SLAMF6

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
SLAMF6
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2IF7

Идентификаторы
ПсевдонимыSLAMF6, CD352, KALI, KALIb, Ly108, NTB-A, NTBA, SF2000, SLAM family member 6
Внешние IDOMIM: 606446 MGI: 1353620 HomoloGene: 49945 GeneCards: SLAMF6
Расположение гена (человек)
1-я хромосома человека
Хр.1-я хромосома человека[1]
1-я хромосома человека
Расположение в геноме SLAMF6
Расположение в геноме SLAMF6
Локус1q23.2-q23.3Начало160,485,030 bp[1]
Конец160,523,262 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
1-я хромосома мыши
Хр.1-я хромосома мыши[2]
1-я хромосома мыши
Расположение в геноме SLAMF6
Расположение в геноме SLAMF6
Локус1 H3|1 79.54 cMНачало171,745,082 bp[2]
Конец171,780,737 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • upper lobe of left lung
Наибольшая экспрессия в
  • subcutaneous adipose tissue
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

114836

30925

Ensembl

ENSG00000162739

ENSMUSG00000015314

UniProt

Q96DU3

Q9ET39

RefSeq (мРНК)

NM_052931
NM_001184714
NM_001184715
NM_001184716

NM_030710
NM_001347186
NM_001347187

RefSeq (белок)

NP_001171643
NP_001171644
NP_001171645
NP_443163

NP_001334115
NP_001334116
NP_109635

Локус (UCSC)Chr 1: 160.49 – 160.52 MbChr 1: 171.75 – 171.78 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

SLAMF6 — мембранный белок, продукт гена человека SLAMF6[5][6]. Входит в семейство сигнальных лимфоцитарных молекул активации (англ. Signaling lymphocytic activation molecule, SLAM).

Описание[править | править код]

Белок относится к трансмембранным белкам 1-го типа подсемейства CD2 суперсемейства иммуноглобулинов. Эспрессирован на естественных киллерах, T- и B-лимфицитах. После фосфорилирования связывается с SH2D1A, а также с SH2-домен-содержащими фосфатазами SHP. Функционирует как ко-рецептор, играющий роль в активации естественных киллеров. Опосредует ингибиторный сигнал в естественных киллерах при X-ассоциированном лимфопролиферативном синдроме (болезнь Дункана).

Примечания[править | править код]

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000162739 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015314 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Bottino C., Falco M., Parolini S., Marcenaro E., Augugliaro R., Sivori S., Landi E., Biassoni R., Notarangelo L.D., Moretta L., Moretta A. NTB-A [correction of GNTB-A], a novel SH2D1A-associated surface molecule contributing to the inability of natural killer cells to kill Epstein-Barr virus-infected B cells in X-linked lymphoproliferative disease (англ.) // Journal of Experimental Medicine[англ.] : journal. — Rockefeller University Press[англ.], 2001. — August (vol. 194, no. 3). — P. 235—246. — doi:10.1084/jem.194.3.235. — PMID 11489943. — PMC 2193462.
  6. ↑ Entrez Gene: SLAMF6 SLAM family member 6. Архивировано 5 декабря 2010 года.

Литература[править | править код]

  • Claus M., Meinke S., Bhat R., Watzl C. Regulation of NK cell activity by 2B4, NTB-A and CRACC. (англ.) // Frontiers in Bioscience[англ.] : journal. — Frontiers in Bioscience[англ.], 2007. — Vol. 13, no. 13. — P. 956—965. — doi:10.2741/2735. — PMID 17981603.
  • Hercend T., Meuer S., Brennan A., etal. Natural killer-like function of activated T lymphocytes: differential blocking effects of monoclonal antibodies specific for a 90-kDa clonotypic structure (англ.) // Cell. Immunol. : journal. — 1984. — Vol. 86, no. 2. — P. 381—392. — doi:10.1016/0008-8749(84)90393-9. — PMID 6610481.
  • Kong G., Dalton M., Wardenburg J.B., etal. Distinct tyrosine phosphorylation sites in ZAP-70 mediate activation and negative regulation of antigen receptor function (англ.) // Mol. Cell. Biol.[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 16, no. 9. — P. 5026—5035. — PMID 8756661. — PMC 231504.
  • Lee Y.J., Luisiri P., Clark M.R. A novel complex, p40/42, is constitutively associated with the B cell antigen receptor and phosphorylated upon receptor stimulation (англ.) // J. Immunol.[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 157, no. 9. — P. 3828—3837. — PMID 8892612.
  • Gray C.W., Ward R.V., Karran E., etal. Characterization of human HtrA2, a novel serine protease involved in the mammalian cellular stress response (англ.) // Eur. J. Biochem.[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 267, no. 18. — P. 5699—5710. — doi:10.1046/j.1432-1327.2000.01589.x. — PMID 10971580.
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Del Valle J.M., Engel P., Martín M. The cell surface expression of SAP-binding receptor CD229 is regulated via its interaction with clathrin-associated adaptor complex 2 (AP-2) (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 19. — P. 17430—17437. — doi:10.1074/jbc.M301569200. — PMID 12621057.
  • Tangye S.G., Nichols K.E., Hare N.J., van de Weerdt B.C. Functional requirements for interactions between CD84 and Src homology 2 domain-containing proteins and their contribution to human T cell activation (англ.) // J. Immunol.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 171, no. 5. — P. 2485—2495. — doi:10.4049/jimmunol.171.5.2485. — PMID 12928397.
  • Clark H.F., Gurney A.L., Abaya E., etal. The secreted protein discovery initiative (SPDI), a large-scale effort to identify novel human secreted and transmembrane proteins: a bioinformatics assessment (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 13, no. 10. — P. 2265—2270. — doi:10.1101/gr.1293003. — PMID 12975309. — PMC 403697.
  • Valdez P.A., Wang H., Seshasayee D., etal. NTB-A, a new activating receptor in T cells that regulates autoimmune disease (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2004. — Vol. 279, no. 18. — P. 18662—18669. — doi:10.1074/jbc.M312313200. — PMID 14988414.
  • Flaig R.M., Stark S., Watzl C. Cutting edge: NTB-A activates NK cells via homophilic interaction (англ.) // J. Immunol.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 172, no. 11. — P. 6524—6527. — doi:10.4049/jimmunol.172.11.6524. — PMID 15153464.
  • Zhang Z., Henzel W.J. Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites (англ.) // Protein Sci.[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 13, no. 10. — P. 2819—2824. — doi:10.1110/ps.04682504. — PMID 15340161. — PMC 2286551.
  • Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., etal. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Stark S., Watzl C. 2B4 (CD244), NTB-A and CRACC (CS1) stimulate cytotoxicity but no proliferation in human NK cells (англ.) // Int. Immunol.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 18, no. 2. — P. 241—247. — doi:10.1093/intimm/dxh358. — PMID 16410313.
  • Gregory S.G., Barlow K.F., McLay K.E., etal. The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1 (англ.) // Nature : journal. — 2006. — Vol. 441, no. 7091. — P. 315—321. — doi:10.1038/nature04727. — PMID 16710414.
  • Eissmann P., Watzl C. Molecular analysis of NTB-A signaling: a role for EAT-2 in NTB-A-mediated activation of human NK cells (англ.) // J. Immunol.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 177, no. 5. — P. 3170—3177. — doi:10.4049/jimmunol.177.5.3170. — PMID 16920955.
  • Cao E., Ramagopal U.A., Fedorov A., etal. NTB-A receptor crystal structure: insights into homophilic interactions in the signaling lymphocytic activation molecule receptor family (англ.) // Immunity : journal. — Cell Press, 2006. — Vol. 25, no. 4. — P. 559—570. — doi:10.1016/j.immuni.2006.06.020. — PMID 17045824.
  • Banerjee P., Feuer G., Barker E. Human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) p12I down-modulates ICAM-1 and -2 and reduces adherence of natural killer cells, thereby protecting HTLV-1-infected primary CD4+ T cells from autologous natural killer cell-mediated cytotoxicity despite the reduction of major histocompatibility complex class I molecules on infected cells (англ.) // J. Virol.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 81, no. 18. — P. 9707—9717. — doi:10.1128/JVI.00887-07. — PMID 17609265. — PMC 2045425.
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=SLAMF6&oldid=120676692