Гаплогруппа D (Y-ДНК)

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Это старая версия этой страницы, сохранённая 213.162.68.240 (обсуждение) в 18:55, 4 ноября 2020 (rv). Она может серьёзно отличаться от текущей версии.
Перейти к навигации Перейти к поиску
Гаплогруппа D
Тип Y-ДНК
Время появления 64,7-83 тыс. лет назад[1]
Место появления Африка, Азия[1]
Предковая группа DE
Сестринские группы E
Субклады D1, D2
Мутации-маркеры CTS3946, CTS4030/Z1605
Файл:Haplogroup D (Y-DNA) migration map.png
Гипотетический северный маршрут миграции носителей гаплогруппы D

Гаплогруппа D (CTS3946) — гаплогруппа ДНК Y-хромосомы. Как гаплогруппа D, так и E содержат однонуклеотидный полиморфизм M168, который имеется во всех гаплогруппах, кроме A и B (см. группа CT), а также полиморфизм уникального события YAP, уникальный для гаплогруппы DE — общего предка D и Е.

Происхождение

Крис Тайлер-Смит с коллегами считают, что гаплогруппа D образовалась в Африке около 73000 л. н., а около 71 тыс. лет назад отделилась западноафриканская линия D0[1]. И гаплогруппа D, и гаплогруппа E содержат характеристику уникальный полиморфизм событий YAP, но показывают общее происхождение. Гаплогруппа D1 родилась в Азии около 60 000 лет назад. Гаплогруппа D1 не встречается за пределами Азии. Гаплогруппа D2 была обнаружена незначительно в Африке и Передней Азии[2].

По мнению Т. Карафет, гаплогруппа D возникла в Азии около 60 тыс. лет назад[3][4].

Палеогенетика

  • Гаплогруппа D обнаружена у образца Ma91 (ок. 4319 л. н.) из Малайзии[5].
  • Субклад D1a2b1 выявлен у представителя культуры Дзёмон, жившего примерно 3500—3800 лет назад[6].
  • Гаплогруппа D1a2a1 определена у представителя кобанской культуры из могильника Заюково-3, расположенного близ села Заюково в Баксанском районе Кабардино-Балкарии (VIII—VII века до н. э.)[7].

Обзор

В настоящее время встречается с высокой частотой среди населения Тибета, Японского архипелага[8] и Андаманских островов, однако, в силу неизвестных обстоятельств, пока не обнаружена на полуострове Индостан. Айны в Японии, а также народы джарава и онге на Андаманских островах имеют почти исключительно данную гаплогруппу, хотя у айнов кроме гаплогруппы D1a2 (81,3%[9]) с частотой около 15 % также встречается Y-хромосомная гаплогруппа C3.

Также хромосомы с гаплогруппой D обнаружены с низкой или умеренной частотой у народов Центральной Азии и севера Восточной Азии, а также у китайцев-хань и народов мяо-яо в Китае и некоторых национальных меньшинств китайских провинций Сычуань и Юньнань, говорящих на тибето-бирманских языках и проживающих в непосредственной близости от тибетцев.

В отличие от гаплогруппы C, гаплогруппа D не мигрировала из Азии через Берингию в Новый Свет.

Гаплогруппа D также примечательна своей исключительной географической дифференциацией, когда определённый подкласс гаплогруппы чётко локализуется в какой-либо популяции, где большой процент лиц имеют гаплогруппу D:

Такая, по-видимому, древняя диверсификация гаплогруппы D заставляет предположить, что её скорее следует охарактеризовать как «супергаплогруппу», «макрогаплогруппу».

Особо характерными являются примеры гаплогруппы D у населения Японских островов, поскольку они содержат комплекс из как минимум пяти отдельных мутаций, свойственных гаплогруппе D, что ясно отличает их от гаплогруппы D, обнаруженной у жителей Тибета и Андаманских островов. Этот факт является свидетельством того, что гаплогруппа D1a2 была модальной гаплогруппой доисторической культуры Дзёмон на Японских островах.

Подклассы

Филогенетическое дерево

ISOGG (version: 14.151)[10].

Примечания

  1. 1 2 3 4 Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Thomas, Mark G.; Yang, Huanming; Arciero, Elena; Asan; Connell, Bruce A.; Jones, Abigail L.; Haber, Marc. A Rare Deep-Rooting D0 African Y-Chromosomal Haplogroup and Its Implications for the Expansion of Modern Humans out of Africa (англ.) // Genetics : journal. — 2019. — 13 June. — P. genetics.302368.2019. — ISSN 0016-6731. — doi:10.1534/genetics.119.302368. — PMID 31196864.
  2. 1 2 Estes, Roberta Exciting New Y DNA Haplogroup D Discoveries! (англ.). DNAeXplained - Genetic Genealogy (21 июня 2019). Дата обращения: 8 июля 2019.
  3. Shi et al. (2008) Y chromosome evidence of earliest modern human settlement in East Asia and multiple origins of Tibetan and Japanese populations, BMC Biology
  4. Tatiana M. Karafet et al. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromosomal Haplogroup Tree, Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008
  5. Hugh McColl et al. Ancient Genomics Reveals Four Prehistoric Migration Waves into Southeast Asia, 2018
  6. POB-162 Phenotype and phylogeny of Neolithic Japanese hunter-gatherers, Jomon people, based on whole nuclear genome sequences // SMBE 2018 Архивная копия от 7 июля 2018 на Wayback Machine
  7. Eugenia Boulygina et al. Mitochondrial and Y-chromosome diversity of the prehistoric Koban culture of the North Caucasus, 2020
  8. Michael F. Hammer, Tatiana M. Karafet, Hwayong Park, Keiichi Omoto, Shinji Harihara, Mark Stoneking and Satoshi Horai, «Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes», Journal of Human Genetics Volume 51, Number 1 / January, 2006.
  9. Yusuke Watanabe, Izumi Naka, Seik-Soon Khor, Hiromi Sawai, Yuki Hitomi, Katsushi Tokunaga, Jun Ohashi Analysis of whole Y-chromosome sequences reveals the Japanese population history in the Jomon period, 2019
  10. Y-DNA Haplogroup D and its Subclades - 2019
  11. 1 2 3 Hammer MF, Karafet TM, Park H et al. (2006). "Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes". J. Hum. Genet. 51 (1): 47–58. doi:10.1007/s10038-005-0322-0. PMID 16328082.
  12. D YTree. www.yfull.com. Дата обращения: 3 сентября 2019.
  13. Y-DNA Haplogroup D and its Subclades - 2014

Литература

  • Shi; et al. (2008), "Y chromosome evidence of earliest modern human settlement in East Asia and multiple origins of Tibetan and Japanese populations" (PDF), BMC Biology, 6 (45), doi:10.1186/1741-7007-6-45 {{citation}}: Явное указание et al. в: |author= (справка)Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)

См. также

Эволюционное древо гаплогрупп Y-хромосомы человека
Y-хромосомный Адам
    A0-T
A00   A0   A1
    A1a   A1b
A1b1 BT
  B   CT
DE   CF
D   E C F
F1  F2  F3    GHIJK  
    G HIJK
H IJK
IJ K
I J LT (K1) K2
L (K1a)   T (K1b)       K2a/K2a1/NO/NO1 K2b
N O   K2b1     P (K2b2)/P1  
  S (K2b1a) M (K2b1b) Q R  

Ссылки