Проект:Биоинформатика
Перейти к навигации
Перейти к поиску
 | Этот проект малоактивен. Информацию по восстановлению малоактивного проекта см. здесь. Если активность проекта увеличится или данный шаблон был проставлен по ошибке, замените параметр малоактивный на активный, замените дату на сегодняшнюю, а также обновите статус активности в каталоге проектов. Если участники сообщества не проявляют активность в проекте долгое время (например, более полугода), замените его на {{Статус проекта|неактивный}}. (Шаблон установлен 27 октября 2021 года) |
Целью проекта «Биоинформатика» является создание и улучшение русскоязычных статьей, посвященных высокопроизводительным технологиям современной биологии и методам биоинформатического анализа данных. Улучшение статьей является частью учебного процесса студентов ФББ МГУ, ФКН ВШЭ и ШБ. Этот проект в значительной степени вдохновлен аналогичным проектом в МФТИ.
Правила[править код]
- Участники могут выбрать одну из статей представленных в таблице ниже или предложить статью самостоятельно, в этом случае статью необходимо согласовать с преподавателем.
- Целью работы является получение статьей статуса добротной или улучшения ее статуса в ряду добротная-хорошая-избранная. Улучшение статуса автоматически обозначает получение максимального балла. Пожалуйста, ознакомьтесь с требованиями к статье и процедурой выдвижения
- Над каждой статьей работают два студента: вы можете сами выбрать, с кем вы работаете над статьей.
- Выбрав статью, вы должны сами вписать свои имена и ники в таблицу ниже.
- Статью необходимо подготовить не позднее 24.04.2020 и прислать ссылку на нее преподавателю для проверки текста
- Статья, не получившая статус, может быть зачтена в том случае, если она
- Была согласована с преподавателем и выдвинута на статус добротной не позднее 03.05.2020
- Все замечания, высказанные опытными участниками Википедии до 03.05.2020, должны были учтены, а необходимые исправления внесены до 12.05.2020.
- Проверка будет осуществляться по состоянию на 12.05.2020
Кураторы проекта[править код]
Статьи, над которым работают участники проекта (2020 год)[править код]
| Статья | Участники | Ники | Что сделать | Статус, дата сдачи |
|---|---|---|---|---|
| Количественный анализ экспрессии генов | улучшить структуру, расширить | |||
| Транскриптомика одиночных клеток | Потанина, Скаков | Darya Potanina | Согласовано 03.05.2020, получен статус | |
| Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA) | Азбукина, Мыларщиков | DmitryOne | Согласовано 20.04.20, номинировано, ведется работа | |
| ChIP-seq | Мищенко, Галкин | Prosto polinushka, Scibroth | добавить новую информацию о модификациях, обновить информацию о софте | Согласовано 18.04.2020, номинировано |
| Поиск пиков в данных ChiP-Seq | ||||
| Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico | Кучеренко | Creepyorange | ||
| Функциональная аннотация геномов млекопитающих | Бартыш, Гладнева | Katyabartysh, Eva Tern | Согласовано 12.04.2020, получен статус | |
| Энциклопедия_элементов_ДНК | ||||
| Молекулярный докинг | Елизарова | evel147 | Дополнить информацией из литературы и статей | Согласовано 18.04.20, получен статус |
| Вложенная полимеразная цепная реакция | Буян, Кравченко | Павел Крав | Перевести на русский, обязательно добавить раздел про nested PCR в основную статью Полимеразная цепная реакция и связать с новой страницей | Согласовано 29.03.2020, получен статус |
| Полимеразная цепная реакция в реальном_времени | Чашникова, Миронова | mimiroha | Сделать текст более структурированным, дополнить совеременной информацией про приложения, связать с ChIP и Количественным анализом экспрессии | Согласовано 12.05.2020, номинировано, замечания учтены |
| 16S рРНК | Гусева, Юдина | Eguseva | Дополнить, дописать, зачем используется и почему, связать с релевантными страницами | Согласовано 30.03.2020, получен статус |
| Методы секвенирования нового поколения | Веселова, Никитин | yas0n1a, Nikkent | Дополнить, структурировать текст, добавить иллюстрации и примеры | Согласовано 23.04.2020, получен статус |
| Микробиом | Камышева, Шпудейко | Дополнить, структурировать текст, добавить иллюстрации и примеры | Согласовано 29.03.2020, получен статус | |
| Предсказание структуры белка | Угольков, Васильева | Ugol24d | Дополнить - перечислить подходы, софт, etc | Согласовано 20.04.2020, получен статус |
| Модель замен | Довести до добротной | |||
| FASTA | Бусыгин | DaydreamingElephant | Дополнить, довести до добротной | Согласовано 16.04.2020, получен статус |
| Молекулярная эволюция | Цветков, Григорьян | Расширить | Согласовано 22.04.2020, номинировано, проигнорированы замечания | |
| Двугибридный анализ | Серебренникова, Морозов | Дополнить, сделать более читаемой. | Согласовано 23.04.2020, номинировано, ведется работа | |
| Нанопоровое секвенирование | Календр, Рюмина | E.caterina Ryu, Romanbioengee | Дописать про методы анализа, довести до добротной | Согласовано 14.04.2020, получен статус |
| Количественный анализ альтернативного сплайсинга | Ириоглов, Черкашина | Дополнить примерами, структурировать | Согласовано 24.04.2020, номинировано | |
| Сборка Golden Gate | Зинкевич | Arsen-z | Перевести на русский и доработать | Согласовано 20.04.2020, получен статус, статья рекомендована в хорошие. |
| ATAC-seq | Минина | Minina | Создание новой статьи | Согласовано 05.03.2020, получен статус |
| Эпигеномика | Минина | Minina | Создание новой статьи | Согласовано 05.03.2020, получен статус |
| Пространственная транскриптомика | Козюлина, Гурылева | Создание новой статьи | Согласовано 24.04.2020, получен статус | |
| Биоинформатика | Попов А, Селифанова М | Привести в порядок, добавить актуальную информацию |
Архив[править код]
(2019 год) Статьи, над которым работали участники проекта[править код]
| Статья | Участники | Ники | Что сделать | Статус |
|---|---|---|---|---|
| Групповой анализ дифференциальной экспрессии | Маргасюк, Посицельская | Sergey Margasyuk | получен статус | |
| Количественный анализ экспрессии генов | Николаева | согласовано, требуются стилистические правки | ||
| Транскриптомика одиночных клеток | Исаев, Карпухина | serj.hop AnnShw | ||
| Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA) | ||||
| Секвенирование РНК | Морозова | morozova_ea | обновить | согласовано, получен статус |
| Визуализация данных секвенирования РНК | Волынкина, Галивонджян | InnaVolynkina | Добавить новую информацию, подробнее описать, подправить битые ссылки | согласовано, получен статус |
| Коррекция на множественное тестирование | Матвейшина, Котюргин | Mek1314 | получен статус | |
| ChIP-seq | Сефербекова, Теплова | zairasef, AdaTeplova | добавить новую информацию о модификациях, улучшить текст, связать с поиском пиков | согласовано, получен статус |
| Поиск пиков в данных ChiP-Seq | ||||
| Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico | ||||
| секвенирование экзома | Карань, Пиунова | akartar.n, | согласовано, получен статус | |
| Функциональная аннотация геномов млекопитающих | ||||
| Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE) | Васильева, Шагиев | Yeessa, Cyber500 | получен статус | |
| Cytoscape | Кузнецова, Максимов | согласовано, получен статус | ||
| SAMtools | Аксенова, Панова | Maribish, Nooroka | согласовано, получен статус | |
| Предсказание генов | Борисов, Зареченская | согласовано, получен статус | ||
| Проект «Раковый геном» | Рюмин, Чаплий | ruminkd, chaplyk | согласовано, получен статус | |
| Энциклопедия_элементов_ДНК | ||||
| AutoDock | Герасева, Преображенская | Geraseva | сделать текст более читаемым, улучшить структуру | согласовано, получен статус |
| Молекулярный докинг | Усманов, Положинцев | Rustamusmanov973, Temasonos | Дополнить информацией из литературы и статей | согласовано |
| Промотор | Литвин, Радкевич | Litvinanna, Emir.radkevich | Улучшить, добавить инструменты поиска | Согласовано, получен статус |
| Выравнивание последовательностей | Гавриш, Авдюнина | GGleb42WP, P.avdiunina | Расширить статью, добавить информацию | согласовано, получен статус |
| en:Chromosome conformation capture | Калашникова, Гладкова | AKalashnikova, Gladmarine | перевести, придумать русское название | согласовано, получен статус |
(2018 год) Статьи, над которым работали участники проекта[править код]
(2017 год) Статьи, над которым работали участники проекта[править код]
| Статья | Количество студентов на статью | Участник[и] | Ник[и] |
|---|---|---|---|
| Ensembl | 2 | Злобин, Маслова | alex_the_evil, Valmarfgecnf |
| Групповой анализ дифференциальной экспрессии | 2 | ||
| Мотив (молекулярная биология) | 2 | Молдован, Пензар | Arajmob,Dmitrypenzar1996 |
| Транскриптомика одиночных клеток | 2 | Адамейко, Галкин | Delfinio, Radiation7 |
| Метод дробовика | 2 | Беженцев, Сахарова | Malenkaya vrednaya polymeraza, Eka_Sa |
| ДНК-микрочип | 2 | Кузнецова, Ливенский | kuznetmaria, livenskyi |
| TopHat | 2 | Березина, Валяева | Krevetkakrevetochka, Annvalyaeva |
| KEGG | 2 | Скибина Е., Волосникова М. | ES Skibina, Marinarazdvatri |
| UniProt | 2 | Дидковская Н., Санжаева У. | Nataliyadi, USanzhaeva |
| Белок-белковые взаимодействия | 2 | Хвень, Яровенко | Irishkasuperfresh, Brokoro |
| AutoDock | 2 | Белоусов, Пушкарёва | belv, opushkareva |
| GenBank | 2 | Кузнецов, Софронова | |
| Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA) | 2 | ||
| Коррекция на множественное тестирование | 2 | Степаков, Менделевич | , Strausyatina |
| Логотип последовательностей | 2 | Рябых, Погорельская | alexapogorelskaya |
| Фармакогенетика | 2 | Безсуднова, Мухалева | Redgzb, Bezu |
| MEME | 2 | Хачатурян, Буянова | Zyukeriya, sonya_sofia7 |
| Атлас ракового генома | 2 | Швецова, Корягина | theurgeforhappiness, liluoppi |
| BWA (выравнивание биологических последовательностей) | 1 | Prosvirov Kirill | Akado2009 |
| STRING | 1 | Кононкова | A_Kononkova |
| Визуализация данных секвенирования РНК | 1 | ||
| Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE) | 1 | Елена Шушкевич | ElenaShush |
| Модель_замен | 1 | ||
| Поиск пиков в данных ChiP-Seq | 1 | ||
| Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico | 1 | ||
| Секвенирование РНК | 1 | Ася Стол | smartnbeautiful |
| секвенирование экзома | 1 | Дюгай Илья | |
| Функциональная аннотация геномов млекопитающих | 1 | Ксения Янкина | Salatcesar |
| Cytoscape | 1 | Ковальчук Михаил | kvlml |
| ChIP-seq | 1 | Ярослав Лозинский | Lozinsky.yaroslav |
| Теплокарта | 1 | Симонова Александра | alexandrevna |
| Генная_онтология | 1 | Сегодин Виталий | MC Poh |
| Метод присоединения соседей | 1 | Тихонова Полина | tikhonovapolly |
| Pfam | 1 | Мошенский Денис | loven-doo |
| SAMtools | 1 | Холина Татьяна | rainy_TK |
| Анализ метаболических потоков | 1 | Демкив Андрей | Andrey_demkiv |
| Байесовский подход в филогенетике | 1 | Худякова Ксения | khudyakova |
| Интерактом | 1 | Богдан Кириллов | Bakirillov |
| Позиционная весовая матрица | 1 | Сингх Лавприт | Preety |
| Предсказание генов | 1 | Чайников Антон | mrgutkun |
| Проект «Раковый геном» | 1 | Теванян Элен | Элен Теванян |
| Энциклопедия_элементов_ДНК | 1 | Филиппова Екатерина | edfilippova |
| FAIRE-Seq | 1 | Миронов Алексей | |
| Секвенирование древней ДНК | 1 | Кунин Михаил | |
| Формат файлов GFF | 1 | Ольга Васюткина | sunnymouse |
(2016 год) Статьи, над которым работали участники проекта[править код]
| Участник[и] | Ник[и] | Статья | Комментарий | Статус | дата окончания правки |
|---|---|---|---|---|---|
| Панкевич | Pankevich-ev | STARR-seq | перевод en:STARR-seq | согласовано | |
| Образцова, Попов | Alcedattis | Пространственное_выравнивание | перевод en:Structural_alignment | согласовано | |
| Гафуров, Меерсон, Носикова | FBA | Анализ_метаболических_потоков | перевод, en:Flux balance analysis | согласовано | |
| Дудина, Елисеев, Малеева | Dudinadar, Glennerad | Секретомика | перевод, en:Secretomics | согласовано | |
| Абдрахманов, Анисимова | SunnyBeque | Метагеномика | перевод en:Metagenomics | согласовано | |
| Галкин Фёдор | Предсказание генов | перевод en:Gene_prediction | согласовано | ||
| Босхомджиева Баина, Андреева Анна | bainabos, lazyraccoon | Интерактом | перевод en:Interactome | согласовано | |
| Гусев, Евстафьева, Желудкевич | zheludkevich.anna | Коррекция на множественное тестирование | доведение до статуса добротной | согласовано | |
| Нуждина Екатерина | Alezanalp | BWA (выравнивание биологических последовательностей) | создание новой статьи, применение, алгоритмы, проблемы | список литературы согласован | |
| Беседина Лиза, Вакуленко Юля | biobesedina, vakulenko_julia | Байесовский подход в филогенетике | Перевод en:Bayesian inference in phylogeny | согласовано | |
| Шафиков Радик | iltarn.mos | Секвенирование ДНК одиночных клеток | создание новой статьи | согласовано | |
| Травин Дмитрий, Трушина Наталия, Козлова Мария | TravinD, Nitrushina | Баркодирование ДНК | перевод en:DNA barcoding | согласовано | |
| Мазитова Саша | AlMazitova | Метод дробовика | перевод en:Shotgun_sequencing | согласовано | |
| Минькина Елена | Meatargz | Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico | создание новой статьи | согласовано | |
| Тишина Соня, Федорова Алла | sonirabi, Triasteran | Множественное_выравнивание_последовательностей | перевод en:Multiple_sequence_alignment | согласовано | |
| Марсиаль | Mahoul | Ensembl | перевод en:Ensembl | согласовано | |
| Сутормин Дмитрий, Новикова Мария, Ежова Маргарита | sutormin94, Vadius Marie, rita501 | Вызов пиков | создание новой статьи | согласовано, нет списка литературы | |
| Кунин Михаил | mikhail_kunin | GenBank | перевод en:GenBank | согласовано | |
| Медведев, Мамедов | D.o.medvedev, Z_Krookie | Фармакогенетика | перевод en:Pharmacogenetics | согласовано | |
| Котлов | avkitex | AutoDock | перевод и дополнение AutoDock | согласовано | |
| Бикметов | Bikdm | Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA) | перевод en:Weighted correlation network analysis | Согласовано | |
| Трофимов | Предсказание функции белка | перевод en:Protein_function_prediction | не согласовано |
(2015 год) Статьи, над которым работали участники проекта[править код]
| Участник[и] | Ник[и] | Статья | Комментарий | Статус | дата окончания правки |
|---|---|---|---|---|---|
| Алешин | Vasily msu11 | Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE) | улучшение существующей статьи | источники согласованы | |
| Аккуратов | eakkuratov | визуализация данных РНК-сек | зачем нужно, что рисуют, примеры программ: genome browser, IGV, tablet, sashimi plot (MISO), … | источники согласованы | |
| Галицына, Бредихин | Rilalim raordan, kerkomen | SAMtools | и формат bam/sam. зачем нужен, как пользоваться en:SAMtools | источники согласованы | |
| Филаретов | Dragongene | Инкубатор:Sequence logo | может стоит придумать русское название en:Sequence_logo | источники согласованы | |
| Столярова, Бутусова | taisniqm, amadreaera | Позиционная весовая матрица | en:Position_weight_matrix | источники согласованы | |
| Клинк | GalkaKlink | Инкубатор:Групповой анализ дифференциальной экспрессии | GOstat, gorilla, goseq и т. д. Нужно придумать русское название. | ||
| Фоменко, Чаплин | lenafomenko, Chaplin_av | Инкубатор:Pfam | Описание БД: история, что есть, как пользоваться. en:Pfam | источники согласованы | |
| Девяткин | AndreiDeviatkin | методы изучения редактирования РНК | секция в Секвенирование_РНК | ||
| Ланина | No.lanina | Энциклопедия_элементов_ДНК | улучшение существующей статьи | согласован перевод | |
| Моисеева | janemoiseeva | Функциональная аннотация геномов млекопитающих | сайт проекта | ||
| Калинина, Новаковский, Елисеева | MarinaKalinina, fransilvion, julia-eliseeva | Атлас_Ракового_Генома | en:The_Cancer_Genome_Atlas | согласован перевод | |
| Безменова, Сафина | bsshka, noraneko | Предпочтение кодонов | en:Codon Usage Bias, нужно придумать русское название | источники согласованы | |
| Бурская, Сигалова | GreyCrow | Модель_замен | en:Substitution_model, нужно придумать русское название | источники согласованы | |
| Артюхов, Прохорова | eugeniaprokhorova | Проект «Раковый геном» | en:Cancer Genome Project, en:COSMIC cancer database | ||
| Климчук | Olesyaklm | Инкубатор:STRING | en:STRING | ||
| Белова, Гречникова | секвенирование экзома | en:Exome Sequencing | согласован перевод | ||
| Максудов, Нафеев, Шарафиев | pipeline |
(2014 год) Статьи, над которым работали участники проекта[править код]
| Участник[и] | Ник[и] | Статья | Комментарий | Статус | дата окончания правки |
|---|---|---|---|---|---|
| Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE) | улучшение существующей статьи | ||||
| Кулешов | Maxim Kuleshov | ДНК-микрочип | улучшение существующей статьи | Источники одобрены | 10.05.2014 |
| Дворкина, Муравьева | DashaDv, Fox.fbb.msu | ПЦР в реальном времени | улучшение существующей статьи | Источники одобрены | 09.05.2014 |
| Шадрина, Захаров | Olya_ldvgr, Matvey zaharov 25 | FAIRE-Seq | Источники одобрены | 09.05.2014 | |
| Зотова, Акулич | Umbrella22 | ChIP-seq | en:ChIP-sequencing | Источники одобрены | 09.05.2014 |
| Антоненко, Шилин | Eka-hal-lo, I.Shilin | Секвенирование древней ДНК | неандертальцы, денисовец и т. д | Источники одобрены | 09.05.2014 |
| Осипова | Elosip | Транскриптомика одиночных клеток | методы, проблемы, достижения | 15.05.2014 | |
| Брильков | brilkov | Секвенирование ДНК одиночных клеток | методы, проблемы, достижения | ||
| Шехирева, Залевский | KsushaSh,Aozalevsky | Предсказание вторичной структуры РНК | en:Nucleic_acid_structure_prediction | Источники одобрены | 9.05.2014 |
| Аюпов, Андрианов | ARustam, Esquel roche | Мотивы последовательностей (ДНК, РНК и белков) | en:Sequence_motif | ||
| Шмаков, Ситник | Arxcaeli, Zaheridor | Белок-белковые взаимодействия | en:Protein–protein_interaction | Перевод | 15.05.2014 |
| Поршнев, Шашков | ShashkovS | MEME | принципы работы en:Multiple_EM_for_Motif_Elicitation | Источники одобрены | 15.05.2014 |
| Тахавеев, Кондратьев | Vakeel | Cytoscape | зачем нужен, основные применения en:Cytoscape | Источники одобрены | 10.05.2014 |
| Балакирева | TopHat | принципы работы, зачем нужен, альтернативы [1] | Источники одобрены | 8.05.2014 | |
| визуализация данных РНК-сек | зачем нужно, что рисуют, примеры программ: genome browser, IGV, tablet, sashimi plot (MISO), ... | ||||
| SAMtools | и формат bam/sam. зачем нужен, как пользоваться en:SAMtools | ||||
| Bioconductor | en:Bioconductor | ||||
| Гаранина, Гараева | irinagaranina, alice_garaeva | Теплокарта | улучшение существующей статьи | Источники одобрены | 9.05.2014 |
| Sequence logo | может стоит придумать русское название en:Sequence_logo | ||||
| Позиционная весовая матрица | Position_weight_matrix | ||||
| Гущина, Лунева | Gushchina | Генная_онтология | en:Gene_ontology | Источники одобрены | 9.05.2014 |
| Gene set enrichment analysis | GOstat, gorilla, goseq и т.д. Нужно придумать русское название. | ||||
| Кузькина | karatuk | nj-tree | Нужно придумать русское название. Метод_присоединения_соседей | Перевод английской вики. Согласовано. | 12.05.2014 |
| Котляров | Nikmort | Коррекция на множественное тестирование | en:Multiple_comparisons_problem | ||
| Мансурходжаев, Васетенков | Tim | KEGG | Описание БД: история, что есть, как пользоваться. en:KEGG | Источники одобрены | 11.05.2014 |
| Абдуллаев, Абашкин | , Dmitro_Fbb | Pfam | Описание БД: история, что есть, как пользоваться. en:Pfam | Источники одобрены | |
| Сернова | wild_cat_NVS | UniProt | Описание БД: история, что есть, как пользоваться. en:UniProt | Источники одобрены | 08.05.2014 |
| Шарапова, Андреянова | Yana,ekaandreyanova | Формат файлов GFF | en:General_feature_format | Источники одобрены | 09.05.2014 |
| Иванова, Цепкова | Della FeniX, | Секвенирование_РНК | улучшение существующей статьи | 09.05.2014 | |
| методы изучения редактирования РНК | секция в Секвенирование_РНК | ||||
| Энциклопедия_элементов_ДНК | улучшение существующей статьи |
(2013 год) Статьи, над которым работали участники проекта[править код]
| Участник[и] | Статья | Комментарий | Статус |
|---|---|---|---|
| Александров, Аюпов | Methyl Array | www.illumina.com | Источники одобрены |
| Вербицкая | Бисульфитное секвенирование | Русская статья сильно меньше английской | Перевод с английского |
| Анисенко, Золотарев, Галиева | Открытый хроматин | необходимо активное взаимодействие с участниками, пишущими про DNase и FAIRE | Источники одобрены |
| Братцева, Ибрагимов | DNase-seq | DNase I hypersensitive sites sequencing | Источники одобрены |
| Изотова | FAIRE-Seq | ||
| Гуляева, Козлова | Иммунопреципитация | В списке изначально был RIP-[seq, chip, etc], однако это при отсутствии статьи по иммунопреципитации это как-то преждевременно | Источники одобрены |
| Ярахмедов, Иванов | Профилирование РНК | Статья должна описывать основные типы анализа клеточной РНК сгруппированные по ее (РНК) типу: по биологическому типу: polyA/not-polyA, short, microRNA, non-coding RNA, etc.; по локализации: цитоплазма, ядро, ядрышко и т.д. - см варианты в ENCODE. | |
| Джумашев, Коннова | Кэп-анализ экспрессии генов | Cap analysis gene expression | Источники одобрены |
| Калинина | ДНК-микрочип | Существующая статья совсем маленькая | Источники одобрены |
| Карпов, Евсютина | Секвенирование спаренных концов | Необоходимо написать общую статью про PET и добавить разделы или отдельные статьи про RNA-PET (Карпов) и про DNA-PET (Евсютина) | Источники одобрены |
| Карпова | Секвенирование РНК | RNA-seq | Источники одобрены |
| Дзама, Маллохассани | Альтернативный сплайсинг | Существующая статья совсем маленькая. | Источники одобрены |
| Кирюхина | ChIP-seq | необходимо взаимодействие с авторами статьи про иммунопреципитацию | |
| Лопатина | Определение конформации хромосом | en:Chromosome conformation capture | Источники одобрены |
| Максимычев | ChIA-PET | en:ChIA-PET | Источники одобрены |
| Журавлева, Нафеев | Позиционирование нуклеосом | Источники одобрены | |
| Золотарева, Рябичко | Протеомика | Должны быть описаны основные варианты масс-спек анализа протеомов. | Источники одобрены |
| Караваева, Тухбатова | Профилирование репликации | Repli-chip, Repli-seq | Источники одобрены |
| Кузнецов | Двугибридный анализ | Источники одобрены | |
| Маслова, Миссарова | Методы секвенирования нового поколения Высокоэффективное секвенирование | Небольшая статья про просто секвенирование уже есть. Следует либо дополнить ее, либо написать новую. В последнем случае надо не забыть добавить ссылку на статью про секвенирование. Необходимо взаимодействие с участниками, пишущими про отдельные методы | Источники одобрены |
| Медведева, (Ширшиков отказался) | Illumina/Solexa_method | Существует статья про компанию, нужна про принцип метода. | |
| Мигур, Пятницкий | SOLiD | Источники одобрены | |
| Мукосей, Лапшин | Helicos Biosciences | Источники одобрены | |
| Никулина | Polony sequencing | Источники одобрены | |
| Потанин | Ion semiconductor sequencing | Источники одобрены | |
| Нарайкина, Шелякин | Одномолекулярное секвенирование в реальном времени | Источники одобрены | |
| Борисевич | Нанопоровое секвенирование | Источники одобрены | |
| Попков, Сапунов | Картирование коротких ридов | надо подумать над названием | Источники одобрены |
| Свистунова, Солдатов | Инкубатор:Количественный анализ экспрессии генов | Источники одобрены | |
| Синицын, Ступников | Количественный анализ альтернативного сплайсинга | Источники одобрены | |
| Сливко-Кольчик, Танас | differential (two samples) analysis of gene expression and alternative splicing | надо написать разделы в Количественный анализ экспрессии генов и Количественный анализ альтернативного сплайсинга. Рекомендуется объединить усилия с участниками, пишущими про time series. | Источники одобрены |
| Червонцева, Тетерина | time series analysis of gene expression and alternative splicing | Дописать необходимые разделы в Количественный анализ экспрессии генов и Количественный анализ альтернативного сплайсинга. Необходимо обратить внимания на все сложные модели (кроме попарных сравнений) а не только на временные зависимости. Рекомендуется объединить усилия с участниками, пишущими про парные сравнения. | Источники одобрены |
| Чернецова, Труханов | Однонуклеотидный полиморфизм | дописать саму статью и добавить методы поиска | Источники одобрены |
| Шерстюк, Чуклина, Мухина | Полногеномный поиск ассоциаций | Так как на русском статьи про GWAS нет, то стоит начать с нее, а "SNP imputation" сделать разделом или отдельной страницей - в зависимости от объема. | Источники одобрены |
| Давтян | Предлагается примкнуть к группе пишущей про GWAS | ||
| Балычев | Выравнивание последовательностей | en:Sequence alignment | Перевод с английского |