МикроРНК: различия между версиями

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Интерактивная навигация по истории
[отпатрулированная версия][отпатрулированная версия]
← Предыдущая правкаСледующая правка →
Содержимое удалено Содержимое добавлено
ВизуальныйВики-текст
дополнение
дополнение
Строка 8: Строка 8:


Оценка общего числа уникальных мРНК, являющихся мишенями типичной микроРНК, варьирует в зависимости от метода, использованного для получения такой оценки<ref>{{cite journal |author=Thomson DW, Bracken CP, Goodall GJ |title=Experimental strategies for microRNA target identification |journal=Nucleic Acids Res. |volume=39 |issue=16 |pages=6845–53 |date=September 2011 |pmid=21652644 |pmc=3167600 |doi=10.1093/nar/gkr330 |url=}}</ref>. По оценкам 2004 года, мишенями типичной микроРНК могут быть лишь 7 мРНК, более поздние оценки были выше<ref>{{cite journal |author=John B, Enright AJ, Aravin A, Tuschl T, Sander C, Marks DS |title=Human MicroRNA targets |journal=PLoS Biol. |volume=2 |issue=11 |pages=e363 |date=November 2004 |pmid=15502875 |pmc=521178 |doi=10.1371/journal.pbio.0020363 |url=}}</ref>. Крэк ({{lang-en|Krek}}) и коллеги установили, что микроРНК позвоночных в общей сложности имеют приблизительно 200 транскриптов-мишеней<ref>{{cite journal |author=Krek A, Grün D, Poy MN, Wolf R, Rosenberg L, Epstein EJ, MacMenamin P, da Piedade I, Gunsalus KC, Stoffel M, Rajewsky N |title=Combinatorial microRNA target predictions |journal=Nat. Genet. |volume=37 |issue=5 |pages=495–500 |date=May 2005 |pmid=15806104 |doi=10.1038/ng1536 |url=}}</ref>. Selbach и коллеги, а также Baek и коллеги установили, что одна микроРНК может подавлять образование сотен белков<ref>{{cite journal |author=Selbach M, Schwanhäusser B, Thierfelder N, Fang Z, Khanin R, Rajewsky N |title=Widespread changes in protein synthesis induced by microRNAs |journal=Nature |volume=455 |issue=7209 |pages=58–63 |date=September 2008 |pmid=18668040 |doi=10.1038/nature07228 |url=}}</ref> and Baek et al.<ref>{{cite journal |author=Baek D, Villén J, Shin C, Camargo FD, Gygi SP, Bartel DP |title=The impact of microRNAs on protein output |journal=Nature |volume=455 |issue=7209 |pages=64–71 |date=September 2008 |pmid=18668037 |pmc=2745094 |doi=10.1038/nature07242 |url=}}</ref>, однако такая репрессия носит относительно умеренный характер (менее 2 фолдов).
Оценка общего числа уникальных мРНК, являющихся мишенями типичной микроРНК, варьирует в зависимости от метода, использованного для получения такой оценки<ref>{{cite journal |author=Thomson DW, Bracken CP, Goodall GJ |title=Experimental strategies for microRNA target identification |journal=Nucleic Acids Res. |volume=39 |issue=16 |pages=6845–53 |date=September 2011 |pmid=21652644 |pmc=3167600 |doi=10.1093/nar/gkr330 |url=}}</ref>. По оценкам 2004 года, мишенями типичной микроРНК могут быть лишь 7 мРНК, более поздние оценки были выше<ref>{{cite journal |author=John B, Enright AJ, Aravin A, Tuschl T, Sander C, Marks DS |title=Human MicroRNA targets |journal=PLoS Biol. |volume=2 |issue=11 |pages=e363 |date=November 2004 |pmid=15502875 |pmc=521178 |doi=10.1371/journal.pbio.0020363 |url=}}</ref>. Крэк ({{lang-en|Krek}}) и коллеги установили, что микроРНК позвоночных в общей сложности имеют приблизительно 200 транскриптов-мишеней<ref>{{cite journal |author=Krek A, Grün D, Poy MN, Wolf R, Rosenberg L, Epstein EJ, MacMenamin P, da Piedade I, Gunsalus KC, Stoffel M, Rajewsky N |title=Combinatorial microRNA target predictions |journal=Nat. Genet. |volume=37 |issue=5 |pages=495–500 |date=May 2005 |pmid=15806104 |doi=10.1038/ng1536 |url=}}</ref>. Selbach и коллеги, а также Baek и коллеги установили, что одна микроРНК может подавлять образование сотен белков<ref>{{cite journal |author=Selbach M, Schwanhäusser B, Thierfelder N, Fang Z, Khanin R, Rajewsky N |title=Widespread changes in protein synthesis induced by microRNAs |journal=Nature |volume=455 |issue=7209 |pages=58–63 |date=September 2008 |pmid=18668040 |doi=10.1038/nature07228 |url=}}</ref> and Baek et al.<ref>{{cite journal |author=Baek D, Villén J, Shin C, Camargo FD, Gygi SP, Bartel DP |title=The impact of microRNAs on protein output |journal=Nature |volume=455 |issue=7209 |pages=64–71 |date=September 2008 |pmid=18668037 |pmc=2745094 |doi=10.1038/nature07242 |url=}}</ref>, однако такая репрессия носит относительно умеренный характер (менее 2 фолдов).

⚫
Кроме многоклеточных растений и животных, микроРНК известны и у некоторых одноклеточных организмов, например, водоросли ''[[Chlamydomonas reinhardtii]]''<ref name="Chlamydomonas">{{статья |автор=Attila Molnar, Andrew Basset, Frank Schwach et al. |заглавие= Highly specific gene silencing by artificial microRNAs in the unicellular alga ''Chlamydomonas reinhardtii''|ссылка=http://www.weigelworld.org/research/publications/2009/pdfs/Molnar%20Plant%20J%202009.pdf |язык= |издание=The Plant Journal |тип= |год=2009 |том= |номер= |страницы= |doi=10.1111/j.1365-313X.2008.03767.x |issn=}}</ref>. У грибов микроРНК пока выделены не были, однако различные особенности их развития указывают на то, что микроРНК, возможно, также кодируются и их геномом<ref name="Fungi">{{статья |автор=Kanika Jain, B.B. Chattoo |заглавие=Comparative miRNA analysis in pathogenic fungi |ссылка=http://www.biotconf.org/PDFs/1664.pdf |язык= |издание= |тип= |год= |том= |номер= |страницы= |doi= |issn=}}</ref>.


== История ==
== История ==
Строка 84: Строка 82:
Взаимодействия между микроРНК и комплементарными последовательностями в генах и даже псевдогенах, имеющих гомологичные последовательности, считаются обратным каналом связи, регулирующими экспрессию генов, между генами-паралогами. Эти микроРНК, названные {{нп5|Конкурирующие эндогенные РНК|конкурирующими эндогенными РНК|en|ceRNA}}, связываются со специальными регуляторными элементами на генах и псевдогенах, что может служить ещё одним объяснением постоянного наличия в геноме некодирующих последовательностей<ref name="pmid21802130">{{cite journal | author = Salmena L, Poliseno L, Tay Y, Kats L, Pandolfi PP | title = A ceRNA hypothesis: the Rosetta Stone of a hidden RNA language? | journal = Cell | volume = 146 | issue = 3 | pages = 353–8 |date=August 2011 | pmid = 21802130 | pmc = 3235919 | doi = 10.1016/j.cell.2011.07.014 }}</ref>.
Взаимодействия между микроРНК и комплементарными последовательностями в генах и даже псевдогенах, имеющих гомологичные последовательности, считаются обратным каналом связи, регулирующими экспрессию генов, между генами-паралогами. Эти микроРНК, названные {{нп5|Конкурирующие эндогенные РНК|конкурирующими эндогенными РНК|en|ceRNA}}, связываются со специальными регуляторными элементами на генах и псевдогенах, что может служить ещё одним объяснением постоянного наличия в геноме некодирующих последовательностей<ref name="pmid21802130">{{cite journal | author = Salmena L, Poliseno L, Tay Y, Kats L, Pandolfi PP | title = A ceRNA hypothesis: the Rosetta Stone of a hidden RNA language? | journal = Cell | volume = 146 | issue = 3 | pages = 353–8 |date=August 2011 | pmid = 21802130 | pmc = 3235919 | doi = 10.1016/j.cell.2011.07.014 }}</ref>.


== Эволюция ==
МикроРНК являются важными филогенетическими маркерами из-за их поразительно низкой скорости эволюции<ref name=Wheeler2009/>. Считается, что микроРНК как регуляторные элементы развились из интерферирующих РНК, ранее использовавшихся для защиты от экзогенного генетического материала, например, вирусов<ref>{{cite journal|last=Pashkovskiy|first=P. P.|coauthors=Ryazansky, S. S.|title=Biogenesis, evolution, and functions of plant microRNAs.|journal=Biochemistry-Moscow|year=2013|volume=78|pages=627–637|doi=10.1134/S0006297913060084|pmid=23980889|url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23980889}}</ref>. Впрочем, некоторые микроРНК, например, человеческие микроРНК семейства hsa-mir-548, могли появиться из миниатюрных инвертированных транспозонов<ref>{{статья |автор=Piriyapongsa J, Jordan IK. |заглавие=A family of human microRNA genes from miniature inverted-repeat transposable elements. |ссылка= |язык= |издание=PLoS One |тип= |год=2007 |том=2 |номер=2 |страницы= |doi= |issn=}}</ref>. Их появление открыло возможности для развития морфологического разнообразия, поскольку регуляция экспрессии гена смогла стать более тонкой и направленной, что особенно важно в процессе индивидуального развития отдельных органов<ref name="Heimberg2008"/> и, возможно, вообще всего живого<ref name=Peterson2010>{{cite journal | author = Peterson KJ, Dietrich MR, McPeek MA | title = MicroRNAs and metazoan macroevolution: insights into canalization, complexity, and the Cambrian explosion | journal = BioEssays | volume = 31 | issue = 7 | pages = 736–47 |date=July 2009 | pmid = 19472371 | doi = 10.1002/bies.200900033 | url = }}</ref>. Действительно, быстрые темпы морфологических изменений, как правило, коррелируют с накоплением микроРНК<ref name=Wheeler2009>{{cite journal | author = Wheeler BM, Heimberg AM, Moy VN, Sperling EA, Holstein TW, Heber S, Peterson KJ | title = The deep evolution of metazoan microRNAs | journal = Evol. Dev. | volume = 11 | issue = 1 | pages = 50–68 | year = 2009 | pmid = 19196333 | doi = 10.1111/j.1525-142X.2008.00302.x | url = }}</ref><ref name=Heimberg2008>{{cite journal | author = Heimberg AM, Sempere LF, Moy VN, Donoghue PC, Peterson KJ | title = MicroRNAs and the advent of vertebrate morphological complexity | journal = Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. | volume = 105 | issue = 8 | pages = 2946–50 |date=February 2008 | pmid = 18287013 | pmc = 2268565 | doi = 10.1073/pnas.0712259105 |bibcode = 2008PNAS..105.2946H }}</ref>.

Новые виды микроРНК появляются многими способами. Они могут возникать из случайно возникающих шпилек в некодирующей области ДНК (то есть интронах или межгенных элементах), а также путём дупликации или модификации существующих микроРНК<ref name=Nozawa2010/>. Они также могут повляться из инвертированных дупликаций белоккодирующих последовательностей, так как из них могут образовываться шпильки<ref>{{cite journal|last=Allen|first=E.|coauthors=Z. X. Xie, A. M. Gustafson, G. H. Sung, J. W. Spatafora, and J. C. Carrington|title=Evolution of microRNA genes by inverted duplication of target gene sequences in Arabidopsis thaliana.|journal=Nature Genetics|year=2004|volume=36|pages=1282–1290|doi=10.1038/ng1478|url=http://www.nature.com/ng/journal/v36/n12/abs/ng1478.html|issue=12|pmid=15565108}}</ref>. Скорость эволюции (то есть замены нуклеотидов) в недавно появившихся микроРНК сопоставима с таковой в некодирующей ДНК, что подразумевает эволюцию посредством нейтрального дрейфа. Впрочем, в более древних микроРНК скорость эволюции значительно ниже и может составлять менее одной замены на сто миллионов лет<ref name=Peterson2010/>. Это подтверждает что, когда микроРНК приобретает определённую функцию, она подвергается чрезвычайно жёсткому отбору<ref name=Nozawa2010/> и в дальнейшем почти не меняется. Кроме того, различные регионы в пределах гена микроРНК находятся под влиянием различных эволюционных процессов, причём участки, необходимые для процессинга и функционирования, имеют значительно большую сохранность<ref>{{cite journal|last=Warthmann|first=N.|coauthors=S. Das, C. Lanz, and D. Weigel|title=Comparative analysis of the MIR319a MicroRNA locus in Arabidopsis and related Brassicaceae.|journal=Molecular Biology and Evolution|year=2008|volume=25|issue=5|pages=892–902|doi=10.1093/molbev/msn029|pmid=18296705|url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18296705}}</ref>. Изредка микроРНК исчезают из генома животного<ref name=Peterson2010/>, хотя недавно появившиеся микроРНК (и, следовательно, нефункциональные) теряются часто<ref name=Nozawa2010>{{cite journal | author = Nozawa M, Miura S, Nei M | title = Origins and evolution of microRNA genes in Drosophila species | journal = Genome Biol Evol | volume = 2 | issue = | pages = 180–9 | year = 2010 | pmid = 20624724 | pmc = 2942034 | doi = 10.1093/gbe/evq009 | url = }}</ref>. У Arabidopsis thaliana рассчитанная скорость утраты генов микроРНК составляет 1,2 – 3,3 гена на миллион лет<ref>{{cite journal|last=Fahlgren|first=N.|coauthors=S. Jogdeo, K. D. Kasschau, C. M. Sullivan, E. J. Chapman, S. Laubinger, L. M. Smith, M. Dasenko, S. A. Givan, D. Weigel, and J. C. Carrington|title=MicroRNA gene evolution in Arabidopsis lyrata and Arabidopsis thaliana.|journal=Plant Cell|year=2010|volume=22|issue=4|pages=1074–1089|doi=10.1105/tpc.110.073999|url=http://www.plantcell.org/content/22/4/1074.abstract}}</ref>. Это делает гены микроРНК удобными филогенетическими маркерами, и, возможно, в них кроется объяснение такая сложность филогенетических взаимоотношений членистоногих<ref name="pmid20486135">{{cite journal | author = Caravas J, Friedrich M | title = Of mites and millipedes: recent progress in resolving the base of the arthropod tree | journal = BioEssays | volume = 32 | issue = 6 | pages = 488–95 |date=June 2010 | pmid = 20486135 | doi = 10.1002/bies.201000005 }}</ref>.

⚫
МикроРНК присутствуют в геномах большинства эукариот, от бурых водорослей<ref name="pmid20520714">{{cite journal | author = Cock JM, Sterck L, Rouzé P, Scornet D, Allen AE, Amoutzias G, Anthouard V, Artiguenave F, Aury JM, Badger JH, ''et al''. | title = The Ectocarpus genome and the independent evolution of multicellularity in brown algae | journal = Nature | volume = 465 | issue = 7298 | pages = 617–21 |date=June 2010 | pmid = 20520714 | doi = 10.1038/nature09016 |bibcode = 2010Natur.465..617C }}</ref> до животных. Впрочем, различия в функциях микроРНК и их процессинге указывают на то, что они появились независимо у животных и растений<ref>{{cite journal|last=Cuperus|first=J. T.|coauthors=N. Fahlgren, and J. C. Carrington|title=Evolution and functional diversification of MIRNA genes.|journal=Plant Cell|year=2011|volume=23|issue=2|pages=431–442|doi=10.1105/tpc.110.082784|pmid=21317375|url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21317375}}</ref>. Кроме многоклеточных растений и животных, микроРНК известны и у некоторых одноклеточных организмов, например, водоросли ''[[Chlamydomonas reinhardtii]]''<ref name="Chlamydomonas">{{статья |автор=Attila Molnar, Andrew Basset, Frank Schwach et al. |заглавие= Highly specific gene silencing by artificial microRNAs in the unicellular alga ''Chlamydomonas reinhardtii''|ссылка=http://www.weigelworld.org/research/publications/2009/pdfs/Molnar%20Plant%20J%202009.pdf |язык= |издание=The Plant Journal |тип= |год=2009 |том= |номер= |страницы= |doi=10.1111/j.1365-313X.2008.03767.x |issn=}}</ref>. У грибов микроРНК пока выделены не были, однако различные особенности их развития указывают на то, что микроРНК, возможно, также кодируются и их геномом<ref name="Fungi">{{статья |автор=Kanika Jain, B.B. Chattoo |заглавие=Comparative miRNA analysis in pathogenic fungi |ссылка=http://www.biotconf.org/PDFs/1664.pdf |язык= |издание= |тип= |год= |том= |номер= |страницы= |doi= |issn=}}</ref>. Среди всех видов по состоянию на март 2010 микроРНК были описаны у 5000 видов<ref name=Dimond2010>{{Cite news
| author = Dimond PF
| date = 15 March 2010 | accessdate = 10 July 2010
| title = miRNAs' Therapeutic Potential | periodical = Genetic Engineering & Biotechnology News
| volume = 30 | issue = 6 | page = 1
| url = http://www.genengnews.com/gen-articles/mirnas-therapeutic-potential/3216/
| archiveurl = http://www.webcitation.org/5r7L7BfnG | archivedate = 10 July 2010
| postscript = <!-- Bot inserted parameter. Either remove it; or change its value to "." for the cite to end in a ".", as necessary. -->}}</ref>. Хотя у бактерий широко распространены короткие фрагменты РНК длиной от 50 до нескольких сотен нуклеотидов, настоящие микроРНК у бактерий отсутствуют<ref name="pmid16717284">{{cite journal | author = Tjaden B, Goodwin SS, Opdyke JA, Guillier M, Fu DX, Gottesman S, Storz G | title = Target prediction for small, noncoding RNAs in bacteria | journal = Nucleic Acids Res. | volume = 34 | issue = 9 | pages = 2791–802 | year = 2006 | pmid = 16717284 | pmc = 1464411 | doi = 10.1093/nar/gkl356 }}</ref>.


== Механизм действия микроРНК ==
== Механизм действия микроРНК ==

Версия от 11:15, 27 апреля 2014

Ми́кроРНК (англ. microRNA, miRNA) — малые некодирующие молекулы РНК длиной около 22 нуклеотидов, обнаруженные у растений, животных и некоторых вирусов, принимающие участие в трансляционной и посттрансляционной регуляции экспрессии генов[1]. микроРНК кодируются ядерной ДНК в случае растений и животных и вирусной ДНК в случае вирусов (то есть геном вирусов, имеющих микроРНК, должен быть представлен ДНК). Взаимодействие микроРНК с мРНК осуществляется за счёт комплементарного спаривания оснований. В результате такого взаимодействия мРНК оказывается инактивированной, поскольку рибосома не может синтезировать белок на её матрице. Такие комплексы часто быстро деградируются клеткой («направленная деградация»)[2][3]. Также имеются указания на возможность взаимодействия микроРНК непосредственно с ДНК генов в процессе РНК-зависимого метилирования ДНК, которое является одним из ключевых механизмов репрессии генов, аллельного исключения и предотвращения активности транспозонов[4]. Человеческий геном может содержать информацию о более чем 1000 микроРНК[5][6], многочисленных в клетках разных типов[7], и мишенями микроРНК являются мРНК около 60% генов[8][9].

микроРНК высококонсервативны среди эукариот, и считается, что микроРНК представляют собой жизненно необходимый и эволюционно древний компонент регуляции экспрессии генов[10][11][12][13]. Хотя основные компоненты жизненного цикла микроРНК одинаковы у растений и животных, набор микроРНК у представителей этих двух царств развился независимо с различными моделями функционирования[14]. Для растительных микроРНК характерно полное или почти полное комплементарное соответствие своим мРНК-мишеням, и они индуцируют репрессию генов, запуская деградацию транскриптов-мишеней[15][16]. Связывание микроРНК с транскриптами может осуществляться как в кодирующей, так и некодирующей области[16]. микроРНК животных, напротив, способны распознавать нужную мРНК по как минимум 6—8 нуклеотидам на её 5’-конце[8][17]. Свойством регуляции, осуществляемой микроРНК, является комбинаторная регуляция. Иными словами, данная микроРНК может иметь несколько мРНК-мишеней, и данная мРНК может иметь несколько соответствующих ей микроРНК[18][19].

Первые микроРНК были описаны в начале 1990-х годов[20], однако как отдельный класс биологических регуляторных молекул с определёнными функциями их стали рассматривать только в начале 2000-х. С этого момента были установлены многочисленные роли микроРНК в негативной регуляции (транскрипционная деградация или изоляция, подавление трансляции) и возможная вовлечённость в механизмы позитивной регуляции (активация транскрипции и трансляции). Будучи задействованными в регуляции экспрессии генов, микроРНК оказываются вовлечёнными в большую часть биологических процессов[21][22][23][24][25][26][27]. В различных клетках и тканях имеются различные наборы микроРНК[28].

Отклонения в экспрессии микроРНК были показаны при многих болезненных состояниях. Исследуются также возможности микроРНК-терапии[29][30][31][32].

Оценка общего числа уникальных мРНК, являющихся мишенями типичной микроРНК, варьирует в зависимости от метода, использованного для получения такой оценки[33]. По оценкам 2004 года, мишенями типичной микроРНК могут быть лишь 7 мРНК, более поздние оценки были выше[34]. Крэк (англ. Krek) и коллеги установили, что микроРНК позвоночных в общей сложности имеют приблизительно 200 транскриптов-мишеней[35]. Selbach и коллеги, а также Baek и коллеги установили, что одна микроРНК может подавлять образование сотен белков[36] and Baek et al.[37], однако такая репрессия носит относительно умеренный характер (менее 2 фолдов).

История

МикроРНК были открыты в 1993 году Виктором Амбросом, Розалинд Ли и Родой Фейнбраум при изучении гена lin-14, задействованного в развитии у нематоды Caenorhabditis elegans[20]. Они обнаружили, что количество белка LIN-14 регулировался коротким РНК-продуктом гена lin-14. Предшественник из 61 нуклеотида, транскрибированный с гена lin-14, созревал в 22-нуклеотидную молекулу РНК, содержащую последовательности, частично комплементарные к некоторым последовательностям из 3’-нетранслируемой области (3’-UTR) в мРНК, транскрибированной с lin-14. Комплементарность оказалась неободимым и достаточным условиям для подавления трансляции мРНК lin-14 в белок LIN-14. Таким образом, малая РНК lin-14 была первой обнаруженной микроРНК, хотя в то время считали, что наличие таких РНК является особенностью нематоды. Только в 2000 году была описана вторая микроРНК – let-7, подавлявшая экспрессию lin-41, lin-14, lin-28, lin-42 и daf-12 во время переходных этапов в развитии C. elegans. Впоследствии была показана консервативность let-7 у многих видов[38][39], что свидетельствовало о более широком распространении этого феномена.

Номенклатура

Согласно стандартным правилам номенклатуры, названия присваиваются экспериментально выявленным и подтверждённым микроРНК до публикации сообщения об их открытии[40][41]. Приствка “mir” отделяется дефисом, вслед за ней следует номер, говорящий о порядке именования. Например, mir-123 была открыта и названа раньше, чем mir-456. Приставка “mir-” используется для обозначения пре-микроРНК, а “miR-“ – для обозначения зрелой формы. К названию микроРНК с последовательностями, отличающимися на один или два нуклеотида, приписывается дополнительная строчная буква. Так, miR-123a находится в близком родстве с miR-123b. Пре-микроРНК, дающие начало на 100% идентичным микроРНК, но локализованные в разных местах генома, имеют в названии дополнительную цифру, отделенную дефисом. Например, пре-микроРНК hsa-mir-194-1 и hsa-mir-194-2 дают начало идентичным микроРНК (hsa-miR-194), однако они располагаются в разных участках генома. Вид, из которого была выделена микроРНК, обозначается в названии трёхбуквенной приставкой, например, hsa-miR-123 человека (Homo sapiens) и oar-miR-123 овцы (Ovis aries). Для вирусных микроРНК часто используют приставку “v-“, а для микроРНК дрозофилы – “d”. Когда две зрелые микроРНК образуются из двух различных концов исходной пре-микроРНК, к ним добавляется суффикс -3p или -5p. В прошлом также использовали обозначения “s” (смысловая) и “as” (антисмысловая). Когда известен относительный уровень экспрессии для двух микроРНК, имеющих общего предшественника, ту микроРНК, которая экспрессируется на более низком уровне, чем микроРНК с противоположного конца шпильки, помечают звёздочкой. Так, miR-123 и miR-123* имеют общую исходную шпилечную пре-микроРНК, но в клетке обнаруживается больше miR-123, то есть её уровень экспрессии выше.

Биогенез

Большинство описанных генов микроРНК являются межгенными или ориентированными в антисмысловом направлении по отношению к соседним генам, в связи с чем предполагается, что они транскрибируются как независимые единицы[42][42][43][44][45]. Однако в некоторых случаях микроРНК транскрибируется вместе с её хозяйским геном. Это даёт возможность для совместной регуляции микроРНК и белоккодирующего гена[46]. Около 40% микроРНК кодируются генами, лежащими в интронах и небелоккодирующих генах, а в некоторых случаях даже в экзонах длинных небелоккодирующих генов[47]. В этом случае как правило, но не всегда гены микроРНК располагаются в смысловой ориентации[48][49] и потому регулируются вместе с хозяйскими генами[47][50][51]. Другие гены микроРНК имеют общий промотор, причём 42–48% всех микроРНК образуются из полицистронных единиц, содержащих множество отдельных петель, из которых в дальнейшем процессируется зрелая микроРНК[43][52]. Впрочем, получившиеся микроРНК необязательно будут гомологичны по структуре и функциям.

У указанных выше промоторов генов микроРНК было показано наличие мотивов, схожих с мотивами в промоторах других генов, считываемых РНК-полимеразой II, а именно белоккодирующих генов[43][53]. ДНК-шаблон не является единственным фактором, определяющим первичную структуру получившейся микроРНК: для 6% микроРНК показано редактирование РНК (IsomiR[англ.]), то есть сайт-специфическая модификация РНК, позволяющая получать различные РНК-продукты с одной и той же матрицы ДНК. Это позволяет увеличить разнообразие и возможности микроРНК, получаемых с одного гена.

Транскрипция

Гены микроРНК, как правило, транскрибируются РНК-полимеразой II[43][53]. Полимераза часто связывается с промотором, располагающимся рядом с кодирующей последовательностью ДНК, которая станет шпилькой в пре-микроРНК. Получающийся транскрипт кэпируется, полиаденилируется[43][48] и сплайсируется. Транскрипция микроРНК животных начинается с образования фрагмента ~80 нуклеотидов длиной, входящего в одну из ветвей шпильки, которая, в свою очередь, входит в состав предшественника микроРНК длиной в несколько сотен нуклеотидов, называемого первичной микроРНК (pri-микроРНК)[43][48]. Если первоначально образовавшаяся шпилька находится в 3’-UTR, то получающийся транскрипт может выступать и как пре-микроРНК, и как мРНК[48]. Некоторые микроРНК транскрибируются РНК-полимеразой III. Особенно это касается тех микроРНК, гены которых находятся под Alu-повторами, генами тРНК и диспергированными повторами у мдекопитающих (mammalian wide interspersed repeat (MWIR))[54].

Ядерный процессинг

Одна pri-микроРНК может содержать от одного до шести предшественников микроРНК (пре-микроРНК). Эти шпилечные структуры состоят из 70 нуклеотидов каждая. Двуцепочечная РНК в шпильках распознаётся ядерными белками: DiGeorge Syndrome Critical Region 8 (DGCR8, назван в связи с синдромом Ди Джорджи) или Pasha у беспозвоночных. DGCR8 функционирует в комплексе с Drosha – белком, разрезающим РНК, образуя так называемый «микропроцессор»[55]. В этом комплексе DGCR8 таким образом ориентирует каталитический домен РНКазы III, входящий в состав Drosha, что он «вырезает» шпильки из pri-микроРНК, разрезая РНК на расстоянии 11 нуклеотидов от основания шпильки. Получающийся продукт имеет 2 выступающих нуклеотида на 3’-конце, он имеет 3’-гидроксильную и 5’-фосфатную группы. Этот продукт часто называют пре-микроРНК (предшественник микроРНК).

Пре-микроРНК, сплайсирующиеся из интронов и не проходящие через «микропроцессор», называются миртронами[англ.]. Раньше считалось, что миртроны имеются только у дрозофилы и С. elegans, однако в настоящее время они обнаружены и у млекопитающих[56].

Предположительно 16% пре-микроРНК подвергаются ядерному редактированию РНК[57][58][59]. В наиболее распространённом случае ферменты, известные как аденозин-дезаминазы, действующие на РНК (ADARs) катализируют переход аденина (А) в инозин (I). Редактирование РНК может останавливать ядерный процессинг (так, например, происходит в случае pri-miR-142, которая после редактирования разрушается РНКазой Tudor-SN) и повлиять на последующие события, в том числе цитоплазматический процессинг микроРНК, а также изменить мРНК-мишень процессируемой микроРНК (например, в случае miR-376, функционирующей в центральной нервной системе)[57].

Ядерный экспорт

Пре-микроРНК экспортируются из ядра при помощи нуклеоцитоплазматического переносчика – белка не указано название статьи. Этот белок, входящий в семейство кариоферинов[англ.], распознаёт два «свешивающихся» нуклеотида на 3’-конце пре-микроРНК, которые появились, как писалось ранее, при разрезании pri-микроРНК. Транспорт в цитоплазму, опосредованный Exportin-5, происходит с затратой энергии в виде ГТФ, которую несёт белок Ran[англ.][60].

Цитоплазматический процессинг

В цитоплазме пре-микроРНК разрезается ферментом Dicer, содержащим каталитический центр РНКазы III[61]. Эта эндорибонуклеаза взаимодействует с 3’-концом шпильки и вырезает петлю, соединяющую 3’- и 5’-концы шпильки. В результате образуется дуплекс (микроРНК:микроРНК*), состоящий из двух цепей микроРНК по 22 нуклеотида длиной каждая[61]. На процессивность Dicer влияет длина шпильки и петли, и несовершенность связывания цепей в дуплексе микроРНК:микроРНК* способствует их разъединению[61][62]. Хотя каждая из цепей дуплекса потенциально может выступать как функциональная микроРНК, лишь одна из них впоследствии входит в РНК-индуцируемый комплекс выключения гена (RNA-induced silencing complex (RISC)), в котором осуществляется взаимодействие микроРНК и её мРНК-мишени.

Биогенез у растений

Биогенез микроРНК у растений отличается от такового у животных в основном в этапах ядерного процессинга и экспорта. Если у животных разрезание осуществляется двумя различными ферментами и дважды – внутри ядра и вне его, то у растений оба разрезания осуществляет один и тот же фермент, гомологичный Dicer животных – Dicer-like1 (DL1). DL1 функционирует лишь внутри ядра растительной клетки, что говорит о том, что обе реакции происходят в ядре. У растений до того как дуплексы микроРНК:микроРНК* транспортируются из ядра, их «свешивающиеся» нуклеотиды на 3’-конце метилируются при помощи РНК-метилтрансферазы[англ.], называемой Hua-Enhancer1[англ.] (HEN1). Дуплекс далее транспортируется из ядра в цитоплазму при помощи белка Hasty (HST), гомолога Exportin-5, где дуплекс распадается и зрелая микроРНК включается в состав RISC[63].

РНК-индуцируемый комплекс выключения гена

Основная статья: РНК-индуцируемый комплекс выключения гена

Зрелая микроРНК является частью активного РНК-индуцируемого комплекса выключения гена (RISC), куда также входят Dicer и многие другие белки[64]. RISC также известен как микроРНК-рибонуклеопротеиновый комплекс (микроРНП, microRNP)[65], а RISC, содержащий микроРНК, иногда обозначают как miRISC.

Процессинг пре-микроРНК, осуществляемый Dicer, вероятно, связан с распадом дуплекса. В miRISC включается только одна цепь дуплекса, выбранная на основании её термодинамической нестабильности и более слабому, по сравнению с другой цепью, спариванию оснований[66][67][68]. На выбор цепи также может повлиять наличие шпильки[69]. Вошедшая в miRISC цепь назвается «направляющей». Другая цепь, названная «пассажирской», так как она обладает меньшей энергией в стабильном состоянии (её обозначают *), в норме деградирует. В некоторых случаях обе цепи дуплекса становятся функциональными микроРНК и действуют на различные виды мРНК[70].

Центральную роль в функционировании RISC играют белки семейства Argonaute (Ago). Эти белки необходимы для микроРНК-индуцированного выключения мРНК и имеют для консервативных центра, связывающих микроРНК: домен PAZ, взаимодействующий с участком на 3’-конце микроРНК, и домен PIWI, структурно напоминающий рибонуклеазу Н и связывающий 5’-конец микроРНК. Вместе они связывают зрелую микроРНК и ориентируют её подходящим образом для взаимодействия с мРНК-мишенью. Некоторые Argonaute, например, человеческий Ago2, непосредственно разрезают транскрипт-мишень. Белки этого семейства также могут привлекать дополнитальные белки для осуществляется репрессии трансляции[71]. Человеческий геном кодирует 8 белков семейства Argonaute, разделяемые по последовательностям аминокислот на 2 группы: AGO (4 белка, находящиеся во всех клетках мелкопитающих, у человека они называются E1F2C/hAgo) и PIWI (найдены в клетках зародышевых путей и кроветворных клетках)[65][71].

Дополнительными компонентами RISC являются следующие белки: TRBP (белок, связывающий трансактивирующую РНК, образуемую в ответ на ВИЧ)[72], PACT (белковый активатор интерферона, индуцируемый протеинкиназой), комплекс SMN, FMRP, Tudor-SN, предполагаемая ДНК-хеликаза MOV10, TNRC6B[60][73][74].

Выключение гена может осуществляться путём деградации мРНК или предотвращения её трансляции. Так, miR16 содержит последовательность, комплементарную AU-богатому элементу, имеющемуся в 3’-UTR многих нестабильных мРНК, например, TNF альфа или GM-CSF. Установлено, что, если между микроРНК и мРНК-мишенью существует полное соответствие, то Ago2 может разрезать мРНК и приводить к её непосредственной деградации. Если же полного соответствия нет, то выключение достигается предотвращением трансляции[21].

Обращение микроРНК

Обращение микроРНК необходим для быстрых изменений в экспрессии генов, кодирующих микроРНК. В ходе созревания микроРНК в цитоплазме белки Argonaute стабилизируют направляющую цепь, а «пассажирская» цепь в большинстве случаев разрушается. При этом Argonaute дольше стабилизируют микроРНК, имеющие большее число мишеней, способствуя таким образом деградации микроРНК, не имеющих мишеней[75].

Разрушение микроРНК у C. elegans опосредовано 5’–3’-экзорибонуклеазой XRN2, также известной как Rat1p[76]. У растений белки SDN (small RNA degrading nuclease – малые РНК-деградирующие нуклеазы) разрушают микроРНК в противоположном (3’–5’) направлении. Похожие белки кодируются и в геномах животных, но их роли ещё пока не были описаны[75].

Некоторые модификации микроРНК оказывают влияние на их стабильность. Как было показано у растения Arabidopsis thaliana, у растений зрелые микроРНК стабилизируются добавлением метильных групп к 3’-концу. Метильные группы, присоединённые к микроРНК 2’-O-связью, препятствуют присоединению урацила (U) уридилтрансферазой, а эта модификация связана с деградацией микроРНК. Однако уридинилирование может, напротив, защищать некоторые микроРНК; последствия таких модификаций к настоящему моменту не вполне ясны. Известно также уридинилирование микроРНК у животных. И растительные, и животные микроРНК могут быть изменены добавлением аденина (А) к 3’-концу микроРНК. Дополнительный аденин, присоединяемый к концу miR-122?! млекопитающих (микроРНК, многочисленная в печени, играет важную роль при развитии гепатита С), стабилизирует молекулу, и растительные микроРНК с дополнительным аденином на конце меньше разрушаются[75].

Функции в клетке

Как говорилось выше, микроРНК играют важную роль в регуляции экспрессии генов. МикроРНК комплементарны определённому фрагменту на одной или нескольких мРНК. МикроРНК животных обычно комплементарны 3’-UTR, в то время как микроРНК растений, как правило, комплементарны кодирующей части мРНК[77]. Полное или почти полное спаривание оснований микроРНК и мРНК-мишенью запускает разрушение мишени[78]. Так происходит у растений[79]; у животных микроРНК комплементарно взаимодействует не со всей мРНК, как у растений, а лишь с её частью. Точное соответствие необходимо лишь на небольшом участке длиной 2–7 нуклеотида (так называемый “seed region” микроРНК[8][17])[80]. микроРНК животных, помимо активации разрезания транскрипта-мишени, во многих случаях блокируют трансляцию[81] (такое явление известно и у растений, но оно значительно меньше распространено[79]). МикроРНК, частично комплементарные своим мишеням, могут также активизировать деаденилирование?! мРНК, что сокращает её срок жизни[82]. В настоящее время то, что микроРНК вызывает деградацию мРНК-мишени, хорошо изучено и известно, но механизм трансляционной репрессии (осущесвляется ли она только через разрушение мРНК, только через подавление трансляции специальными факторами или в комбинации обоих механизмов) является предметом горячих споров. Недавние исследования miR-430 у данио-рерио, а также bantam-miRNA и miR-9 у культуры клеток дрозофилы показали, что трансляционная репрессия обусловлена разрушением комплекса инициации трансляции и не связана с деаденилированием[83][84].

Иногда микроРНК вызывают также модификацию гистонов и метилирование ДНК в области промоторов, что влияет на экспрессию генов-мишеней[85][86].

9 механизмов действия микроРНК описано и охарактеризовано с помощью обобщённой математической модели[87]:

  1. ингибирование инициации Cap-40S;
  2. подавление присоединения рибосомной субъединицы 60S;
  3. подавление элонгации;
  4. диссоциации рибосомного комплекса (преждевременная терминация);
  5. деградация котрансляционных вспомогательных белков;
  6. отделение Р-телец;
  7. распад мРНК (дестабилизация);
  8. разрезание мРНК;
  9. подавление транскрипции через микроРНК-опосредованную реорганизацию

Эти механизмы зачастую бывает невозможно разделить, используя экспериментальные данные о постоянных скоростях реакций. Тем не менее, они различаются в термодинамическом отношении и имеют различные кинетические профили[87].

В отличие микроРНК растений, микроРНК животных действуют на различные наборы генов[17]. Однако гены, вовлечённые в процессы, общие для всех клеток, относительно редко бывают мишенями микроРНК и, судя по всему, находятся под влиянием отбора, препятствующего их взаимодействию с микроРНК[88].

Двуцепочечные молекулы РНК (дцРНК) могут активировать гены по механизму, называемому активацией РНК. Мишенями дцРНК являются промоторы генов, которые потенциально могут увеличить транскрипцию связанных генов. Это явление было продемонстрировано на клетках человека с использованием искусственных дцРНК, называемых малыми активирующими РНК[англ.] (small activating RNA, saRNA)[89], а также для эндогенных микроРНК[90].

Взаимодействия между микроРНК и комплементарными последовательностями в генах и даже псевдогенах, имеющих гомологичные последовательности, считаются обратным каналом связи, регулирующими экспрессию генов, между генами-паралогами. Эти микроРНК, названные конкурирующими эндогенными РНК[англ.], связываются со специальными регуляторными элементами на генах и псевдогенах, что может служить ещё одним объяснением постоянного наличия в геноме некодирующих последовательностей[91].

Эволюция

МикроРНК являются важными филогенетическими маркерами из-за их поразительно низкой скорости эволюции[92]. Считается, что микроРНК как регуляторные элементы развились из интерферирующих РНК, ранее использовавшихся для защиты от экзогенного генетического материала, например, вирусов[93]. Впрочем, некоторые микроРНК, например, человеческие микроРНК семейства hsa-mir-548, могли появиться из миниатюрных инвертированных транспозонов[94]. Их появление открыло возможности для развития морфологического разнообразия, поскольку регуляция экспрессии гена смогла стать более тонкой и направленной, что особенно важно в процессе индивидуального развития отдельных органов[95] и, возможно, вообще всего живого[96]. Действительно, быстрые темпы морфологических изменений, как правило, коррелируют с накоплением микроРНК[92][95].

Новые виды микроРНК появляются многими способами. Они могут возникать из случайно возникающих шпилек в некодирующей области ДНК (то есть интронах или межгенных элементах), а также путём дупликации или модификации существующих микроРНК[97]. Они также могут повляться из инвертированных дупликаций белоккодирующих последовательностей, так как из них могут образовываться шпильки[98]. Скорость эволюции (то есть замены нуклеотидов) в недавно появившихся микроРНК сопоставима с таковой в некодирующей ДНК, что подразумевает эволюцию посредством нейтрального дрейфа. Впрочем, в более древних микроРНК скорость эволюции значительно ниже и может составлять менее одной замены на сто миллионов лет[96]. Это подтверждает что, когда микроРНК приобретает определённую функцию, она подвергается чрезвычайно жёсткому отбору[97] и в дальнейшем почти не меняется. Кроме того, различные регионы в пределах гена микроРНК находятся под влиянием различных эволюционных процессов, причём участки, необходимые для процессинга и функционирования, имеют значительно большую сохранность[99]. Изредка микроРНК исчезают из генома животного[96], хотя недавно появившиеся микроРНК (и, следовательно, нефункциональные) теряются часто[97]. У Arabidopsis thaliana рассчитанная скорость утраты генов микроРНК составляет 1,2 – 3,3 гена на миллион лет[100]. Это делает гены микроРНК удобными филогенетическими маркерами, и, возможно, в них кроется объяснение такая сложность филогенетических взаимоотношений членистоногих[101].

МикроРНК присутствуют в геномах большинства эукариот, от бурых водорослей[102] до животных. Впрочем, различия в функциях микроРНК и их процессинге указывают на то, что они появились независимо у животных и растений[103]. Кроме многоклеточных растений и животных, микроРНК известны и у некоторых одноклеточных организмов, например, водоросли Chlamydomonas reinhardtii[104]. У грибов микроРНК пока выделены не были, однако различные особенности их развития указывают на то, что микроРНК, возможно, также кодируются и их геномом[105]. Среди всех видов по состоянию на март 2010 микроРНК были описаны у 5000 видов[106]. Хотя у бактерий широко распространены короткие фрагменты РНК длиной от 50 до нескольких сотен нуклеотидов, настоящие микроРНК у бактерий отсутствуют[107].

Механизм действия микроРНК

Файл:MiRNA.jpg

Клиническое значение

Изменения в генах микроРНК могут играть роль в развитии ряда заболеваний. В некоторых исследованиях отмечается возможная роль микроРНК при шизофрении.[108]

МикроРНК miR-140 участвует в патогенезе остеоартрита, регулируя, экспрессию гена ADAMTS5. У мышей, не экспрессирующих miR-140, нарушена пролиферация хондроцитов, мыши имеют карликовый фенотип.

Примечания

  1. ↑ Chen, Kevin; Rajewsky, Nikolaus (2007). "The evolution of gene regulation by transcription factors and microRNAs". Nature Reviews Genetics. 8 (2): 93—103. doi:10.1038/nrg1990. PMID 17230196.
  2. ↑ Bartel DP (January 2009). "MicroRNAs: target recognition and regulatory functions". Cell. 136 (2): 215—33. doi:10.1016/j.cell.2009.01.002. PMC 3794896. PMID 19167326.
  3. ↑ Kusenda B, Mraz M, Mayer J, Pospisilova S (November 2006). "MicroRNA biogenesis, functionality and cancer relevance". Biomed Pap Med Fac Univ Palacky Olomouc Czech Repub. 150 (2): 205—15. doi:10.5507/bp.2006.029. PMID 17426780.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  4. ↑ Галицкий В.А. (2008). "Гипотеза о механизме инициации малыми РНК метилирования ДНК de novo и аллельного исключения" (PDF). Цитология. 50(4): 277—286.
  5. ↑ Homo sapiens miRNAs in the miRBase at Manchester University
  6. ↑ Bentwich I, Avniel A, Karov Y, Aharonov R, Gilad S, Barad O, Barzilai A, Einat P, Einav U, Meiri E, Sharon E, Spector Y, Bentwich Z (July 2005). "Identification of hundreds of conserved and nonconserved human microRNAs". Nat. Genet. 37 (7): 766—70. doi:10.1038/ng1590. PMID 15965474.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  7. ↑ Lim LP, Lau NC, Weinstein EG, Abdelhakim A, Yekta S, Rhoades MW, Burge CB, Bartel DP (April 2003). "The microRNAs of Caenorhabditis elegans". Genes Dev. 17 (8): 991—1008. doi:10.1101/gad.1074403. PMC 196042. PMID 12672692.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  8. ↑ 1 2 3 Lewis BP, Burge CB, Bartel DP (2005). "Conserved seed pairing, often flanked by adenosines, indicates that thousands of human genes are microRNA targets". Cell. 120 (1): 15—20. doi:10.1016/j.cell.2004.12.035. PMID 15652477.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  9. ↑ Friedman RC, Farh KK, Burge CB, Bartel DP (January 2009). "Most mammalian mRNAs are conserved targets of microRNAs". Genome Res. 19 (1): 92—105. doi:10.1101/gr.082701.108. PMC 2612969. PMID 18955434.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  10. ↑ Tanzer A, Stadler PF (May 2004). "Molecular evolution of a microRNA cluster". J. Mol. Biol. 339 (2): 327—35. doi:10.1016/j.jmb.2004.03.065. PMID 15136036.
  11. ↑ Molnár A, Schwach F, Studholme DJ, Thuenemann EC, Baulcombe DC (June 2007). "miRNAs control gene expression in the single-cell alga Chlamydomonas reinhardtii". Nature. 447 (7148): 1126—9. Bibcode:2007Natur.447.1126M. doi:10.1038/nature05903. PMID 17538623.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  12. ↑ Kren BT, Wong PY, Sarver A, Zhang X, Zeng Y, Steer CJ (2009). "MicroRNAs identified in highly purified liver-derived mitochondria may play a role in apoptosis". RNA Biol. 6 (1): 65—72. doi:10.4161/rna.6.1.7534. PMID 19106625.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  13. ↑ Lee CT, Risom T, Strauss WM (April 2007). "Evolutionary conservation of microRNA regulatory circuits: an examination of microRNA gene complexity and conserved microRNA-target interactions through metazoan phylogeny". DNA Cell Biol. 26 (4): 209—18. doi:10.1089/dna.2006.0545. PMID 17465887.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  14. ↑ Shabalina SA, Koonin EV (October 2008). "Origins and evolution of eukaryotic RNA interference". Trends in Ecology and Evolution. 10 (10): 578—587. doi:10.1016/j.tree.2008.06.005. PMC 2695246. PMID 18715673.
  15. ↑ Brodersen P, Sakvarelidze-Achard L, Bruun-Rasmussen M, Dunoyer P, Yamamoto YY, Sieburth L, Voinnet O (May 2008). "Widespread translational inhibition by plant miRNAs and siRNAs". Science. 320 (5880): 1185—90. Bibcode:2008Sci...320.1185B. doi:10.1126/science.1159151. PMID 18483398.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  16. ↑ 1 2 He L, Hannon GJ (July 2004). "MicroRNAs: small RNAs with a big role in gene regulation". Nature. 5 (7): 522—531. doi:10.1038/nrg1379. PMID 15211354.
  17. ↑ 1 2 3 Lewis BP, Shih IH, Jones-Rhoades M, Bartel DP, Burge CB (2003). "Prediction of Mammalian MicroRNA Targets". Cell. 115 (7): 787—798. doi:10.1016/S0092-8674(03)01018-3. PMID 14697198.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  18. ↑ Rajewsky, Nikolaus. "microRNA target predictions in animals". Nature Genetics. 38 (6s): S8—S13. doi:10.1038/ng1798.
  19. ↑ Krek, Azra. "Combinatorial microRNA target predictions". Nature Genetics. 37 (5): 495—500. doi:10.1038/ng1536. PMID 15806104. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |coauthors= игнорируется (|author= предлагается) (справка)
  20. ↑ 1 2 Lee RC, Feinbaum RL, Ambros V (December 1993). "The C. elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14". Cell. 75 (5): 843—54. doi:10.1016/0092-8674(93)90529-Y. PMID 8252621.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  21. ↑ 1 2 Lim LP, Lau NC, Garrett-Engele P, Grimson A, Schelter JM, Castle J, Bartel DP, Linsley PS, Johnson JM (February 2005). "Microarray analysis shows that some microRNAs downregulate large numbers of target mRNAs". Nature. 433 (7027): 769—73. Bibcode:2005Natur.433..769L. doi:10.1038/nature03315. PMID 15685193.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка) Ошибка в сносках?: Неверный тег <ref>: название «pmid15685193» определено несколько раз для различного содержимого
  22. ↑ Brennecke J, Hipfner DR, Stark A, Russell RB, Cohen SM (April 2003). "bantam encodes a developmentally regulated microRNA that controls cell proliferation and regulates the proapoptotic gene hid in Drosophila". Cell. 113 (1): 25—36. doi:10.1016/S0092-8674(03)00231-9. PMID 12679032.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  23. ↑ Cuellar TL, McManus MT (December 2005). "MicroRNAs and endocrine biology". J. Endocrinol. 187 (3): 327—32. doi:10.1677/joe.1.06426. PMID 16423811.
  24. ↑ Poy MN, Eliasson L, Krutzfeldt J, Kuwajima S, Ma X, Macdonald PE, Pfeffer S, Tuschl T, Rajewsky N, Rorsman P, Stoffel M (November 2004). "A pancreatic islet-specific microRNA regulates insulin secretion". Nature. 432 (7014): 226—30. Bibcode:2004Natur.432..226P. doi:10.1038/nature03076. PMID 15538371.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  25. ↑ Chen CZ, Li L, Lodish HF, Bartel DP (January 2004). "MicroRNAs modulate hematopoietic lineage differentiation". Science. 303 (5654): 83—6. Bibcode:2004Sci...303...83C. doi:10.1126/science.1091903. PMID 14657504.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  26. ↑ Wilfred BR, Wang WX, Nelson PT (July 2007). "Energizing miRNA research: a review of the role of miRNAs in lipid metabolism, with a prediction that miR-103/107 regulates human metabolic pathways". Mol. Genet. Metab. 91 (3): 209—17. doi:10.1016/j.ymgme.2007.03.011. PMC 1978064. PMID 17521938.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  27. ↑ Harfe BD, McManus MT, Mansfield JH, Hornstein E, Tabin CJ (August 2005). "The RNaseIII enzyme Dicer is required for morphogenesis but not patterning of the vertebrate limb". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102 (31): 10898—903. Bibcode:2005PNAS..10210898H. doi:10.1073/pnas.0504834102. PMC 1182454. PMID 16040801.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  28. ↑ Lagos-Quintana M, Rauhut R, Yalcin A, Meyer J, Lendeckel W, Tuschl T (April 2002). "Identification of tissue-specific microRNAs from mouse". Curr. Biol. 12 (9): 735—9. doi:10.1016/S0960-9822(02)00809-6. PMID 12007417.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  29. ↑ Trang P, Weidhaas JB, Slack FJ (December 2008). "MicroRNAs as potential cancer therapeutics". Oncogene. 27 Suppl 2: S52—7. doi:10.1038/onc.2009.353. PMID 19956180.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  30. ↑ Li C, Feng Y, Coukos G, Zhang L (December 2009). "Therapeutic microRNA strategies in human cancer". AAPS J. 11 (4): 747—57. doi:10.1208/s12248-009-9145-9. PMC 2782079. PMID 19876744.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  31. ↑ Fasanaro P, Greco S, Ivan M, Capogrossi MC, Martelli F (January 2010). "microRNA: emerging therapeutic targets in acute ischemic diseases". Pharmacol. Ther. 125 (1): 92—104. doi:10.1016/j.pharmthera.2009.10.003. PMID 19896977.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  32. ↑ Hydbring, Per (August 2013). "Clinical applications of microRNAs". F1000Research. 2. doi:10.12688/f1000research.2-136.v2. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |coauthors= игнорируется (|author= предлагается) (справка)Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  33. ↑ Thomson DW, Bracken CP, Goodall GJ (September 2011). "Experimental strategies for microRNA target identification". Nucleic Acids Res. 39 (16): 6845—53. doi:10.1093/nar/gkr330. PMC 3167600. PMID 21652644.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  34. ↑ John B, Enright AJ, Aravin A, Tuschl T, Sander C, Marks DS (November 2004). "Human MicroRNA targets". PLoS Biol. 2 (11): e363. doi:10.1371/journal.pbio.0020363. PMC 521178. PMID 15502875.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка) Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  35. ↑ Krek A, Grün D, Poy MN, Wolf R, Rosenberg L, Epstein EJ, MacMenamin P, da Piedade I, Gunsalus KC, Stoffel M, Rajewsky N (May 2005). "Combinatorial microRNA target predictions". Nat. Genet. 37 (5): 495—500. doi:10.1038/ng1536. PMID 15806104.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  36. ↑ Selbach M, Schwanhäusser B, Thierfelder N, Fang Z, Khanin R, Rajewsky N (September 2008). "Widespread changes in protein synthesis induced by microRNAs". Nature. 455 (7209): 58—63. doi:10.1038/nature07228. PMID 18668040.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  37. ↑ Baek D, Villén J, Shin C, Camargo FD, Gygi SP, Bartel DP (September 2008). "The impact of microRNAs on protein output". Nature. 455 (7209): 64—71. doi:10.1038/nature07242. PMC 2745094. PMID 18668037.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  38. ↑ Reinhart BJ, Slack FJ, Basson M, Pasquinelli AE, Bettinger JC, Rougvie AE, Horvitz HR, Ruvkun G (February 2000). "The 21-nucleotide let-7 RNA regulates developmental timing in Caenorhabditis elegans". Nature. 403 (6772): 901—6. Bibcode:2000Natur.403..901R. doi:10.1038/35002607. PMID 10706289.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  39. ↑ Pasquinelli AE, Reinhart BJ, Slack F, Martindale MQ, Kuroda MI, Maller B, Hayward DC, Ball EE, Degnan B, Müller P, Spring J, Srinivasan A, Fishman M, Finnerty J, Corbo J, Levine M, Leahy P, Davidson E, Ruvkun G (November 2000). "Conservation of the sequence and temporal expression of let-7 heterochronic regulatory RNA". Nature. 408 (6808): 86—9. doi:10.1038/35040556. PMID 11081512.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  40. ↑ Ambros V, Bartel B, Bartel DP, Burge CB, Carrington JC, Chen X, Dreyfuss G, Eddy SR, Griffiths-Jones S, Marshall M, Matzke M, Ruvkun G, Tuschl T (March 2003). "A uniform system for microRNA annotation". RNA. 9 (3): 277—9. doi:10.1261/rna.2183803. PMC 1370393. PMID 12592000.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  41. ↑ Griffiths-Jones S, Grocock RJ, van Dongen S, Bateman A, Enright AJ (January 2006). "miRBase: microRNA sequences, targets and gene nomenclature". Nucleic Acids Res. 34 (Database issue): D140—4. doi:10.1093/nar/gkj112. PMC 1347474. PMID 16381832.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  42. ↑ 1 2 Lau NC, Lim LP, Weinstein EG, Bartel DP (October 2001). "An abundant class of tiny RNAs with probable regulatory roles in Caenorhabditis elegans". Science. 294 (5543): 858—62. Bibcode:2001Sci...294..858L. doi:10.1126/science.1065062. PMID 11679671.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  43. ↑ 1 2 3 4 5 6 Lee Y, Kim M, Han J, Yeom KH, Lee S, Baek SH, Kim VN (October 2004). "MicroRNA genes are transcribed by RNA polymerase II". EMBO J. 23 (20): 4051—60. doi:10.1038/sj.emboj.7600385. PMC 524334. PMID 15372072.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  44. ↑ Lagos-Quintana M, Rauhut R, Lendeckel W, Tuschl T (October 2001). "Identification of novel genes coding for small expressed RNAs". Science. 294 (5543): 853—8. Bibcode:2001Sci...294..853L. doi:10.1126/science.1064921. PMID 11679670.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  45. ↑ Lee RC, Ambros V (October 2001). "An extensive class of small RNAs in Caenorhabditis elegans". Science. 294 (5543): 862—4. Bibcode:2001Sci...294..862L. doi:10.1126/science.1065329. PMID 11679672.
  46. ↑ Mraz M, Dolezalova D, Plevova K, Stano Kozubik K, Mayerova V, Cerna K, Musilova K, Tichy B, Pavlova S, Borsky M, Verner J, Doubek M, Brychtova Y, Trbusek M, Hampl A, Mayer J, Pospisilova S (March 2012). "MicroRNA-650 expression is influenced by immunoglobulin gene rearrangement and affects the biology of chronic lymphocytic leukemia". Blood. 119 (9): 2110—3. doi:10.1182/blood-2011-11-394874. PMID 22234685.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  47. ↑ 1 2 Rodriguez A, Griffiths-Jones S, Ashurst JL, Bradley A (October 2004). "Identification of mammalian microRNA host genes and transcription units". Genome Res. 14 (10A): 1902—10. doi:10.1101/gr.2722704. PMC 524413. PMID 15364901.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  48. ↑ 1 2 3 4 Cai X, Hagedorn CH, Cullen BR (December 2004). "Human microRNAs are processed from capped, polyadenylated transcripts that can also function as mRNAs". RNA. 10 (12): 1957—66. doi:10.1261/rna.7135204. PMC 1370684. PMID 15525708.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  49. ↑ Weber MJ (January 2005). "New human and mouse microRNA genes found by homology search". FEBS J. 272 (1): 59—73. doi:10.1111/j.1432-1033.2004.04389.x. PMID 15634332.
  50. ↑ Kim YK, Kim VN (February 2007). "Processing of intronic microRNAs". EMBO J. 26 (3): 775—83. doi:10.1038/sj.emboj.7601512. PMC 1794378. PMID 17255951.
  51. ↑ Baskerville S, Bartel DP (March 2005). "Microarray profiling of microRNAs reveals frequent coexpression with neighboring miRNAs and host genes". RNA. 11 (3): 241—7. doi:10.1261/rna.7240905. PMC 1370713. PMID 15701730.
  52. ↑ Altuvia Y, Landgraf P, Lithwick G, Elefant N, Pfeffer S, Aravin A, Brownstein MJ, Tuschl T, Margalit H (2005). "Clustering and conservation patterns of human microRNAs". Nucleic Acids Res. 33 (8): 2697—706. doi:10.1093/nar/gki567. PMC 1110742. PMID 15891114.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  53. ↑ 1 2 Zhou X, Ruan J, Wang G, Zhang W (March 2007). "Characterization and identification of microRNA core promoters in four model species". PLoS Comput. Biol. 3 (3): e37. Bibcode:2007PLSCB...3...37Z. doi:10.1371/journal.pcbi.0030037. PMC 1817659. PMID 17352530.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка) Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  54. ↑ Faller M, Guo F (November 2008). "MicroRNA biogenesis: there's more than one way to skin a cat". Biochim. Biophys. Acta. 1779 (11): 663—7. doi:10.1016/j.bbagrm.2008.08.005. PMC 2633599. PMID 18778799.
  55. ↑ Gregory RI, Chendrimada TP, Shiekhattar R (2006). "MicroRNA biogenesis: isolation and characterization of the microprocessor complex". Methods Mol. Biol. 342: 33—47. doi:10.1385/1-59745-123-1:33. ISBN 1-59745-123-1. PMID 16957365.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  56. ↑ Berezikov E, Chung WJ, Willis J, Cuppen E, Lai EC (October 2007). "Mammalian mirtron genes". Mol. Cell. 28 (2): 328—36. doi:10.1016/j.molcel.2007.09.028. PMC 2763384. PMID 17964270.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  57. ↑ 1 2 Kawahara Y, Megraw M, Kreider E, Iizasa H, Valente L, Hatzigeorgiou AG, Nishikura K (September 2008). "Frequency and fate of microRNA editing in human brain". Nucleic Acids Res. 36 (16): 5270—80. doi:10.1093/nar/gkn479. PMC 2532740. PMID 18684997.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  58. ↑ Winter J, Jung S, Keller S, Gregory RI, Diederichs S (March 2009). "Many roads to maturity: microRNA biogenesis pathways and their regulation". Nat. Cell Biol. 11 (3): 228—34. doi:10.1038/ncb0309-228. PMID 19255566.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  59. ↑ Ohman M (October 2007). "A-to-I editing challenger or ally to the microRNA process". Biochimie. 89 (10): 1171—6. doi:10.1016/j.biochi.2007.06.002. PMID 17628290.
  60. ↑ 1 2 Murchison EP, Hannon GJ (June 2004). "miRNAs on the move: miRNA biogenesis and the RNAi machinery". Curr. Opin. Cell Biol. 16 (3): 223—9. doi:10.1016/j.ceb.2004.04.003. PMID 15145345.
  61. ↑ 1 2 3 Lund E, Dahlberg JE (2006). "Substrate selectivity of exportin 5 and Dicer in the biogenesis of microRNAs". Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 71: 59—66. doi:10.1101/sqb.2006.71.050. PMID 17381281.
  62. ↑ Ji X (2008). "The mechanism of RNase III action: how dicer dices". Curr. Top. Microbiol. Immunol. Current Topics in Microbiology and Immunology. 320: 99—116. doi:10.1007/978-3-540-75157-1_5. ISBN 978-3-540-75156-4. PMID 18268841.
  63. ↑ Lelandais-Brière C, Sorin C, Declerck M, Benslimane A, Crespi M, Hartmann C (March 2010). "Small RNA diversity in plants and its impact in development". Current Genomics. 11 (1): 14—23. doi:10.2174/138920210790217918. PMC 2851111. PMID 20808519.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  64. ↑ Rana TM (January 2007). "Illuminating the silence: understanding the structure and function of small RNAs". Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 8 (1): 23—36. doi:10.1038/nrm2085. PMID 17183358.
  65. ↑ 1 2 Schwarz DS, Zamore PD (May 2002). "Why do miRNAs live in the miRNP?". Genes Dev. 16 (9): 1025—31. doi:10.1101/gad.992502. PMID 12000786.
  66. ↑ Krol J, Sobczak K, Wilczynska U, Drath M, Jasinska A, Kaczynska D, Krzyzosiak WJ (2004). "Structural features of microRNA (miRNA) precursors and their relevance to miRNA biogenesis and small interfering RNA/short hairpin RNA design". J Biol Chem. 279 (40): 42230—9. doi:10.1074/jbc.M404931200. PMID 15292246.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка) Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  67. ↑ Khvorova A, Reynolds A, Jayasena SD (2003). "Functional siRNAs and miRNAs exhibit strand bias". Cell. 115 (2): 209—16. doi:10.1016/S0092-8674(03)00801-8. PMID 14567918.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  68. ↑ Schwarz DS, Hutvágner G, Du T, Xu Z, Aronin N, Zamore PD (2003). "Asymmetry in the assembly of the RNAi enzyme complex". Cell. 115 (2): 199—208. doi:10.1016/S0092-8674(03)00759-1. PMID 14567917.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  69. ↑ Lin SL, Chang D, Ying SY (2005). "Asymmetry of intronic pre-miRNA structures in functional RISC assembly". Gene. 356: 32—8. doi:10.1016/j.gene.2005.04.036. PMC 1788082. PMID 16005165.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  70. ↑ Okamura K, Chung WJ, Lai EC (2008). "The long and short of inverted repeat genes in animals: microRNAs, mirtrons and hairpin RNAs". Cell Cycle. 7 (18): 2840—5. doi:10.4161/cc.7.18.6734. PMC 2697033. PMID 18769156.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  71. ↑ 1 2 Pratt AJ, MacRae IJ (July 2009). "The RNA-induced silencing complex: a versatile gene-silencing machine". J. Biol. Chem. 284 (27): 17897—901. doi:10.1074/jbc.R900012200. PMC 2709356. PMID 19342379.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  72. ↑ MacRae IJ, Ma E, Zhou M, Robinson CV, Doudna JA (January 2008). "In vitro reconstitution of the human RISC-loading complex". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105 (2): 512—7. Bibcode:2008PNAS..105..512M. doi:10.1073/pnas.0710869105. PMC 2206567. PMID 18178619.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  73. ↑ Mourelatos Z, Dostie J, Paushkin S, Sharma A, Charroux B, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (March 2002). "miRNPs: a novel class of ribonucleoproteins containing numerous microRNAs". Genes Dev. 16 (6): 720—8. doi:10.1101/gad.974702. PMC 155365. PMID 11914277.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  74. ↑ Meister G, Landthaler M, Peters L, Chen P, Urlaub H, Lurhmann R, Tuschl T (December 2005). "Identification of Novel Argonaute-Associated Proteins". Current Biology. 15 (23): 2149—55. doi:10.1016/j.cub.2005.10.048. PMID 16289642.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  75. ↑ 1 2 3 Kai ZS, Pasquinelli AE (January 2010). "MicroRNA assassins: factors that regulate the disappearance of miRNAs". Nat. Struct. Mol. Biol. 17 (1): 5—10. doi:10.1038/nsmb.1762. PMID 20051982.
  76. ↑ Chatterjee S, Großhans H (September 2009). "Active turnover modulates mature microRNA activity in Caenorhabditis elegans". Nature. 461 (7263): 546—459. Bibcode:2009Natur.461..546C. doi:10.1038/nature08349. PMID 19734881.
  77. ↑ Wang XJ, Reyes JL, Chua NH, Gaasterland T (2004). "Prediction and identification of Arabidopsis thaliana microRNAs and their mRNA targets". Genome Biol. 5 (9): R65. doi:10.1186/gb-2004-5-9-r65. PMC 522872. PMID 15345049.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка) Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  78. ↑ Kawasaki H, Taira K (2004). "MicroRNA-196 inhibits HOXB8 expression in myeloid differentiation of HL60 cells". Nucleic Acids Symp Ser. 48 (48): 211—2. doi:10.1093/nass/48.1.211. PMID 17150553.
  79. ↑ 1 2 Moxon S, Jing R, Szittya G, Schwach F, Rusholme Pilcher RL, Moulton V, Dalmay T (October 2008). "Deep sequencing of tomato short RNAs identifies microRNAs targeting genes involved in fruit ripening". Genome Res. 18 (10): 1602—9. doi:10.1101/gr.080127.108. PMC 2556272. PMID 18653800.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  80. ↑ Mazière P, Enright AJ (June 2007). "Prediction of microRNA targets". Drug Discov. Today. 12 (11—12): 452—8. doi:10.1016/j.drudis.2007.04.002. PMID 17532529.
  81. ↑ Williams AE (February 2008). "Functional aspects of animal microRNAs". Cell. Mol. Life Sci. 65 (4): 545—62. doi:10.1007/s00018-007-7355-9. PMID 17965831.
  82. ↑ Eulalio A, Huntzinger E, Nishihara T, Rehwinkel J, Fauser M, Izaurralde E (January 2009). "Deadenylation is a widespread effect of miRNA regulation". RNA. 15 (1): 21—32. doi:10.1261/rna.1399509. PMC 2612776. PMID 19029310.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  83. ↑ Bazzini AA, Lee MT, Giraldez AJ (April 2012). "Ribosome profiling shows that miR-430 reduces translation before causing mRNA decay in zebrafish". Science. 336 (6078): 233—7. Bibcode:2012Sci...336..233B. doi:10.1126/science.1215704. PMID 22422859.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  84. ↑ Djuranovic S, Nahvi A, Green R (April 2012). "miRNA-mediated gene silencing by translational repression followed by mRNA deadenylation and decay". Science. 336 (6078): 237—40. Bibcode:2012Sci...336..237B. doi:10.1126/science.1215691. PMID 22499947.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  85. ↑ Tan Y, Zhang B, Wu T, Skogerbø G, Zhu X, Guo X, He S, Chen R (2009). "Transcriptional inhibiton of Hoxd4 expression by miRNA-10a in human breast cancer cells". BMC Mol. Biol. 10: 12. doi:10.1186/1471-2199-10-12. PMC 2680403. PMID 19232136.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка) Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  86. ↑ Hawkins PG, Morris KV (March 2008). "RNA and transcriptional modulation of gene expression". Cell Cycle. 7 (5): 602—7. doi:10.4161/cc.7.5.5522. PMC 2877389. PMID 18256543.
  87. ↑ 1 2 Ошибка в сносках?: Неверный тег <ref>; для сносок Zinovyev_2012 не указан текст
  88. ↑ Stark A, Brennecke J, Bushati N, Russell RB, Cohen SM (2005). "Animal MicroRNAs confer robustness to gene expression and have a significant impact on 3'UTR evolution". Cell. 123 (6): 1133—46. doi:10.1016/j.cell.2005.11.023. PMID 16337999.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  89. ↑ Li LC. Small RNA-Mediated Gene Activation // RNA and the Regulation of Gene Expression: A Hidden Layer of Complexity. — Caister Academic Press, 2008. — ISBN http://www.horizonpress.com/rnareg.
  90. ↑ Place RF, Li LC, Pookot D, Noonan EJ, Dahiya R (2008). "MicroRNA-373 induces expression of genes with complementary promoter sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105 (5): 1608—13. Bibcode:2008PNAS..105.1608P. doi:10.1073/pnas.0707594105. PMC 2234192. PMID 18227514.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  91. ↑ Salmena L, Poliseno L, Tay Y, Kats L, Pandolfi PP (August 2011). "A ceRNA hypothesis: the Rosetta Stone of a hidden RNA language?". Cell. 146 (3): 353—8. doi:10.1016/j.cell.2011.07.014. PMC 3235919. PMID 21802130.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  92. ↑ 1 2 Wheeler BM, Heimberg AM, Moy VN, Sperling EA, Holstein TW, Heber S, Peterson KJ (2009). "The deep evolution of metazoan microRNAs". Evol. Dev. 11 (1): 50—68. doi:10.1111/j.1525-142X.2008.00302.x. PMID 19196333.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  93. ↑ Pashkovskiy, P. P. (2013). "Biogenesis, evolution, and functions of plant microRNAs". Biochemistry-Moscow. 78: 627—637. doi:10.1134/S0006297913060084. PMID 23980889. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |coauthors= игнорируется (|author= предлагается) (справка)
  94. ↑ Piriyapongsa J, Jordan IK. A family of human microRNA genes from miniature inverted-repeat transposable elements. // PLoS One. — 2007. — Т. 2, № 2.
  95. ↑ 1 2 Heimberg AM, Sempere LF, Moy VN, Donoghue PC, Peterson KJ (February 2008). "MicroRNAs and the advent of vertebrate morphological complexity". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105 (8): 2946—50. Bibcode:2008PNAS..105.2946H. doi:10.1073/pnas.0712259105. PMC 2268565. PMID 18287013.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  96. ↑ 1 2 3 Peterson KJ, Dietrich MR, McPeek MA (July 2009). "MicroRNAs and metazoan macroevolution: insights into canalization, complexity, and the Cambrian explosion". BioEssays. 31 (7): 736—47. doi:10.1002/bies.200900033. PMID 19472371.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  97. ↑ 1 2 3 Nozawa M, Miura S, Nei M (2010). "Origins and evolution of microRNA genes in Drosophila species". Genome Biol Evol. 2: 180—9. doi:10.1093/gbe/evq009. PMC 2942034. PMID 20624724.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  98. ↑ Allen, E. (2004). "Evolution of microRNA genes by inverted duplication of target gene sequences in Arabidopsis thaliana". Nature Genetics. 36 (12): 1282—1290. doi:10.1038/ng1478. PMID 15565108. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |coauthors= игнорируется (|author= предлагается) (справка)
  99. ↑ Warthmann, N. (2008). "Comparative analysis of the MIR319a MicroRNA locus in Arabidopsis and related Brassicaceae". Molecular Biology and Evolution. 25 (5): 892—902. doi:10.1093/molbev/msn029. PMID 18296705. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |coauthors= игнорируется (|author= предлагается) (справка)
  100. ↑ Fahlgren, N. (2010). "MicroRNA gene evolution in Arabidopsis lyrata and Arabidopsis thaliana". Plant Cell. 22 (4): 1074—1089. doi:10.1105/tpc.110.073999. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |coauthors= игнорируется (|author= предлагается) (справка)
  101. ↑ Caravas J, Friedrich M (June 2010). "Of mites and millipedes: recent progress in resolving the base of the arthropod tree". BioEssays. 32 (6): 488—95. doi:10.1002/bies.201000005. PMID 20486135.
  102. ↑ Cock JM, Sterck L, Rouzé P, Scornet D, Allen AE, Amoutzias G, Anthouard V, Artiguenave F, Aury JM, Badger JH; et al. (June 2010). "The Ectocarpus genome and the independent evolution of multicellularity in brown algae". Nature. 465 (7298): 617—21. Bibcode:2010Natur.465..617C. doi:10.1038/nature09016. PMID 20520714. {{cite journal}}: Явное указание et al. в: |author= (справка)Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  103. ↑ Cuperus, J. T. (2011). "Evolution and functional diversification of MIRNA genes". Plant Cell. 23 (2): 431—442. doi:10.1105/tpc.110.082784. PMID 21317375. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |coauthors= игнорируется (|author= предлагается) (справка)
  104. ↑ Attila Molnar, Andrew Basset, Frank Schwach et al. Highly specific gene silencing by artificial microRNAs in the unicellular alga Chlamydomonas reinhardtii // The Plant Journal. — 2009. — doi:10.1111/j.1365-313X.2008.03767.x.
  105. ↑ Kanika Jain, B.B. Chattoo. Comparative miRNA analysis in pathogenic fungi.
  106. ↑ Dimond PF (15 March 2010). "miRNAs' Therapeutic Potential". Genetic Engineering & Biotechnology News. Vol. 30, no. 6. p. 1. Архивировано 10 июля 2010. Дата обращения: 10 июля 2010.
  107. ↑ Tjaden B, Goodwin SS, Opdyke JA, Guillier M, Fu DX, Gottesman S, Storz G (2006). "Target prediction for small, noncoding RNAs in bacteria". Nucleic Acids Res. 34 (9): 2791—802. doi:10.1093/nar/gkl356. PMC 1464411. PMID 16717284.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  108. ↑ Evidence for X-chromosomal schizophrenia associated with microRNA alterations. Feng J, Sun G, Yan J, Noltner K, Li W, Buzin CH, Longmate J, Heston LL, Rossi J, Sommer SS. PLoS One. 2009 Jul 1;4(7):e6121. PMID 19568434

Литература

Внешние ссылки

Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=МикроРНК&oldid=62759967