IRF1

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Регуляторный фактор интерферона 1
Protein IRF1 PDB 1if1.png
PDB rendering based on 1if1.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
СимволIRF1 ; IRF-1; MAR
Внешние IDOMIM: 147575 MGI96590 HomoloGene1658 GeneCards: IRF1 Gene
Профиль экспрессии РНК
PBB GE IRF1 202531 at tn.png
Больше информации
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez365916362
EnsemblENSG00000125347ENSMUSG00000018899
UniProtP10914P15314
RefSeq (мРНК)NM_002198NM_001159393
RefSeq (белок)NP_002189NP_001152865
Локус (UCSC)Chr 5:
131.82 – 131.83 Mb
Chr 11:
53.77 – 53.78 Mb
Поиск в PubMed[1][2]

Регуляторный фактор интерферон 1 белок, который у человека кодируется геном IRF1.[1][2]

Функция[править | править код]

Регуляторный фактор Интерферон 1 первым из членов семейства регуляторных факторов транскрипции (IRF) интерферона был идентифицирован. Сначала был описан, как фактор транскрипции, способный активировать экспрессию цитокинов интерферона бета[en],[3] но впоследствии было выявлено, что IRF-1 может функционировать в качестве активатора транскрипции или репрессора различных генов-мишеней. IRF-1 регулирует экспрессию генов-мишеней путём связывания с интерфероном стимулирующих элементов ответа (ISRE) в своих промоторах . Белок IRF-1 связывается с ISRE через N-терминальные спираль-поворот-спираль ДНК-связывающие домены,[4], которые высоко консервативны среди всех белков IRF.

Также было выявлено, что помимо своей функции в качестве фактора транскрипции, IRF-1 способен трансактивировать белок-супрессор опухолей р53 посредством его кофактора p300[en].[5]

IRF-1, как было выявлено, играет роль в иммунных откликах, регулирующих апоптоз, повреждения ДНК и подавление опухолей.[6]

Регуляция[править | править код]

Было выявлено, что экстремальное С-окончание[en] IRF-1 регулирует способность активировать транскрипцию, нанотела[en], направленные в эту область (MF1) способны увеличивать активность IRF-1.[7]

Модельные организмы[править | править код]

Модельные организмы были использованы при исследовании функций IRF1. Условная линия нокаутных мышей, называемая Irf1tm1a(EUCOMM)Wtsi,[11][12] была создана в рамках международной программы консорциума Нокаутная мышь[en] - большой мутагенезный проект для создания и распространения модельных животных для изучения болезней заинтересованными учёными - в институте Сенгера.[13][14][15]

Самцы и самки животных прошли стандартное фенотипическое обследование[en], чтобы определить влияние удаления.[9][16] Двадцать пять испытаний были проведены и два фенотипических параметра оказались аномальными. Гомозиготные[en] мутантные животные имели патологию лимфоцитов периферической крови[en], в частности, уменьшение числа CD8-положительных Т-клеток и NK клеток и увеличение CD4-положительных Т-клеток. Мыши также имели аномалии фенотипа кожного покрова, определённого изучением хвостового эпидермиса.[9]

Взаимодействия[править | править код]

IRF1 было показано, взаимодействуют с:

См. также[править | править код]

Примечания[править | править код]

  1. Maruyama M., Fujita T., Taniguchi T. Sequence of a cDNA coding for human IRF-1 (англ.) // Nucleic Acids Res  (англ.) : journal. — 1989. — June (vol. 17, no. 8). — P. 3292. — doi:10.1093/nar/17.8.3292. — PMID 2726461.
  2. Itoh S., Harada H., Nakamura Y., White R., Taniguchi T. Assignment of the human interferon regulatory factor-1 (IRF1) gene to chromosome 5q23-q31 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1991. — November (vol. 10, no. 4). — P. 1097—1099. — doi:10.1016/0888-7543(91)90208-V. — PMID 1680796.
  3. Miyamoto M., Fujita T., Kimura Y., Maruyama M., Harada H., Sudo Y., Miyata T., Taniguchi T. Regulated expression of a gene encoding a nuclear factor, IRF-1, that specifically binds to IFN-beta gene regulatory elements (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1988. — September (vol. 54, no. 6). — P. 903—913. — doi:10.1016/S0092-8674(88)91307-4. — PMID 3409321.
  4. Escalante C.R., Yie J., Thanos D., Aggarwal A.K. Structure of IRF-1 with bound DNA reveals determinants of interferon regulation (англ.) // Nature : journal. — 1998. — January (vol. 391, no. 6662). — P. 103—106. — doi:10.1038/34224. — PMID 9422515.
  5. Dornan D., Eckert M., Wallace M., Shimizu H., Ramsay E., Hupp T.R., Ball K.L. Interferon regulatory factor 1 binding to p300 stimulates DNA-dependent acetylation of p53 (англ.) // Mol. Cell. Biol.  (англ.) : journal. — 2004. — November (vol. 24, no. 22). — P. 10083—10098. — doi:10.1128/MCB.24.22.10083-10098.2004. — PMID 15509808.
  6. Entrez Gene: IRF1 interferon regulatory factor 1. Архивировано 8 марта 2010 года.
  7. Möller A., Pion E., Narayan V., Ball K.L. Intracellular activation of interferon regulatory factor-1 by nanobodies to the multifunctional (Mf1) domain (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2010. — December (vol. 285, no. 49). — P. 38348—38361. — doi:10.1074/jbc.M110.149476. — PMID 20817723.
  8. Citrobacter infection data for Irf1. Wellcome Trust Sanger Institute. Дата обращения: 19 марта 2015. Архивировано 3 апреля 2015 года.
  9. 1 2 3 Gerdin A.K. The Sanger Mouse Genetics Programme: High throughput characterisation of knockout mice (англ.) // Acta Ophthalmologica  (англ.) : journal. — Wiley-Liss, 2010. — Vol. 88, no. S248. — doi:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x.
  10. Mouse Resources Portal Архивная копия от 24 декабря 2011 на Wayback Machine, Wellcome Trust Sanger Institute.
  11. International Knockout Mouse Consortium (недоступная ссылка). Дата обращения: 19 марта 2015. Архивировано 20 марта 2012 года.
  12. Mouse Genome Informatics. Дата обращения: 19 марта 2015. Архивировано 9 января 2015 года.
  13. Skarnes W.C., Rosen B., West A.P., Koutsourakis M., Bushell W., Iyer V., Mujica A.O., Thomas M., Harrow J., Cox T., Jackson D., Severin J., Biggs P., Fu J., Nefedov M., de Jong P.J., Stewart A.F., Bradley A. A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function (англ.) // Nature : journal. — 2011. — Vol. 474, no. 7351. — P. 337—342. — doi:10.1038/nature10163. — PMID 21677750.
  14. Dolgin E. Mouse library set to be knockout (англ.) // Nature. — 2011. — June (vol. 474, no. 7351). — P. 262—263. — doi:10.1038/474262a. — PMID 21677718.
  15. Collins F.S., Rossant J., Wurst W. A mouse for all reasons (англ.) // Cell. — Cell Press, 2007. — January (vol. 128, no. 1). — P. 9—13. — doi:10.1016/j.cell.2006.12.018. — PMID 17218247.
  16. van der Weyden L., White J.K., Adams D.J., Logan D.W. The mouse genetics toolkit: revealing function and mechanism. (англ.) // Genome Biol  (англ.) : journal. — 2011. — Vol. 12, no. 6. — P. 224. — doi:10.1186/gb-2011-12-6-224. — PMID 21722353.
  17. Narayan V., Pion E., Landré V., Müller P., Ball K.L. Docking dependent ubiquitination of the interferon regulatory factor-1 tumour suppressor protein by the ubiquitin ligase CHIP (англ.) // J Biol Chem. : journal. — 2010. — October (vol. 286, no. 1). — P. 607—619. — doi:10.1074/jbc.M110.153122. — PMID 20947504.
  18. Kular R.K., Yehiely F., Kotlo K.U., Cilensek Z.M., Bedi R., Deiss L.P. GAGE, an antiapoptotic protein binds and modulates the expression of nucleophosmin/B23 and interferon regulatory factor 1 (англ.) // J. Interferon Cytokine Res. : journal. — 2009. — October (vol. 29, no. 10). — P. 645—655. — doi:10.1089/jir.2008.0099. — PMID 19642896.
  19. Narayan V., Eckert M., Zylicz A., Zylicz M., Ball K.L. Cooperative regulation of the interferon regulatory factor-1 tumor suppressor protein by core components of the molecular chaperone machinery (англ.) // J Biol Chem. : journal. — 2009. — September (vol. 284, no. 38). — P. 25889—25899. — doi:10.1074/jbc.M109.019505. — PMID 19502235.
  20. Schaper F., Kirchhoff S., Posern G., Köster M., Oumard A., Sharf R., Levi B.Z., Hauser H. Functional domains of interferon regulatory factor I (IRF-1) (англ.) // Biochem. J.  (англ.) : journal. — 1998. — October (vol. 335, no. 1). — P. 147—157. — PMID 9742224.
  21. Sharf R., Azriel A., Lejbkowicz F., Winograd S.S., Ehrlich R., Levi B.Z. Functional domain analysis of interferon consensus sequence binding protein (ICSBP) and its association with interferon regulatory factors (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1995. — June (vol. 270, no. 22). — P. 13063—13069. — doi:10.1074/jbc.270.22.13063. — PMID 7768900.
  22. Umegaki N., Tamai K., Nakano H., Moritsugu R., Yamazaki T., Hanada K., Katayama I., Kaneda Y. Differential regulation of karyopherin alpha 2 expression by TGF-beta1 and IFN-gamma in normal human epidermal keratinocytes: evident contribution of KPNA2 for nuclear translocation of IRF-1 (англ.) // J. Invest. Dermatol.  (англ.) : journal. — 2007. — June (vol. 127, no. 6). — P. 1456—1464. — doi:10.1038/sj.jid.5700716. — PMID 17255955.
  23. Negishi H., Fujita Y., Yanai H., Sakaguchi S., Ouyang X., Shinohara M., Takayanagi H., Ohba Y., Taniguchi T., Honda K. Evidence for licensing of IFN-gamma-induced IFN regulatory factor 1 transcription factor by MyD88 in Toll-like receptor-dependent gene induction program (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2006. — October (vol. 103, no. 41). — P. 15136—15141. — doi:10.1073/pnas.0607181103. — PMID 17018642.
  24. Masumi A., Wang I.M., Lefebvre B., Yang X.J., Nakatani Y., Ozato K. The histone acetylase PCAF is a phorbol-ester-inducible coactivator of the IRF family that confers enhanced interferon responsiveness (англ.) // Mol. Cell. Biol.  (англ.) : journal. — 1999. — March (vol. 19, no. 3). — P. 1810—1820. — PMID 10022868.
  25. Chatterjee-Kishore M., van Den Akker F., Stark G.R. Adenovirus E1A down-regulates LMP2 transcription by interfering with the binding of stat1 to IRF1 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — July (vol. 275, no. 27). — P. 20406—20411. — doi:10.1074/jbc.M001861200. — PMID 10764778.
  26. Sgarbanti M., Borsetti A., Moscufo N., Bellocchi M.C., Ridolfi B., Nappi F., Marsili G., Marziali G., Coccia E.M., Ensoli B., Battistini A. Modulation of human immunodeficiency virus 1 replication by interferon regulatory factors (англ.) // Journal of Experimental Medicine  (англ.) : journal. — Rockefeller University Press  (англ.), 2002. — May (vol. 195, no. 10). — P. 1359—1370. — doi:10.1084/jem.20010753. — PMID 12021315.
  27. Lee J.H., Chun T., Park S.Y., Rho S.B. Interferon regulatory factor-1 (IRF-1) regulates VEGF-induced angiogenesis in HUVECs (англ.) // Biochim. Biophys. Acta  (англ.) : journal. — 2008. — September (vol. 1783, no. 9). — P. 1654—1662. — doi:10.1016/j.bbamcr.2008.04.006. — PMID 18472010.

Литература[править | править код]

  • Harada H., Taniguchi T., Tanaka N. The role of interferon regulatory factors in the interferon system and cell growth control (англ.) // Biochimie  (англ.) : journal. — 1999. — Vol. 80, no. 8—9. — P. 641—650. — doi:10.1016/S0300-9084(99)80017-0. — PMID 9865486.
  • Pitha P.M., Au W.C., Lowther W., Juang Y.T., Schafer S.L., Burysek L., Hiscott J., Moore P.A. Role of the interferon regulatory factors (IRFs) in virus-mediated signaling and regulation of cell growth (англ.) // Biochimie  (англ.) : journal. — 1999. — Vol. 80, no. 8—9. — P. 651—658. — doi:10.1016/S0300-9084(99)80018-2. — PMID 9865487.
  • Yu-Lee L. Stimulation of interferon regulatory factor-1 by prolactin (англ.) // Lupus : journal. — 2002. — Vol. 10, no. 10. — P. 691—699. — doi:10.1191/096120301717164921. — PMID 11721695.
  • Pine R. IRF and tuberculosis (неопр.) // J. Interferon Cytokine Res.. — 2002. — Т. 22, № 1. — С. 15—25. — doi:10.1089/107999002753452629. — PMID 11846972.
  • Romeo G., Fiorucci G., Chiantore M.V., Percario Z.A., Vannucchi S., Affabris E. IRF-1 as a negative regulator of cell proliferation (неопр.) // J. Interferon Cytokine Res.. — 2002. — Т. 22, № 1. — С. 39—47. — doi:10.1089/107999002753452647. — PMID 11846974.
  • Cha Y., Sims S.H., Romine M.F., Kaufmann M., Deisseroth A.B. Human interferon regulatory factor 1: intron-exon organization (англ.) // DNA Cell Biol.  (англ.) : journal. — 1992. — Vol. 11, no. 8. — P. 605—611. — doi:10.1089/dna.1992.11.605. — PMID 1382447.
  • Harada H., Fujita T., Miyamoto M., Kimura Y., Maruyama M., Furia A., Miyata T., Taniguchi T. Structurally similar but functionally distinct factors, IRF-1 and IRF-2, bind to the same regulatory elements of IFN and IFN-inducible genes (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1989. — Vol. 58, no. 4. — P. 729—739. — doi:10.1016/0092-8674(89)90107-4. — PMID 2475256.
  • Miyamoto M., Fujita T., Kimura Y., Maruyama M., Harada H., Sudo Y., Miyata T., Taniguchi T. Regulated expression of a gene encoding a nuclear factor, IRF-1, that specifically binds to IFN-beta gene regulatory elements (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1988. — Vol. 54, no. 6. — P. 903—913. — doi:10.1016/S0092-8674(88)91307-4. — PMID 3409321.
  • Harada H., Takahashi E., Itoh S., Harada K., Hori T.A., Taniguchi T. Structure and regulation of the human interferon regulatory factor 1 (IRF-1) and IRF-2 genes: implications for a gene network in the interferon system (англ.) // Mol. Cell. Biol.  (англ.) : journal. — 1994. — Vol. 14, no. 2. — P. 1500—1509. — PMID 7507207.
  • Sharf R., Azriel A., Lejbkowicz F., Winograd S.S., Ehrlich R., Levi B.Z. Functional domain analysis of interferon consensus sequence binding protein (ICSBP) and its association with interferon regulatory factors (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1995. — Vol. 270, no. 22. — P. 13063—13069. — doi:10.1074/jbc.270.22.13063. — PMID 7768900.
  • Willman C.L., Sever C.E., Pallavicini M.G., Harada H., Tanaka N., Slovak M.L., Yamamoto H., Harada K., Meeker T.C., List A.F. Deletion of IRF-1, mapping to chromosome 5q31.1, in human leukemia and preleukemic myelodysplasia (англ.) // Science : journal. — 1993. — Vol. 259, no. 5097. — P. 968—971. — doi:10.1126/science.8438156. — PMID 8438156.
  • Drew P.D., Franzoso G., Becker K.G., Bours V., Carlson L.M., Siebenlist U., Ozato K. NF kappa B and interferon regulatory factor 1 physically interact and synergistically induce major histocompatibility class I gene expression (англ.) // J. Interferon Cytokine Res. : journal. — 1997. — Vol. 15, no. 12. — P. 1037—1045. — doi:10.1089/jir.1995.15.1037. — PMID 8746784.
  • Ronco L.V., Karpova A.Y., Vidal M., Howley P.M. Human papillomavirus 16 E6 oncoprotein binds to interferon regulatory factor-3 and inhibits its transcriptional activity (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1998. — Vol. 12, no. 13. — P. 2061—2072. — doi:10.1101/gad.12.13.2061. — PMID 9649509.
  • Nozawa H., Oda E., Ueda S., Tamura G., Maesawa C., Muto T., Taniguchi T., Tanaka N. Functionally inactivating point mutation in the tumor-suppressor IRF-1 gene identified in human gastric cancer (англ.) // Int. J. Cancer  (англ.) : journal. — 1998. — Vol. 77, no. 4. — P. 522—527. — doi:10.1002/(SICI)1097-0215(19980812)77:4<522::AID-IJC8>3.0.CO;2-W. — PMID 9679752.
  • Schaper F., Kirchhoff S., Posern G., Köster M., Oumard A., Sharf R., Levi B.Z., Hauser H. Functional domains of interferon regulatory factor I (IRF-1) (англ.) // Biochem. J.  (англ.) : journal. — 1998. — Vol. 335, no. 1. — P. 147—157. — PMID 9742224.
  • Masumi A., Wang I.M., Lefebvre B., Yang X.J., Nakatani Y., Ozato K. The histone acetylase PCAF is a phorbol-ester-inducible coactivator of the IRF family that confers enhanced interferon responsiveness (англ.) // Mol. Cell. Biol.  (англ.) : journal. — 1999. — Vol. 19, no. 3. — P. 1810—1820. — PMID 10022868.