Пирролизин

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Пирролизин
Pyrrolysine.svg
Пирролизин
Общие
Хим. формула C12H21N3O3
Физические свойства
Молярная масса 255,313 г/моль
Классификация
Рег. номер CAS 448235-52-7
PubChem 5460671
SMILES
ChemSpider 4574156
Приводятся данные для стандартных условий (25 °C, 100 кПа), если не указано иного.

Пирролизин — это природная аминокислота, кодируемая генами некоторых метаногенных архей. Пирролизин входит в состав некоторых ферментов метаболизма метана.

Пирролизин является производным аминокислоты лизина и кодируется кодоном UAG (обычно 'amber' стоп-кодоном). Возможно, модифицируется в случае наличия специфической последовательности нуклеотидов PYLIS, которая образует стебелек и петлю в структуре мРНК, усиливая включение пирролизина вместо терминации трансляции. Кодон UAG используется реже, чем другие стоп-кодоны, и, если встречается в открытой рамке считывания, за ним, как правило, следуют другие стоп-кодоны.

Рядом с кластером генов переноса метильной группы археи Methanosarcina barkeri располагается ген pylT, который кодирует необычную тРНК с антикодоном CUA. Соседний ген pylS кодирует аминоацил-тРНК-синтетазу второго класса, которая присоединяет пирролизин к тРНК-продукту гена pylT. Оперон, содержащий гены pylT и pylS также найден в геномах других секвенированных представителей семейства Methanosarcinaceae. Гомологи генов pylS и pylT обнаружены также в грам-положительной бактерии Desulfitobacterium hafniense, хотя функции этих гомологов у данной бактерии неизвестны.[1]

Первоначально было показано, что продукт гена pylT — тРНК с антикодоном (CUA), может быть «заряжена» аминокислотой лизином с помощью белка PylS. Относительно недавно было показано, что тРНК с аниткодоном CUA может быть «заряжена» лизином в условиях in vitro последовательным взаимодействием с лизиновыми тРНК-синтетазами первого и второго класса из M. barkeri. Последние данные указывают на то, что происходит прямое присоединение пирролизина к тРНК с антикодоном CUA при помощи белкового продукта гена pylS. Это означает, что пирролизин представляет собой 22ую аминокислоту, закодированную генетически.[2]

Для обозначения пирролизина ИЮПАК рекомендует трехбуквенное сокращение Pyl и однобуквенное O.

См. также[править | править вики-текст]

Примечания[править | править вики-текст]

  1. John F. Atkins and Ray Gesteland (2002). «The 22nd Amino Acid». Science 296 (5572): 1409–1410. DOI:10.1126/science.1073339. PMID 12029118.
  2. Krzycki J (2005). «The direct genetic encoding of pyrrolysine». Curr Opin Microbiol 8 (6): 706–712. DOI:oi:10.1016/j.mib.2005.10.009. PMID 16256420.

Внешние ссылки[править | править вики-текст]