Е-бокс: различия между версиями

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Следующая правка →
Содержимое удалено Содержимое добавлено
ВизуальныйВики-текст
← Новая страница: «''' Е-бокс ''' (Enhancer Box) — ДНК-последовательность, найденная в некоторых [[промотор]…»
(нет различий)

Версия от 14:16, 8 апреля 2015

Е-бокс (Enhancer Box) — ДНК-последовательность, найденная в некоторых промоторных областях у эукариот, которые действует в качестве связывающего сайта белка и, как было установлено, регулируют экспрессию генов в нейронах, мышцах и других тканях.[1] Спецификация такой ДНК-последовательности — CANNTG (где N может быть любой нуклеотид), с палиндромной канонической последовательностью[англ.] CACGTG,[2] которая распознаётся и связывается факторами транскрипции для инициации транскрипции генов. После того, как факторы транскрипции связываются с промоторами через E-бокс, другие ферменты могут связываться с промотором и облегчать транскрипцию мРНК из ДНК.

Открытие

E-бокс был обнаружен в сотрудничестве между Сусуму Тонегава (англ. Susumu Tonegawa) и Уолтером Гилбертом (англ. Walter Gilbert) лабораториями в 1985 году в качестве элемента управления иммуноглобулином тяжелой цепью усилителей.[3][4] Они обнаружили, что область 140 спаренных оснований в тканеспецифической транскрипции усилительного элемента было достаточно для повышения различных уровней транскрипции в различных тканях и последовательностях. Они предположили, что белки, созданные определенными тканями, учавствуют в этих этих усилителях, чтобы активировать наборы генов при дифференцировке клеток.

В 1989 году лаборатория Дэвида Балтимора обнаружили первые два связанных Е-боксом белка, E12 и E47.[5] Эти усилители иммуноглобулинов можно связать, как гетеродимеры белков через bHLH домены. В 1990 году на примере другого E-белка, ITF-2A (позднее переименованный в E2-2Alt) было обнаружено, что можно привязать иммуноглобулин к легкой цепи усилителей.[6] Два года спустя, третий E-бокс, связывающий белок, HEB, был обнаружен при обследовании кДНК библиотеки из HeLa клеток.[7] Вариант сплайсинга E2-2 был обнаружен в 1997 г. и была обнаружена ингибиция промотора мышечноспециализированными генами.[8]

С тех пор, исследователи установили, что E-бокс влияет на транскрипцию генов у некоторых эукариот и нашел связывающие факторы Е-бокса, которые идентифицируют консесуальные последовательности[англ.] E-Box.[9] В частности, несколько экспериментов показали, что E-бокс неотъемлемая часть транскрипционно-трансляционной, петли обратной связи, которая содержит циркадные часы .

Связывание с помощью Е-бокса

Связывающие белки E-боксов играют важную роль в регуляции транскрипционной активности. Эти белки обычно содержат основной спираль-петля-спираль (англ. Basic helix-loop-helix) структурный мотив белка, который позволяет им связываться как димеры.[10] Этот мотив состоит из двух амфипатических α-спиралей, разделенных небольшой последовательностью аминокислот, образующих один или более β-поворотов. В гидрофобных взаимодействиях между этими α-спиралями стабилизируется димеризация. Кроме того, каждый мономер bHLH имеет основную область, которая помогает взаимному опзнаванию между мономером bHLH и E-боксом (основная область взаимодействует с большим желобком ДНК). В зависимости от мотива ДНК («CAGCTG» или «CACGTG») белок bHLH имеет различный набор основных остатков.

Относительное положение CTRR и E-Box

Связывание Е-боксом модулируется у мышей посредством Zn2+. CT-Rich регионы (CTRR), расположенные на примерно 23 нуклеотида выше Е-бокса, имеют важное значение для связывания E-боксом, трансактивации (увеличение скорости генетической экспрессии), и транскрипции циркадных генов BMAL1/NPAS2 и BMAL1/CLOCK комплексов.[11]

Специфичность связывания различных Е-боксов отражается на их функции. E-боксы с различными функциями имеют различное количество и тип факторов связывания.[12]

Консенсуальная последовательность E-бокса, как правило, — CANNTG; Однако, существуют другие Е-боксы со сходными последовательностями, называемые неканонические E-боксами. Они включают, но не ограничиваются ими:

  • CACGTT последовательность 20 bp выше гена PER2 и регулирует свою экспрессию[13]
  • CAGCTT последовательность находит в MyoD основной усилитель[14]
  • CACCTCGTGAC последовательность в проксимальной промоторной области человеческого и крысиного APOE, являющегося белковым компонентом липопротеинов.[15]

Роль в циркадных часах

Связь между генным регулированием Е-боксов и и циркадными часами была обнаружена в 1997 году, когда Хао, Аллен, и Хардин (Биологический факультет в Техасском университете A&M) проанализировали ритмичность периода осцилляций гена в Drosophila melanogaster.[16] Они нашли циркадный усилитель транскрипции гена в 69 bp фрагмента ДНК. В зависимости от уровней белков, усилитель повышает уровни транскрипции мРНК как в условиях LD (свет-темнота), так и DD (постоянная темнота). Усилитель был необходим для повышения уровня экспрессии гена, но не для циркадной ритмичности. Он также работает независимо как цель BMAL1/CLOCK комплекса.

E-бокс играет важную роль в циркадных генах; до сих пор, девять управляемых циркадных генов были идентифицированы: PER1, Per2, BHLHB2, BHLHB3, CRY1, DBP, Nr1d1, Nr1d2 и RORC.[17] Так как E-бокс подключен к нескольким циркадным генам, возможно, что гены и белки, связанные с ним «важные и уязвимые точки в циркадной системе».[18]


E-бокс является одним из пяти крупнейших семей транскрипционных факторов, связанных с циркадной фазой и находится в большинстве тканей.[19] Всего 320 E-боксов, управляющих генами, находятся в SCN (супрахиазматическое ядро), печени, аорты, надпочечников, WAT (белой жировой ткани), головного мозга, предсердия, желудочка, префронтальной коры, скелетных мышц, ВАТ (бурой жировой ткани) и кости свода черепа.

E-бокс, подобно CLOCK-зависимым элементам (EL-box; GGCACGAGGC) также важен в поддержании циркадной ритмичности в clock-управляющих генах . Аналогично обычному E-боксу, E-бокс, подобный clock-управляющим элементам, может также вызвать транскрипцию BMAL1/CLOCK, которая затем может привести к экспрессии в других EL-box, содержащих гены (Ank, DBP, Nr1d1).[20] Тем не менее, есть различия между EL-box и регулярным E-боксом. Подавление Dec1 и DEC2 имеет сильное влияние на E-бокс, чем на EL-box. Кроме того, Hes1, который может связываться с другой консенсуальной последовательностью (CACNAG, известной как N-box), показывает эффект подавления в EL-box, но не в E-боксе.

Оба неканонические E-бокс и подобная E-бокс последовательность, имеют решающее значение для циркадного колебания. Последние исследования в этой области формирует гипотезу, что каждый канонический или неканоническими E-бокс, следующий за подобной Е-бокс последовательностью, с интервалом 6 спаренных оснований между ними, — необходимое сочетание для циркадной транскрипции.[21] Силикоанализ также показывает, что интервал существовал и у других известных clock-управляющих генов.

Роль белков в связывании E-боксов

Есть несколько белков, которые связываются с E-боксом и влияют на транскрипцию генов .

Комплекс CLOCK-BMAL1

Этот комплекс является неотъемлемой частью циркадного цикла млекопитающих и имеет жизненно важное значение в поддержании циркадной ритмичности.

Зная, что связывание активирует транскрипцию гена в промоторной области, исследователи обнаружили в 2002 году, что в DEC1 и DEC2 (транскрипционные факторы bHLH) репрессируют комплекс CLOCK-BMAL1 посредством прямого взаимодействия на BMAL1 и/или конкуренции для элементов Е-бокса. Они пришли к выводу, что DEC1 и DEC2 были регуляторами молекулярных часов млекопитающих.[22]

В 2006 году Риппергер и Шиблер обнаружили, что связывание этого комплекса E-боксом ускоряет циркадную транскрипцию DBP и переходы хроматина (изменение от хроматина до факультативного гетерохроматина).[23] Был сделан вывод, что CLOCK регулирует экспрессию DBP путем связывания с E-боксом мотивов усиливающих областей, расположенных в первом и втором интронах.

C-Myc (онкоген)

C-Myc , ген, кодирующий транскрипционный фактор Myc, играет важную роль в регулировании клеточной пролиферации и апоптоза млекопитающих.

В 1991 году исследователи протестировали, может ли с-Мус связываться с ДНК путем димеризации его с E12. Димеры химерного белка с E6 , способны связываться с элементом E-бокса (GGCCACGTGACC), который был опознаваем другими белками HLH.[24] Экспрессия E6 подавила функцию с-Мус, которая определяла связь между ними обоими.

В 1996 году было обнаружено, что Мус гетеродимеризуется с MAX и что этот гетеродимерный комплекс может связываться с CAC (G/A)TG последовательностью Е-бокса и активировать транскрипцию.[25]

В 1998 году был сделан вывод, что функция с-Мус зависит от активации транскрипции определенных генов через элементы E-бокса.[26]

MyoD

MyoD происходит от семьи Mrf bHLH и его основная роль заключается в миогенезе, формировании мышечной ткани.[27] Другие члены этого семейства включают миогенин, Myf5, Myf6, Mist1 и NEX-1.

Когда MyoD связывается с мотивом CANNTG E-бокса, инициируется мышечная дифференцировка и экспрессия мышечно-специфических белков.[28] Исследователи удаляли различные части рекомбинантной MyoD и пришли к выводу, что MyoD использует включённые элементы, чтобы связать E-бокс и тетраплексную структуру промоторной последовательности мышечно-специфического гена интегрина α7 и саркомерного sMtCK .

MyoD регулирует HB-EGF (связывающий гепарин EGF-подобный фактор роста[англ.]), член семьи EGF (Эпидермальный фактор роста), стимулирует рост и пролиферацию клеток.[29] Он играет важную роль в развитии гепатоцеллюлярной карциномы, рака предстательной железы, рака молочной железы, рака пищевода, и рака желудка.

MyoD может также связываться с неканоническими E-боксами MyoG и регулировать свою экспрессию.[30]

MyoG

MyoG принадлежит семейству факторов транскрипции MyoD. Связывающий MyoG Е-бокс является необходимым для формирования нервно-мышечного синапса в качестве сигнального пути HDAC-Dach2-миогенина в экспрессии генов скелетных мышц.[31] У пациентов с симптомом атрофии мышц была выявлена пониженная экспрессией MyoG.[32]

MyoG и MyoD, как также было выявлено, обладают дифференциацией миобластов.[33] Они действуют путем трансактивации катепсином B промоторной активности и вызывают его экспрессию в мРНК.

E47

E47 производится путем альтернативного сплайсинга Е2А в E47 специфически кодированных bHLH экзонов. Его роль заключается в регулировании специфической экспрессии гена в ткани и дифференциации. Многие киназы были связаны с Е47 в том числе 3PK и MK2. Эти два белка образуют комплекс с Е47 и уменьшают его транскрипционную активность.[34] CKII и PKA, как также было выявлено in vitro, фосфорилируют E47.[35][36][37]

Как и в других E-боксах, связывающих белки, E47 также связывается с последовательностью CANNTG в E-боксе. У гомозиготных нокаутных мышей E2A, развитие В-клеткок останавливается до стадии размещения DJ и В-клетки не могут созревать.[38] E47, как было выявлено, связывается как гетеродимер (с E12)[39] или как гомодимер (но слабее).[40]

Последние исследования

Хотя структурная основа взаимодействия BMAL1/CLOCK с E-боксом неизвестна, недавние исследования показали, что мотивы bHLH белковых доменов BMAL1/CLOCK очень похожи на bHLH других содержащих его белков, например, Myc/Max, кристализованных E-боксами.[41] Это предполагает, что необходимы специфические основания, для поддержки этого высокого сродства связывания. Кроме того, ограничения последовательности в области вокруг циркадного E-бокса полностью не изучены: это, как полагают, необходимо, но не достаточно; E-боксы должны быть случайным образом разнесены друг от друга в генетической последовательности для того, чтобы происходила циркадная транскрипция. Последние исследования E-боксов была направлены ​​на то, чтобы найти больше связываемых белков, а также открыть больше механизмов для ингибирования связывания.

Недавнее исследование Университета Упсалы в Швеции связывает комплекс AST2-Rack1 с ингибицией связывания комплекса BMAL1-CLOCK с Е-боксом.[42] Исследователи изучили роль Astakine-2 в индуцированном мелатонином циркадном регулировании у ракообразных и обнаружили, что AST2 необходим для ингибирования связывания комплекса BMAL1-CLOCK с E-боксом. Кроме того, они обнаружили, что секреция мелатонина отвечает за регулирование экспрессии AST2 и предположили, что ингибирование связывания E-бокса влияет на CLOCK у любого животного с молекулами AST2.

Исследователи из Медицинской школы университета Нанкин обнаружили, что амплитуда FBXL3 (F-бокс/богатых лейцином повторов белка) экспрессируется через E-бокс.[43] Они изучали мышей с дефицитом FBXL3 и обнаружили, что он регулирует петлю обратной связи в циркадных ритмах, влияя на циркадный период.

Исследование, опубликованное 4 апреля 2013 исследователями Гарвардской медицинской школы обнаружило, что нуклеотиды по обе стороны от E-бокса влияют на то, какие транскрипционные факторы могут связываться с самим E-боксом.[44] Эти нуклеотиды определяют 3-D пространственное расположение нити в ДНК и ограничивают размер связывания факторов транскрипции. Исследование также показало различия в связывании матриц между естественными условиями и в пробирке (in vivo и in vitro).

Примечания

  1. ↑ Massari, M. E.; Murre, C. (2000). "Helix-loop-helix proteins: regulators of transcription in eucaryotic organisms". Molecular and Cellular Biology. 20 (2): 429—440. doi:10.1128/mcb.20.2.429-440.2000. PMC 85097. PMID 10611221.
  2. ↑ Chaudhary, J; Skinner, M K. (May 1999). "Basic helix-loop-helix proteins can act at the E-box within the serum response element of the c-fos promoter to influence hormone-induced promoter activation in Sertoli cells". Mol Endocrinol. 13 (5): 774—786. doi:10.1210/mend.13.5.0271. PMID 10319327.
  3. ↑ Ephrussi, A; Church, GM; Tonegawa, S; Gilbert, W (1985). "B lineage-specific interactions of an immunoglobulin enhancer with cellular factors in vivo". Science. 227 (4683): 134—140. doi:10.1126/science.3917574. PMID 3917574.
  4. ↑ Church, GM; Ephrussi, A; Gilbert, W; Tonegawa, S (1985). "Cell-type-specific contacts to immunoglobulin enhancers in nuclei". Nature. 313 (6005): 798—801. Bibcode:1985Natur.313..798C. doi:10.1038/313798a0. PMID 3919308.
  5. ↑ Murre, C; Mc Caw, P S; Vaessin, H; Caudy, M; Jan, L Y; Cabrera, C V; Buskin, J N; Hauschka, S D; Lassar, A B; Weintraub, Harold; Baltimore, David; et al. (Aug 1989). "Interactions between heterologous helix-loop-helix proteins generate complexes that bind specifically to a common DNA sequence". Cell. 58 (3): 537—544. doi:10.1016/0092-8674(89)90434-0. PMID 2503252. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |displayauthors= игнорируется (|display-authors= предлагается) (справка); Явное указание et al. в: |author10= (справка); Явное указание et al. в: |first9= (справка)
  6. ↑ Henthorn, P; Kiledjian, M; Kadesch, T (1990). "Two distinct transcription factors that bind the immunoglobulin enhancer microE5/kappa 2 motif". Science. 247 (4941): 467—470. Bibcode:1990Sci...247..467H. doi:10.1126/science.2105528. PMID 2105528.
  7. ↑ Hu S-J, Olson E N; Kingston, R E. (1992). "HEB". Mol Cell Biol. 12 (3): 1031—1042. PMC 369535. PMID 1312219.
  8. ↑ Chen, B; Lim, R W. (Jan 1997). "Physical and functional interactions between the transcriptional inhibitors Id3 and ITF-2b. Evidence toward a novel mechanism regulating muscle-specific gene expression". J Biol Chem. 272 (4): 2459—2463. doi:10.1074/jbc.272.4.2459. PMID 8999959.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  9. ↑ Mädge B.: E-Box. In: Schwab M. (Ed.) Encyclopedia of Cancer: SpringerReference (www.springerreference.com). Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2009. doi:10.1007/SpringerReference_173452
  10. ↑ Ellenberger, T; Fass, D; Arnaud, M; Harrison, S C. (Apr 1994). "Crystal structure of transcription factor E47: E-box recognition by a basic region helix-loop-helix dimer". Genes Dev. 8 (8): 970—980. doi:10.1101/gad.8.8.970. PMID 7926781.
  11. ↑ Muñoz; Michelle Brewer; Ruben Baler (2006). "Modulation of BMAL/CLOCK/E-Box complex activity by a CT-rich cis-acting element". Molecular and Cellular Endocrinology. 252 (1—2): 74—81. doi:10.1016/j.mce.2006.03.007. PMID 16650525.
  12. ↑ Bose; Boockfor FR (2010). "Episodes of prolactin gene expression in GH3 cells are dependent on selective promoter binding of multiple circadian elements". Endocrinology. 151 (5): 2287—2296. doi:10.1210/en.2009-1252. PMC 2869263. PMID 20215567.
  13. ↑ Yoo, S.H.; Ko, C.H.; Lowrey, P.L.; Buhr, E.D.; Song, E.J.; Chang, S.; Yoo, O.J.; Yamazaki, S.; Lee, C.; et al. (2005). "A noncanonical E-box enhancer drives mouse Period2 circadian oscillations in vivo". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 102 (7): 2608—2613. doi:10.1073/pnas.0409763102. PMC 548324. PMID 15699353. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |displayauthors= игнорируется (|display-authors= предлагается) (справка); Явное указание et al. в: |author10= (справка); Явное указание et al. в: |first9= (справка)
  14. ↑ Zhang, X.; Patel, S. P.; McCarthy, J. J.; Rabchevsky, A. G.; Goldhamer, D. J.; Esser, K. A. (2012). "A non-canonical E-box within the MyoD core enhancer is necessary for circadian expression in skeletal muscle". Nucleic Acids Res. 40 (8): 3419—3430. doi:10.1093/nar/gkr1297. PMID 22210883.
  15. ↑ Enrique, Salero; Cecilio, Giménez; Francisco, Zafra (Mar 2003). Biochem J. 370 (3): 979—986. {{cite journal}}: |title= пропущен или пуст (справка)
  16. ↑ Hao, H; Allen, D L; Hardin, P E. (Jul 1997). "A circadian enhancer mediates PER-dependent mRNA cycling in Drosophila melanogaster". Mol Cell Biol. 17 (7): 3687—3693. PMC 232220. PMID 9199302.
  17. ↑ Panda, S; Antoch MP; Miller BH; Su AI; Schook AB; Straume M; Schultz PG; Kay SA; Takahashi JS; Hogenesch JB (May 2002). "Coordinated transcription of key pathways in the mouse by the circadian clock". Cell. 109 (3): 307—320. doi:10.1016/S0092-8674(02)00722-5. PMID 12015981.
  18. ↑ Herzog, Erik (October 2007). "Neurons and networks in daily rhythms". Nature Reviews Neuroscience. 8 (10): 790—802. doi:10.1038/nrn2215. PMID 17882255.
  19. ↑ Yan, Jun; Haifang Wang; Yuting Liu; Chunxuan Shao (October 2008). "Analysis of Gene Regulatory Networks in the Mammalian Circadian Rhythm". PLOS Computational Biology. 4 (10): e1000193. Bibcode:2008PLSCB...4E0193Y. doi:10.1371/journal.pcbi.1000193. PMC 2543109. PMID 18846204.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  20. ↑ Ueshima, T; Kawamoto T; Honda KK; Noshiro M; Fujimoto K; Nakao S; Ichinose N; Hashimoto S; Gotoh O; Kato Y (December 2012). "Identification of a new clock-related element EL-box involved in circadian regulation by BMAL1/CLOCK and HES1". Gene. 510 (2): 118—125. doi:10.1016/j.gene.2012.08.022. PMID 22960268.
  21. ↑ Nakahata, Y; Yoshida M; Takano A; Soma H; Yamamoto T; Yasuda A; Nakatsu T; Takumi T (January 2008). "A direct repeat of E-box-like elements is required for cell-autonomous circadian rhythm of clock genes". BMC Mol Biol. 9 (1): 1. doi:10.1186/1471-2199-9-1. PMID 18177499.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  22. ↑ Honma, S; Kawamoto, T; Takagi, Y; Fujimoto, K; Sato, F; Noshiro, M; Kato, Y; Honma, K. (2002). "Dec1 and Dec2 are regulators of the mammalian molecular clock". Nature. 419 (6909): 841—844. Bibcode:2002Natur.419..841H. doi:10.1038/nature01123. PMID 12397359.
  23. ↑ Ripperger, J A.; Schibler, U. (Mar 2006). "Rhythmic CLOCK-BMAL1 binding to multiple E-box motifs drives circadian Dbp transcription and chromatin transitions". Nat. Genet. 38 (3): 369—374. doi:10.1038/ng1738. PMID 16474407.
  24. ↑ Prendergast, G C; Ziff, E B. (Jan 1991). "Methylation-sensitive sequence-specific DNA binding by the c-Myc basic region". Science. 251 (4990): 186—189. Bibcode:1991Sci...251..186P. doi:10.1126/science.1987636. PMID 1987636.
  25. ↑ Desbarats, L; Gaubatz, S; Eilers, M. (Feb 1996). "Discrimination between different E-box-binding proteins at an endogenous target gene of c-myc". Genes Dev. 10 (4): 447—460. doi:10.1101/gad.10.4.447. PMID 8600028.
  26. ↑ Xiao, Q; Claassen, G; Shi, J; Adachi, S; Seivy, J; Hann, S R. (Dec 1998). "Transactivation-defective c-MycS retains the ability to regulate proliferation and apoptosis". Genes Dev. 12 (24): 3803—3808. doi:10.1101/gad.12.24.3803. PMID 9869633.
  27. ↑ Mädge B.: E-Box. In: Schwab M. (Ed.) Encyclopedia of Cancer: SpringerReference (www.springerreference.com). Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2009. doi:10.1007/SpringerReference_173452
  28. ↑ Shklover, J; Etzioni, S; Weisman-Shomer, P; Yafe, A; Bengal, E; Fry, M. (2007). "MyoD uses overlapping but distinct elements to bind E-box and tetraplex structures of regulatory sequences of muscle-specific genes". Nucleic Acids Res. 35 (21): 7087—7095. doi:10.1093/nar/gkm746. PMID 17942416.
  29. ↑ Mädge B.: E-Box. In: Schwab M. (Ed.) Encyclopedia of Cancer: SpringerReference (www.springerreference.com). Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2009. doi:10.1007/SpringerReference_173452
  30. ↑ Bergstrom, D. A.; Penn, B. H.; Strand, A.; Perry, R. L.; Rudnicki, M. A.; Tapscott, S. J. (2002). "Promoter-specific regulation of MyoD binding and signal transduction cooperate to pattern gene expression". Mol. Cell. 9 (3): 587—600. doi:10.1016/s1097-2765(02)00481-1. PMID 11931766.
  31. ↑ Tang, H; Goldman, D (2006). "Activity-dependent gene regulation in skeletal muscle is mediated by a histone deacetylase (HDAC)-Dach2-myogenin signal transduction cascade". Proc Natl Acad Sci USA. 103 (45): 16977—16982. Bibcode:2006PNAS..10316977T. doi:10.1073/pnas.0601565103. PMC 1636564. PMID 17075071.
  32. ↑ Ramamoorthy, S; Donohue, M; Buck, M. (2009). "Decreased Jun-D and myogenin expression in muscle wasting of human cachexia". Am J Physiol Endocrinol Metab. 297 (2): E392—401. doi:10.1152/ajpendo.90529.2008. PMC 2724118. PMID 19470832.
  33. ↑ Jane, D.T.; Morvay, L.C.; Koblinski, J.; Yan, S.; Saad, F.A.; Sloane, B.F.; et al. (2002). "Evidence that E-box promoter elements and MyoD transcription factors play a role in the induction of cathepsin B gene expression during human myoblast differentiation". Biol. Chem. 383 (12): 1833—1844. doi:10.1515/BC.2002.207. PMID 12553720. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |displayauthors= игнорируется (|display-authors= предлагается) (справка); Явное указание et al. в: |author7= (справка); Явное указание et al. в: |first6= (справка)
  34. ↑ Neufeld, B.; Hoffmeyer, A.; Jordan, B. W. M.; Chen, P.; Dinev, D.; Ludwig, S.; Rapp, U. R.; et al. (2000). "Serine/Threonine Kinases 3pK and MAPK-activated Protein Kinase 2 Interact with the Basic Helix-Loop-Helix Transcription Factor E47 and Repress Its Transcriptional Activity". J. Biol. Chem. 275 (27): 20239—20242. doi:10.1074/jbc.C901040199. PMID 10781029. {{cite journal}}: Явное указание et al. в: |author2= (справка)Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  35. ↑ Johnson; Wang X.; Hardy S.; Taparowsky, E. J.; Konieczny, S. F. (1996). "Casein kinase II increases the transcriptional activities of MRF4 and MyoD independently of their direct phosphorylation". Mol. Cell. Biol. 16 (4): 1604—1613. PMC 231146. PMID 8657135.
  36. ↑ Sloan; Shen C. P.; McCarrick-Walmsley R.; Kadesch T. (1996). "Phosphorylation of E47 as a potential determinant of B-cell-specific activity". Mol. Cell. Biol. 16 (12): 6900—6908. PMC 231693. PMID 8943345.
  37. ↑ Shen; Kadesch T. (1995). "B-cell-specific DNA binding by an E47 homodimer". Mol. Cell. Biol. 15 (8): 4518—4524. PMC 230691. PMID 7623842.
  38. ↑ Bain; Izon, D. J.; Amsen, D; Kruisbeek, A. M.; Weintraub, B. C.; Krop, I; Schlissel, M. S.; Feeney, A. J.; Van Roon, M; et al. (1994). "E2A proteins are required for proper B cell development and initiation of immunoglobulin gene rearrangements". Cell. 79 (5): 885—892. doi:10.1016/0092-8674(94)90077-9. PMID 8001125. {{cite journal}}: Явное указание et al. в: |author2= (справка)
  39. ↑ Lassar; Davis R. L.; Wright W. E.; Kadesch T.; Murre C.; Voronova A.; Baltimore D.; Weintraub H. (1991). "Functional activity of myogenic HLH proteins requires hetero-oligomerization with E12/E47-like proteins in vivo". Cell. 66 (2): 305–315. doi:10.1016/0092-8674(91)90620-e. PMID 1649701.
  40. ↑ Murre; McCaw P. S., Vaessin H., Caudy M., Jan L. Y., Jan Y. N., Cabrera C. V., Buskin J. N., Hauschka S. D., Lassar A. B.; Vaessin, H; Caudy, M; Jan, L. Y.; Jan, Y. N.; Cabrera, C. V.; Buskin, J. N.; Hauschka, S. D.; Lassar, A. B.; et al. (1989). "Interactions between heterologous helix-loop-helix proteins generate complexes that bind specifically to a common DNA sequence". Cell. 58 (3): 537—544. doi:10.1016/0092-8674(89)90434-0. PMID 2503252. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |displayauthors= игнорируется (|display-authors= предлагается) (справка); Явное указание et al. в: |author2= (справка)Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  41. ↑ Muñoz, E; Brewer, M; Baler, R. (Sep 2002). "Circadian Transcription: THINKING OUTSIDE THE E-BOX". J Biol Chem. 277 (39): 36009—36017. doi:10.1074/jbc.m203909200. PMID 12130638.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  42. ↑ Watthanasurorot, A; Saelee, N; Phongdara, A; Roytrakul, S; Jiranavichpaisal, P; Söderhäll, K; Söderhäll, I. (Mar 2013). "Astakine 2—the Dark Knight Linking Melatonin to Circadian Regulation in Crustaceans". PLOS Genetics. 3 (3): e1003361. doi:10.1371/journal.pgen.1003361.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  43. ↑ Shi, G; Xing, L; Liu, Z; Qu, Z; Wu, X; Dong, Z; Wang, X; Gao, X; Huang, M; Yang, L.; Liu, Y.; Ptacek, L. J.; Xu, Y.; et al. (2013). "Dual roles of FBXL3 in the mammalian circadian feedback loops are important for period determination and robustness of the clock". Proc Natl Acad Sci U S A. 110 (12): 4750—5. Bibcode:2013PNAS..110.4750S. doi:10.1073/pnas.1302560110. PMC 3606995. PMID 23471982. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |displayauthors= игнорируется (|display-authors= предлагается) (справка); Явное указание et al. в: |author10= (справка); Явное указание et al. в: |first9= (справка)
  44. ↑ Gordân, R; Shen, N; Dror, I; Zhou, T; Horton, J; Rohs, R; Bulyk, ML. (Apr 2013). "Genomic Regions Flanking E-Box Binding Sites Influence DNA Binding Specificity of bHLH Transcription Factors through DNA Shape". Cell Rep. 3 (4): 1093—104. doi:10.1016/j.celrep.2013.03.014. PMC 3640701. PMID 23562153.
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=Е-бокс&oldid=69866359