Гаплогруппа L3 (мтДНК)

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Гаплогруппа L3
Тип мтДНК
Время появления 104 000—84 000 лет тому назад[1]
Место появления Восточная Африка[2]
Предковая группа Митохондриальная Ева
Субклады L3a, L3b, L3c, L3d, L3e, L3f, L3h, L3i, L3j, L3k, L3x, M, N [3]
Мутации-маркеры 769, 1018, 16311

Гаплогруппа L3 — в популяционной генетике — гаплогруппа митохондриальной ДНК человека.

Происхождение[править | править вики-текст]

Предполагается, что гаплогруппа возникла около 105—85 тыс. лет тому назад.

Гаплогруппа L3 была обнаружена у представителя культуры докерамического неолита B[4]. Субклада L3x2a была обнаружена у обитателя эфиопской пещеры Мота, жившего 4500 лет назад[5].

Распространение[править | править вики-текст]

Чаще всего данная гаплогруппа встречается в Восточной Африке, в отличие от других территорий Африки, где 2/3 всех митохондриальных ДНК представляют гаплогруппы L1 и L2[6].

L3 подразделяется на несколько подгрупп, одна из которых, как предполагается, является предком макро-гаплогрупп M и N, от которых произошло большинство неафриканских народов.

Одна из этих линий, которая определяется потерей участка DdeI на np 10394, представляет лишь небольшой процент африканских мтДНК, однако является, по-видимому, предком почти половины всех европейских, азиатских и индейских мтДНК."[7]

По мнению Мака-Майер и др., «L3 больше связана с евразийскими гаплогруппами, чем с наиболее разнообразными африканскими кластерами L1 и L2»[8] L3 — это гаплогруппа, от которой происходят все современные люди за пределами Африки.[9].

В Европе на мтДНК макрогаплогруппу L приходится <1 %, при этом ~ 65 % европейских L линий прибыли в историческое время, а оставшиеся 35 % L мтДНК образуют европейские субклады, прибывшие в Европу из Африки к югу от Сахары 11 000 лет назад[10].

Подклассы (потомки) гаплогруппы L3[править | править вики-текст]

Филогенетическое дерево[править | править вики-текст]

Приведённое ниже филогенетическое дерево основано на публикации Ван Овена (Van Oven 2008) и последующих опубликованных исследованиях.

  • L3
    • L3a 152, 523-524d, 12816 16316
    • L3b 3450, 5773, 6221, 9449, 10086, 13914A, 15311, 15824, 15944d, 16124, 16278, 16362 (западная Африка)
      • L3b1 10373, 16519
        • L3b1a 11002
        • L3b1b 152, 9079, 15664
      • L3b2 3420, 16183C, 16189
    • L3c 195, 498.1C, 678, 3582, 4491, 5393, 7394, 9337, 9682, 12373, 14221, 14371, 14560, 14587, 16311, 16362
    • L3d 5147, 7424, 8618, 13886, 14284, 16124 (западная Африка)
      • L3d1 6680
        • L3d1a 4048, 7648, 11887
          • L3d1a 4048, 7648, 11887
            • L3d1a1 1503, 16319
        • L3d1b 5046
        • L3d1c 3203, 9111, 11239, 12870, 13542, 16166
        • L3d1d 7765, 9151, 16086, 16256, 16368, 16519
      • L3d2 3394, 11518, 12873, 14272, 14584, 15115
      • L3d3 4688
        • L3d3a 2416, 15208
    • L3j 5821, 6182, 6722, 8676, 9365, 9731A, 12280, 12534, 14260, 15314, 15479, 15514
    • L3e 2352, 14212 (центральная Африка/Судан)
      • L3e1 189, 200, 6221, 6587, 14152, 15670, 15942, 16327
        • L3e1a 16185
          • L3e1a1 185, 8650, 16311
          • L3e1a2 195, 207, 5774A, 9254, 11024, 14569, 16209
          • L3e1a3 10398
        • L3e1b 14926, 16325d
        • L3e1c 3675, 5460, 8289.1CCCCCTCTA, 8701, 14323
        • L3e1d 152, 8703, 9300, 12738, 16176
        • L3e1e 10370, 14571A
      • L3e2 195, 14905, 16320, 16519
        • L3e2a 4823, 13105, 14869
        • L3e2b 16172, 16183C, 16189
          • L3e2b1 408A, 2483, 9377, 16188.1C
          • L3e2b2 11377, 16182C
      • L3e3 195, 2000, 6524, 9554, 10667, 10816, 13101C, 16265T
        • L3e3a 10286, 12397
        • L3e3b 4655, 12248, 13197, 13651, 15812
      • L3e4 3915, 5584, 11257, 13749, 16051
      • L3e5 398, 8392, 16041
    • L3i 7645
      • L3i1 10679, 11260, 13800A
        • L3i1a 13967, 14060, 15758
        • L3i1b 2158, 13687, 16153
      • L3i2 152, 189, 504, 523-524d, 5441, 8222, 12630, 14818, 15388, 15944d, 16260, 16311 (Эфиопия — ранее называлась L3w)
    • L3k 235, 494, 3918, 6620G, 9467, 13135, 13992, 15314
    • L3x 3483, 5899.1C, 6401, 8311, 8817, 13708, 16169 (Эфиопия, оромо)[11]
      • L3x1 204, 15172, 16278
      • L3x2 249d, 494, 9941, 16195
        • L3x2a 3435, 16193, 16223
    • L3f 3396, 4218, 15514, 15944d, 16209, 16519 (восточная Африка)
      • L3f1 5601, 9950
        • L3f1a 3693, 4350, 5194, 14148, 15106
        • L3f1b 189, 200, 1822, 7819A, 8527, 8932, 11440, 14769, 16292, 16311
          • L3f1b1 8410, 10070, 16129, 16295
          • L3f1b2 7235A
          • L3f1b3 711, 6806, 7158
      • L3f2 745.1T, 16311
        • L3f2b 374.1A, 2442, 5342, 11016, 12338, 15466, 15658
        • L3f3 189, 318, 959, 4643, 5181, 6602, 8158, 8251, 9932, 10604, 11770, 15940, 16176, 16234 (Чадский бассейн, центральная Африка)[12]
    • L3h- 7861, 9575
      • L3h1 1719, 4388, 5300, 9509, 11590, 16311
        • L3h1a 5492
          • L3h1a1 516, 709, 4117, 5316, 8047, 8485, 9080, 12432, 13708, 13926, 14110
          • L3h1a2 8781A
            • L3h1a2a 146, 4688, 4742, 8943, 12175, 12236, 12519, 14587, 14862, 15646, 16399
        • 'L3h1b 189C, 195, 523-524d, 10044, 14410, 16284, 16256A
          • L3h1b1 3777

Примечания[править | править вики-текст]

  1. Tishkoff et al., Whole-mtDNA Genome Sequence Analysis of Ancient African Lineages, Mol. Biol. Evol, 24(3):757-68. 2007
  2. Salas et al. (2002), The Making of the African mtDNA Landscape, Am J Hum Genet. 2002 November; 71(5): 1082–1111
  3. van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394. http://www.phylotree.org, mtDNA tree Build 2 (14 Oct 2008)
  4. Fernández E. et al. (2014), Ancient DNA analysis of 8000 B.C. Near Eastern farmers supports an Early Neolithic pioneer maritime colonization of mainland Europe through Cyprus and the Aegean Islands, PLoS Genetics 10(6): e1004401.
  5. Ancient Ethiopian genome reveals extensive Eurasian admixture throughout the African continent
  6. Wallace D. C. et al. (2000), Origin of haplogroup M in Ethiopia, Am J Hum Genet 67(Suppl):217
  7. Wallace et al., Mitochondrial DNA variation in human evolution and disease, Gene, 1999 Sep 30;238(1):211-30
  8. Maca-Meyer et al. (2001), Major genomic mitochondrial lineages delineate early human expansions, BMC Genetics 2001, 2:13
  9. Cambridge DNA Services
  10. María Cerezo et al. «Reconstructing ancient mitochondrial DNA links between Africa and Europe»
  11. Kivisild et al. 2004 November. «Ethiopian Mitochondrial DNA Heritage: Tracking Gene Flow Across and Around the Gate of Tears» American Journal of Human Genetics 75(5): 759
  12. Černý et al., (2009). Migration of Chadic speaking pastoralists within Africa based on population structure of Chad Basin and phylogeography of mitochondrial L3f haplogroup. BMC Evolutionary Biology, 9:63, 2.

См. также[править | править вики-текст]

Древо гаплогрупп мтДНК человека

Митохондриальная Ева
|
L0 L1 L2 L3 L4 L5 L6 L7
|
M N
| |
CZ D E G Q R A S X Y N1 N2
| | | |
C Z B F R0 pre-JT P UK I N1a W
| | |
HV JT U K
| |
H V J T Устаревшие кластеры IWX


Ссылки[править | править вики-текст]

Общие сведения[править | править вики-текст]

Гаплогруппа L3[править | править вики-текст]