CD47

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
CD47
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2JJS, 2JJT, 2VSC, 4CMM, 4KJY, 5IWL

Идентификаторы
ПсевдонимыCD47, IAP, MER6, OA3, CD47 molecule
Внешние IDOMIM: 601028 MGI: 96617 HomoloGene: 1346 GeneCards: CD47
Расположение гена (человек)
3-я хромосома человека
Хр.3-я хромосома человека[1]
3-я хромосома человека
Расположение в геноме CD47
Расположение в геноме CD47
Локус3q13.12Начало108,043,091 bp[1]
Конец108,091,862 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
16-я хромосома мыши
Хр.16-я хромосома мыши[2]
16-я хромосома мыши
Расположение в геноме CD47
Расположение в геноме CD47
Локус16|16 B5Начало49,620,896 bp[2]
Конец49,735,373 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001025079
NM_001025080
NM_001777
NM_198793
NM_001382306

NM_010581
NM_001368415
NM_001368416
NM_001368417
NM_001368418

RefSeq (белок)

NP_001768
NP_942088
NP_001369235

NP_034711
NP_001355344
NP_001355345
NP_001355346
NP_001355347

Локус (UCSC)Chr 3: 108.04 – 108.09 MbChr 16: 49.62 – 49.74 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

CD47 — поверхностный клеточный гликопротеин, играющий роль в межклеточном взаимодействии, предотвращает захват нормальных эритроцитов фагоцитарными клетками. Лиганд рецептора SIRPA (SIRPα, CD172a).

Структура[править | править код]

Белок состоит из 323 аминокислот.

Функции[править | править код]

CD47 играет роль в клеточной адгезии, являясь рецептором для тромбоцитарного THBS1, и в модулировании интегринов. Играет важную роль в формировании памяти и синаптической пластичности в гиппокампе. CD47 является лигандом рецептора SIRPA (SIRPα), связывание с которым блокирует созревание незрелых дендритных клеток и ингибирует образование цитокинов зрелыми дендритными клетками. Взаимодействие с другим рецептором SIRPG способствует межклеточной адгезии. Предотвращает клиренс из крови нормальных эритроцитов.

В марте 2012 года были опубликованы результаты исследования, согласно которым CD47 препятствует фагоцитозу раковых клеток. Блокирование взаимодействий CD47—SIRPα антителами к CD47 позволило уменьшить лейкосаркому у мышей[5][6][7]. Более того, опосредованный анти-CD47 антителами фагоцитоз раковых клеток макрофагами, как оказалось, может инициировать противоопухолевый иммунный ответ Т-клеток и на многие другие ранее не поддававшиеся иммунотерапии разновидности рака[8][9].

Распределение в тканях[править | править код]

Белок широко представлен в различных тканях взрослого организма. Особенно его много в эпителии и мозге.

Примечания[править | править код]

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000196776 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000055447 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Edris B., Weiskopf K., Volkmer A. K., Volkmer J. P., Willingham S. B., Contreras-Trujillo H., Liu J., Majeti R., West R. B., Fletcher J. A., Beck A. H., Weissman I. L., van de Rijn M. Antibody therapy targeting the CD47 protein is effective in a model of aggressive metastatic leiomyosarcoma. (англ.) // Proceedings Of The National Academy Of Sciences Of The United States Of America. — 2012. — 24 April (vol. 109, no. 17). — P. 6656—6661. — doi:10.1073/pnas.1121629109. — PMID 22451919. [исправить]
  6. Willingham S. B., Volkmer J. P., Gentles A. J., Sahoo D., Dalerba P., Mitra S. S., Wang J., Contreras-Trujillo H., Martin R., Cohen J. D., Lovelace P., Scheeren F. A., Chao M. P., Weiskopf K., Tang C., Volkmer A. K., Naik T. J., Storm T. A., Mosley A. R., Edris B., Schmid S. M., Sun C. K., Chua M. S., Murillo O., Rajendran P., Cha A. C., Chin R. K., Kim D., Adorno M., Raveh T., Tseng D., Jaiswal S., Steinberg G. K., Li G., So S. K., Majeti R., Harsh G. R., van de Rijn M., Teng N. N., Sunwoo J. B., Alizadeh A. A., Clarke M. F., Weissman I. L. The CD47-signal regulatory protein alpha (SIRPa) interaction is a therapeutic target for human solid tumors. (англ.) // Proceedings Of The National Academy Of Sciences Of The United States Of America. — 2012. — 24 April (vol. 109, no. 17). — P. 6662—6667. — doi:10.1073/pnas.1121623109. — PMID 22451913. [исправить]
  7. ScienceNow, S. C. P. Williams, One Drug to Shrink All Tumors Архивировано 29 марта 2012 года., 26 March 2012
  8. Tseng D., Volkmer J. P., Willingham S. B., Contreras-Trujillo H., Fathman J. W., Fernhoff N. B., Seita J., Inlay M. A., Weiskopf K., Miyanishi M., Weissman I. L. Anti-CD47 antibody-mediated phagocytosis of cancer by macrophages primes an effective antitumor T-cell response. (англ.) // Proceedings Of The National Academy Of Sciences Of The United States Of America. — 2013. — 2 July (vol. 110, no. 27). — P. 11103—11108. — doi:10.1073/pnas.1305569110. — PMID 23690610. [исправить]
  9. Unanue E. R. Perspectives on anti-CD47 antibody treatment for experimental cancer. (англ.) // Proceedings Of The National Academy Of Sciences Of The United States Of America. — 2013. — 2 July (vol. 110, no. 27). — P. 10886—10887. — doi:10.1073/pnas.1308463110. — PMID 23784781. [исправить]

Библиография[править | править код]

  • Дмитрий Джагаров (2015). CD47 – удостоверение личности на уровне клеток. Academia.edu
  • Oldenborg, P. A. (2013). CD47: A Cell Surface Glycoprotein Which Regulates Multiple Functions of Hematopoietic Cells in Health and Disease. ISRN hematology, 2013: 614619. doi: 10.1155/2013/614619
  • Soto Pantoja, D. R., Kaur, S., Miller, T. W., et al. & Roberts, D. D. (2013) Leukocyte surface antigen CD47. UCSD Molecule Pages, 2(1), 19-36.
  • Brown E.J., Frazier W.A. Integrin-associated protein (CD47) and its ligands. (англ.) // Trends Cell Biol.  (англ.) : journal. — 2001. — Vol. 11, no. 3. — P. 130—135. — doi:10.1016/S0962-8924(00)01906-1. — PMID 11306274.
  • Oldenborg P.A. Role of CD47 in erythroid cells and in autoimmunity. (англ.) // Leuk. Lymphoma  (англ.) : journal. — 2004. — Vol. 45, no. 7. — P. 1319—1327. — doi:10.1080/1042819042000201989. — PMID 15359629.
  • Kaczorowski D.J., Billiar T.R. Targeting CD47: NO limit on therapeutic potential. (англ.) // Circ. Res.  (англ.) : journal. — 2007. — Vol. 100, no. 5. — P. 602—603. — doi:10.1161/01.RES.0000261609.44977.25. — PMID 17363705.
  • Campbell I.G., Freemont P.S., Foulkes W., Trowsdale J. An ovarian tumor marker with homology to vaccinia virus contains an IgV-like region and multiple transmembrane domains. (англ.) // Cancer Res.  (англ.) : journal. — 1992. — Vol. 52, no. 19. — P. 5416—5420. — PMID 1394148.
  • Brown E., Hooper L., Ho T., Gresham H. Integrin-associated protein: a 50-kD plasma membrane antigen physically and functionally associated with integrins. (англ.) // J. Cell Biol.  (англ.) : journal. — 1991. — Vol. 111, no. 6 Pt 1. — P. 2785—2794. — doi:10.1083/jcb.111.6.2785. — PMID 2277087.
  • Lindberg F.P., Gresham H.D., Schwarz E., Brown E.J. Molecular cloning of integrin-associated protein: an immunoglobulin family member with multiple membrane-spanning domains implicated in alpha v beta 3-dependent ligand binding. (англ.) // J. Cell Biol.  (англ.) : journal. — 1993. — Vol. 123, no. 2. — P. 485—496. — doi:10.1083/jcb.123.2.485. — PMID 7691831.
  • Mawby W.J., Holmes C.H., Anstee D.J., et al. Isolation and characterization of CD47 glycoprotein: a multispanning membrane protein which is the same as integrin-associated protein (IAP) and the ovarian tumour marker OA3. (англ.) // Biochem. J.  (англ.) : journal. — 1995. — Vol. 304 ( Pt 2). — P. 525—530. — PMID 7998989.
  • Lindberg F.P., Lublin D.M., Telen M.J., et al. Rh-related antigen CD47 is the signal-transducer integrin-associated protein. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1994. — Vol. 269, no. 3. — P. 1567—1570. — PMID 8294396.
  • Gao A.G., Lindberg F.P., Finn M.B., et al. Integrin-associated protein is a receptor for the C-terminal domain of thrombospondin. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1996. — Vol. 271, no. 1. — P. 21—4. — doi:10.1074/jbc.271.1.21. — PMID 8550562.
  • Cherif-Zahar B., Raynal V., Gane P., et al. Candidate gene acting as a suppressor of the RH locus in most cases of Rh-deficiency. (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1996. — Vol. 12, no. 2. — P. 168—173. — doi:10.1038/ng0296-168. — PMID 8563755.
  • Chung J., Gao A.G., Frazier W.A. Thrombspondin acts via integrin-associated protein to activate the platelet integrin alphaIIbbeta3. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1997. — Vol. 272, no. 23. — P. 14740—14746. — doi:10.1074/jbc.272.23.14740. — PMID 9169439.
  • Jiang P., Lagenaur C.F., Narayanan V. Integrin-associated protein is a ligand for the P84 neural adhesion molecule. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1999. — Vol. 274, no. 2. — P. 559—562. — doi:10.1074/jbc.274.2.559. — PMID 9872987.
  • Hermann P., Armant M., Brown E., et al. The vitronectin receptor and its associated CD47 molecule mediates proinflammatory cytokine synthesis in human monocytes by interaction with soluble CD23. (англ.) // J. Cell Biol.  (англ.) : journal. — 1999. — Vol. 144, no. 4. — P. 767—775. — doi:10.1083/jcb.144.4.767. — PMID 10037797.
  • Chung J., Wang X.Q., Lindberg F.P., Frazier W.A. Thrombospondin-1 acts via IAP/CD47 to synergize with collagen in alpha2beta1-mediated platelet activation. (англ.) // Blood  (англ.) : journal. — American Society of Hematology  (англ.), 1999. — Vol. 94, no. 2. — P. 642—648. — PMID 10397731.
  • Longhurst C.M., White M.M., Wilkinson D.A., Jennings L.K. A CD9, alphaIIbbeta3, integrin-associated protein, and GPIb/V/IX complex on the surface of human platelets is influenced by alphaIIbbeta3 conformational states. (англ.) // Eur. J. Biochem.  (англ.) : journal. — 1999. — Vol. 263, no. 1. — P. 104—111. — doi:10.1046/j.1432-1327.1999.00467.x. — PMID 10429193.
  • Mateo V., Lagneaux L., Bron D., et al. CD47 ligation induces caspase-independent cell death in chronic lymphocytic leukemia. (англ.) // Nat. Med. : journal. — 1999. — Vol. 5, no. 11. — P. 1277—1284. — doi:10.1038/15233. — PMID 10545994.
  • Wu A.L., Wang J., Zheleznyak A., Brown E.J. Ubiquitin-related proteins regulate interaction of vimentin intermediate filaments with the plasma membrane. (англ.) // Mol. Cell  (англ.) : journal. — 1999. — Vol. 4, no. 4. — P. 619—625. — doi:10.1016/S1097-2765(00)80212-9. — PMID 10549293.
  • Erb L., Liu J., Ockerhausen J., et al. An RGD sequence in the P2Y(2) receptor interacts with alpha(V)beta(3) integrins and is required for G(o)-mediated signal transduction. (англ.) // J. Cell Biol.  (англ.) : journal. — 2001. — Vol. 153, no. 3. — P. 491—501. — doi:10.1083/jcb.153.3.491. — PMID 11331301.
  • Rebres R.A., Vaz L.E., Green J.M., Brown E.J. Normal ligand binding and signaling by CD47 (integrin-associated protein) requires a long range disulfide bond between the extracellular and membrane-spanning domains. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 37. — P. 34607—34616. — doi:10.1074/jbc.M106107200. — PMID 11454874.
  • Yuhua Wang, Zhenghong Xu, Shutao Guo, Lu Zhang, Arati Sharma, Gavin P Robertson and Leaf Huang. Intravenous Delivery of siRNA Targeting CD47 Effectively Inhibits Melanoma Tumor Growth and Lung Metastasis (англ.) // Molecular Therapy. : journal. — 2013. — Vol. 21. — P. 1919—1929. — doi:10.1038/mt.2013.135.