Гаплогруппа L (Y-ДНК): различия между версиями

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
[непроверенная версия][непроверенная версия]
Содержимое удалено Содержимое добавлено
Нет описания правки
Метки: с мобильного устройства из мобильной версии
Строка 36: Строка 36:
=== Пакистан ===
=== Пакистан ===
L3 (M357) часто встречается среди [[буриши|буришей]] и [[пуштуны|пуштунов]], умеренно распространена среди населения Пакистана в целом вдоль реки Инд.
L3 (M357) часто встречается среди [[буриши|буришей]] и [[пуштуны|пуштунов]], умеренно распространена среди населения Пакистана в целом вдоль реки Инд.

L1a и L1c-M357 обнаружены 24% среди [[Белуджи|Белуджей]], L1a и L1c найдены 8% среди дравидоязычных [[Брагуи (народ)|Брагуйев]] в соответствии с Julie di Cristofaro et al. 2013 г.<ref>{{Статья|автор=Julie Di Cristofaro, Erwan Pennarun, Stéphane Mazières, Natalie M. Myres, Alice A. Lin|заглавие=Afghan Hindu Kush: Where Eurasian Sub-Continent Gene Flows Converge|ссылка=http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0076748|издание=PLOS ONE|год=2013-10-18|том=8|выпуск=10|страницы=e76748|issn=1932-6203|doi=10.1371/journal.pone.0076748}}</ref>
L3a (PK3) обнаружена в значительном количестве (около 23 %) среди [[калаши|калашей]] на северо-западе Пакистана.
L3a (PK3) обнаружена в значительном количестве (около 23 %) среди [[калаши|калашей]] на северо-западе Пакистана.

Версия от 07:00, 3 июля 2017

Гаплогруппа L
{{{размер}}}px
Тип Y-ДНК
Время появления 30-25 тыс. лет назад
Место появления Индостан
Предковая группа K
Сестринские группы K(xLT) и T
Субклады L1, L2 и L3
Мутации-маркеры M20

Гаплогруппа L (M20) — гаплогруппа ДНК человеческой Y-хромосомы.

Происхождение

Происхождение связывается с Южной Азией, с западом полуострова Индостан. Распространение данной гаплогруппы хорошо коррелирует с областью распространения хараппской культуры и её ближайших потомков. Также с низкой частотой встречается у населения Центральной Азии, Юго-западной Азии, Северной Африки и Южной Европы вдоль побережья Средиземного моря.

L (K1a) является потомком субклады LT (K1) гаплогруппы K, от которой произошла около 42600 лет назад[1].

Палеогенетика

Субклада L1a была обнаружена у представителей халколита Азербайджана из пещеры Арпа (ок. 6 тыс. л. н.)[2].

Исследование ДНК скелета гуннского периода из Музея естественной истории (г. Будапешт), датированного средней третью V века, показало, что он имел Y-хромосомную гаплогруппу L[3].

Распространение

Сенгупта и др. (Sengupta et al., 2006) недавно открыли три подветви гаплогруппы L: L1 (M76), L2 (M317) и L3 (M357). Все три ветви имеются в Иране и Пакистане, но только L1 регулярно встречается в Индии. Такое распространение заставляет предположить, что L1 является туземной для Индии, поскольку плотность её распространения равномерно уменьшается по мере удаления от восточного побережья Индостана. Предположительно исконными носителями данной гаплогруппы были носители дравидийских языков.

Ряд предварительных исследований — например, данные людей, заказавших исследования своих гаплотипов в коммерческих лабораториях[4] — показывают, что большинство европейских примеров гаплогруппы L, скорее всего, относятся к подклассу L2 (M317), который в Южной Азии является наиболее редким подклассом данной гаплогруппы.

Индия

В настоящее время гаплогруппа L распространена среди населения Индии с частотой от 7 до 15 % (Basu et al. 2003, Cordaux et al. 2004, Sengupta et al. 2006, Thamseem et al. 2006). Наиболее высокая частота и разнообразие подклассов наблюдается на юго-западе Пакистана в Белуджистане вдоль побережья (28 %). Довольно низка плотность распространения гаплогруппы L среди племенных групп Индии (около 5,6-7 %) (Cordaux et al. 2004, Sengupta et al. 2006, Thamseem et al. 2006), что позволяет предположить, что данная гаплогруппа не была свойственна местному населению эпохи палеолита.

Более ранние исследования (например, Wells et al. 2001) отмечают, что очень высокая частота (почти 50 %) гаплогруппы L для Южной Индии, возможно, объясняется экстраполяцией данных, полученных по выборке из 84 калларов, тамилоязычной касты воинов из штата Тамил Наду, из которых у 40 человек (около 48 %) обнаружена мутация M20, определяющая гаплогруппу L. Последующие исследования различных народов Индии показали, что такая высокая частота гаплогруппы L среди калларов является аномалией для региона; в целом гаплогруппа L в редких случаях едва достигает 25 % отдельных популяций Индостана.

Пакистан

L3 (M357) часто встречается среди буришей и пуштунов, умеренно распространена среди населения Пакистана в целом вдоль реки Инд.

L1a и L1c-M357 обнаружены 24% среди Белуджей, L1a и L1c найдены 8% среди дравидоязычных Брагуйев в соответствии с Julie di Cristofaro et al. 2013 г.[5]

L3a (PK3) обнаружена в значительном количестве (около 23 %) среди калашей на северо-западе Пакистана.

Также гаплогруппа L встречается с частотой около 18 % среди парсов-мужчин в Пакистане, однако их STR-гаплотипы объединяют их в общий кластер, отличный от большинства других представителей гаплогруппы L в Пакистане.[6]

Левант

В небольшой выборке, взятой у друзов Израиля, гаплогруппа L была обнаружена у 7 человек из 20 (35 %). С другой стороны, исследования, проведенные на более широких выборках, показали, что мутация L-M20 в среднем составляет 5 % среди друзов Израиля[7], 4 % среди друзов Ливана[8]. Кроме этого, она не была обнаружена вообще в выборке из 59 друзов Сирии.

Западная Азия

Гаплогруппа L встречается в Иране (4/117 или 3,4 % L1-M76 и 3/117 или 2,6 % L2-M317 из общей частоты в 7/117 или 6,0 % встречаемости гаплогруппы L в южном Иране и 1/33 или 3,0 % L3-M357 в Южном Азербайджане (Regueiro et al. 2006)) и в Турции (22/523 или 4,2 % (Cinnioğlu et al. 2004)). Гаплогруппа L-M20 также была обнаружена с частотой 1,63 % (12/734) в большой выборке армян.[9]

Европа

В статье Орнелла Семино и др.[10] сообщается об обнаружении мутации M11-G, то есть одной из мутаций, определяющих гаплогруппу L, с частотой от 1 % до 3 % в образцах из Ливана, Турции, Грузии, Греции, Венгрии, Калабрии и Андалусии. Выборки, на которых исследовалась частота гаплогруппы в Европе, обычно были довольно малы, поэтому возможно, что частота гаплогруппы L в Средиземноморье может отличаться в более высокую или более низкую сторону от результатов Семино и др., однако более точные исследования по состоянию на 2009 год отсутствуют.

Подклассы

Ниже перечислены подклассы гаплогруппы L вместе с определяющими мутациями, согласно дереву 2006 г.[11]:

  • L (M11, M20, M22, M61, M185, M295) — типична для населения Пакистана
    • L*
    • L1 (M27, M76) — типична для дравидоязычных каст Индии и Шри-Ланки, умеренно распространена среди индоиранских народов Южной Азии
    • L2 (M317) — обнаружена с низкой частотой в Центральной Азии, Юго-Восточной Азии и Южной Европе
      • L2*
      • L2a (M349)
      • L2b (M274)
    • L3 (M357) — часто встречается среди буришей и пуштунов, умеренно распределена среди населения Пакистана

Примечания

  1. L YTree
  2. Iosif Lazaridis et al. The genetic structure of the world’s first farmers, 2016.
  3. Казахстанский ДНК-проект
  4. individuals who have had their Y-chromosomes tested by commercial labs
  5. Julie Di Cristofaro, Erwan Pennarun, Stéphane Mazières, Natalie M. Myres, Alice A. Lin. Afghan Hindu Kush: Where Eurasian Sub-Continent Gene Flows Converge // PLOS ONE. — 2013-10-18. — Т. 8, вып. 10. — С. e76748. — ISSN 1932-6203. — doi:10.1371/journal.pone.0076748.
  6. Raheel Qamar, Qasim Ayub, Aisha Mohyuddin, Agnar Helgason, Kehkashan Mazhar, Atika Mansoor, Tatiana Zerjal, Chris Tyler-Smith, and S. Qasim Mehdi, "Y-Chromosomal DNA Variation in Pakistan, " American Journal of Human Genetics 70:1107-1124, 2002.
  7. 12/222 Shlush et al. 2008
  8. 1/25 Shlush et al. 2008
  9. Michael E. Weale, Levon Yepiskoposyan, Rolf F. Jager, Nelli Hovhannisyan, Armine Khudoyan, Oliver Burbage-Hall, Neil Bradman, Mark G. Thomas, "Armenian Y chromosome haplotypes reveal strong regional structure within a single ethno-national group, " Human Genetics (2001) 109 : 659—674.
  10. Ornella Semino, Svetlana Limborska, Svetlana Arbuzova et al., The Genetic Legacy of Paleolithic Homo sapiens sapiens in Extant Europeans: A Y Chromosome Perspective Science (Volume 290, 10 November 2000).
  11. the 2006 ISOGG tree

Литература

  • A. Basu et al.: Ethnic India: A Genomic View, With Special Reference to Peopling and Structure. Genome research, 2003, http://www.genome.org/cgi/doi/10.1101/gr.1413403.
  • R. Cordaux et al.: Independent Origins of Indian Caste and Tribal Paternal Lineages. Current Biology, 2004, Vol. 14, p. 231—235
  • C. Cinnioğlu et al., "Excavating Y-chromosome haplotype strata in Anatolia, " Hum Genet (2004) 114 : 127—148, http://evolutsioon.ut.ee/publications/Cinnioglu2004.pdf
  • R. Qamar et al.: Y-Chromosomal DNA Variation in Pakistan. American Journal of Human Genetics, 2002, p. 1107—1124
  • M. Regueiro et al.: "Iran: Tricontinental Nexus for Y-Chromosome Driven Migration, " Human Heredity, 2006, vol. 61, pp. 132-43.
  • S. Sahoo et al.: A prehistory of Indian Y chromosomes: Evaluating demic diffusion scenarios. PNAS 2006, www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.0507714103
  • S. Sengupta et al.: Polarity and Temporality of High-Resolution Y-Chromosome Distributions in India Identify Both Indigenous and Exogenous Expansions and Reveal Minor Genetic Influence of Central Asian Pastoralists. American Journal of Human Genetics, 2006, p. 202—221
  • I. Thamseem et al.: Genetic affinities among the lower castes and tribal groups of India: Inference from Y chromosome and mitochondrial DNA. BMC Genetics, 2006, http://www.biomedcentral.com/1471-2156/7/42
  • Sadaf Firasat, Shagufta Khaliq, Aisha Mohyuddin, Myrto Papaioannou, Chris Tyler-Smith, Peter A Underhill and Qasim Ayub: Y-chromosomal evidence for a limited Greek contribution to the Pathan population of Pakistan. European Journal of Human Genetics (2007) Vol. 15, p. 121—126. http://www.nature.com/ejhg/journal/v15/n1/full/5201726a.html
  • R. Spencer Wells, Nadira Yuldasheva, Ruslan Ruzibakiev, Peter A. Underhill, Irina Evseeva, Jason Blue-Smith, Li Jin, Bing Su, Ramasamy Pitchappan, Sadagopal Shanmugalakshmi, Karuppiah Balakrishnan, Mark Read, Nathaniel M. Pearson, Tatiana Zerjal, Matthew T. Webster, Irakli Zholoshvili, Elena Jamarjashvili, Spartak Gambarov, Behrouz Nikbin, Ashur Dostiev, Ogonazar Aknazarov, Pierre Zalloua, Igor Tsoy, Mikhail Kitaev, Mirsaid Mirrakhimov, Ashir Chariev, and Walter F. Bodmer: «The Eurasian Heartland: A continental perspective on Y-chromosome diversity.» Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America v.98(18); Aug 28, 2001

См. также

Эволюционное древо гаплогрупп Y-хромосомы человека
Y-хромосомный Адам
    A0-T
A00   A0   A1
    A1a   A1b
A1b1 BT
  B   CT
DE   CF
D   E C F
F1  F2  F3    GHIJK  
    G HIJK
H IJK
IJ K
I J LT (K1) K2
L (K1a)   T (K1b)       K2a/K2a1/NO/NO1 K2b
N O   K2b1     P (K2b2)/P1  
  S (K2b1a) M (K2b1b) Q R  


Ссылки