DDR1

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
DDR1
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
Символ DDR1 ; CAK; CD167; DDR; EDDR1; HGK2; MCK10; NEP; NTRK4; PTK3; PTK3A; RTK6; TRKE
Внешние ID OMIM: 600408 MGI99216 HomoloGene68212 ChEMBL: 5319 GeneCards: DDR1 Gene
номер EC 2.7.10.1
Профиль экспрессии РНК
PBB GE DDR1 1007 s at tn.png
PBB GE DDR1 207169 x at tn.png
PBB GE DDR1 208779 x at tn.png
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 780 12305
Ensembl ENSG00000137332 ENSMUSG00000003534
UniProt Q08345 Q03146
RefSeq (мРНК) NM_001202521 NM_001198831
RefSeq (белок) NP_001189450 NP_001185760
Локус (UCSC) Chr 6:
30.84 – 30.87 Mb
Chr 17:
35.68 – 35.7 Mb
Поиск в PubMed [1] [2]

DDR1 (англ. discoidin domain receptor tyrosine kinase 1; CD167a , КФ 2.7.10.1) — мембранный белок, фермент из надсемейства рецепторных тирозинкиназ, продукт гена DDR1.

DDR1 входит в группу рецепторов, которые содержат домен, гомологичный белку дискоидин 1 из Dictyostelium discoideum.

Функции[править | править код]

Рецептор DDR1 играет роль в межклеточных взаимодействиях и распознавании.[1] Взаимодействие между лейкоцитарным DDR1 и коллагеном облегчает адгезию, миграцию, дифференцировку/созревание лейкоцитов и продукцию ими цитокинов и хемокинов. [2]

Структура[править | править код]

DDR1 — крупный белок, состоит из 895 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 101,1 кДа. N-концевой участок (398 аминокислот) является внеклеточным, далее расположен единственный трансмембранный фрагмент и внутриклеточный фрагмент (470 аминокислот). Внеклеточный фрагмент включает 4 участка N-гликозилирования. Цитозольный участок включает протеинкиназный домен, участок связывания с АТФ, 4 аутофосфорилируемых тирозинов и PPxY-мотив.

Рецептор взаимодействует с WWC1 (посредством WW доменов), входит в тримолекулярный комплекс с белками WWC1 и PRKCZ (как правило в несвязанном с коллагеном состоянии).

В результате альтернативного сплайсинга образуются 5 изоформ белка.

Каталитическая активность[править | править код]

Внутриклеточный протеинкиназный домен фосфорилирует собственные остатки тирозина, перенося фосфатную группу с АТФ на гидроксильную группу аминокислоты. Аутофосфорилирование происходит при взаимодействии DDR1 с коллагенами типов I—VI.

Тканевая специфичность[править | править код]

Белок в небольшой степени экспрессирован на эпителиальных клетках большинства тканей, максимальная экспрессия наблюдается в мозге, лёгких, плаценте и почках. Высокая степень экспрессии найдена во многих линиях клеток карциномы, особенно в клетках рака молочной железы. Отсутствует в соединительной ткани, на эндотелиальных клетках, в жировой и мышечной тканях и на гематопоэтических клетах.

См.также[править | править код]

Примечания[править | править код]

  1. Uniprot database entry for CD11a (accession number Q08345)
  2. Yoshimura T, Matsuyama W, Kamohara H (2005). «Discoidin domain receptor 1: a new class of receptor regulating leukocyte-collagen interaction». Immunol. Res. 31 (3): 219–30. DOI:10.1385/IR:31:3:219. PMID 15888913.

Библиография[править | править код]

  • Yoshimura T, Matsuyama W, Kamohara H (2005). «Discoidin domain receptor 1: a new class of receptor regulating leukocyte-collagen interaction». Immunol. Res. 31 (3): 219–30. DOI:10.1385/IR:31:3:219. PMID 15888913.
  • Edelhoff S, Sweetser DA, Disteche CM (1995). «Mapping of the NEP receptor tyrosine kinase gene to human chromosome 6p21.3 and mouse chromosome 17C». Genomics 25 (1): 309–11. DOI:10.1016/0888-7543(95)80144-B. PMID 7774938.
  • Shelling AN (1995). «Localization of an epithelial-specific receptor kinase (EDDR1) to chromosome 6q16». Genomics 25 (2): 584–7. DOI:10.1016/0888-7543(95)80065-T. PMID 7789998.
  • Weiner TM, Liu ET, Craven RJ, Cance WG (1995). «Expression of growth factor receptors, the focal adhesion kinase, and other tyrosine kinases in human soft tissue tumors». Ann. Surg. Oncol. 1 (1): 18–27. DOI:10.1007/BF02303537. PMID 7834423.
  • Laval S (1995). «Isolation and characterization of an epithelial-specific receptor tyrosine kinase from an ovarian cancer cell line». Cell Growth Differ. 5 (11): 1173–83. PMID 7848919.
  • Kato JY, Matsuoka M, Strom DK, Sherr CJ (1994). «Regulation of cyclin D-dependent kinase 4 (cdk4) by cdk4-activating kinase». Mol. Cell. Biol. 14 (4): 2713–21. PMID 8139570.
  • Di Marco E (1993). «Molecular cloning of trkE, a novel trk-related putative tyrosine kinase receptor isolated from normal human keratinocytes and widely expressed by normal human tissues». J. Biol. Chem. 268 (32): 24290–5. PMID 8226977.
  • Perez JL (1994). «Identification and chromosomal mapping of a receptor tyrosine kinase with a putative phospholipid binding sequence in its ectodomain». Oncogene 9 (1): 211–9. PMID 8302582.
  • Johnson JD, Edman JC, Rutter WJ (1993). «A receptor tyrosine kinase found in breast carcinoma cells has an extracellular discoidin I-like domain». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90 (12): 5677–81. DOI:10.1073/pnas.90.12.5677. PMID 8390675.
  • Perez JL, Jing SQ, Wong TW (1996). «Identification of two isoforms of the Cak receptor kinase that are coexpressed in breast tumor cell lines». Oncogene 12 (7): 1469–77. PMID 8622863.
  • Valent A (1996). «Assignment of the NTRK4 (trkE) gene to chromosome 6p21». Hum. Genet. 98 (1): 12–5. DOI:10.1007/s004390050152. PMID 8682498.
  • Playford MP (1996). «The genomic structure of discoidin receptor tyrosine kinase». Genome Res. 6 (7): 620–7. DOI:10.1101/gr.6.7.620. PMID 8796349.
  • Sakuma S (1997). «Receptor protein tyrosine kinase DDR is up-regulated by p53 protein». FEBS Lett. 398 (2–3): 165–9. DOI:10.1016/S0014-5793(96)01234-3. PMID 8977099.
  • Nemoto T (1998). «Overexpression of protein tyrosine kinases in human esophageal cancer». Pathobiology 65 (4): 195–203. DOI:10.1159/000164123. PMID 9396043.
  • Tanaka K (1998). «Expression profile of receptor-type protein tyrosine kinase genes in the human thyroid». Endocrinology 139 (3): 852–8. DOI:10.1210/en.139.3.852. PMID 9492013.
  • Vogel W, Gish GD, Alves F, Pawson T (1998). «The discoidin domain receptor tyrosine kinases are activated by collagen». Mol. Cell 1 (1): 13–23. DOI:10.1016/S1097-2765(00)80003-9. PMID 9659899.
  • Shrivastava A (1998). «An orphan receptor tyrosine kinase family whose members serve as nonintegrin collagen receptors». Mol. Cell 1 (1): 25–34. DOI:10.1016/S1097-2765(00)80004-0. PMID 9659900.
  • Vogel W (2000). «Discoidin domain receptor 1 is activated independently of beta(1) integrin». J. Biol. Chem. 275 (8): 5779–84. DOI:10.1074/jbc.275.8.5779. PMID 10681566.
  • Foehr ED (2000). «Discoidin domain receptor 1 (DDR1) signaling in PC12 cells: activation of juxtamembrane domains in PDGFR/DDR/TrkA chimeric receptors». FASEB J. 14 (7): 973–81. PMID 10783152.
  • Weiner HL (2001). «Consistent and selective expression of the discoidin domain receptor-1 tyrosine kinase in human brain tumors». Neurosurgery 47 (6): 1400–9. DOI:10.1097/00006123-200012000-00028. PMID 11126911.
  • Mohan RR, Mohan RR, Wilson SE (2001). «Discoidin domain receptor (DDR) 1 and 2: collagen-activated tyrosine kinase receptors in the cornea». Exp. Eye Res. 72 (1): 87–92. DOI:10.1006/exer.2000.0932. PMID 11133186.

Ссылки[править | править код]