SEMA7A

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
SEMA7A
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

3NVQ

Идентификаторы
ПсевдонимыSEMA7A, CD108, CDw108, H-SEMA-K1, H-Sema-L, JMH, SEMAK1, SEMAL, semaphorin 7A (John Milton Hagen blood group), PFIC11
Внешние IDOMIM: 607961 MGI: 1306826 HomoloGene: 2678 GeneCards: SEMA7A
Расположение гена (человек)
15-я хромосома человека
Хр.15-я хромосома человека[1]
15-я хромосома человека
Расположение в геноме SEMA7A
Расположение в геноме SEMA7A
Локус15q24.1Начало74,409,289 bp[1]
Конец74,433,958 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
9-я хромосома мыши
Хр.9-я хромосома мыши[2]
9-я хромосома мыши
Расположение в геноме SEMA7A
Расположение в геноме SEMA7A
Локус9|9 BНачало57,847,395 bp[2]
Конец57,870,148 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • stromal cell of endometrium

  • Цитоархитектоническое поле Бродмана 9
Наибольшая экспрессия в
  • cumulus cell

  • cerebellar cortex

  • anterior horn of spinal cord

  • barrel cortex

  • pontine nuclei
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

8482

20361

Ensembl

ENSG00000138623
ENSG00000288455

ENSMUSG00000038264

UniProt

O75326

Q9QUR8

RefSeq (мРНК)

NM_003612
NM_001146029
NM_001146030

NM_011352

RefSeq (белок)

NP_001139501
NP_001139502
NP_003603

NP_035482

Локус (UCSC)Chr 15: 74.41 – 74.43 MbChr 9: 57.85 – 57.87 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Семафорин-7A (англ. Semaphorin 7A, GPI membrane anchor; SEMA7A; CD108) — мембранный гликопротеин класса семафоринов, прикреплён к клеточной мембране за счёт гликозилфосфатидилинозитольной группы. Антиген группы крови John-Milton-Hagen (JMH). Продукт гена человека SEMA7A[5].

Структура[править | править код]

SEMA7A состоит из 666 аминокислот, молекулярная масса 74,8 кДа. Содержит один Ig-подобный домен типа C2. Гликозилфосфатидилинозитол заякоривает белок на мембране.

Взаимодействует с интегринами ITGA1 и ITGB1 и с рецептором семафоринов PLXNC1.

Функции[править | править код]

SEMA7A играет важную роль в интегрин-опосредованной передаче сигнала. Функционирует в регуляции клеточной миграции и в иммунном ответе. Стимулирует образование комплексов фокальной адгезии, активацию протеинкиназы PTK2/FAK1 и последующее фосфорилирование киназ MAPK1 и MAPK3. Стимулирует продукцию воспалительных цитокинов моноцитами и макрофагами. Играет важную роль в модулировании воспалительной реакции и T-клеточного иммунного ответа. Белок стимулирует рост аксонов в эмбриональной обонятельной луковице. Участвует в прикреплении меланоцитов, их росте и образовании дендритных отростков.

Кроме этого, белок служит рецептором малярийного паразита Plasmodium falciparum.

Группа крови JMH[править | править код]

Система группы крови John Milton Hagen (JMH) — высокочастотный антиген эритроцитарной группы крови человека.[6] Система состоит из 6 антигенов, расположенных на семафорине-7A[7], но, как правило, они не вызывают существенного гемолиза или гемолитических расстройств новорожденных.[8]

Тканевая локализация[править | править код]

Белок экспрессирован на активированных лимфоцитах и эритроцитах. Детектируется на кератиноцитах, эндотелиальных клетках кровеносных сосудов кожи. Экспрессирован на фибробрастах, меланоцитах, в плаценте, яичках, яичниках, селезёнке, мозге, спинном мозге, лёгких, сердце, надпочечниках, лимфатических узлах, вилочковой железе, кишечнике и почках.

Примечания[править | править код]

  1. ↑ 1 2 3 ENSG00000288455 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000138623, ENSG00000288455 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038264 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Entrez Gene: SEMA7A semaphorin 7A, GPI membrane anchor (John Milton Hagen blood group).
  6. ↑ Bobolis, Kristie A.; Moulds, John J.; Telen, Marilyn J. Isolation of the JMH Antigen on a Novel Phosphatidylinositol-Linked Human Membrane Protein (англ.) : journal. Архивировано 21 октября 2018 года.
  7. ↑ Johnson, S.T. JMH blood group system: a review. (неопр.) // Immunohematology. — 2014. — Т. 30, № 1. — С. 18—23. — PMID 25238240.
  8. ↑ JMH. bbguy.org. Дата обращения: 21 октября 2018. Архивировано 21 октября 2018 года.

Литература[править | править код]

  • Xu X., Ng S., Wu Z.L., etal. Human semaphorin K1 is glycosylphosphatidylinositol-linked and defines a new subfamily of viral-related semaphorins. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1998. — Vol. 273, no. 35. — P. 22428—22434. — doi:10.1074/jbc.273.35.22428. — PMID 9712866.
  • Lange C., Liehr T., Goen M., etal. New eukaryotic semaphorins with close homology to semaphorins of DNA viruses. (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1998. — Vol. 51, no. 3. — P. 340—350. — doi:10.1006/geno.1998.5256. — PMID 9721204.
  • Yamada A., Kubo K., Takeshita T., etal. Molecular cloning of a glycosylphosphatidylinositol-anchored molecule CDw108. (англ.) // J. Immunol.  (англ.) (рус. : journal. — 1999. — Vol. 162, no. 7. — P. 4094—4100. — PMID 10201933.
  • Angelisová P., Drbal K., Cerný J., etal. Characterization of the human leukocyte GPI-anchored glycoprotein CDw108 and its relation to other similar molecules. (англ.) // Immunobiology : journal. — 1999. — Vol. 200, no. 2. — P. 234—245. — doi:10.1016/s0171-2985(99)80073-4. — PMID 10416131.
  • Tamagnone L., Artigiani S., Chen H., etal. Plexins are a large family of receptors for transmembrane, secreted, and GPI-anchored semaphorins in vertebrates. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1999. — Vol. 99, no. 1. — P. 71—80. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80063-X. — PMID 10520995.
  • Mine T., Harada K., Matsumoto T., etal. CDw108 expression during T-cell development. (англ.) // Tissue Antigens  (англ.) (рус. : journal. — 2000. — Vol. 55, no. 5. — P. 429—436. — doi:10.1034/j.1399-0039.2000.550505.x. — PMID 10885563.
  • Holmes S., Downs A.M., Fosberry A., etal. Sema7A is a potent monocyte stimulator. (неопр.) // Scand. J. Immunol.. — 2002. — Т. 56, № 3. — С. 270—275. — doi:10.1046/j.1365-3083.2002.01129.x. — PMID 12193228.
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., etal. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
  • Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., etal. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). (англ.) // Genome Res.  (англ.) (рус. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Maurin J.C., Delorme G., Machuca-Gayet I., etal. Odontoblast expression of semaphorin 7A during innervation of human dentin. (англ.) // Matrix Biol.  (англ.) (рус. : journal. — 2005. — Vol. 24, no. 3. — P. 232—238. — doi:10.1016/j.matbio.2005.03.005. — PMID 15907379.
  • Hu Y., Malone J.P., Fagan A.M., etal. Comparative proteomic analysis of intra- and interindividual variation in human cerebrospinal fluid. (англ.) // Mol. Cell. Proteomics : journal. — 2006. — Vol. 4, no. 12. — P. 2000—2009. — doi:10.1074/mcp.M500207-MCP200. — PMID 16199891.
  • Koh J.M., Oh B., Lee J.Y., etal. Association study of semaphorin 7a (sema7a) polymorphisms with bone mineral density and fracture risk in postmenopausal Korean women. (англ.) // J. Hum. Genet.  (англ.) (рус. : journal. — 2006. — Vol. 51, no. 2. — P. 112—117. — doi:10.1007/s10038-005-0331-z. — PMID 16372136.
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=SEMA7A&oldid=131031102