (ноябрь 2020).
  20. Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses. nextstrain. Дата обращения: 18 января 2020.
  21. Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses. nextstrain. Дата обращения: 18 января 2020.
  22. CoV2020. platform.gisaid.org. Дата обращения: 12 января 2020.
  23. Initial genome release of novel coronavirus (амер. англ.). Virological (11 января 2020). Дата обращения: 12 января 2020.
  24. NCBI: Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome
  25. NCBI: Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome
  26. Redacción (2020-01-25). "Cómo se compara el actual coronavirus con el SARS y qué aprendió China de la mortífera epidemia de hace 17 años". BBC News Mundo. Дата обращения: 27 января 2020.
  27. Wei Ji, 2020, с. 1—29.
  28. Китайский коронавирус оказался гибридом вирусов змеи и летучей мыши.
  29. Callaway, 2020.
  30. Snakes?! The Slippery Truth of a Flawed Wuhan Virus Theory. One paper advanced a controversial theory about the disease's origin. Other scientists aren't biting.
  31. Zhou, 2020.
  32. Novel Coronavirus (2019-nCoV) advice for the public. — World Health Organisation. — Дата обращения: 26.01.2020.
  33. Главное о китайском коронавирусе. Есть ли опасность массового заражения жителей России. Телеканал 360°, 22 января 2020.
  34. В Китае выявили метод лечения нового коронавируса. «Известия», 23 января 2020.

Литература

Ссылки

Дополнительные ссылки